Curriculum Vitae
Junior Barrera
Bolsista de Produtividade Em Pesquisa do CNPq - Nível 1B
Histórico no CNPq
SciELO - artigos em texto completo| Dados pessoais | Formação acadêmica/Titulação | Atuação profissional | Linhas de pesquisa | Projetos de pesquisa | Áreas de atuação |
| Idiomas | Prêmios e títulos | Produção científica, tecnológica e artística/cultural | Dados complementares | Indicadores de produção | Outras informações relevantes |
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Curriculum Vitae Junior Barrera Bolsista de Produtividade Em Pesquisa do CNPq - Nível 1B |
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Histórico no CNPqSciELO - artigos em texto completo |
| Nome | Junior Barrera |
| Nome em citações bibliográficas | BARRERA, Junior |
| Sexo | Masculino |
| Endereço profissional | Universidade de São Paulo,
Instituto de Matemática e Estatística,
Departamento de Ciência da Computação.
Rua do Matão, 1010 Cidade Universitária 05508090 - Sao Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30916256 Fax: (11) 30916134 E-mail: jb@ime.usp.br URL da Homepage: www.bioinfo.usp.br |
| 1998 | Livre-docência. Instituto de Matemática e Estatística Usp, IME / USP, Brasil. Título: Morfologia matemática: teoria, sistemas e aplicações, Ano de obtenção: 1998. Palavras-chave: Morfologia matemática. |
| 1988 - 1992 |
Doutorado
em Engenharia Elétrica Sistemas.
Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, POLI/USP, Brasil. Título: Uma abordagem unificada para os problemas de visão computacional: a morfologia matemática, Ano de Obtenção: 1992. Orientador: Gerald Jean Francis Banon. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Decomposição de operadores de reticulado; Morfologia matemática. |
| 1984 - 1987 |
Mestrado
em Computação Aplicada.
Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais, INPE, Brasil. Título: Uma abordagem unificada para os problemas de Processamento Digital de Imagens: a Morfologia Matemática, Ano de Obtenção: 1987. Orientador: Nelson D'àvila Mascarenhas Dr. Gerald Jean Francis Banon. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPQ, Brasil. Palavras-chave: Processamento digital de imagens; Morfologia matemática. |
| 1978 - 1983 |
Graduação
em Engenharia Elétrica.
Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, POLI/USP,
Brasil.
Título: Controle Automático - Projeto e simulação de um controlador para um reator nuclear. Orientador: Roberto de Moura Sales. |
| Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais, INPE, Brasil. |
| Vínculo institucional | ||
| 1985 - 1992 | Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: pesquisador assistente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Atividades |
| 01/1985 - 06/1992 | Pesquisa e desenvolvimento , Divisão de Processamento de Imagens, . | |
| Linhas de pesquisa
Aplicações da Morfologia Matemática em Análise de Imagens Desenvolvmento de sistemas computacionais para análise de imagens Pesquisa teórica em Morfologia Matemática |
| 1/1991 - 1/1992 | Extensão universitária , Divisão de Processamento de Imagens, . | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Introduction to Digital Image Processing. Curso Internacional de Sensoriamento Remoto.. |
| 1/1991 - 1/1992 | Extensão universitária , Divisão de Processamento de Imagens, . | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Introduction to Digital Image Processing. Curso Internacional de Sensoriamento Remoto.. |
| 12/1988 - 12/1989 | Estágios . | |
| Estágio realizado Doutorado Sanduíche na Ëcole des Mines de Paris, orientado pelo Dr. Jean Serra, na área de Morfologia Matemática.. |
| Universidade de São Paulo, USP, Brasil. |
| Vínculo institucional | ||
| 2005 - Atual | Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Titular do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Vínculo institucional | ||
| 1998 - 2005 | Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Vínculo institucional | ||
| 1992 - 1998 | Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: professor doutor do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Atividades |
| 07/2005 - Atual | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, . | |
| Cargo ou função Presidente da Comissão de Pesquisa do IME-USP. |
| 10/2004 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Projetos de pesquisa
Biomedical Research Informatics for Global Health Training Program - BRIGHT |
| 3/2003 - Atual | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Membro da Congregação do IME-USP. |
| 2/2002 - Atual | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, . | |
| Cargo ou função Membro da Comissão de Pós-Graduação do Programa de Doutorado em Bioinformática da USP. |
| 1/1992 - Atual | Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação. | |
| Disciplinas ministradas Álgebra Booleana Aprendizado Computacional Computação Gráfica Estrutura de Dados Introdução à Computação Morfologia Matemática Processamento de Imagens |
| 1/1992 - Atual | Ensino, Ciência da Computação [Sp-Capital], Nível: Pós-Graduação. | |
| Disciplinas ministradas Processamento Digital de Imagens: Teoria e Aplicações Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens Aprendizado Computacional: Teoria, Algoritmos e Aplicações |
| 6/2003 - 6/2005 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Membro da Comissão de Pesquisa do IME-USP. |
| 5/2000 - 3/2005 | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Projetos de pesquisa
Cooperation for Gene Analysis Expression |
| 11/2000 - 11/2004 | Direção e administração, Instituto de Matemática e Estatística, . | |
| Cargo ou função Coordenador Científico do Núcleo de Pesquisa em Bioinformática da USP. |
| 7/2003 - 7/2004 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Microarrays. II Latin-American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research.. |
| 5/2002 - 5/2004 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Vice-presidente da Comissão de Pós-Graduação do Programa de Doutorado em Bioinformática da USP. |
| 6/2000 - 6/2003 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Membro da Comissão de Pesquisa do IME-USP. |
| 4/2001 - 4/2003 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Membro do Conselho do Depto. de Ciência da Computação. |
| 2/2000 - 8/2002 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Presidente da Comissão de Pesquisa do IME-USP. |
| 8/1998 - 8/2001 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Representante do DCC na Comissão de Cultura e Extensão (suplente). |
| 4/1994 - 4/1999 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Representante do DCC na Comissão de Iniciação Científica (suplente). |
| 9/1995 - 9/1997 | Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Cargo ou função Vice-coordenador da Comissão de Informática do IME-USP. |
| 1/1996 - 1/1996 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Automatic Programming of Morphological Machines. Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. |
| 3/1993 - 3/1995 | Direção e administração, Instituto de Matemática e Estatística, . | |
| Cargo ou função Vice Diretor do Centro de Ensino de Computação do IME-USP. |
| 1/1995 - 1/1995 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Morfologia Matemática. Parte prática. Workshop de Morfologia Matemática.. |
| 1/1994 - 1/1994 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens Binárias. IX Escola de Computação - UFPE.. |
| 1/1993 - 1/1993 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Processamento Digital de Imagens. Parte prática. EBAI.. |
| 1/1992 - 1/1992 | Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. | |
| Atividade de extensão realizada Mini-curso: Overview of Mathematical Morphology. SIBGRAPI.. |
| 1. | Aplicações da Morfologia Matemática em Análise de Imagens |
| Objetivos: Aplicar
os sistemas computacionais desenvolvidos e as técnicas de Morfologia
Matemática estudadas na solução de problemas reais de análise de
imagens.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: Análise de imagens; Morfologia Matematica. |
| 2. | Desenvolvmento de sistemas computacionais para análise de imagens |
| Objetivos: Desenhar e implementar sistemas computacionais para análise de imagens por Morfologia Matemática..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: Análise de imagens; Segmentacao de Imagens; Sistemas de Processamento de Imagens. |
| 3. | Pesquisa teórica em Morfologia Matemática |
| Objetivos: Estudar
famílias de operadores morfológicos e suas decomposições em termos de
operadores elementares da Morfologia Matemática (erosão, dilatação,
anti-erosão, anti-dilatação).. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: complete lattice; Decomposição de operador; Morfologia Matematica. |
| 4. | Aplicações de projeto de operadores morfológicos a problemas de análise de expressão gênica |
| Objetivos: Aplicar
técnicas de projeto de operadores morfológicos a problemas de análise
de sinais de expressão gênica. Um problema típico dessa classe é
reconhecer um conjunto mínimo de genes que seja suficiente para
distinguir um dado estado biológico de outros. Por exemplo, escolher
genes, cuja expressão, permite distinguir tumores^cancerígenos de
diversos tipos.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: Análise de expressão gênica; Pattern Recognition; projeto de operadores de reticulado. |
| 5. | Desenvolvimento de sistemas computacionais para a mineração de dados |
| Objetivos: Desenvolvimento
de ambientes computacionais para a mineração de dados de biologia
molecular. Esses ambientes incluem bancos de dados heterogêneos,
algoritmos de reconhecimento de padrões (projeto de operadores
morfológicos), e computação de alto desempenho.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: Mineração de dados; Bancos de dados; Alto desempenho. |
| 6. | Identificação de redes de regulação gênica |
| Objetivos: Aplicação
de técnicas de identificação de sistemas dinâmicos de reticulado às
redes de expressão gênica. Os dados dinâmicos observados são medidas de
expressão gênica, em geral, obtidas por experimentos que usam a
tecnologia de microarrays.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: redes de expressão gênica; identificação de sistema dinâmico; microarray. |
| 7. | Aplicação de projeto de operadores morfológicos a problemas reais de análise de imagens |
| Objetivos: Aplicação
das técnicas de projeto de operadores morfológicos para a solução de
problemas reais de análise de imagens. Alguns problemas abordados são
reconhecimento de caracteres, reconhecimento de dígitos manuscritos,
reconhecimento de assinaturas, perseguição de alvos em imagens de
movimento, etc.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: projeto de operadores de reticulado; Reconhecimento de dígitos manuscritos; Reconhecimento de caracteres. |
| 8. | Identificação de sistemas dinâmicos de reticualdo |
| Objetivos: Desenvolver
uma teoria matemática e algoritmos computacionais, que permitam a
identificação de sistemas dinâmicos discretos de reticulados finitos, a
partir de dados observados da dinâmica do sistema a ser identificado.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: simulação; sistema dinâmico de reticulado; identificação de sistema dinâmico. |
| 9. | Projeto de operadores morfológicos por aprendizado computacional |
| Objetivos: Desenvolver
uma teoria matemática e algoritmos computacionais que permitam o
projeto de operadores morfológicos a partir de amostras de
treinamento.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Aeronáutica e espaço; Agricultura, pecuária, silvicultura, exploração florestal. Palavras-chave: automatic programming; Decomposição de operador; Design of morphological operators; Morfologia Matematica. |
| 2004 - Atual | Biomedical Research Informatics for Global Health Training Program - BRIGHT |
| Descrição: Projeto
conjunto com o IME-USP, MIT e Harvard Medical School, no qual
aplicaremos técnicas de análise de imagens por nós desenvolvidas para
resolução de problemas em expressão gênica e bioinformática. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Lucila Ohno Machado - Integrante / Richard Maas - Integrante / Eduardo Massad - Integrante / Junior Barrera - Coordenador. . |
| 2000 - 2005 | Cooperation for Gene Analysis Expression |
| Descrição: Desenvolver
técnicas de análise de expressão gênica e aplica-las ao entendimento de
Problemas biológicos, como o controle do ciclo celular. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Hugo Aguirre Armelin - Integrante / Junior Barrera - Coordenador. . |
| 2002 - 2004 | Identificação
de Genes que Regulam Fenótipos de Interesse em Agropecuária através da
Análise Computacional de Seqüências de Expressão |
| Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para pesquisar melhorias vegetais e animais..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador. . |
| 2002 - Atual | Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo da Malária Humana na Amazônia Brasileira |
| Descrição: Análise
de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica,
para entender mecanismos biológicos presentes no parasita da malária.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Hernando A del Portillo Obando - Integrante / Junior Barrera - Coordenador. . |
| 2002 - Atual | Cursos / Organização Mundial da Saúde |
| Descrição: Organização de cursos de Bioinformática de curta duração para alunos latino-americanos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Hernando A del Portillo Obando - Integrante / Junior Barrera - Coordenador. . |
| 1. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação.
|
| 2. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics).
|
| 3. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
|
| 4. | Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
|
| 5. | Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.
|
| Compreende | Português (Bem), Espanhol (Bem), Francês (Bem), Inglês (Bem). |
| Fala | Português (Bem), Espanhol (Pouco), Francês (Bem), Inglês (Bem). |
| Lê | Português (Bem), Espanhol (Bem), Francês (Bem), Inglês (Bem). |
| Escreve | Português (Bem), Espanhol (Pouco), Francês (Bem), Inglês (Bem). |
| 2005 | Aprovado no concurso de Professor Titular do Departamento de Ciência da Computação do IME/USP, com as méidas: 10; 10; 10; 10; 9.9., Depto de Ciência da Computação do IME-USP. |
| 2004 | Melhor apresentação no CAMDA 2004, com o trabalho A New Annotation Tool for Malaria Based on Inference of Probabilistic Genetic Networks, Critical Assessment of Microarray Data Analysis / Duke University. |
| 2004 | Aprovado no concurso de Professor Titular em Ciência da Computação, com as médias 9.65, 9.65, 9.8, 9.96 e 9.98., Depto. de Ciência da Computação / IME-USP. |
| 2004 | Membro do Comitê Assessor Externo da EMBRAPA Informática Agropecuária, CNPTIA - EMBRAPA. |
| 2004 | Vice-presidente da AB3C, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. |
| 2002 | Convite para comissão julgadora de teses na área de Morfologia Matemática na Universidade de Amsterdam, Universidade de Amsterdam, Holanda. |
| 1996 | Orientador da dissertação de mestrado que tirou o primeiro lugar no concurso de teses e dissertações da SBC, Sociedade Brasileira de Computação. |
| 1992 | Uma das tres melhores teses de doutorado produzidas na USP em Ciências Exatas em 1992, Universidade de São Paulo. |
| 1983 | Segundo colocado do concurso de trabalhos de iniciação científica da SBC, Sociedade Brasileira de Computação. |
| Produção científica, tecnológica e artística/cultural | Ver informações complementares |
| Produção bibliográfica | Produção técnica | Orientações concluídas | Demais trabalhos |
| Produção bibliográfica |
| Artigos publicados em periódicos (Completo) |
| 1. | SILVA, Paulo J S ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; KIM, Seungchan ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, Leônidas O ; SUH, Edward ; DOUGHERTY, Edward R . Feature selection algorithms to find strong genes. Pattern Recognition Letters, 2005. |
| 2. | HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior . A Unifying View for Stack Filter Design Based on Graph Search Methods. Pattern recognition, 2005. |
| 3. | MARTINS JR, D C ; CESAR JR, Roberto M ; BARRERA, Junior . W-operator window design by minimization of mean conditional entropy. Pattern Analysis and Applications, 2005. |
| 4. | BARRERA, Junior ; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. . An environment for knowledge discovery in Biology. Computers in Medicine and Biology, v. 34, p. 427-447, 2004. |
| 5. | BRUN, Marcel ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Nonlinear filter design using envelopes. Journal Of Mathematical Image And Vision, Estados Unidos, v. 21, n. 1, p. 81-97, 2004. |
| 6. | BARRERA, Junior ; TORRES, Martha . A parallel algorithm for finding small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. Genetics and Molecular Biology, Brasil, v. 27, n. 4, p. 686-690, 2004. |
| 7. | HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior . A greedy algorithm for decomposing convex structuring elements. Journal of Mathematical Imaging and Vision, v. 8, p. 269-289, 2003. |
| 8. | BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior . Design of optimal binary filters under joint multiresolution-envelope constraint.. Pattern recognition letters, v. 24, p. 937-945, 2003. |
| 9. | HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior . A note on Park and Chin algorithm. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, v. 24, n. 1, p. 139-144, 2002. |
| 10. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Inference from clustering with application to gene expression microarrays. Journal of Computational Biology, Estados Unidos, v. 9, n. 1, p. 105-126, 2002. |
| 11. | KIM, S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Strong feature sets from small samples. Journal of Computational Biology, v. 9, n. 1, p. 127-146, 2002. |
| 12. | HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Multiresolution design of aperture operators. Journal of Mathematical Image and Vision, v. 19, p. 199-222, 2002. |
| 13. | HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P. . Segmentation of microarray images by mathematical morphology. Real time imaging, Estados Unidos, v. 8, p. 491-505, 2002. |
| 14. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Pattern recognition theory in nonlinear signal processing. Journal of Mathematical Imaging and Vision, v. 16, p. 181-197, 2002. |
| 15. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; MOZELLEL, Gerard ; KIM, Seungchan ; BRUN, Marcel . Multiresolution Analysis for Optimal Binary Filters. Journal Of Mathematical Image And Vision, v. 14, n. 1, p. 53-72, 2001. |
| 16. | BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, R. F. . From the sup-decomposition to sequential decompositions. Journal of Mathematical Imaging And Vision, v. 15, n. 3, p. 197-216, 2001. |
| 17. | BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, R. F. . Sub-compact and inf-compact representations of W-operators. Fundamenta Informaticae, v. 45, n. 4, p. 283-294, 2001. |
| 18. | TOMITA, N. S. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Iterative Design of Morphological Binary Image Operators. Optical Engineering, v. 39, n. 12, p. 3106-3123, 2000. |
| 19. | HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E. . A combinatorial optimization technique for the sequential decomposition of erosions and dilations. Journal Of Mathematical Image And Vision, v. 14, n. 1, p. 17-33, 2000. |
| 20. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; BRUN, Marcel . Hybrid human-machine binary morphological operator design. Signal Processing, v. 80, p. 1469-1487, 2000. |
| 21. | TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . A switching algorithm for design of optimal increasing binary filters over large windows. Pattern Recognition, v. 33, n. 6, p. 1059-1081, 2000. |
| 22. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. . Aperture filters. Signal Processing, v. 80, n. 4, p. 697-721, 2000. |
| 23. | BARRERA, Junior ; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of morphological machines by PAC learning. Fundamenta Informaticae, v. 41, p. 229-258, 2000. |
| 24. | KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Multiresolution Bayesian design of binary filters. Electronic Imaging, v. 9, n. 3, p. 283-295, 2000. |
| 25. | BARRERA, Junior ; BANON, G. J. F. ; LOTUFO, R. A. . MMach: a mathematical morphology toolbox for the Khoros system. Journal of Electronic Imaging, v. 6, n. 1, p. 54-67, 1998. |
| 26. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T. . Design of optimal morphological operators from prior filters. Acta Steriologica, v. 16, n. 3, p. 193-200, 1997. |
| 27. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Bayesian design of optimal morphological operators based on prior distributions for conditional probabilities. Acta Steriologica, v. 16, n. 3, p. 167-174, 1997. |
| 28. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of binary morphological machines by design of statistically optimal operators in the context of computational learning theory. Journal of Electronic Imaging, v. 6, n. 1, p. 54-67, 1997. |
| 29. | BARRERA, Junior ; SALAS, G. P. . Set operations on collections of closed intervals and their applications to the automatic programming of morphological machines. Journal of Electronic Imaging, p. 335-352, 1993. |
| 30. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Decomposition of mappings between complete lattices by Mathematical Morphology. Signal Processing, v. 30, p. 299-327, 1993. |
| 31. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Minimal representation for translation invariant set mappings by Mathematical Morphology. SIAM Journal on Applied Mathematics, v. 51, n. 6, p. 1782-1798, 1991. |
| 32. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Morphological filtering for stripping correction of SPOT images. Photogrametria, v. 43, p. 195-205, 1989. |
| Livros publicados/organizados ou edições |
| 1. | COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) ; KOSLOW, Steven (Org.) ; CESAR JR, Roberto M (Org.) . Real-Time Imaging. Special Issue on Image Processing for Molecular Biology. Elsevier, 2004. |
| 2. | COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; CESAR JR, Roberto Marcondes (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) . Genetics and Molecular Biology. Special Section on Bioinformatics. . Brazilian Society for Genetics, 2004. |
| 3. | BARRERA, Junior (Org.) ; ASTOLA, Jaakko (Org.) . Journal of Electronic Imaging. Special Issue on Nonlinear Image Processing. SPIE, 1997. |
| 4. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens. Recife: Escola de Computacao, 1994. v. 1. 250 p. |
| Capítulos de livros publicados |
| 1. | BARRERA, Junior ; BANON, G. J. F. ; DOUGHERTY, Edward R . Automatic design of morphological operators. In: Fernand Meyer, Michel Schimidt. (Org.). Extensions. , 2005, v. , p. -. |
| 2. | HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, E R . Aperture filtures: theory, application and multi-resolution analysis.. In: Stephen Marshall; Giovanni L. Sicuranza.. (Org.). ADVANCES ON NONLINEAR SIGNAL AND IMAGE PROCESSING.. , 2005, v. , p. -. |
| 3. | BARRERA, Junior ; CESAR JUNIOR, R. M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; VÊNCIO, R Z ; MERINO, E F ; YAMAMOTO, M M ; LEONARDI, Florência G ; PEREIRA, C A B ; OBANDO, Hernando A Del Portillo . Constructing probabilistic genetic networks of Plasmodium Falciparum from dynamical expression signals of the Intraerythoricitic Development Cycle. CAMDA, 2004.. , 2005, v. , p. -. |
| 4. | BARRERA, Junior ; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; HIRATA, N. S. T. . Automatic Programming of Morphological Machines. In: Henk Heijmans; John Goutsias. (Org.). Mathematical Morphology. , 2000, v. , p. 229-258. |
| 5. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Logical Image operators. In: Edward R. Dougherty; Jaakko A. Astola. (Org.). Nonlinear filters for image processing. , 1999, v. , p. 1-58. |
| 6. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Computational Gray-Scale Operators. In: Edward R. Dougherty; Jaakko A. Astola. (Org.). Non linear filters for image processing. , 1999, v. , p. 61-96. |
| Textos em jornais de notícias/revistas |
| 1. | BARRERA, Junior . A mathematical morphology toolbox for Matlab. Electronic Imaging, SPIE/IS & T. International Technical Working Group Newsletter, v. 8, 01 jan. 1998. |
| 2. | DIAS, L. A. V. ; C NETO, G. ; BARRERA, Junior ; SOUZA, R. C. M. . Imagens e computadores: uma nova fronteira. Ciência Hoje, v. 7 - 37, p. 35 - 44. |
| Trabalhos em eventos (Completo) |
| 1. | BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, R F . Binary Decision Diagrams as a New Paradigm for Morphological Machines. In: International Symposium on Mathematical Morphology, 2005, Paris. proceedings of the 7th International Symposium on Mathematical Morphology. Paris, 2005. p. 3-12. |
| 2. | VAQUERO, Daniel André ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R. . A maximum likelyhood approach for multi-resolution W-operator design. In: SIBGRAPI, 2005, Natal. SIBGRAPI, 2005. |
| 3. | MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior . Automatic window design for gray-scale image processing based on entropy minimization.. In: CIARP, 2005, Havana. CIARP, 2005, 2005. |
| 4. | RIS, Marcelo ; BARRERA, Junior ; Bretani, H. . U-curve search for biological state characterization and genetic network design.. In: GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics,, 2005, New Port. GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics,, 2005. |
| 5. | TREPODE, Nestor W ; ARMELIN, H. A. ; BITNER, M. ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R. F. . Modeling cell cycle regulation by discrete dynamical systems.. In: GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, 2005, New Port. GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, 2005. |
| 6. | MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior . W-operator window design by maximization of training data information. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2004, Curitiba, 2004. p. 162-169. |
| 7. | BARRERA, Junior ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; MERINO, E F ; PEREIRA, C A B ; VÊNCIO, R Z ; LEONARDI, F G ; YAMAMOTO, M M ; PORTILLO, H A . A new annotation tool for malaria based on inference of probabilistic genetic networks. In: Critical Assessment of Microarray Data Analysis (CAMDA 2004), 2004, Durham, 2004. p. 36-40. |
| 8. | BARRERA, Junior ; CESAR JR, Roberto M ; DANTAS, Daniel de O ; MARTINS JR, David C ; TREPODE, Nestor W . From microarray images to biological knowledge. In: Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional, 2003, Rio de Janeiro. Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional - E-papers, 2003. |
| 9. | TORRES, Martha ; BARRERA, Junior . A parallel algorithm for enumerating combinations. In: International Conference on Parallel Processing (ICPP'03), 2003, 2003. p. 581-588. |
| 10. | HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TERADA, R. . The incremental splitting of intervals algorithm for the design of binary image operators. In: international Symposium of Mathematical Morphology, 2002, Sydney. ISMM 2002, 2002. p. 219-227. |
| 11. | BARRERA, Junior ; MARTIN, P. A. ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. . Identification of input-free finite lattice dynamical systems under envelope constraints. In: International Symposium on Mathematical Morphology, 2002, Sydney. ISMM 2002, 2002. p. 337-345. |
| 12. | TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. . A high performance algorithm for Boolean function minimization: the partioned incremental splitting of intervals (PISI). In: SPIE 2002, 2002, San Jose. SPIE 2002, 2002. v. 4667. p. 386-395. |
| 13. | BRUN, Marcel ; BALAGURUNATHAN, Y. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R. . Clustering granulometric features . In: SPIE 2002, 2002. Image Processing: Algorithms and Systems, 2002. v. 4667. p. 36-42. |
| 14. | BALAGURUNATHAN, Y. ; HASHIMOTO, R.F. ; KIM, S. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R. . Granulometric classifiers from small samples. In: SPIE 2002, 2002. Image Processing: Algorithms and Systems, 2002. v. 4667. p. 100-108. |
| 15. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JUNIOR, R. M. ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Time series inference from clustering. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics. San Jose : SPIE, 2001. v. 4266. p. 222-227. |
| 16. | KIM, S ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Finding Robust Linear Expression-Based Classifiers. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics. San Jose : SPIE, 2001. v. 4266. p. 207-212. |
| 17. | ARMELIN, H. A. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; FERREIRA, J. E. ; HIRATA, N. S. T. ; NEVES, E. J. . A simulator for gene expression networks. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics. San Jose : SPIE, 2001. v. 4266. p. 248-259. |
| 18. | HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. . Microarray gridding by mathematical morphology. In: SIBGRAPI, 2001, Florianópolis. SIBGRAPI. p. 112-119. |
| 19. | BRUN, Marcel ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Hybrid human-machine non-linear filter design using envelopes. In: SIBGRAPI, 2001, Florianópolis. SIBGRAPI, 2001. p. 106-111. |
| 20. | HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Image restoration by multiresolution aperture filters. In: NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001, San Jose. NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001. v. 4304. p. 256-264. |
| 21. | BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W. ; DANTAS, D. O. ; TERADA, R. . Multiresolution classification trees in OCR design. In: SIBGRAPI, 2001, Florianopolis. SIBGRAPI 2001, 2001. p. 59-66. |
| 22. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. . Dynamical systems with morphological transitions. In: NSIP, 2001, Baltmor. Non Linear Signal Processing, 2001. |
| 23. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. . Modeling temporal morphological systems via lattice dynamical systems. In: Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE, 2001, San Jose. Non linear image processing and pattern analysis XII, 2001. v. 4304. p. 265-276. |
| 24. | DOUGHERTY, E R ; BARRERA, Junior . Nonlinear filtering and pattern recognition: are they the same?. In: Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001. Proceedings of SPIE. v. 4304. p. 1-6. |
| 25. | BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; TERADA, R. . Boosting OCR classifier by optimal edge noise filtering. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and Its Applications to Image and Signal Processing. p. 371-380. |
| 26. | HIRATA JR, R. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Some applications of aperture filters. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 2000. p. 119-128. |
| 27. | DOUGHERTY, Edward R ; KIM, S ; MOZELLE, G. ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel . Multiresolution filter design. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 2000, San Jose. Non Linear Image Processing, 2000. v. 3961. p. 12-21. |
| 28. | KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Bayesian Multiresolution filter design. In: SPIE Nonlinear Image processing, 2000, San Jose. SPIE Nonlinear Image Processing, 2000. v. 3961. p. 22-33. |
| 29. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Design of Statistically Optimal Morphological Operators. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampera. European Signal Processing Conference, 2000. |
| 30. | HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Design of Gray-Scale Nonlinear filters via multiresolution apertures. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampere. European Signal Processing Conference. |
| 31. | HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Bayesian Switching algorithm for the optimal increasing binary filter. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampere. European Signal Processing Conference, 2000. v. IV. p. 1889-1892. |
| 32. | MADEIRA, H. M. ; BARRERA, Junior . Incremental evaluation of BDD-represented set operaators. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 308-315. |
| 33. | HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R. . Text segmentation by automatically designed morphological operators. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 284-291. |
| 34. | HIRATA JR, R. ; FLORES, F. C. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F. . Color Image Gradients for Morphological Segmentation. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 316-323. |
| 35. | BARRERA, Junior ; FLORES, F. C. ; HIRATA JR, R. ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F. . Morphological operators for segmentation of color images. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 300-307. |
| 36. | HASHIMOTO, R F ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E R . From the sup-decomposition to a sequential decomposition. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and Its Applications to Image and Signal Processing, 2000. p. 13-22. |
| 37. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; BRUN, Marcel . Hybrid human-machine binary morphological operator design. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1999, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1999. v. 3646. p. 162-173. |
| 38. | BARRERA, Junior ; TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R . Efficient switching algorithm for designing binary filters. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1999, San Jose. Nonlinear Image processing, 1999. v. 3646. p. 185-196. |
| 39. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. . Optimal range-domain window filters. In: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, 1999, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1999. v. 3646. |
| 40. | BARRERA, Junior . Design of morphological set operators by statistical optimization. In: IEEE-EURASIP Workshop on Nonlinear Signal and Image Processing, 1999, Antalia. Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP '99), 1999. p. 185-189. |
| 41. | DOUGHERTY, Edward R ; BITNER, M. ; CHEN, Y. ; KIM, S ; SILVAKUMAR, K. ; BARRERA, Junior ; MELTZER, P. ; TRENT, J. . Nonlinear filters in genomic control. In: IEEE-EURASIP Workshop in Nonlinear Signal and Image Processing, 1999, Antalia. Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP '99), 1999. p. 10-15. |
| 42. | HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; FLORES, F. C. ; LOTUFO, R. A. . Automatic dessign of morphological operators for motion segmentation. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics, Image Processing and Vision, 1999, Campinas. Computer Graphics, Image Processing and Vision, 1999. p. 283-292. |
| 43. | TOMITA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Design of Statistically Optimal Stack Filters. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 265-274. |
| 44. | MADEIRA, H. M. ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . A new paradigma for architectures of morphological machines: binary decision diagrams. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 293-301. |
| 45. | BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F . A simple algorithm for decomposing convex structuring elements. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 293-301. |
| 46. | BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Representation of gray-scale windowed operators. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1998. p. 19-26. |
| 47. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Prior information in the design of optimal binary filters. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1998. p. 259-266. |
| 48. | BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E. ; HASHIMOTO, Ronaldo F . Finding optimal sequential decomposition of erosions and dilations. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing. p. 299-306. |
| 49. | DOUGHERTY, Edward R ; GREGORYAN, A. M. ; BARRERA, Junior ; TOMITA, N. S. T. . Binary filter design optimization, prior information and robustness. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, Orlando. Mathematical Modeling and Estimation Techniques in Computer Vision, 1998. v. 3457. p. 230-241. |
| 50. | TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Design of large window binary filters via iteration. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, Boston. Intelligent Robots and Computer Vision, 1998. v. 3422. p. 173-182. |
| 51. | BARRERA, Junior ; TERADA, R. ; LOTUFO, R. A. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . An OCR based on Mathematical Morphology. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, San Jose. Non Linear Image Processing, 1998. v. 3304. p. 19720. |
| 52. | BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel . Translation invariant transformations of discrete random sets. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1998, Rio de Janeiro. SUBGRAPI, 1998. p. 450-455. |
| 53. | BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R. . Fast algorithms to compute the elementary operators of Maathematical Morphology. In: BrazilianSymposium on Computer Graphics and Image Processing, 1997, Campos do Jordão. SIBGRAPI, 1997. p. 163-170. |
| 54. | BARRERA, Junior ; ZAMPIROLLI, F. A. ; LOTUFO, R. A. . Morphological operators characterized by neighbourhood graphs. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1997, Campos do Jordão. SIBGRAPI, 1997. p. 179-186. |
| 55. | HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. . A tutorial on image segmentation via mathematical morphology with Khoros. In: Khoros workshop, 1997, Albuquerquue. Khoros '97 Proceedings. p. 192-206. |
| 56. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Optimal filters from prior filters. In: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, 1997, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1997. v. 3026. p. 2-7. |
| 57. | BARRERA, Junior ; SALAS, G. P. . Set operations on collections of closed intervals and their applications to the automatic programming of MMach's. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1996, Atlanta. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1996. p. 377-384. |
| 58. | BARRERA, Junior ; TERADA, R. ; SILVA, F. S. C. ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of MMach's for OCR. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1996, Atlanta. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1996. p. 385-392. |
| 59. | DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Morphological paradigma for loss function-based design of morphological filters. In: Conference of the Society for Optical Engineering, 1996, Orlando. Visual Information Processing, 1996. v. 2753. p. 3-10. |
| 60. | TOMITA, N. S. T. ; BARRERA, Junior . Programação automática de máquinas morfológicas binárias baseada em aprendizagem PAC. In: XXIII SEMISH, 1996, Recife. XXIII SEMISH, 1996. p. 517-525. |
| 61. | BARRERA, Junior ; TOMITA, N. S. T. ; SILVA, F. S. C. ; TERADA, R. . Automatic programming of binary morphological machines by PAC learning. In: Conference of the International Society fr Optical Engineering, 1995, San Diego. Neural, Morphological and Stochastic Methods in Image and Signal Processing, 1995. v. 2568. p. 233-244. |
| 62. | SILVA, F. S. C. ; BARRERA, Junior . Automating the generation of proceduress to analyse binary images. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de imagens, 1995, Curitiba. SIBGRAPI, 1995. |
| 63. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Set operator decomposition and conditionally translation invariant elementary operators. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1994, Fontainebleau. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1994. p. 5-12. |
| 64. | BARRERA, Junior ; SILVA, F. S. C. ; BANON, G. J. F. . Automatic programming of binary morphological machines. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1994, San Diego. Image Algebra and Morphological Image Processing, 1994. v. 2300. p. 229-240. |
| 65. | BARRERA, Junior ; BANON, G. J. F. ; LOTUFO, R. A. . A Mathematical Morphology toolbox for the Khoros system. In: Conference of the International Society for mathematical Morphology, 1994, San Diego. Image algebra and mathematical Morphology, 1994. v. 2300. p. 241-252. |
| 66. | BARRERA, Junior . A decomposition theorem in Mathematical Morphology. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1993, Barcelona. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1993. p. 234-237. |
| 67. | BARRERA, Junior ; BANON, G. J. F. . Expressiveness of the morphological language. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1992, San Diego. Image Algebra and Morphological Image processing, 1992. v. 1769. p. 264-275. |
| 68. | BARRERA, Junior . Estudo da proliferação celular por análise de imagens. In: Simpósio Brassileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1991, Sãao Paulo. SIBGRAPI '91, 1991. p. 201-212. |
| 69. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Morphological filtering for stripping correction of SPOT images. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1988, Itaipava. SIBGRAPI, 1988. p. 132-143. |
| 70. | II, F. A. M. ; DIAS, L. A. V. ; DÁLGE, J. C. ; BARRERA, Junior . Mudança automática no traçado de contornos por ocasião de redução de escala utilizando a Morfologia matemática . In: Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remto, 1988, Natal. Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988. |
| 71. | ROSIM, S. ; MARCONDES, S. P. ; MONTEIRO, A. M. ; DUTRA, L. V. ; BARRERA, Junior . ANIMA: analisador de imagens aplicado a sensoriamento remoto . In: Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988, Natal. Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988. |
| 72. | BARRERA, Junior ; MASCARENHAS, N. D. ; BANON, G. J. F. . Aplicações da Morfologia Matemática. In: SEMISH, 1987, Salvador. SEMISH, 1987. p. 72-87. |
| 73. | SANTELLANO, J. ; BARRERA, Junior . Sistemas de Processamento de Imagens. In: Simpósio Brasileiro do Microfilme, 1986, São Paulo. Simpósio Brasileiro do Microfilme, 1986. |
| 74. | BARRERA, Junior ; DUTRA, L V ; MASCARENHAS, N D A ; MONTEIRA, A M V ; ROSIM, S . Anima: sistema de análise morfológica de imagens microscópicas. In: I Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 1986, Campinas, 1986. |
| 75. | GUICHOU, C. ; BARRERA, Junior . Um instrumento de análise de imagens: por computadora morfologia matemática. In: SEMISH, 1985, Porto Alegre. SEMISH, 1985. |
| Trabalhos em eventos (Resumo) |
| 1. | MARTINS JR, D C ; CESAR JR, R M ; BARRERA, Junior . Genetic network architecture identification by conditional entropy analysis. In: 1o International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 2. | TREPODE, N W ; ARMELIN, H A ; BITTNER, M ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M D . An approach for studying genetic networks: discreted dynamical system simulation. A case study: the cell cycle. In: 1º International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 3. | TORRES, M ; BARRERA, Junior . A parallel algorithm to find small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003. |
| 4. | TORRES, M ; BARRERA, Junior . A parallel algorithm for agglomerative hierarchical clustering using complete link. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 5. | SILVA, P J S ; HASHIMOTO, R F ; KIM, S ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, L O ; SUH, E ; DOUGHERTY, E R . Feature Selection Algorithms to Find Strong Genes. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 6. | CAREZZATO, C J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J ; COSTA, L F . Classification of genomic regions by chaos game representation images and fractal dimension. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. |
| 7. | SOUZA, J e S ; SAKABE, N J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J . A large-scale study of SNPs in regulatory elements of alternative splicing and their possible relation to human diseases. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003. |
| 8. | COSTA, L F ; FABBRI, R ; BARRERA, Junior . Simple Microarray Gridding by a Minimization Procedure on Image Projections. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 9. | BARRERA, Junior ; CESAR JR, R M ; FERREIRA, J E ; GUBITOSO, M D . An environment for knowlegde discovery in bioinformatics applications. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003. |
| 10. | PINTO, C. C. D. A. ; RBILOTTA, C. C. ; BARRERA, Junior . Implementation of a morphological machine for classificatiion of human cromossomes. In: World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 1994, Rio de Janeiro. Word Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 1994. |
| 11. | MASCARENHAS, N. D. ; BARRERA, Junior . Experiência do INPE em Processamento de Imagens Médicas. In: Simpósio Brasileiro de Processamento de Imagens em Medicina, 1991, São Paulo. Simpósio Brasileiro de Processamento de Imagens em Medicina, 1991. |
| 12. | BARRERA, Junior ; VINCENT, L. ; RAPHAELA, M. ; MEYER, F. . Étude de la proliferation cellulaire par analise morphologique dímage. In: Cercle Français de Miscroscopie Quantitative, 1989, Paris. Cercle Français de Microscopie Quantitative, 1989. |
| 13. | DUTRA, L. V. ; ROSIM, S. ; MONTEIRO, A. M. ; BARRERA, Junior ; MASCARENHAS, N. D. . An image analysis system: ANIMA. In: International Electronic Imagery & Cnference, 1987, USA. International Electronic Imagery & Conference, 1987. |
| 14. | MASCARENHAS, N. D. ; BARRERA, Junior ; DUTRA, L. V. ; MONTEIRO, A. M. ; ROSIM, S. . Microscopia Computadorizada. In: SEMISH, 1986, Recife. SEMISH, 1986. p. 613-615. |
| 15. | GUICHOU, C. ; BARRERA, Junior . Morfologia em tom de cinza. In: Simpósio Brasileiro de Inteligência Artificial, 1985, São José dos Campos. Simpósio Brasileiro de Inteligência Artificial, 1985. |
| 16. | BARRERA, Junior . Simulação Digital de Redes Neurais. In: SEMISH, 1983, Campinas. SEMISH, 1983. p. 551-555. |
| 17. | BARRERA, Junior ; KOHN, A. F. . Simulação de redes neurais usando computador digital. In: Reunião Anual da SBPC, 1983, Campinas. Reunião Anual da SBPC, 1983. |
| Demais tipos de produção bibliográfica |
| 1. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Set mapping decomposition by Mathematical Morphology. Sao Jose dos Campos: INPE, 1999 (Relatorio tecnico). |
| 2. | BARRERA, Junior . Morfologia Matematica: teoria, sistemas e aplicacoes. Sao Paulo: IME-USP, 1998 (Sistematizacao de atividades para livre doscencia). |
| 3. | BARRERA, Junior . Uma abordagem unificada para os problemas de visao computacional: a Morfologia Matematica. Sao Jose dos campos: INPE, 1992 (Tese de doutorado). |
| 4. | BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Study of a pair of dual minimal representations for translation invariant set mappings by mathematical morphology. Sao Jose dos Campos: INPE, 1990 (Relatorio tecnico). |
| 5. | SERRA, J. ; BARRERA, Junior . Elements of functional analysis in mathematical morphology. Fontainebleau: CMM-ENSMP, 1989 (Relatorio tecnico). |
| 6. | BARRERA, Junior ; VINCENT, L. ; MEYER, F. ; RAPHAELA, M. . Etude de la proliferation cellulaire par analyse morphologique d images. Fontainebleau: CMM-ENSMP, 1989 (Relatorio tecnico). |
| 7. | BARRERA, Junior . Uma abordagem unificada para os problemas de processamento digital de imagens: a morfologia matematica. Sao Jose dos Campos: INPE, 1987 (Dissertacao de mestrado). |
| 8. | BARRERA, Junior . Processamento Digital de Imagens. Sao Jose dos Campos: INPE, 1985 (Relatorio tecnico). |
| Produção técnica |
| Softwares sem registro de patente |
| 1. | BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. . SDC morphology toolbox. 1999. |
| 2. | BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. . MMach: a mathematical morphology toolbox for the khoros system. 1997. |
| 3. | BARRERA, Junior ; DUTRA, L. V. ; MONTEIRO, A. M. ; ROSIM, S. ; MASCARENHAS, N. D. . ANIMA: analisador de imagens. 1987. |
| Processos ou técnicas |
| 1. | BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; KIM, Seungchang ; DOUGHERTY, Edward R . Evaluating Data Clustering Procedures. 2003. |
| 2. | SILVA, Paulo J S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Generating Feature Sets Using Linear Programming. 2002. |
| Demais tipos de produção técnica |
| 1. | BARRERA, Junior . Editor associado da revista Image Analysis and Stereology, de janeiro de 2000 a março de 2002. 2002. (Editor associado de revistas internacionais). |
| 2. | BARRERA, Junior . Editor associado da revista Pattern recognition, editada pela International Society for Pattern Recognition, desde 2001. 2001. (Editor associado de revistas internacionais). |
| 3. | BARRERA, Junior . Editor associado para Reconhecimento de Padrões da revista Journal of Electronic Imaging, edited by SPIE, desde 1999. 1999. (Editor associado de revistas internacionais). |
| 4. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Nature Genetics. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 5. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista SIAM Review. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 6. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista SIAM on Applied Mathematics. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 7. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista PAMI-IEEE. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 8. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Journal of Mathematical Image and Vision. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 9. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Signal Processing. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 10. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Pattern Recognition Letters. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 11. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Image Understanding. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 12. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Computational Biology. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 13. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Real Time Imaging. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 14. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Bioinformatics. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 15. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Image Analysis & Stereology. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 16. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Journal of Electronic Imaging. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 17. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalho para a revista Pattern Recognition. 1998. (Revisor de trabalhos para revistas internacionais). |
| 18. | BARRERA, Junior . Revisor de projetos para a FAPESP. 1998. (Revisor de projetos para agências de fomento). |
| 19. | BARRERA, Junior . Revisor de projetos para o CNPq. 1998. (Revisor de projetos para agências de fomento). |
| 20. | BARRERA, Junior . Revisor de projetos para a FAPERJ. 1998. (Revisor de projetos para agências de fomento). |
| Orientações concluídas |
| Mestrado |
| 1. | Gustavo P. Esteves. Validação de medidas de expressão gênica em imagens de microarray. 2004. Dissertação - Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Co-Orientador: Junior Barrera. |
| 2. | Daniel O. Dantas. Uma técnica automática para medida de sinal de imagens de cDNA. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Junior Barrera. |
| 3. | Caetano Giminez Carezato. Análise de classificadores de seqüências projetados por aprendizado computacional supervisionado e não supervisionado. 2004. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera. |
| 4. | Nestor Walter Trepode. Identificação de sistemas dinâmicos finitos: aplicações para a modelagem de redes genéticas. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Junior Barrera. |
| 5. | David Martins Jr. Redução de dimensionalidade baseada na entropia condicional média. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, . Co-Orientador: Junior Barrera. |
| 6. | Franklin Cesar Flores. Segmentação de vídeo digital por morfologia matemática. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera. |
| 7. | Francisco A Zampirolli. Desenvolvimento de um sistema de analise morfologica de imagens baseado em grafos de vizinhanca. 1997. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera. |
| 8. | Roberto Hirata Jr. Segmentacao de imagens por tecnicas da morfologia matematica. 1997. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera. |
| 9. | Nina S T Tomita. Programacao automatica de maquinas morfologicas binarias baseada em aprendizado PAC. 1996. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Junior Barrera. |
| 10. | Guillermo P Salas. Operacoes sobre colecoes de intervalos e suas aplicacoes a programacao automatica de maquinas morfologicas. 1996. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera. |
| Doutorado |
| 1. | Marcel Brun. Projetos de operadores morfológicos multi-escala por otimização estatística. 2002. 0 f. Tese (Doutorado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera. |
| 2. | Roberto Hirata Jr. Projeto de operadores morfológicos para imagens e sinais: abordagem de reticulados finitos. 2001. Tese - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera. |
| 3. | Ronaldo Fumio Hashimoto. Mudança de estrutura de representação de operadores em morfologia matemática. 2000. Tese - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Junior Barrera. |
| 4. | Nina S. T. Hirata. Projeto automático de operadores explorando conhecimento a priori. 2000. Tese (Doutorado em Ciência da Computação [Sp-Capital]) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera. |
| Demais trabalhos |
| 1. | BARRERA, Junior . Organizador do Primeiro Icobicobi, International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Ribeirão Preto. 2003 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 2. | BARRERA, Junior . Organizador de workshop em Morfologia Matemática para a conferênica da SIAM . 2002 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 3. | BARRERA, Junior . Organizador do curso internacional de Bioinformática, patrocinado pela OMS. . 2002 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 4. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o ISMM (International Symposium on Mathematical Morphology and its Applications to Image and Signal Processing). 2002 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 5. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis / IS&T/SPIE´s 13th Annual Symposium on Electronic Imaging: Science and Technology. 2001 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 6. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o IEEE Workshop on Scale-Space and Morphology in Computer Vision. 2001 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 7. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para a conferência International Joint Conference IBERAMIA-SBIA, I Workshop on Artificial Intelligence and Computer Vision. 2000 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 8. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o ISMM (International Symposium on Mathematical Morphology and its Applications to Image and Signal Processing). 2000 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 9. | BARRERA, Junior . Organizador do Workshop de Morfologia Matemática no SIBGRAPI. 1999 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 10. | BARRERA, Junior . Organizador do Workshop de Morfologia Matemática no SIBGRAPI . 1998 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 11. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o simpósio Mathematical Modeling and Estimation Techniques in Computer Vision. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1998 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 12. | BARRERA, Junior . Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1997 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 13. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o simpósio Statistical and Scholastic Methods for Image Processing II. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1997 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 14. | BARRERA, Junior . Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1996 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 15. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o II Workshop on Cybernetic Vision, São Carlos Institute of Physics, University of São Paulo. 1996 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 16. | BARRERA, Junior . Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1995 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 17. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o VIII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, SIBGRAPI 95, Universidade Federal de São Carlos. 1995 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 18. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o VII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, SIBGRAPI 94. 1994 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| 19. | BARRERA, Junior . Membro da Comissão Organizadora do SIBGRAPI 92. 1992 (Organização de encontros, simpósios e congressos). |
| 20. | BARRERA, Junior . Revisor de trabalhos para o simpósio Statistical and Stochastic Methods for Image Processing. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1991 (Revisor de trabalhos para conferências). |
| Participação em bancas examinadoras | Participação em bancas de comissões julgadoras | Participação em eventos | Orientações em andamento |
| Participação em bancas examinadoras |
| Dissertações |
| 1. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Lílian Nogueira de Faria. Reconstrução 3D de imagens tomográficas de Raios-X de arcos coronais em ambiente paralelo. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos. |
| 2. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Archias Alves de Almeida Filho. Maximização de entropia em lingüística computacional para a língua portuguesa. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 3. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Integração para dados e aplicações em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 4. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Gustavo Henrique Esteves. Validação de procedimentos para medida de expressão gênica a partir de imagens de cDNA Microarray. 2002. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Centro de Tratamento e Pesquisa do Hospital do Câncer. |
| 5. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Teófilo Emídio de Campos. Técnicas de seleção de características com aplicações em reconhecimento de faces. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 6. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Vital Cruvinel Ferreira. Restauração de imagens tomográficas de ciência dos solos por métodos iterativos. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos. |
| 7. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Luiz Eduardo da Silva. Algoritmo de fotomosaico para imagens coloridas por morfologia matemática. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. |
| 8. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Luciano Silva. Algoritmos geométricos discretos: complexidade e aplicações. 1998. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 9. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Aluir Porfírio Dal Poz. Correlação estrutural aplicada à extração automática de apoio de campo em imagens digitais. 1996. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil) - Escola Politécnica da Usp. |
| 10. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Guillermo Pablo Salas. Operações sobre coleções de intervalos e suas aplicações à programação automática de máquinas morfológicas. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 11. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Nina Sumiko Tomita Hirata. Programação automática de máquinas morfológicas binárias baseada em Aprendizado PAC. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 12. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Jussara Carneiro da Cunha. Inspeção de placas de circuito impresso utilizando morfologia matemática. 1995. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia. |
| 13. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Ulisses de Mendonça Braga Neto. Reconstrução Volumétrica e Análise de Imagens Tridimensionais por Morfologia Matemática. 1994. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas. |
| 14. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Tania Mezzadri Centeno. Limiarização de impressões digitais a partir da morfologia matemática. 1994. Dissertação (Mestrado em Computação) - Centro Federal de Educação Tecnológica do Paraná. |
| 15. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcos Cordeiro d'Ornellas. Algoritmos rápidos para o processamento morfológico de imagens binárias. 1992. Dissertação (Mestrado em Engenharia Eletrônica e Computação) - Instituto Tecnológico de Aeronáutica. |
| Teses de doutorado |
| 1. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Murillo Rodrigo Petrucelli Homem. Reconstrução tridimensional de imagens com o uso de deconvolução a partir de seções bidimensionais obtidas em microscopia óptica. 2003. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos Usp. |
| 2. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Márcio Magini. O estudo de mapas equivariantes sob a ação do grupo octaédrico: um sistema dinâmico para a evolução do código genético. 2002. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos. |
| 3. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcos Cordeiro d'Ornellas. Algorithmic patterns for morphological image processing. 2001. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - University of Amsterdam. |
| 4. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Hieu T. Nguyen. Segmentation of video into spatio-temporal objects. 2001. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - University of Amsterdam. |
| 5. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Ronaldo Fumio Hashimoto. Mudança de estrutura de representação de operadores em morfologia matemática. 2000. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 6. | BARRERA, Junior. Participação em banca de João Ricardo de Freitas Oliveira. O uso de algoritmos genéticos na decomposição morfológica de operadores invariantes em translação aplicados em imagens digitais. 1998. Tese (Doutorado em Computação Aplicada) - Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais. |
| 7. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Roseli de Deus Lopes. Técnicas de processamento de imagens tridimensionais baseadas em regiões adaptativas. 1998. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Escola Politécnica da Usp. |
| 8. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Roberto Marcondes Cesar Junior. Análise multi-escala de formas bidimensionais. 1997. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos. |
| 9. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Jun Okamoto Junior. Planejamento da aquisição de vistas de um objeto para fusão sensorial e obtenção de seu modelo tridimensional. 1994. Tese (Doutorado em Engenharia Mecatrônica) - Escola Politécnica da Usp. |
| 10. | BARRERA, Junior. Participação em banca de Alejandro César Frery Orgambide. Algumas ferramentas estatísticas na síntese, processamento e análise de imagens de radar de abertura sintética. 1993. Tese (Doutorado em Computação Aplicada) - Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais. |
| Participação em bancas de comissões julgadoras |
| Professor titular |
| 1. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Sérgio Ricardo Nozawa). 2003. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp. |
| Concurso público |
| 1. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente. 2004. Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto Usp. |
| 2. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de ingresso na carreira do Prof. Ronaldo Fumio Hashimoto. 2003. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 3. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Profa. Cristina Gomes Fernandes). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 4. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (José Augusto Ramos Soares). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 5. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (José Coelho Pina Junior). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 6. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assitente (Kunio Okuda). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 7. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Cláudia Monteiro Peixoto). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 8. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Elisabeti Kira). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 9. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Adilson Simonis). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 10. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Aurélio Ribeiro Leite de Oliveira). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 11. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Nelson Mugayar Kuhl). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 12. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Antonio Elias Fabris). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 13. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Luis Carlos de Castro Santos). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 14. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Joyce da Silva Bevilacqua). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 15. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Alexandre Megiorin Roma). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 16. | BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor no Depto. de Engenharia de Computação e Sistemas Digitais. 1999. Escola Politécnica da Usp. |
| Livre docência |
| 1. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Roberto Marcondes Cesar Jr.. 2003. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 2. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Julio Michael Stern. 2002. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 3. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Antonio Elias Fabris. 2002. Instituto de Matemática e Estatística Usp. |
| 4. | BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Sérgio Shiguemi Furuie. 2002. Escola Politécnica da Usp. |
| Participação em eventos |
| 1. | Palestra convidada: Bioinformática. 2002. (Participações em eventos/Congresso). |
| 2. | Palestra convidada: Design of aperture filters. 1999. (Participações em eventos/Congresso). |
| 3. | Palestra convidada: Non linear filters for genomic control . 1999. (Participações em eventos/Congresso). |
| 4. | Palestra convidada: Programmation automatique des systems morphologiques par apprentissage. 1995. (Participações em eventos/Congresso). |
| 5. | Palestra convidada: Morphological Representation of Translation Invariant Set Operators. 1994. (Participações em eventos/Congresso). |
| 6. | Palestra convidada: Uma caixa de ferramentas de Morfologia Matemática para o Sistema KHOROS. 1993. (Participações em eventos/Congresso). |
| 7. | Palestra convidada: Análise de dados de microarray. 2002. (Participações em eventos/Seminário). |
| 8. | Palestra convidada: Um ambiente integrado para a análise de dados de genética. 2001. (Participações em eventos/Seminário). |
| 9. | Palestra convidada: Nonlinear filters in genomic control. 1999. (Participações em eventos/Seminário). |
| 10. | Palestra convidada: From Microarray images to biological knowledge. 2002. (Participações em eventos/Simpósio). |
| 11. | Palestra convidada: Model-Based Design of Optimal Morphological Filters. 2000. (Participações em eventos/Simpósio). |
| 12. | Palestra convidada: Automatic algorithm design in the context of Morphological Machines. 1997. (Participações em eventos/Simpósio). |
| 13. | Palestra convidada: Experiência do INPE em processamento de imagens médicas. 1991. (Participações em eventos/Simpósio). |
| 14. | Palestra Convidada: Dos sinais de Microarrays à descoberta de conhecimento biológico. 2003. (Participações em eventos/Encontro). |
| 15. | Palestra convidada: An integrated environment for analysis of genetic data. 2002. (Participações em eventos/Encontro). |
| 16. | Palestra convidada: Descoberta de conhecimento em biologia molecular através da bioinformática. 2001. (Participações em eventos/Encontro). |
| 17. | Palestra convidada: Design of morphological operators by computational learning. 2001. (Participações em eventos/Encontro). |
| 18. | Palestra convidada: Non linear filters in genomic control. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 19. | Palestra convidada: Non linear filters in genomic control. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 20. | Palestra convidada: Non linear filters in genomic control. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 21. | Palestra convidada: Design of aperture filters for motion tracking and segmentation. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 22. | Palestra convidada: Hybrid human-machine design of morphological operators. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 23. | Palestra convidada: The switching algorithm for designing increasing operators. 1999. (Participações em eventos/Encontro). |
| 24. | Palestra convidada: Programação Automática de Máquinas Morfológicas por PAC Learning. 1998. (Participações em eventos/Encontro). |
| 25. | Palestra convidada: Parallelisation des operateurs morphologiques. 1995. (Participações em eventos/Encontro). |
| 26. | Palestra convidada: Data mining and dynamical modeling in Biology: a semiotic view. 2003. (Participações em eventos/Outra). |
| 27. | Palestra convidada / Session Probalility in Genetics. 2002. (Participações em eventos/Outra). |
| 28. | Palestra convidada: Non linear filters in genomic control. 1999. (Participações em eventos/Outra). |
| 29. | Palestra convidada: Design of morphological operators by generalized PAC learning. 1999. (Participações em eventos/Outra). |
| 30. | Programação Automática de Máquinas Morfológicas . 1995. (Participações em eventos/Outra). |
| Orientações em andamento |
| Mestrado |
| 1. | Daniel André Vaquero. Projeto de operadores morfológicos por multi-resolução. Início: 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador). |
| Doutorado |
| 1. | Israel Tojal da Silva. Redes de expressão gênica. Início: 2005. Tese (Doutorado em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp. (Co-orientador). |
| 2. | Daniel de Oliveira Dantas. Análise de expressão gênica. Início: 2004. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp. (Orientador). |
| 3. | Marcelo Ris. Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno. Início: 2003. Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador). |
| 4. | Jorge Estéfano Santana de Souza. Estudo em larga escala de ocorrência de SNPs em elelentos reguladores de Splicing e sua possível relação com doenças humanas. Início: 2003. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Co-orientador). |
| 5. | David Corrêa Martins Jr. Identificação de redes de expressão gênica em malária. Início: 2003. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Co-orientador). |
| 6. | Nestor Walter Trepode. Modelagem de Ciclo Celular. Início: 2002. Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador). |
| Produção bibliográfica | Produção técnica | Orientações concluídas | Demais trabalhos | Dados complementares |
| Produção bibliográfica |
| Artigos publicados em periódicos |
| Completos | 32 |
| Trabalhos em eventos |
| Completos | 75 |
| Resumos | 17 |
| Livros e capítulos |
| Livros publicados ou organizados | 4 |
| Capítulos de livros publicados | 6 |
| Textos em jornais ou revistas (magazines) |
| Revistas (Magazines) | 2 |
| Demais tipos de produção bibliográfica | 8 |
| Produção técnica |
| Softwares |
| Softwares sem registro ou patente | 3 |
| Processos ou técnicas |
| Processos ou técnicas sem registro ou patente | 2 |
| Demais tipos de produção técnica | 20 |
| Orientações concluídas |
| Mestrado |
| Orientador principal | 8 |
| Co-Orientador | 2 |
| Doutorado |
| Orientador principal | 4 |
| Demais trabalhos | 20 |
| Dados complementares |
| Participação em bancas examinadoras | 25 |
| Participação em bancas de comissões julgadoras | 21 |
| Participação em eventos | 30 |
| Orientações em andamento | 7 |
| A atuação profissional de Junior Barrera envolve atividades de pesquisa básica em matemática, desenvolvimento de software, aplicações de técnicas desenvolvidas a problemas de análise de imagens e genética, e funções administrativas. A sua principal contribuição científica foi o desenvolvimento de técnicas formais para o projeto de operadores de reticulado a partir de exemplos, o que inclui contribuições em decomposição algébrica, estimação estatística e otimização combinatória. Ele foi co-projetista de dois softwares de muito uso na comunidade internacional de processamento de imagens: as toolboxes de morfologia matemática mmach e mmorph, respectivamente, para asplataformas Khoros e Matlab. Desde de 1999 tem concentrado suas atividades de pesquisa na área de Bioinformática, principalmente na análise de expressão gênica. Atualmente, ele é editor associado de duas revistas internacionais: Pattern Recognition e Journal of Electronic Imaging (SPIE). As suas principais funções administrativas são a presidência do Núcleo de Bioinformática-USP e a presidência da comissão de pesquisas do IME-USP. Recentemente, apresentou palestras plenárias convidadas em uma conferência da American Mathematical Society sobre expressão gênica, na conferência européia de processamento de sinais não lineares e na conferência da SBMAC. Organizou um minisimpósio sobre Morfologia Matemática na conferência da SIAM de Boston. Ainda ele é um dos coordenadores da USP do progrma de Bioinformática da Organização Mundial da Saúde, coordenador de um projeto de pesquisas do MCT em Bioinformática, um dos pesquisadores principais de dois projetos FAPESP e membro de um projeto CNPq-NSF.. |
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