Núcleo de Pesquisa em Bioinformática da USP - NPB


A missão do NPB é o desenvolvimento de modelos matemáticos e ferramentas computacionais para armazenamento, manipulação, análise e visualização de dados experimentais em biologia e medicina.

Dissertação de mestrado



Número total de itens: 56

2011

1.   Cleber Silva Ferreira da Luz. Uma solução paralela para o problema da subsequência máxima em GPU. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2011.
Orientador: Siang Wun Song.
2.   Cleonice Conceição Caro de Souza. Computação bioinspirada em análise de expressões genicas. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2011.
Orientador: David Corrêa Martins Junior.
3.   Felipe Breve Siola. Análise Exploratória em Segmentação de Imagens. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2011.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
4.   Sandra Regina Vargas Fernandes. Análise de expressões gênicas através de GPUs. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2011.
Orientador: David Corrêa Martins Junior.

2010

1.   André Luiz de Oliveira. GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para a reconstrução de sequências e aplicação na descoberta de novos vírus. Dissertação (Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2010.
Orientador: Arthur Gruber.
2.   Bruna Renata Silva Corrêa. Biologia Sistêmica de Plasmodium vivax: análise computacional do genoma e transcritoma do parasita. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2010.
Orientador: Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio.
3.   Cristiano Perez Garcia. Segmentação de imagens de CT (provisório). Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
4.   Danillo Cunha de Almeida e Silva. Anotação Genômica Probabilística de organismos de interesse a Bioenergia. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Microsoft Research/Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paul. Início: 2010.
Orientador: Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio.
5.   Frank Dennis Julca Aguilar. Reconhecimento online de expressões matemáticas manuscritas. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
6.   Herbert J. L. Laricano. Aperfeiçoamento de máquinas de busca para imagens. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Roberto Hirata Junior.
7.   Igor Bonadio. Predicao de Genes utilizando Modelos de Covariancia. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
8.   Joel Edu Sanchez Castro. Decomposições Sequenciais a partir da Sup-Decomposição. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2010.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
9.   Leissi Margarita Castañeda León. Busca de objetos em vídeos baseada em modelos obtidos a partir de um conjunto de imagens. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Roberto Hirata Junior.
10.   Liliane Santana de Oliveira. Anotacao de Sequencias Biologicas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
11.   Lucas Vicente da Silva. Quantificação de Angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas (CAM) de embriâo de galinha. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
12.   Luiz Felipe Franco Belussi. A ser definido. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
13.   Marcela Ortega. Implementação de transaçoes assíncronas para o tratamento de eventos no processamento de requisições em larga escala. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Início: 2010.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
14.   Martha Chaddad. Estudo da utilização de cultura de meristemas para limpeza de Leifsonia xyli em Cana-de-açucar. Dissertação (Mestrado em Fisiologia e Bioquímica de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz-ESALQ/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2010.
Orientador: Helaine Carrer.
15.   Rafael de O. L. Gonçalves. A importância dos atributos de cores em PDI e CBIR. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Roberto Hirata Junior.
16.   Tales Pinheiro de Andrade. Interações Gênicas usando Redes Booleanas Restritas no Contexto de Problema de Satisfação de Restrições. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2010.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.

2009

1.   Alexandre Yukio Harano. Implementação eficiente de operadores morfológicos usando técnicas de pré-processamento. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
2.   Bernardo Magri. Criptografia em cartões do padrão ISO. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Início: 2009.
Orientador: Routo Terada.
3.   Charles Iury Oliveira Martins. Segmentação estrutural de imagens a partir do aprendizado de modelos de grafos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2009.
Orientador: Roberto Marcondes Cesar Junior.
4.   Diego Raphael Amancio. Uso de redes complexas em processamento de línguas naturais. Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, . Início: 2009.
Orientador: Luciano da Fontoura Costa.
5.   Edwin Delgado Huaynalaya. Segmentação de ovos de Schistossoma mansoni em imagens microscópicas. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2009.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.
6.   Giseli de Araujo Ramos. Deteção de lábios usando dispositivos móveis. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2009.
Orientador: Roberto Marcondes Cesar Junior.
7.   Henrique Morimitsu. Uma abordagem estrutural para detecção de placas em ambientes internos por dispositivos móveis. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Roberto Marcondes Cesar Junior.
8.   Luiz Fernando Corte Real. Simulação do Movimento Browniano de Moléculas de Água em Estruturas Biológicas Complexas. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2009.
Orientador: Marcel Parolin Jackowski.
9.   Luiz Thibério Lira Diniz Rangel. Desenvolvimento da plataforma EGene para anotação funcional e integração com banco de dados: aplicação e validação em transcritos de Eimeria spp. de galinha domestica. Dissertação (Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Arthur Gruber.
10.   Melline Fontes Noronha. Dinâmica da Fermentação Alcoólica: Aplicação de Redes Booleanas Probabilísticas Sensíveis a Contextona Dinâmica da Expressão Gênica na Linhagem Industrial PE-2 da Saccharomyces cerevisiae durante o Processo Fermentativo. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2009.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
11.   Renato Callado Borges. Simulador de Imagens de Ressonância Magnética de Difusão. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2009.
Orientador: Marcel Parolin Jackowski.
12.   Rosario Alejandra Medina Rodriguez. Aspectos Teóricos e Práticos do Classificador Baseado em Segmentos de Retas em Problemas de Multiclassificação. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
13.   Vitor Hugo Louzada Patricio. Identificando Genes Canalizadores usando Redes Booleanas Probabilísticas Contextuais. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
14.   Vitor Onuchic. Utilizando GHMM em alinhamento multiplo.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2009.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
15.   Willian Yukio Honda. Classificação de padrões em problemas com grande número de classes. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2009.
Orientador: Nina Sumiko Tomita Hirata.

2008

1.   Cleber M Okida. Autenticação de dispositivos móveis. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2008.
Orientador: Routo Terada.
2.   Dionathan Nakamura. Criptografia com curvas elípticas. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Início: 2008.
Orientador: Routo Terada.
3.   Felipe Fedel Silva. Identificação e análise de genes fotossintéticos em cana-de-açúcar. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2008.
Orientador: Helaine Carrer.
4.   Gustavo Luiz Duarte. Controle de transações no ambiente de computação móvel. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2008.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
5.   Rodrigo Bernardo Pimentel. Estimação de pose em dispositivos móveis. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2008.
Orientador: Roberto Hirata Junior.
6.   Ubiratan Augusto Lima. Análise de uma Rede Genética Probabilística que representa o controle do ciclo celular. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Bioinformática) - Departamento de Ciência da Computação Bioinfo Usp, . Início: 2008.
Orientador: Junior Barrera.
7.   Wellington Souza. Criptografia em smart cards. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Início: 2008.
Orientador: Routo Terada.

2007

1.   Camila Corrêa Morais. Extensão do Protocolo EPP para o sistema de registro de nomes domínio Brasil. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Marco Dimas Gubitoso.
2.   César Seragiotto. Segurança em dispositivos sem fio. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Routo Terada.
3.   Jean Fabian Tavares Barreto. Simulação de tecidos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Marco Dimas Gubitoso.
4.   Jihan Zoghbi. Segmentação de Tumores Cerebrais em Imagens de Ressonância Magnética. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Marcel Parolin Jackowski.
5.   Luis Roberto P. Paula. Bull´s Eye Morfológico. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2007.
Orientador: Roberto Hirata Junior.
6.   Mauricio Chui Rodrigues. Serviços Web e a NPDL. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2007.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
7.   Pablo Cesar Calcina CCore. Uma linguagem de scripts para ambientes multicore. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Marco Dimas Gubitoso.
8.   Valdson S Cleto. Emparelhamento bilinear. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2007.
Orientador: Routo Terada.

2006

1.   Eduardo Leal Oliveira Camargo. Análise do proteoma da madeira de Eucalyptus grandis. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Fisiologia de Plantas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2006.
Orientador: Carlos Alberto Labate.
2.   Elcio Koiti Nakamura. Otimização aplicada à busca de genes principais. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2006.
Orientador: Carlos Humes Jr.
3.   Luis Felipe Boaretto. Análise do proteoma de folhas de Eucaliptus grandis apresentado os sintomas da ferrugem. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Fisiologia de Plantas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2006.
Orientador: Carlos Alberto Labate.

*itens sem ano

1.   . Genoma Funcional: Knockout de genes relacionados à patogenicidade em Xylella fastidiosa-CVC.. . Início: 0.
Supervisor: Helaine Carrer.
2.   . Estudo Filogenetico do Cloroplasto da Cana-de-açúcar.. . Início: 0.
Supervisor: Helaine Carrer.
3.   . Clonagem e Análise da Expressão do gene que confere Resistencia aos Herbicidas Inibidores da Enzima Acetolactato Sintase em Plantas.. . Início: 0.
Supervisor: Helaine Carrer.


(*) Relatório criado com produções desde 2001 até HOJE
Data de processamento: 03/07/2011 14:30:26