Instituto Nacional de Ciencia e Tecnologia do Bioetanol - INCT Bioetanol


CNPq - Programa BioEn - FAPESP
Apoios de Vision Group - IME-USP - Vision e Laboratorio Nacional de Ciencia e Tecnologia do Bioetanol - CTBE

Total de projetos de pesquisa



Número total de itens: 310

2013

1.   2013-Atual. Análise funcional de genes de sinalização e defesa do cacaueiro na interação Moniliophthora perniciosa x Solanum lycopersicum
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Juliana Leles Costa - Integrante.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
2.   2013-Atual. Aplicação de estresses abióticos em genótipos contrastantes e cana-de-açúcar. com vistas à seleção de indicadores morfofisiológicos, bioquímicos e moleculares para a avaliação de graus de tolerância
Descrição: O projeto faz parte de uma linha de pesquisa com fisiologia de estresses abióticos em plantas cultivadas, e está vinculado ao Grupo de pesquisa Ecofisiologia de Vegetais Superiores sob Estresses Ambientais sob nossa liderança, cadastrado na Instituição e no CNPq. Nos últimos anos o grupo do Laboratório de Fisiologia vegetal da UFRPE, vem desenvolvendo pesquisas em parceria com algumas IFES integrantes da RIDESA, juntamente com UNICAMP e USP, em projetos já aprovados pela FINEP e CNPq, além partícipe do INCT Bioetanol.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Coordenador / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Tercílio Calsa Jr - Integrante / Natália Vaz da Silva - Integrante / Elaine Cristina Alves da Silva - Integrante / Flamarion dos Santos Araújo - Integrante / Cibele Alves dos Santos - Integrante.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
3.   2013-Atual. CARACTERIZAÇÃO DO PERFIL METABÓLICO E TRANSCRICIONAL DO PATOSSISTEMA MONILIOPHTHORA PERNICIOSA X SOLANUM LYCOPERSICUM
Descrição: A vassoura-de-bruxa consiste em uma das mais importantes doenças que acometem o cacaueiro (Theobroma cacao), sendo causada pelo basidiomiceto Moniliophthora perniciosa e caracterizada pelos sintomas de inchamento e indução de brotações laterais nos ramos infectados. A espécie Solanum lycopersicum (Syn. Lycopersicon esculentum), também hospedeiro do fungo M. perniciosa, apresenta uma cultivar miniatura 'Micro-Tom' (MT), a qual demonstrou ser um modelo genético adequado para o estudo da interação com esse patógeno, com sintomas característicos de hipertrofia, hiperplasia e formação de vassouras. Sabe-se que o desenvolvimento dos sintomas da vassoura-de-bruxa e a resposta de defesa das plantas estão relacionados à sinalização por fitohormônios, sendo de suma importância um entendimento aprofundado sobre essa complexa rede hormonal no modelo já estabelecido para M. perniciosa. Desse modo, no presente projeto, plantas de MT, mutantes e transgênicos com alterações na via biossintética/percepção dos hormônios ácido salicílico (AS), ácido jasmônico (JA) e etileno (ET) serão desafiadas com M. perniciosa para determinação da incidência da doença e analisadas por RT-qPCR para genes marcadores de resposta associada a esses hormônios. O transcriptoma de plantas inoculadas com o fungo do biótipo-S e -C também será revelado pelo seqüenciamento por RNA-Seq, buscando a avaliação de genes relacionados principalmente aos fitohormônios. Além disso, serão feitas avaliações de metabolômica por meio de ressonância magnética nuclear (NMR), e cromatografia gasosa (GC) e líquida (LC) acopladas à espectrômetro de massa (MS) em plantas de MT, mutantes hormonais e transgênicos, inoculados com biótipos-S e C, com intuito de observar o perfil metabólico em diferentes tipos de interação (compatível e incompatível) com o fungo M. perniciosa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Gildemberg Amorim Leal Junior - Integrante / Lázaro Eustáquio Pereira Peres - Integrante / Juliana Deganello - Integrante.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
4.   2013-Atual. CARACTERIZAÇÃO FISIOLÓGICA E DO PERFIL DE EXPRESSÃO GÊNICA DO TRANSPORTE DE NITRATO DURANTE A AQUISIÇÃO E REMOBILIZAÇÃO EM CANA-DE-AÇÚCAR (SACCHARUM SPP.)
Descrição: O crescente aumento da produtividade da agricultura moderna, somado a alta demanda de fontes renováveis de energia, tem levado ao uso indiscriminado de fertilizantes nitrogenados, gerando impactos negativos ao ambiente. Assim, fica evidente a necessidade de melhorar a eficiência na aplicação e o uso de fertilizantes nitrogenados pelas culturas. No Brasil, a cana-de-açúcar apresenta grande destaque, tanto pelo seu impacto econômico quanto pela sua área plantada. Comparada a outras culturas, a eficiência do uso de nitrato pela cana-de-açúcar como fonte inorgânica de N é baixa, sendo que as causas fisiológicas e genéticas dessa reduzida resposta ainda não são totalmente conhecidas. O presente projeto objetiva caracterizar o processo de absorção de nitrato em raízes de cana-de-açúcar, bem como sua regulação em relação ao status de N da planta e às fontes inorgânicas de N (amônio e nitrato) e caracterizar o transporte e remobilização de nitrato e N derivado de nitrato na parte aérea através de estudos de cinética de absorção e redistribuição de 15N. A caracterização do perfil transcricional dos genes da família NRT/PRT (NITRATE TRANSPORTERS/ PEPTIDE TRANSPORTERS) que codificam os transportadores de membrana de nitrato em plantas será relacionada com os dados obtidos quanto à absorção e transporte de nitrato pelas plantas de cana-de-açúcar.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Joni Esrom Lima - Integrante / Luis Henrique Damasceno Cerezino - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
5.   2013-Atual. Central de Bioenergia
Descrição: Implantação de uma central de equipamentos de grande porte em caráter multiusuário voltada para o estudo da fotossíntese e transformação catalítica da biomassa em combustíveis renováveis, bem como para a caracterização do desempenho de combustíveis não-fósseis em máquinas e células de combustível.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Coordenador / Osvaldo Ferrarese Filho - Integrante / Flavio Vicente Seixas - Integrante / Juliana Parisotto Polentine - Integrante / Camila da Silva - Integrante / Claudia Dias Arieira - Integrante / Marcos Rafael Nanni - Integrante / Maulo Luciano Baesso - Integrante / Tiago Roque Benetoli da Silva - Integrante / Lúcio Cardoso Filho - Integrante / Antonio Frerriani Branco - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Secretaria de Estado da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior do Paraná - Auxílio financeiro.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
6.   2013-Atual. Descritores fisiológicos em espécies florestais da Caatinga visando à produção de mudas para reflorestamento em áreas degradadas
Descrição: A Caatinga possui uma grande diversidade de espécies vegetais que apresentam mecanismos de adaptação as condições adversas é de extrema relevância o conhecimento da morfofisiologia de espécies da caatinga frente aos estresses abióticos, em especial o déficit hídrico. O presente projeto irá avaliar as necessidades fisiológicas das mesmas, assim como tolerância à seca, sendo de extrema importância na seleção dessas espécies para áreas degradadas e/ou reflorestamento.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Coordenador / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Elaine Cristina Alves da Silva - Integrante / Flamarion dos Santos Araújo - Integrante / Natalia Vaz da Silva - Integrante / Cibele Alves dos Santos - Integrante.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
7.   2013-Atual. Diferenças fisiológicas, anatômicas e moleculares envolvidas na tolerância de diferentes acessos de Jatropha curcas L. (Euphorbiaceae) à salinidade
Descrição: A presente proposta envolve atividades de pesquisa científica e tecnológica cooperativa entre instituições e pesquisadores Brasileiros, Indianos, Colombianos e Alemães. As atividades descritas nesta proposta têm como objetivo central a caracterização, por múltiplas vias, das características fisiológicas, moleculares e morfológicas/anatômicas envolvidas na tolerância ao estresse salino de diferentes acessos de Jatropha curcas L.. Com isso, nossa abordagem pretende combinar resultados obtidos pela ecofisiologia vegetal, aliadas a análise das rotas metabólicas com anotações genômicas para correlacionar dados de sequência com funções moleculares específicas. Essas ferramentas em conjunto deverão permitir grandes avanços na biologia vegetal e na biologia molecular de plantas, em especial no campo da identificação de rotas metabólicas ou proteínas candidatas responsivas ao estresse salino em Jatropha curcas L.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissionalizante: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Marcelo Francisco Pompelli - Integrante / Egidio Bezerra Neto - Integrante / Ana Paula Stechhahn Lacchia - Integrante / Ederson Akio Kido - Integrante / Agnaldo Rodrigues de Melo Chaves - Integrante / Indra Dutt Bhatt - Integrante / Guenter Kahl - Integrante / Alfredo Jarma Orozco - Integrante / José Bejamin Machado Coelho - Integrante / Nivea Dias dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
8.   2013-Atual. Dinâmica de Recomposição de um Fragmento de Mata Atlântica na ESEC Caetés: Estudos Ecofisiológicos e Anatômicos, edital CPRH nº 01/2013
Descrição: Acompanhar o desenvolvimento e a aclimatação de plantas jovens de espécies nativas recentemente implantadas numa área de 1,2 ha dentro da Estação Ecológica de Caetés, Paulista-PE.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Marcelo Francisco Pompelli - Coordenador / Egidio Bezerra Neto - Integrante / Ana Paula Stechhahn Lacchia - Integrante / José Bejamin Machado Coelho - Integrante / Werner Camargo Antunes - Integrante / Keila Rego Mendes - Integrante. Financiador(es): Agência Estadual de Meio Ambiente e Recursos Hídricos - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
9.   2013-Atual. Implantação da plataforma multiusuária para ensaios de triagem biológica em larga escala [high-throughput screening]
Descrição: A proposta visa ampliar a capacidade analítica da plataforma de Sequenciamento e Expressão Gênica com equipamentos que permitam triagem biológica em larga escala, para ensaios com microrganismos, culturas de células animais e vegetais para características fisiológicas que atendam a diferentes interesses, tais como seleção de organismos produtores de antibióticos e quimioterápicos, seleção de moléculas com atividade antimicrobiana, seleção de organismos produtores de enzimas industriais, biorremediação, identificação de vias metabólicas de resposta a mudanças nas condições ambientais e industriais, ensaios toxicológicos, ensaios de bioindicadores e biomarcadores.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Valdir Queiroz Balbino - Integrante / Marcos Antonio de Morais Junior - Coordenador / Antonio Carlos Freitas - Integrante. Financiador(es): (FACEPE) Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
10.   2013-Atual. Manejo de cultivo e interferência da fisiologia e produção de princípios ativos em nim indiano
Descrição: Avaliar a influência dos estresses hídrico e salino na concentração de azadiractina em folhas de nim, bem como estudar os mecanismos de resposta fisiológicos e bioquímicos da espécie sob essas condições em plantas jovens.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Coordenador / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Natália Vaz da Silva - Integrante / Elaine Cristina Alves da Silva - Integrante / Flamarion dos Santos Araújo - Integrante / Cibele Alves dos Santos - Integrante / Wolfgang Harand - Integrante.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
11.   2013-Atual. MICROALGAS PARA COMBUSTÍVEIS
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
12.   2013-Atual. NANOCATÁLISE NA PRODUÇÃO DE BIOCOMBUSTÍVEIS DE SEGUNDA GERAÇÃO A PARTIR DE BIOMASSA
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
13.   2013-Atual. NEW APPROACHES IMPROVED FUNCTIONALITY OF SACCHAROLYTIC ENZYMES FROM FUNGI. (FAPESP-RCUK)
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
14.   2013-Atual. Projeto Temático FAPESP 2012/23942-9:A função de genes que codificam fosfatases na virulência e na patogenicidade de Aspergillus fumigatus
Descrição: A. fumigatus é um fungo patógeno primário e oportunista, alergênico, que também causa asma severa e sinusites em pacientes imunocompetentes. Devido ao fato de que A. fumigatus produz quantidades prodigiosas de conídios, o trato respiratório humano está continuamente exposto ao fungo. Os conídios alcançam as vias aéreas por inalação e chegam ao pulmão devido ao seu pequeno tamanho; nos alvéolos tornam -se ativos e germinam. O sensoriamento e a obtenção de nutrientes essenciais do ambiente são características fenotípicas que estão associados ao crescimento do saprófita A. fumigatus em ambientes inóspitos. Apesar da importância médica e ecológica, a biologia básica deste organismo é mal compreendida. Dentre os aspectos da fisiologia celular de A. fumigatus, o funcionamento do ajuste fino do balanço entre fosforilação e defosforilação de alvos proteicos ainda é pouco conhecido. Uma vez que as modificações pós-traducionais envolvendo transferência e remoção de grupamentos fosforil de proteínas é um dos mais importantes eventos que têm consequência na sinalização celular em células eucarióticas, os principais objetivos deste projeto são: (i) a caracterização molecular de genes modulados ao nível transcripcional por CrzA, um fator de transcrição chave na via de sinalização de cálcio/calcineurina o qual está posicionado downstream à fosfatase calcineurina. Os genes em questão foram previamente identificados por Chromatin Immunoprecipitation seguida por sequenciamento de DNA (Chip-Seq); (ii ) a caracterização molecular de todos os genes que codificam proteínas fosfatases em A. fumigatus e o seu envolvimento em virulência e patogenicidade; (iii) a verificação da participação das diferentes fosfatases de A. fumigatus nas via de sinalização de integridade da parede celular (CWIP cell wall integrity pathway e osmoresistência (HOG High Osmolarity Glycerol ); e (iv) a identificação global de alvos regulados ao nível transcripcional e proteico por fosfatases de A. fumigatus. Para o cumprimento desses objetivos propostos esses genes serão deletados e os fenótipos das linhagens mutantes bem como a sua virulência e patogenicidade investigadas, tanto no modelo alternativo Galleria mellonella, assim como no modelo de imunossupressão em camundongos. As abordagens propostas neste trabalho poderão ser capazes de descrever novos genes reguladores (e não somente os efetores) nesses processos. Além disso, os resultados obtidos a partir do estudo desses genes irão proporcionar novos conceitos a respeito da biologia e dos mecanismos de sinalização e adaptação ao ambiente do hospedeiro em A. fumigatus.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
15.   2013-Atual. QUÍMICA EM INTERFACES - INTERAÇÕES DE FÁRMACOS, PEPTÍDIOS E ENZIMAS COM MEMBRANAS MODELOS
Descrição: Usando micelas e vesículas como modelos estudaremos as propriedades interfaciais implantando novas técnicas em colaboração com pesquisadores do Brasil e do exterior. Podem-se desenhar surfactantes que se associem, formem vesículas, catalisem e sejam capazes de se auto-reproduzir e catalizar? Qual é o papel da bicamada lipídica na assimetria e nas propriedades seletivas de adsorção de íons ou sobre as propriedades eletrostáticas totais das membranas? Como pode esta seletividade de ligação de íons influenciar as interações membrana / peptídeo? Como se distribuem os íons no interior de vesículas? Qual o mecanismo de associação do íon triflato em micelas zwitteriônicas e positivas com tamanhos variáveis de cadeia? Como utilizar a reação de dediazonização de derivados diazobenzênicos substituídos para investigar escalas de nucleofilicidade relevantes para sistemas biológicos e determinar idealidade em misturas de solventes? Quais as propriedades de agregação, catálise e interação com vesículas de polímeros catiônicos sintéticos?. Como se comporta a paroxonase humana e a asparaginase quando interage com membranas? Qual o mecanismo de interação de BP100, um undecapeptídeo semissintético, com membranas? Podem-se incorporar eficientemente novos compostos imidazólicos e antiinflamatórios em lipossomos? As respostas a estas perguntas, que fazem parte de uma linha de pensamento do nosso grupo, devem trazer contribuições fundamentais e aplicadas na área de sistemas biomiméticos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Coordenador / Iolanda Midea Cuccovia - Integrante / Hernan Chamovich - Integrante / Fábio Herbst Florenzano - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
16.   2013-Atual. Seleção de genótipos de cana-de-açúcar para a produção de biomassa em ambiente sequeiro, Edital CNPq nº 70/2013, Programa Ciências sem Fronteiras, Atração de jovens talentos, BJT
Descrição: No projeto são propostos três experimentos para a identificação de genótipos mais tolerantes e com melhor eficiência de uso da água a partir de semente de cana-de-açúcar oriundas de cruzamentos específicos para a produção de biomassa. Em um primeiro experimento serão feitas seleções de plântulas com crescimento melhor sob déficit hídrico in vitro. Em um segundo experimento, os melhores genótipos serão crescidos em casa-de-vegetação para a avaliação de aspectos morfo-fisiológicos de plantas sob déficit hídrico. Finalmente, em um terceiro momento, os genótipos que se destacarem nas fases anteriores serão avaliados quando a tolerância a seca e produtividade em um experimento de campo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador / Vilma Marques Ferreira - Integrante / Geraldo Verissimo de Souza Barbosa - Integrante / Antonio Pompeiano - Integrante / Lucia Guidi - Integrante. Financiador(es): ASCON-ASSOCIACAO DOS SERVIDORES DO CNPq - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
17.   2013-Atual. Subsídios para avaliação de biossegurança de cultivares geneticamente modificadas de cana de açúcar: fluxo gênico para espécies selvagens e composição nutricional de híbridos comerciais
Descrição: Este projeto visa à obtenção de informações para subsidiar a avaliação de risco, com enfoque em áreas onde não há suficiente informação disponível na literatura científica atual, a saber: a) avaliação do potencial de ocorrência do fluxo gênico entre os híbridos comerciais e espécies nativas do gênero Saccharum, e b) avaliação da composição nutricional e de sua amplitude de variação nos híbridos comerciais nas principais regiões produtoras brasileiras. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Borges. Maria Tereza M. R. - Integrante / Giancarlo Conde Xavier de Oliveira - Coordenador.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.

2012

1.   2012-Atual. Análise de promotores para expressão de proteínas recombinantes em T. reesei
Descrição: O fungo filamentoso Trichoderma reesei apresenta uma eficiente maquinaria de secreção que poderia ser utilizada para produção em larga escala de proteínas homólogas ou heterólogas com aplicação industrial. Nossa proposta visa identificar ou modificar um conjunto de promotores, que permitam a expressão e produção de proteínas em larga escala, utilizando como agente indutor metais e como hospedeiro o fungo filamentoso T. reesei. O desenho e/ou identificação de promotores com potencial utilização em T. reesei nós permitirá produzir as enzimas necessárias para hidrólise da biomassa com consequente diminuição de seu custo, favorecendo a disseminação da utilização de biomassa como fonte para biocombustíveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Coordenador / Flavia Garcia Borges - Integrante / Patricia Pereira Adriani - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
2.   2012-Atual. APLICAÇÃO DE ESTRESSES ABIÓTICOS ISOLADOS E COMBINADOS EM GENÓTIPOS CONTRASTANTES DE CANA-DE-AÇÚCAR
Descrição: Com a necessidade de estudos sobre novas fontes energéticas, a cana-de-açúcar aparece em destaque como uma alternativa altamente eficiente na produção de combustíveis renováveis. Mudanças no metabolismo de carbono podem influenciar diretamente na estrutura da parede celular e na produtividade da planta. O estudo deste metabolismo, acoplado a variações ambientais, como por exemplo o déficit hídrico, pode auxiliar na resposta de questões importantes relacionadas a mudanças no clima. Outro ponto fundamental é o entendimento das variações de composição da parede e açúcares não estruturais em diferentes variedades de cana, uma vez que a escolha da variedade pode ser determinante para a melhor produção de etanol celulósico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (7) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Coordenador / Marcelle Almeida da Silva - Integrante / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Natália Vaz da Silva - Integrante / Cibele Alves dos Santos - Integrante / Rafaela Pereira de Souza - Integrante / Ana Karine Valadares Nascimento - Integrante / Elaine Cristina Alves da Silva - Integrante / Flamarion dos Santos Araújo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
3.   2012-Atual. APLICAÇÃO DE ESTRESSES ABIÓTICOS ISOLADOS E COMBINADOS EM GENÓTIPOS CONTRASTANTES DE CANA-DE-AÇÚCAR, COM VISTA À SELEÇÃO DE INDICADORES MORFOFISIOLÓGICOS, BIOQUÍMICOS E MOLECULARES PARA AVALIAÇÃO DE GRAUS DE TOLERÂNCIA
Descrição: O projeto faz parte de uma linha de pesquisa com fisiologia de estresses abióticos em plantas cultivadas, e está vinculado ao Grupo de pesquisa Ecofisiologia de Vegetais Superiores sob Estresses Ambientais sob nossa liderança, cadastrado na Instituição e no CNPq. Nos últimos anos o grupo do Laboratório de Fisiologia vegetal da UFRPE, vem desenvolvendo pesquisas em parceria com algumas IFES integrantes da RIDESA, juntamente com UNICAMP e USP, em projetos já aprovados pela FINEP e CNPq, além partícipe do INCT Bioetanol.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (7) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Coordenador / Manoel Bandeira Albuquerque - Integrante / Cynthia Maria Carneiro Costa - Integrante / Marcelle Almeida da Silva - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Hugo Henrique Costa do Nascimento - Integrante / Natália Vaz da Silva - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Integrante / Cibele Alves dos Santos - Integrante / Rafaela Pereira de Souza - Integrante / Elaine Cristina Alves da Silva - Integrante / Amanda Pareira Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
4.   2012-Atual. As leveduras selvagens no ambiente industrial fermentativo: efeito do sistema de fermentação, tratamento do fermento, tipo de substrato e bactérias sobre a fermentação alcoólica contaminada por linhagens selvagens de S. cerevisiae e D. bruxellensis
Descrição: Processo 2011/17928-0 - Uma das principais preocupações na indústria sucro-alcooleira é combater os microrganismos contaminantes do processo de produção de álcool, representados pelas bactérias e leveduras que se instalam no processo. Essas leveduras que invadem o processo recebem o nome de leveduras selvagens e os principais gêneros encontrados na cana-de-açúcar saudável são Saccharomyces, Torula e Pichia. Leveduras Saccharomyces cerevisiae que apresentam pseudohifas (brotos que não se separam da célula-mãe) são muito frequentes nas dornas de fermentação e podem causar problemas no processo, inclusive com perda do rendimento fermentativo. Além disto, mais recentemente, a presença dos gêneros Dekkera e Brettanomyces têm sido relacionada também à problemas nos processos fermentativos para produção de etanol. Neste contexto, o presente projeto tem por objetivo principal verificar a performance das leveduras selvagens, representadas pelas linhagens de S. cerevisiae com colônias rugosas e de D. bruxellensis, nas condições do ambiente industrial, ou seja, verificando a influência do tipo de sistema de fermentação, tipo de substrato, tipo de tratamento do fermento e da contaminação por bactérias, sobre a fermentação etanólica conduzida pela levedura industrial PE-02 em situações de contaminação com as leveduras selvagens. Aspectos relativos à competitividade dessas leveduras quanto à disponibilidade de açúcar, tipo de fonte de nitrogênio e de inibidores do substrato serão também avaliados. Os experimentos serão realizados tanto em etapa de frascos quanto em fermentador. Espera-se com este trabalho ter resultados que possam auxiliar no manejo da fermentação alcoólica quando contaminada com essas leveduras selvagens.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
5.   2012-Atual. Bioetanol de cana-de-açúcar: abordagens biotecnológicas para incremento de produtividade via etanol de primeira e segunda geração
Descrição: Este é um projeto temático constituído de subprojetos que, no conjunto, visam aprofundar estudos sobre a produção de bioetanol de cana-de-açúcar. Sua execução contará com a participação do Laboratório de Bioquímica de Plantas (UEM), Embrapa Agroenergia (DF), Instituto de Botânica de São Paulo (SP), Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR, Londrina), Universidade Federal do Paraná (UFPR), Universidade Federal do ABC (Santo André, SP), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bietanol CTBE (Campinas). O projeto contará com 8 bolsas (2 de Mestrado, 4 de Doutorado, 2 de Pós-doutorado), disponilizadas pelo Programa CAPES - Embrapa, e os recursos de custeio serão fornecidos pela Embrapa Agroenergia (DF).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (4) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador / Hugo Bruno Correa Molinari - Integrante.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
Descrição: Este é um projeto temático constituído de subprojetos que, no conjunto, visam aprofundar estudos sobre a produção de bioetanol de cana-de-açúcar. Sua execução contará com a participação do Laboratório de Bioquímica de Plantas (UEM), Embrapa Agroenergia (DF), Instituto de Botânica de São Paulo (SP), Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR, Londrina), Universidade Federal do Paraná (UFPR), Universidade Federal do ABC (Santo André, SP), Universidade Federal de Lavras (UFLA); Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bietanol CTBE (Campinas). O projeto contará com 8 bolsas (2 de Mestrado, 4 de Doutorado, 2 de Pós-doutorado), disponilizadas pelo Programa CAPES - Embrapa, e os recursos de custeio serão fornecidos pela Embrapa Agroenergia (DF). O projeto terá a duração de 5 anos (2012 a 2016).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (4) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Integrante / João Carlos Bespalhok Filho - Integrante / Douglas Silva Domingues - Integrante / Danilo C. Centeno - Integrante / Luciano Vilela de Paiva - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Embrapa Agroenergia - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 1
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
6.   2012-Atual. Cafeato O-metiltransferase: Estrutura da Enzima, Prospecção de Inibidores e Redução da Recalcitrância da Biomassa Lignocelulósica
Descrição: O principal problema a ser solucionado para que a produção de etanol celulósico se torne economicamente viável é a redução da recalcitrância da biomassa lignocelulósica. Neste contexto, investigar o papel dos fenilpropanoides na arquitetura e recalcitrância da parede celular à digestão enzimática e descobrir meios para aumentar a digestibilidade da biomassa lignocelulósica sem reduzir a produtividade é de grande importância científica e tecnológica. Assim, prospectar a existência de inibidores enzimáticos da via de fenilpropanoides poderá fornecer pistas importantes para o aumento da digestibilidade da biomassa. Além disso, a utilização de inibidores químicos para modificar características de interesse em plantas é uma estratégia inovadora, e alternativa, com amplo potencial de aplicações na produção de biocombustíveis. Neste projeto, pretende-se determinar a estrutura da enzima cafeato O-metiltransferase COMT e identificar inibidores eficientes em promover aumentos na digestibilidade dos polissacarídeos da parede celular em variedades de cana-de-açúcar e milho, sem afetar a produção de biomassa. Para o alcance dos Objetivos, pretende-se a aplicação das seguintes Metas: a) Determinar a estrutura tridimensional da cafeato O-metiltransferase (COMT) por meio de modelagem a partir das estruturas 3D homólogas, depositadas no Protein Data Bank (PDB). b) Identificar inibidores enzimáticos in silico por varredura e ?docagem? a partir do modelo tridimensional gerado da enzima selecionada. c) Determinar a atividade da COMT de cana-de-açúcar e milho. d) Avaliar os efeitos dos inibidores identificados in vitro sobre a atividade da COMT extraída das plantas. e) Avaliar os efeitos in vivo de diferentes concentrações dos inibidores sobre o crescimento, biomassas secas e frescas, morfologia, grau brix e digestibilidade da biomassa lignocelulósica de cana-de-açúcar e milho. f) Purificar e sequenciar a enzima. g) Avaliar o conteúdo de lignina, a partição de monolignóis e o conteúdo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
Descrição: O principal problema a ser solucionado para que a produção de etanol celulósico se torne economicamente viável é a redução da recalcitrância da biomassa lignocelulósica. Neste contexto, investigar o papel dos fenilpropanoides na arquitetura e recalcitrância da parede celular à digestão enzimática e descobrir meios para aumentar a digestibilidade da biomassa lignocelulósica sem reduzir a produtividade é de grande importância científica e tecnológica. Assim, prospectar a existência de inibidores enzimáticos da via de fenilpropanoides poderá fornecer pistas importantes para o aumento da digestibilidade da biomassa. Além disso, a utilização de inibidores químicos para modificar características de interesse em plantas é uma estratégia inovadora, e alternativa, com amplo potencial de aplicações na produção de biocombustíveis. Neste projeto, pretende-se determinar a estrutura da enzima cafeato O-metiltransferase COMT e identificar inibidores eficientes em promover aumentos na digestibilidade dos polissacarídeos da parede celular em variedades de cana-de-açúcar e milho, sem afetar a produção de biomassa. Para o alcance dos Objetivos, pretende-se a aplicação das seguintes Metas: a) Determinar a estrutura tridimensional da cafeato O-metiltransferase (COMT) por meio de modelagem a partir das estruturas 3D homólogas, depositadas no Protein Data Bank (PDB). b) Identificar inibidores enzimáticos in silico por varredura e ?docagem? a partir do modelo tridimensional gerado da enzima selecionada. c) Determinar a atividade da COMT de cana-de-açúcar e milho. d) Avaliar os efeitos dos inibidores identificados in vitro sobre a atividade da COMT extraída das plantas. e) Avaliar os efeitos in vivo de diferentes concentrações dos inibidores sobre o crescimento, biomassas secas e frescas, morfologia, grau brix e digestibilidade da biomassa lignocelulósica de cana-de-açúcar e milho. f) Purificar e sequenciar a enzima. g) Avaliar o conteúdo de lignina, a partição de monolignóis e o conteúdo. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante / Ana Paula Ferro - Integrante / Rogério Barbosa de Lima - Integrante / dos Santos, Wanderley Dantas - Integrante / Aline Finger-Teixeira - Integrante / Flávio Augusto Vicente Seixas - Integrante / Angela Valderrama Parizotto - Integrante / Tamires Letícia Cunha Lopes - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
7.   2012-Atual. Caracterização fisiológica e do perfil de expressão gênica do transporte de nitrogênio em cultivares contrastantes de cana-de-açúcar (Saccharum spp) para o processo de Fixação Biológica de N2
Descrição: O aumento da demanda para produção de energia renovável tem levado a intensificação no cultivo de plantas utilizadas como matéria prima para produção de biocombustíveis. A produção de cana-de-açúcar, utilizada tanto para a produção de açúcar como de etanol, apresenta grande importância econômica para o Brasil, e o aumento da demanda por biocombustíveis causou a expansão dessa cultura para solos marginais. Como consequência, o uso de fertilizantes a base de nitrogênio (N) é necessária para manter a alta produtividade, em detrimento do impacto prejudicial da aplicação de fertilizantes na biosfera e seu alto custo energético. Apesar da necessidade da aplicação de fertilizantes nitrogenados, o sucesso do cultivo da cana-de-açúcar no Brasil se baseia, em parte, no processo de fixação biológica de nitrogênio (FBN). Dentre os efeitos benéficos da FBN, o aumento do N total e de biomassa, tem incentivado o uso dos endofíticos no cultivo em detrimento da aplicação de fertilizantes nitrogenados. Além da FBN, as plantas utilizam proteínas transportadoras (famílias AMTs -AMMONIUM TRANSPORTERS- e NRTs -NITRATE TRANSPORTERS-) para adquirir fontes inorgânicas de N no solo, como amônio e nitrato. Até o momento, como a absorção de N é afetada durante a associação planta-endofíticos e as bases moleculares dessa interação ainda permanecem desconhecidas. O objetivo desse projeto é caracterizar fisiologicamente e em nível molecular, o processo de absorção de N em genótipos de cana-de-açúcar contrastantes para a FBN, por meio de estudos de cinética de absorção de N pela raiz e análise quantitativa de transcritos de transportadores de N sob o efeito da FBN.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Joni Esrom Lima - Coordenador / Andre Tagliaferro - Integrante / Luis Henrique Damasceno - Integrante / Layane Batista Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
8.   2012-Atual. DINAMICA DE CRESCIMENTO E SUCESSAO DE COMUNIDADES BACTERIANAS E FUNGICAS DURANTE A COMPOSTAGEM DA TORTA DE FILTRO DE CANA DE ACUCAR
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
9.   2012-Atual. ESTUDO DA VARIAÇÃO GENÉTICA NATURAL EM TOMATEIRO (SOLANUM LYCOPERSICUM) PARA O PROCESSO DE ABSORÇÃO DE NITROGÊNIO
Descrição: O uso excessivo de fertilizantes nitrogenados com o intuito de aumentar a produtividade de culturas de tomateiro (Solanum lycopersicum) é decorrente da expansão da demanda mundial pelo tomate. No entanto, o acúmulo/excesso de formas orgânicas ou inorgânicas de nitrogênio (N) no solo está associado a diversos problemas ambientais. Uma alternativa para contornar esses problemas é a identificação de variabilidade genética para absorção de N, garantindo uma alta produtividade e uma possível melhora na eficiência do uso de N (NUE). Para tanto, os genótipos S. lycopersicum cv 'Santa Clara', S. pimpinellifolium e S. habrochaites, previamente identificadas com maior capacidade de absorção de N, serão utilizados em ensaios de cinética de absorção utilizando traçadores com 15N. Além disso, a quantificação da expressão gênica relativa via amplificação de transcritos reversos (RT-qPCR) de genes relacionados ao transporte de amônio (AMTs) e nitrato (NRTs) irão confirmar se a alta capacidade de absorção de N está relacionada ao transporte de N. A partir da caracterização fisiológica e genética dos genótipos mencionados acima, pretende-se isolar os fatores responsáveis pelas diferenças genéticas, criando linhagens quase-isogênicas (NILs) por introgressão através de cruzamentos sucessivos da maior capacidade de absorção de N na cultivar miniatura de tomateiro 'Micro-Tom'. A disponibilidade de tais NILs, aliada a existência de ampla coleção de mutantes na cv 'Micro-Tom' (www.esalq.usp.br/tomato), contribuirá para futuro estudo funcional da maior capacidade de absorção de N, utilizando-se o mapeamento gênico para busca de gene candidatos no genoma de tomateiro.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Joni Esrom Lima - Integrante / Lázaro Eustáquio Pereira Peres - Integrante / Andre Luis Tagliaferro - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
10.   2012-Atual. ESTUDOS DE PARÂMETROS QUE INFLUENCIAM AS PROPRIEDADES FINAIS DOS CATALISADORES PRODUZIDOS EM ESCALA PILOTO UTILIZANDO A UNIDADE PROTÓTIPO DE CATALISADORES PROCAT DO POLO TECNOLÓGICO DE SANTA CRUZ
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Petróleo Brasileiro S.A. - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
11.   2012-Atual. INCT-Ambientes Marinhos Tropicais - Genômica e Proteômica
Descrição: Prospecção de biomoléculas marinhas úteis à inovação, e ampliação do conhecimento científico da biodiversidade marinha com potencial biotecnológico através de: i) apoio a redes de pesquisas em genômica e proteômica de organismos marinhos com importância biotecnológica; e ii) estruturação de bases de dados genômicos e proteômicos das espécies marinhas; iii) Complementação às demais subpropostas componentes em Expressão gênica e Metagenômica, com foco em análise proteômica e/ou peptidômica de amostras oriundas de espécies e processos biológico-ambientais de interesse, da plataforma continental brasileira e províncias oceânicas visando identificar proteínas/peptídeos bioativos com potencial aplicação biotecnológica nas áreas industrial, farmacológica, agrícola, bioenergética e ambiental.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Rodrigo A. Torres - Integrante / José Maria Landim Dominguez - Coordenador / KRYSTYNA LYRA - Integrante / IRACILDA SAMPAIO - Integrante / WAGNER FRANCO MOLINA - Integrante.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
12.   2012-Atual. Papel dos genes BAHD na determinação da feruloilação e digestibilidade da parede celular em biomassa de gramíneas
Descrição: Nas paredes celulares de gramíneas, os resíduos de ácido ferúlico estão ligados aos arabinoxilanos por ligações do tipo éster e têm a capacidade de formar dímeros que promovem a ligação cruzada (cross-linking) da parede celular. Além disso, é proposto que estes resíduos atuem como sítios de nucleação para a formação de lignina e para a ligação da lignina às redes de xilana/celulose presentes na parede. Estas reações de cross-linking, que ocorrem predominantemente em gramíneas, dificultam a utilização eficiente das paredes celulares como fonte de biomassa para produção de energia. Os genes responsáveis pela feruloilação de xilanas em gramíneas foram identificados in silico por Mitchell et al., 2007. Em trabalho anterior, analisamos a expressão gênica de todos os membros de genes da família PF02458 BAHD (Beat, AHCT, HCBT, DAT) em diferentes tecidos e fases de desenvolvimento de Brachypodium distachyon e quantificamos os ácidos ferúlico e cumárico ligados à parede celular. Neste projeto, pretende-se gerar linhagens homozigotas da planta modelo, Brachypodium distachyon, com níveis reduzidos de feruloilação da parede celular. Estas linhagens serão analisadas quanto à redução da feruloilação de glucuronoarabinoxilano (GAX) e digestibilidade da parede celular. Também, será avaliado o promotor BdIRX3 quanto a sua especificidade a parede celular secundária em diferentes tecidos e fases de desenvolvimento em Brachypodium distachyon. Adicionalmente, o conhecimento gerado nesta planta modelo será aplicado em cana-de-açúcar. A geração de Plantas Geneticamente Modificadas (PGMs) com níveis reduzidos dos transcritos de xilano-feruloil transferases, deverão produzir menor quantidade de ferulatos ligados à parede celular e, assim, gerar uma redução do cross-linking entre os polímeros da mesma. A validação destes genes em Brachypodium poderá facilitar a identificação desta família de genes em outras espécies de importância econômica, como a cana-de-açúcar.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Coordenador. Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
13.   2012-Atual. PRODUÇÃO HETERÓLOGA, CARACTERIZAÇÃO E ENGENHARIA DE XILOSE ISOMERASES PARA APLICAÇÃO NA FERMENTAÇÃO INDUSTRIAL DE PENTOSES
Descrição: Projeto PITE FAPESP-ETH Bioenergia Processo: 2012/50056-0 Auxilio de pesquisa Programa Parceria para Inovação Tecnológica . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
14.   2012-Atual. Projeto PITE FAPESP-ETH Bioenergia Processo: 2012/50056-0 Auxilio de pesquisa Programa Parceria para Innovação Tecnológica
Descrição: Chamada Pública MCT/CNPq - N º 14/2012 - Universal Processo: 473263/2012-2. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
15.   2012-Atual. Prospecção de genes de tolerância à seca em Tripogon spicatus (Nees) Ekman - Sub-projeto Proteômica
Descrição: Estudo do proteoma de Tripogon spicatus, espécie nativas representativa do bioma Caatinga, em condições contrastantes sazonais de maior ou menor incidência de seca, visando a identificação de proteínas vegetais envolvidas nos mecanismos de adaptação fisiológica ao ecossistema semi-árido nordestino, que possibilitem ampliar a compreensão sobre a regulação da expressão gênica destas plantas associada à sua grande adaptação e à fitodiversidade regional.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Carolina Vianna Morgante - Integrante / Karem Guimarães Xavier Meireles - Integrante.
Membro: Tercilio Calsa Junior.

2011

1.   2011-Atual. ADITIVOS MULTIFUNCIONAIS APLICADOS AO PROCESSO DE FCC: DESENVOLVIMENTO DE METODOLOGIA DE AVALIAÇÃO DE ADITIVOS PARA CAPTURA DOS CONTAMINANTES VANÁDIO E GASES SOX
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Petróleo Brasileiro S.A. - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
2.   2011-Atual. Análise proteômica da resposta ao estresse por radiação ultravioleta e seca em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
Descrição: Objetivo: identificação de peptídeos produzidos diferencialmente em cana-de-açúcar e potencialmente associados a mecanismos de resposta à radiação ultravioleta (RUV-B) em condição de estresse por déficit hídrico. Dados de proteoma são relevantes para estabelecer as funções gênicas e associar transcritos a aspectos agronômicos de interesse. Selecao de genes uteis para melhoramento da cana via manipulação genética e como marcadores moleculares auxiliares, para obtenção de novas variedades com maior tolerância a RUV-B e a seca, dadas as previsões de mudanças climáticas globais e impactos na produtividade agrícola.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Isadora Louise Alves da Costa Ribeiro - Integrante / Maria Clara Pestana-Calsa - Integrante / Katia Castanho Scortecci - Integrante / Renata Rodrigues de Almeida - Integrante / Regina Elisabety Oliveira Folha - Integrante / Adauto Gomes Barbosa Neto - Integrante / Amanda Emanuella Rocha de Souza - Integrante / Juliana Maria de Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
3.   2011-Atual. Bioprospecção de fungos filamentosos produtores de holoenzimas com aplicação em biorefinaria (sisbiota)
Descrição: Bioprospecção de fungos filamentosos produtores de holoenzimas com aplicação em biorefinaria.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador / Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
4.   2011-Atual. Bioprospecção demicrorganismos em solos de plantação de cana-de-açúcar para degradação de herbicidas-Biota-Microrganismos-Fapesp
Descrição: O presente projeto tem por objetivo estudar o potencial de fungos e bactérias, isolados de solos de cultivo de cana de açúcar, de degradar esses herbicidas quando emculturas puras ou em consórcio com outros isolados. Estão sendo coletadas amostras de solos de cultura de cana-de-açúcar em diferentes etapas do cultivo, das quais serão isoladas fungos e bactérias que são posteriormente, estudadas para a degradação de diuron, clomazona e haxazona, em fermentação submersa e em microcosmos. O processo de biotransformação/degradação do herbicida é acompanhado por quantificação do composto original remanescente após o crescimento microbiano, assim como, a identificação e quantificação dos metabólitos derivados utilizando técnicas de HPLC-MS. Ainda, é avaliada a toxicidade dos metabólitos gerados em peixes, com o intuito de se verificar se são menos ou mais tóxicos do que o herbicida original.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Mauricio Boscolo - Integrante / Robero da Silva - Integrante / Eduardo Alves Almeida - Integrante.
Membro: Eleni Gomes.
5.   2011-Atual. Caracterização fisiológica e do perfil de expressão gênica do transporte de nitrogênio em cultivares contrastantes de cana-de-açúcar (Saccharum spp) para o processo de Fixação Biológica de N2
Descrição: O aumento da demanda para produção de energia renovável tem levado a intensificação no cultivo de plantas utilizadas como matéria prima para produção de biocombustíveis. A produção de cana-de-açúcar, utilizada tanto para a produção de açúcar como de etanol, apresenta grande importância econômica para o Brasil, e o aumento da demanda por biocombustíveis causou a expansão dessa cultura para solos marginais. Como consequência, o uso de fertilizantes a base de nitrogênio (N) é necessária para manter a alta produtividade, em detrimento do impacto prejudicial da aplicação de fertilizantes na biosfera e seu alto custo energético. Apesar da necessidade da aplicação de fertilizantes nitrogenados, o sucesso do cultivo da cana-de-açúcar no Brasil se baseia, em parte, no processo de fixação biológica de nitrogênio (FBN). Dentre os efeitos benéficos da FBN, o aumento do N total e de biomassa, tem incentivado o uso dos endofíticos no cultivo em detrimento da aplicação de fertilizantes nitrogenados. Além da FBN, as plantas utilizam proteínas transportadoras (famílias AMTs -AMMONIUM TRANSPORTERS- e NRTs -NITRATE TRANSPORTERS-) para adquirir fontes inorgânicas de N no solo, como amônio e nitrato. Até o momento, como a absorção de N é afetada durante a associação planta-endofíticos e as bases moleculares dessa interação ainda permanecem desconhecidas. O objetivo desse projeto é caracterizar fisiologicamente e em nível molecular, o processo de absorção de N em genótipos de cana-de-açúcar contrastantes para a FBN, por meio de estudos de cinética de absorção de N pela raiz e análise quantitativa de transcritos de transportadores de N sob o efeito da FBN.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Joni Esrom Lima - Coordenador / Layane Batista Souza - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
6.   2011-Atual. Controle e papel do metabolismo do ácido ferúlico na arquitetura da parede celular
Descrição: Há uma década, nosso grupo de pesquisa Metabolismo Secundário em Plantas tem estudado os efeitos de compostos tóxicos como aleloquímicos e metais pesados sobre o metabolismo de lipídeos e carboidratos, respiração, metabolismo oxidativo, viabilidade celular, índice de germinação, taxa de crescimento e desenvolvimento. Por motivos históricos, temos dado ênfase ao metabolismo dos fenilpropanóides em plantas bem como aos mecanismos de lignificação induzida por fenilpropanóides com ação alelopática sobre plantas suscetíveis de interesse agrícola como soja e canola. Mais recentemente, temos investigado o papel dos fenilpropanóides na recalcitrância do bagaço da cana-de-açúcar à digestão enzimática. O ácido ferúlico desempenha um papel chave na arquitetura da parede celular. Ele é responsável por ancorar a lignina às pectinas de não-comelinóides (parede tipo I) e hemiceluloses de comelinóides (parede tipo II). Além disso, as pontes diferúlicas promovidas pelo ácido ferúlico interconectam polissacarídeos entre si, dando origem a uma rede que limita o crescimento celular e dificulta a hidrólise enzimática conferindo resistência contra patógenos e herbívoros. Neste projeto, planejamos investigar os mecanismos de síntese, transporte e esterificação do ácido ferúlico a polissacarídeos da parede celular. Neste aspecto, o intuito é identificar inibidores enzimáticos capazes de controlar o metabolismo do ácido ferúlico em plantas com interesse industrial, e que possam ser utilizados como agroquímicos inteligentes capazes de estimular o metabolismo endógeno vegetal, em substituição parcial a inseticidas, fungicidas e plantas transgênicas. Aplicações deste conhecimento deveram trazer benefícios para a produção de alimentos e biocombustíveis por meio da indução de resistência a patógenos, acamamento e dano mecânico; melhorar o aproveitamento energético de forragens e matérias-primas de interesse industrial.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
Descrição: Há uma década, nosso grupo de pesquisa Metabolismo Secundário em Plantas tem estudado os efeitos de compostos tóxicos como aleloquímicos e metais pesados sobre o metabolismo de lipídeos e carboidratos, respiração, metabolismo oxidativo, viabilidade celular, índice de germinação, taxa de crescimento e desenvolvimento. Por motivos históricos, temos dado ênfase ao metabolismo dos fenilpropanóides em plantas bem como aos mecanismos de lignificação induzida por fenilpropanóides com ação alelopática sobre plantas suscetíveis de interesse agrícola como soja e canola. Mais recentemente, temos investigado o papel dos fenilpropanóides na recalcitrância do bagaço da cana-de-açúcar à digestão enzimática. O ácido ferúlico desempenha um papel chave na arquitetura da parede celular. Ele é responsável por ancorar a lignina às pectinas de não-comelinóides (parede tipo I) e hemiceluloses de comelinóides (parede tipo II). Além disso, as pontes diferúlicas promovidas pelo ácido ferúlico interconectam polissacarídeos entre si, dando origem a uma rede que limita o crescimento celular e dificulta a hidrólise enzimática conferindo resistência contra patógenos e herbívoros. Neste projeto, planejamos investigar os mecanismos de síntese, transporte e esterificação do ácido ferúlico a polissacarídeos da parede celular. Neste aspecto, o intuito é identificar inibidores enzimáticos capazes de controlar o metabolismo do ácido ferúlico em plantas com interesse industrial, e que possam ser utilizados como agroquímicos inteligentes capazes de estimular o metabolismo endógeno vegetal, em substituição parcial a inseticidas, fungicidas e plantas transgênicas. Aplicações deste conhecimento deveram trazer benefícios para a produção de alimentos e biocombustíveis por meio da indução de resistência a patógenos, acamamento e dano mecânico; melhorar o aproveitamento energético de forragens e matérias-primas de interesse industrial.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes L Ferrarese - Integrante / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Aline Finger Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 4
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
7.   2011-2012. CULTIVO DE MICROALGAS EM FOTOBIOREATORES COMO MATÉRIA-PRIMA NA PRODUÇÃO DE BIODIESEL
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
8.   2011-Atual. Economia de Baixo Carbono: avaliação de impactos de restrições e perspectivas tecnológicas
Descrição: O objetivo do projeto é desenvolver estudos e pesquisas visando analisar o impacto econômico de políticas ambientais e o desenvolvimento de novas tecnologias redutoras de emissões de gases do efeito estufa sobre a economia brasileira.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Seleghim Júnior - Integrante / Rudinei Toneto - Integrante.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
9.   2011-2013. Efeito da seca e salinidade no proteoma cloroplastidial associado à biossíntese de ácidos graxos em pinhão-manso (Jatropha curcas L.)
Descrição: O conjunto de informações do proteoma de cloroplastos de pinhão-manso associadas à resposta a seca e salinidade é essencial no sentido de integrar os dados genômicos e transcricionais (mais distantes do fenótipo) aos dados traducionais e eventualmente pós-traducionais (mais próximos do fenótipo), aprofundando significativamente a compreensão do fluxo da informação genética do genótipo até o fenótipo e dos mecanismos metabólicos e fisiológicos responsáveis pela tolerância ao estresse, bem como os efeitos deste sobre mecanismos de biossínteses de ácidos graxos nos cloroplastos. A elucidação da regulação da expressão gênica em pinhão-manso ligada à seca e salinidade através da investigação do proteoma de cloroplasto (em especial dos peptídeos diferenciais) através de 2D-PAGE e espectrometria de massas, permitirá identificar peptídeos e os respectivos genes codificantes alterados pelo estresse hídrico e salino, viabilizando um significativo avanço na determinação dos mecanismos de regulação e das interações entre as redes de genes nesta espécie cultivada. A obtenção de dados do proteoma do pinhão-manso é relevante para estabelecer as funções gênicas do cloroplasto para a biossíntese de ácidos graxos, assim como para associar dados moleculares aos aspectos agronômicos de interesse. O objetivo final desse projeto é a seleção de genes alvo úteis para o melhoramento do pinhão-manso através do uso como marcadores moleculares auxiliares no melhoramento tradicional e manipulação genética, auxiliando a obtenção de genótipos com maior tolerância à seca e a solos salinos, maior eficiência no uso da água, bem como maior rendimento na produção de óleo e, consequentemente, de biodiesel.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Maria Clara Pestana-Calsa - Integrante / Katia Castanho Scortecci - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Nayara Patrícia Vieira de Lira - Integrante / Taciana Conceição Manso - Integrante / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Renata Rodrigues de Almeida - Integrante / Regina Elisabety Oliveira Folha - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
Descrição: O conjunto de informações do proteoma de cloroplastos de pinhão-manso associadas à resposta a seca e salinidade é essencial no sentido de integrar os dados genômicos e transcricionais (mais distantes do fenótipo) aos dados traducionais e eventualmente pós-traducionais (mais próximos do fenótipo), aprofundando significativamente a compreensão do fluxo da informação genética do genótipo até o fenótipo e dos mecanismos metabólicos e fisiológicos responsáveis pela tolerância ao estresse, bem como os efeitos deste sobre mecanismos de biossínteses de ácidos graxos nos cloroplastos. A elucidação da regulação da expressão gênica em pinhão-manso ligada à seca e salinidade através da investigação do proteoma de cloroplasto (em especial dos peptídeos diferenciais) através de 2D-PAGE e espectrometria de massas, permitirá identificar peptídeos e os respectivos genes codificantes alterados pelo estresse hídrico e salino, viabilizando um significativo avanço na determinação dos mecanismos de regulação e das interações entre as redes de genes nesta espécie cultivada. A obtenção de dados do proteoma do pinhão-manso é relevante para estabelecer as funções gênicas do cloroplasto para a biossíntese de ácidos graxos, assim como para associar dados moleculares aos aspectos agronômicos de interesse. O objetivo final desse projeto é a seleção de genes alvo úteis para o melhoramento do pinhão-manso através do uso como marcadores moleculares auxiliares no melhoramento tradicional e manipulação genética, auxiliando a obtenção de genótipos com maior tolerância à seca e a solos salinos, maior eficiência no uso da água, bem como maior rendimento na produção de óleo e, consequentemente, de biodiesel... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Cinthya Mirella Pacheco - Integrante / Tercílio Calsa Jr - Coordenador / Nayara Patrícia Vieira de Lira - Integrante / Maria Clara pestana Calsa - Integrante / Katia Castanho Scortecci - Integrante / Taciana Conceição Manso - Integrante / Renata Rodrigues de Almeida - Integrante / Regina Elisabety Oliveira Folha - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
10.   2011-2013. EMU: Laboratório Multiusuários Centralizado de Genômica Funcional Aplicada à Agropecuária e Agroenergia
Descrição: próximos A proposta tem por objetivo a aquisição de equipamentos de última geração para o sequenciamento de DNA, proteínas, identificação de biomoléculas e bioinformática, que deverão equipar o Laboratório Multiusuários Centralizado de Genômica Funcional Aplicada à Agropecuária e Agroenergia da ESALQ. Esta iniciativa é um esforço institucional para construir uma Facility na área de Genômica Funcional que atenda a crescente demanda dos pesquisadores da ESALQ/Cena, além da comunidade científica do Estado de São Paulo. O Laboratório Multiusuários já conta com recursos aprovados pela Finep, no valor de R$ 2.000.000,00 (Proc. Nº ) para as obras de construção civil do prédio que irá abrigar os equipamentos multiusuários, pesquisadores e técnicos de apoio. O Laboratório Multiusuários será um importante centro aglutinador para o desenvolvimento de pesquisas básicas e aplicadas, formação de pessoal e desenvolvimento tecnológico da agropecuária, dos setores florestal e de agroenergia em São Paulo. Atualmente, a ESALQ, em parceria com o Arranjo Produtivo Local do Álcool APLA, Prefeitura de Piracicaba, Grupo Aguassanta (subsidiário do Grupo Cosan), Secretaria Estadual de Desenvolvimento SP, Ministério da Educação e entidades e instituições de pesquisas locais, está coordenando as áreas científica, tecnológica e de inovação do Parque Tecnológico de Agroenergia de Piracicaba. Na área de 150.000 m2 do parque já foram instalados, e estão funcionando, a Faculdade de Tecnologia (FATEC) e o Centro Federal Tecnológico (CEFET). O Núcleo do Parque será constituído pela Incubadora de Empresas e Laboratórios de Pesquisas de empresas das áreas de agroenergia e biotecnologia. Portanto, o Laboratório Multiusuários da ESALQ terá, também, uma importante missão de apoio e prestação de serviços a essas instituições de ensino e às empresas que se instalarem no Parque Tecnológico, possibilitando a obtenção de recursos adicionais à manutenção dos equipamentos e instalações. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (4) . Integrantes: Carlos Alberto Labate - Integrante / Luiz Lehmann Coutinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Carlos Alberto Labate.
11.   2011-Atual. IDENTIFICACAO DE LEVEDURAS FERMENTADORAS DE XILOSE ISOLADAS A PARTIR DO TRATO INTESTINAL DE INSETOS QUE PARASITAM A CANA-DE-ACUCAR
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
12.   2011-Atual. Identificação, Caracterização e Engenharia de Enzimas que Degradam a Parede Celular das Plantas
Descrição: A meta da proposta atual e a identificação, caracterização e engenharia das propriedades catalíticas de enzimas com o objetivo de desenvolvimento de biocatalizadores que podem ser combinados em misturas enzimáticas para a biorefinaria de lignocelulose. A estratégia geral focalizará na caracterização de enzimas identificadas em projetos genomicos dos fungi Aspergillus e das bactérias Bacillus subtilis e Clostridium thermocellum, utilizando uma série de técnicas microbiológicas e bioquímicas em conjunto com abordagens de biologia molecular estrutural. Estes estudos iniciais serão conduzidos em paralelo com analises mais sofisticados com o intuito de identificar em mais detalhes as modificações nos polímeros de parede celular das plantas produzidas pelas enzimas. Estes atividades fornecerão informações para orientar o programa de engenharia de enzimas que melhorará as suas propriedades catalíticas usando estratégias de desenho racional e evolução dirigida visando aplicações de biorefinaria na indústria de polpa de celulose e papel no desenvolvimento de tecnologias na área de bicombustíveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Richard John Ward - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
Descrição: "Identificação, caracterização e engenharia de enzimas que degradam a parede celular das plantas . Processo FAPESP: 2010/18850-2, com vigência de 01/04/2011 a 31/03/2016. Coordenador Prof Dr. Richard John Ward. Valores concedidos R$ 490.808,05 e US$ 356.864,82. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (6) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / Richard J Ward - Coordenador.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
13.   2011-2013. IMPROVING BIOMASS FOR CELLULOSE-DERIVED BIOFEULS, PROTEOMIC AND GENOMIC STRATEGIES FOR MONOCOT CANDIDATES AND EUCALYPTUS
Descrição: The project aims at obtaining an insight into the genes and proteins involved in primary and secondary cell wall formation and in the rearrangement of cell wall components, to improve the saccharification process of cell wall polysaccharides, and also to identify genes related to abiotic stress tolerance to improve biomass production in Eucalyptus spp. This will be done in two fronts: First, with a proteomic study of cell wall proteins from two graminae species: sugarcane (cultivar SP80-3280) a tropical model, and Brachypoium distachyon (line BD21) a temperate one. Both cultivars were chosen as model plants since their genomes will be completely sequenced: SUCEST project from FAPESP, and International Brachypodium Initiative for Brachypodium (http://www.brachypodium.org/). This project is part of the Research Program of the INCT Biotechnology for Bioethanol (FAPESP-CNPq/MCT) coordinated by Dr. Marcos Silveira Buckeridge. The project in the INCT is entitled Characterization of the proteome from the cell wall of sugarcane, and is also the PhD project of the student Maria Juliana Calderan Rodrigues (Fapesp 2007/59327-8). In the second front, we will identify genes and proteins related to secondary cell wall formation and abiotic stress tolerance, such as cold and water stress in Eucalyptus spp. The regulatory role of each gene will be tested in the model plant Arabidopsis thaliana. This project has being approved in the USP-COFECUB agreement (Proc. USP 10.1.2347.8.5) in collaboration with the University Paul Sabatier of Toulouse-France. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Carlos Alberto Labate - Coordenador / Mônica Teresa Veneziano Labate - Integrante / David Henry Moon - Integrante / Fernanda Salvato - Integrante / Helaine Carrer - Integrante / Maria Juliana Calderan Rodrigues - Integrante / Maria Carolina Quecine - Integrante / Elisabeth Jamet - Integrante / Rafael Pont-Lezica - Integrante / Chantal Teulières - Integrante / Christiane Marque - Integrante / Cécile Albenne - Integrante / Roberto Camargo - Integrante.
Membro: Carlos Alberto Labate.
14.   2011-Atual. Interferências alelopáticas de palhadas de várias culturas sobre soja e plantas daninhas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Paulo Alfredo Feitoza Böhm - Integrante / Emy Luiza Ishi Iwamoto - Coordenador / Joselaine Viganó - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
15.   2011-Atual. Manejo nutricional pela associação de gesso de minério e silicato de cálcio visando aumento de resistência à seca de cana-de-açúcar plantada em sistema sequeiro no Nordeste Brasileiro. Edital CNPq nº 14/2011
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador / Vilma Marques Ferreira - Integrante / Simério Carlos Silva Cruz - Integrante / Diogo Henrique Borges - Integrante / Romel Duarte Vilela - Integrante / Geraldo Verissimo de Souza Barbosa - Integrante / Benigno França Amorim de Almeida - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
16.   2011-Atual. Núcleo de Apoio à Pesquisa Centro de Instrumentação para estudos avançados de materiais nanoestruturados e biossistemas
Descrição: Pró-reitora de Pesquisa da USP. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador.
Membro: Igor Polikarpov.
17.   2011-Atual. Participação no Projeto de Pesquisa Temático: Aplicação de métodos físico-químicos e enzimáticos na sacarificação do bagaço de cana: Estudos de microrganismos, processos fermentativos relacionados e métodos de hidrólise .
Descrição: Aplicação de métodos físico-químicos e enzimáticos na sacarificação do bagaço de cana: Estudos de microrganismos, processos fermentativos relacionados e métodos de hidrólise . Processo FAPESP: 2010/12624-0, com vigência de 01/05/2011 a 30/04/2015. Coordenador Profa Dra. Eleni Gomes. Valores concedidos R$ 456.816,67e US$ 123.906,98.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (6) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / eleni Gomes - Coordenador.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
18.   2011-2013. Programa de Apoio à Infraestrutura de Pesquisa. Centros Depositários de Informações, Documentos e/ou Coleções Biológicas.
Descrição: Melhoria e capacitação das coleções científicas do Departamento de Biologia da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo . Coordenador/Responsável: Prof. Dr. Carlos Alberto Garófalo, vigência 01/02/2011 a 31/01/2012. Valor R$ 922.724,95 + US$ 42,864.26.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (6) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / Carlos Alberto Garófalo - Coordenador.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
19.   2011-2013. Prospecção de Holocelulases de Fungos do Cerrado e Screnning de Fungos Endofíticos Produtores de Enzimas Hidrolíticas (Rede Centro Oeste)
Descrição: O objetivo deste trabalho é realizar o isolamento de fungos filamentosos produtores de holocelulases, provenientes de diferentes camadas de compostagem natural de manchas de cerrado preservado situados no Distrito Federal e regiões do Entorno do Distrito Federal. A utilização de processos biotecnológicos alternativos, como a biocatálise industrial, têm um papel fundamental na implementação de tecnologias sustentáveis, contribuindo para a redução dos problemas de poluição ambiental, além de trazer outros benefícios processuais. A utilização de enzimas é atrativa para propósitos industriais devido à sua alta especificidade e eficiência no processo de catálise, visto que a catálise biológica leva à transformação de reagentes comparativamente não tóxicos em produtos relativamente puros sob condições amenas, tendo como conseqüência uma redução nos custos do processo. A implementação bem sucedida de enzimas como biocatalisadores industriais requer a disponibilidade de enzimas com alta atividade específica e termoestabilidade. A principal estratégia da presente proposta é aliar às técnicas clássicas de bioquímica e enzimologia novas ferramentas moleculares e proteômicas no estudo da conversão de biomassa vegetal lignocelulósica por microorganismos, contribuindo dessa forma para a produção de um arsenal de enzimas como ferramentas para obtenção de produtos de interesse industrial. A proteômica pode contribuir fortemente na elucidação de mecanismos envolvidos na regulação da expressão de genes de enzimas industriais em resposta a fatores externos nestes organismos modelo, estudados como conversores de biomassa vegetal. Além disso, a prospecção e o entendimento do controle da expressão de genes poderão, futuramente, ser utilizados no desenvolvimento de novas linhagens de fungos filamentosos mais eficientes na produção, como por exemplo, de etanol celulósico e no branqueamento enzimático de polpa de celulose. Através da utilização das novas tecnologias de seqüenciamento de alt. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Fabiana Fonseca Zanoelo - Integrante / Célia Soares - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fuandação de Amparo à Pesquisa do DF - Auxílio financeiro.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
20.   2011-Atual. Prospecção de inibidores enzimáticos da via de fenilpropanoides visando a redução da recalcitrância da biomassa lignocelulósica para a produção de etanol celulósico
Descrição: Identificar inibidores das enzimas da via dos fenilpropanóides que sejam eficientes em promover aumentos na digestibilidade dos polissacarídeos da parede celular em variedades de cana-de-açúcar e milho, sem afetar a produção de biomassa. Para o alcance destes Objetivos, pretendemos: a) Determinar a estrutura tridimensional das enzimas-alvo (cinamil 4-hidroxilase ? C4H; 4-cumarato CoA:ligase - 4CL; coniferaldeído desidrogenase - CALDH) por meio de modelagem a partir das estruturas 3D homólogas, depositadas no Protein Data Bank (PDB). b) Identificar inibidores in silico por varredura e ?docagen? a partir do modelo tridimensional gerado das enzimas selecionadas. c) Determinar as atividades da C4H, 4CL e CALDH de cana-de-açúcar e milho. d) Verificar os efeitos dos inibidores identificados in vitro sobre as atividades enzimáticas das enzimas de interesse, extraídas das plantas. e) Verificar os efeitos in vivo de diferentes concentrações dos inibidores sobre o crescimento, biomassas secas e frescas, morfologia, grau brix e digestibilidade da biomassa lignocelulósica de cana-de-açúcar e milho. f) Purificar e sequenciar enzimas selecionadas cuja sequência não esteja disponível nos bancos de dados de genes/aminoácidos proteicos. g) Avaliar o conteúdo de lignina, a partição de monolignóis e o conteúdo de ácidos hidroxicinâmicos nas plantas com digestibilidade aumentada pelo uso de inibidores. h) Realizar estudos anatômicos e ultraestruturais nas plantas positivamente afetadas pelos tratamentos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
Descrição: Identificar inibidores das enzimas da via dos fenilpropanóides que sejam eficientes em promover aumentos na digestibilidade dos polissacarídeos da parede celular em variedades de cana-de-açúcar e milho, sem afetar a produção de biomassa. Para o alcance destes Objetivos, pretendemos: a) Determinar a estrutura tridimensional das enzimas-alvo (cinamil 4-hidroxilase ? C4H; 4-cumarato CoA:ligase - 4CL; coniferaldeído desidrogenase - CALDH) por meio de modelagem a partir das estruturas 3D homólogas, depositadas no Protein Data Bank (PDB). b) Identificar inibidores in silico por varredura e ?docagen? a partir do modelo tridimensional gerado das enzimas selecionadas. c) Determinar as atividades da C4H, 4CL e CALDH de cana-de-açúcar e milho. d) Verificar os efeitos dos inibidores identificados in vitro sobre as atividades enzimáticas das enzimas de interesse, extraídas das plantas. e) Verificar os efeitos in vivo de diferentes concentrações dos inibidores sobre o crescimento, biomassas secas e frescas, morfologia, grau brix e digestibilidade da biomassa lignocelulósica de cana-de-açúcar e milho. f) Purificar e sequenciar enzimas selecionadas cuja sequência não esteja disponível nos bancos de dados de genes/aminoácidos proteicos. g) Avaliar o conteúdo de lignina, a partição de monolignóis e o conteúdo de ácidos hidroxicinâmicos nas plantas com digestibilidade aumentada pelo uso de inibidores. h) Realizar estudos anatômicos e ultraestruturais nas plantas positivamente afetadas pelos tratamentos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes L Ferrarese - Integrante / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Victor Hugo Salvador - Integrante / Ana Paula Ferro - Integrante / Aline Finger-Teixeira - Integrante / Flávio Augusto Vicente Seixas - Integrante / Angela Valderrama Parizotto - Integrante / Tamires Letícia Cunha Lopes - Integrante / Dyoni Matias Oliveira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 7
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
21.   2011-Atual. RNAi para controle de Tuta absoluta em tomateiro
Descrição: A cultura do tomateiro (Solanum lycopersicum) é de grande expressão econômica e social no mercado nacional e internacional. O tomateiro é uma das culturas mais sujeitas à ocorrência de pragas e doenças dentre todas as espécies cultivadas. Dentre as pragas que atacam esta cultura, a traça do tomateiro (Tuta absoluta) representa um dos insetos mais danoso, com perdas que podem chegar a 80-100% da produção. Devido à extrema importância da cultura do tomate no mundo, inúmeros esforços têm sido feitos visando o controle desta praga de forma eficiente e sustentável. De modo geral, o manejo de controle atual de T. absoluta possui eficiência variada, com um forte impacto ambiental por ser baseado na aplicação de inseticidas. Visando reduzir o custo e o impacto ambiental, grandes esforços têm sido feito para o desenvolvimento de novas tecnologias de controle de pragas. Neste contexto, o silenciamento gênico por RNA de interferência (RNAi) surge como uma alternativa promissora no combate a insetos-praga, com alta eficiência, especificidade e com redução no impacto ambiental. Por meio da geração de plantas transgênicas expressando RNAi para genes essenciais de insetos-praga específicos, a ingestão destas moléculas de RNAi pelo inseto mediante herbivoria poderá resultar no silenciamento gênico de proteína essencial ao inseto, resultando em fenótipos que podem variar entre perda de apetite, infertilidade ou até a morte. Com o intuito de estabelecer esta técnica para o controle da traça do tomateiro T. absoluta, o presente trabalho tem como objetivo gerar linhas transgênicas de tomateiros expressando de moléculas de RNA capazes de silenciar genes essenciais ao inseto.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Henrique Marques Barbosa de Souza - Integrante / Joni Esrom Lima - Integrante / Roberto Camargo - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
22.   2011-Atual. Sistema antioxidante de cana-de-açúcar em resposta à seca
Descrição: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma das culturas mais importantes para a economia brasileira, fonte de matéria-prima para produção de açúcar e álcool. Para atender a crescente demanda do mercado interno e externo, o setor sucroalcooleiro deverá expandir a área cultivada para regiões no Sudeste e Centro-Oeste, caracterizadas por períodos de seca acentuada. Recentemente, muitos trabalhos têm utilizado estratégias de simulação à seca com genótipos contrastantes para a resposta ao estresse para obtenção do perfil de expressão gênica diferencial dos genótipos tolerantes e sensíveis. Porém, atualmente pouco se conhece sobre os mecanismos bioquímicos, genéticos e moleculares envolvidos na resposta à seca em cana-de-açúcar, especialmente sobre os componentes do sistema antioxidante, que desempenham papel fundamental no combate aos danos causado pela seca. As enzimas superóxido dismutase (SOD), catalase (CAT), ascorbato peroxidase (APX), glutationa S-transferase (GST), glutationa redutase (GR) e guaiacol peroxidase (GPOX), que compõem o sistema antioxidante serão intensamente investigadas e correlacionadas com a resposta à seca em cana-de-açúcar. Tal investigação pode levar ao melhor entendimento dos genes e enzimas envolvidas na resposta ao estresse e caracterização de cultivares tolerantes à seca. Este trabalho pretende identificar, caracterizar e analisar a atividade de enzimas do sistema antioxidante, através de géis de poliacrilamida não desnaturantes e espectrofotometria, além de avaliar o perfil da expressão via quantificação relativa de transcritos reversos de genes codificadores dessas enzimas em genótipos de cana-de-açúcar contrastantes com relação à resposta à seca.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Ferreira, Renato Rodrigues - Integrante / Isabela Amaral Camargo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
23.   2011-Atual. TARGETED ANALYSIS OF MICROBIAL LIGNOCELLULOLYTIC SECRETOMES - A NEW APPROACH TO ENZYME DISCOVERY
Descrição: PROJETO BILATERAL FAPESP RCUK, Projeto No. 10/52362-5 . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
24.   2011-Atual. UTILIZAÇÃO DE RESÍDUOS AGROINDUSTRIAIS NA PRODUÇÃO DE PECTINASES PELO FUNGO Aspergillus oryzae
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Jurgen Andreaus - Integrante / Carlos André Ornellas Ricart - Integrante / Pérola de Oliveira Magalhães Dias Batista - Integrante.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.

2010

1.   2010-Atual. (Bioen/Pronex/Fapesp) Metabolomics and proteomics of sucrose accumulation in sugarcane
Descrição: The project aims to obtain an insight into the genetic factors controlling sucrose accumulation in sugarcane (brix), linking gene expression, proteins and metabolites data in a systems biology approach. The first part of the project will be the characterization of the metabolome and proteome from leaves, mature and immature internodes at different stages of development of the sugarcane cultivar SP80-3280. This plant material was chosen as our model plant as its genome will be completely sequenced by SUCEST. Besides, this cultivar has also good agronomic properties such as high brix, high productivity, high fiber content, resistance to rust and other important diseases of sugarcane. The changes of the metabolome and proteome of the different plant tissues will be compared at different stages of development, and with particular interest during the stage of sucrose accumulation. The metabolome data banks will be built based on metabolite profiling using two complementary mass spectrometry techniques: GC-TOF-MS and LC/MS-MS. In these initial steps we will also develop computational tools to improve mass spectrometry data analysis and annotation. Once the metabolomics, proteomics and bioinformatics plataforms are established, at the end of the second year, we will start the second part of the project with a new set of experiments using two contrasting materials with high and low brix. The high brix material will be composed of two commercial varieties (RB925211 and RB855156), and the low brix group will be represented by introduced genotypes of Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum (Krakatau, IN84106, IN84103, M31/45) with a known history of low sucrose accumulation. The experiments comparing high and low brix genotypes will be conducted in greehouse conditions at UFSCar, under the same conditions established for SP80-3280. In these experiments we will have the collaboration from the group of Prof. Glaucia Mendes Souza whom will generate transcriptomics . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (1) . Integrantes: Carlos Alberto Labate - Coordenador / Fernanda Salvato - Integrante / Simone Guidetti Gonzalez - Integrante / Junior Barrera - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio - Integrante / José Eduardo Ferreira - Integrante / Luis Felipe Boaretto - Integrante / Maria Beatriz Calderan Rodrigues - Integrante / Larissa Prado da Cruz - Integrante / Danielle Izilda Rodrigues da Silva - Integrante / Camila Ribeiro - Integrante.
Membro: Carlos Alberto Labate.
2.   2010-2012. A alelopatia a serviço da agricultura no Paraná: Quantificação de aleloquímicos por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
3.   2010-Atual. Anexo II Chamada 2 - Pesquisa em Redes Temáticas para Ampliação do Conhecimento da Biota, o Papel Funcional, Uso e Conservação da Biodiversidade Brasileira-SISBiota
Descrição: CNPq-Chamada 47- Processo: 563260/2010-6/FAPESP nº 2010/52322-3 - Pesquisa em Redes Temáticas para Ampliação do Conhecimento sobre a Biota, o Papel Funcional, Uso e Conservação da Biodiversidade Brasileira. COORDENADORA: Profa. Dra. MARIA DE LOURDES TEIXEIRA DE MORAES POLIZELI . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (6) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
4.   2010-2012. Caracterização morfológica, fisiológica e genética de leveduras contaminantes da fermentação alcoólica e avaliação do seu potencial competitivo com base na resistência aos fatores estressantes do processo fermentativo
Descrição: Processo 09/14617-4 Uma das principais preocupações na indústria sucro-alcooleira é combater os microrganismos contaminantes do processo de produção de álcool, representados pelas bactérias e leveduras que se instalam no processo. Essas leveduras que invadem o processo recebem o nome de leveduras selvagens e os principais gêneros encontrados na cana-de-açúcar saudável são Saccharomyces, Torula e Pichia. Leveduras Saccharomyces cerevisiae que apresentam pseudohifas (brotos que não se separam da célula-mãe) são muito frequentes nas dornas de fermentação e podem causar problemas no processo, inclusive com perda do rendimento fermentativo. Pouco se conhece sobre as características genéticas, morfológicas, fisiológicas e de resistência ao estresse deste biotipo de levedura. Além disto, mais recentemente, a presença dos gêneros Dekkera e Brettanomyces têm sido relacionada também à problemas nos processos fermentativos para produção de etanol. Desta forma, este trabalho tem por objetivo caracterizar linhagens de Saccharomyces cerevisiae que apresentam células em cachos (pseudohifas) e colônias rugosas, e verificar sua competitividade em processos fermentativos, em comparação com leveduras que apresentam colônias mucosas, com células dispersas. Quanto à espécie D. bruxellensis, pretende-se estudar a tolerância ao estresse quanto à concentração de etanol, açúcar, pH e temperatura, procurando detectar condições nas quais o desenvolvimento destas leveduras seja mínimo, no intuito de facilitar o manejo destas contaminantes no processo. Avaliar-se-á também a inibição das linhagens contaminantes por toxinas killer. Ademais, verificar o poder competitivo das linhagens de S. cerevisiae com biotipo rugoso pode ajudar a entender e manejar o processo de fermentação para minimizar os efeitos prejudiciais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador / Ana Paula Guarnieri Bassi - Integrante / Vandra Renata Reis - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
5.   2010-Atual. Centro de Processos Biologicos e Industriais para Biocombustiveis (CeProBIO)
Descrição: Programa de Cooperação Brasil - União Europeia/Edital CNPq nº 06/2009 - MCT/CNPq/FAPEAM, FAPDF, FAPEMIG, FAPEPI, FAPESP, FAPERJ, FACEPE, FAPERGS - Biocombustíveis de Segunda Geração Processo CNPq No. 490022/2009-0 e FAPESP 09/52840-7. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
6.   2010-Atual. Desenvolvimento de sistemas de produção de girassol (Helianthus annuus L.), mamona (Ricinus communis L.) e pinhão-manso (Jatropha curcas L.) no semiárido com foco na agricultura familiar
Descrição: O projeto, com financiamento da PETROBRAS, tem como objetivo desenvolver tecnologias para a cultura da mamona, girassol e pinhão manso que proporcionem melhoria do desempenho produtivo dessas espécies no âmbito da agricultura familiar do semiárido brasileiro. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Antonio Carlos de Souza Abboud - Coordenador / João Bosco Pitombeira - Integrante / Vagner Maximino Leite - Integrante / José Carlos Fialho de Resende - Integrante / Paulo Sérgio Lima e Silva - Integrante / Gustavo Souza Valladares - Integrante / Luzimar Gonzaga Fernandez - Integrante / João Sebastião de Paula Araújo - Integrante / Ricardo Luiz Louro Berbara - Integrante / Débora Andréa Evangelista Façanha - Integrante / Lúcia Helena Garófalo Chaves - Integrante / Ivan Souto de Oliviera - Integrante / Edilza Maria Felipe Vásquez - Integrante / Smail Soares - Integrante / Alek Sandro Dutra - Integrante / Renildo Luiz Mion - Integrante / Mirian Cristiba Gomes Costa - Integrante / Marisa Mendes - Integrante / Pedro Corrêa Damasceno Junior - Integrante / Júlio Alves Cardoso Filho - Integrante / Everaldo Zonta - Integrante / Sonia Regina de Souza - Integrante / Joaquim Torres Filho - Integrante. Financiador(es): Petrobras Biocombustível - Matriz - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
7.   2010-2012. Desenvolvimento radicular vegetal: controles genéticos, epigenéticos e respostas ambientais
Descrição: O presente projeto se propõe a integrar diversos grupos de pesquisa do país que vem trabalhando em linhas de pesquisa envolvendo o tema do projeto, e nas áreas de fisiologia vegetal, transcriptoma, epigenética, proteômica , bioinformática e genômica funcional, com o objetivo geral comum de estudar os controles do desenvolvimento radicular em algumas espécies de importância econômica para diferentes regiões agrícolas do país. A principal meta é a geração de ferramentas para a manipulação do processo de interação planta-ambiente que permitam o desenvolvimento de novas variedades nacionais mais adaptadas as diferentes condições de estresse biótico e abiótico encontradas naturalmente no país.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Adriana S. Hemerly - Coordenador / Paulo C. G. Ferreira - Integrante / Maria Fátima Grossi de Sá - Integrante / Márcio Alves Ferreira - Integrante / Antonio Costa de Oliveira - Integrante / Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Gilberto Sachetto Martins - Integrante / Márcia Regina Soares da Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
8.   2010-Atual. E.M.U.: FACILITY PARA ESTUDOS AVANÇADOS DE MATERIAIS NANOESTRUTURADOS E BIOSISTEMAS
Descrição: FAPESP No. 2009/54035-4. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
9.   2010-2013. Efeitos alelopáticos de diferentes palhadas sobre a soja: alterações metabólicas e possíveis modos de ação dos aleloquímicos
Descrição: A proposta deste projeto é avaliar o envolvimento de mecanismos alelopáticos de diferentes palhadas de plantas sobre o crescimento da soja, isolando, identificando e quantificando os aleloquímicos e seus possíveis modos de ação. Assim, as etapas a serem desenvolvidas incluem: 1) a avaliação dos efeitos alelopáticos de diferentes palhadas sobre o crescimento das raízes de soja, biomassas fresca e seca e viabilidade celular; 2) a identificação dos aleloquímicos presentes nas palhadas que causarem alterações significativas em parâmetros fisiológicos e bioquímicos da soja; 3) a avaliação dos efeitos dos extratos e/ou dos aleloquímicos em parâmetros fotossintéticos, nas alterações morfológicas e anatômicas, no metabolismo da lignificação e no metabolismo antioxidante da soja. Para o alcance destas metas, serão aplicadas metodologias adequadas como espectrofotomeria, microscopia óptica, fluorescência, análise de gás infravermelho (IRGA) e cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (4) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Paulo Alfredo Feitosa Böhm - Integrante / Graciene de Souza Bido - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante / Anderson Ricardo Soares - Integrante / Gisele Adriana Bubna - Integrante / Rita de Cássia Siqueira-Soares - Integrante / Lima, Rogério Barbosa - Integrante / Ferrarese, Maria de Lourdes Lúcio - Integrante / Hingrid Ariane da Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 16 / Número de orientações: 5
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
10.   2010-Atual. Engenharia de Enzimas de Interesse Industrial
Descrição: As metodologias poderosas de engenharia de proteínas podem ser aplicadas para melhorar as propriedades catalíticas das enzimas usadas na biorefinaria. A engenharia de proteínas necessita a integração multidisciplinar para incorporar diversas técnicas da biologia estrutural, biologia molecular, bioquímica e biofísica de proteínas. Alem das contribuições fundamentais no avanço do entendimento básico da relação entre a estrutura e a função das proteínas, as tecnologias associadas com a engenharia de proteínas estão sendo aplicadas cada vez mais na arena industrial, visando o desenvolvimento de novos produtos de interessa comercial. O projeto atual apresenta duas áreas de pesquisa em andamento em nosso laboratório que aplicam as técnicas de engenharia de proteínas com os objetivos de: 1) criação de enzimas multifuncionais que combinam dois ou mais atividades catalíticas, e 2) estudar a base estrutural da termoestabilidade das xilanases.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
11.   2010-Atual. Engenharia fisiológica da biomassa lignocelulósica da cana-de-açúcar
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
12.   2010-Atual. Estudos de eficiência energética em edificações
Descrição: Uso de simulações CFD e técnicas numéricas de otimização para o projetode novas edificações energeticamente eficientes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Seleghim Júnior - Coordenador.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
13.   2010-2013. Genômica funcional aplicada à descoberta de genes de resistência à ferrugem do eucalipto
Descrição: O objetivo do projeto de inovação tecnológica é o desenvolvimento de uma plataforma de tecnologia genômica, baseada na análise do transcritoma (utilizando as tecnologias SAGE e Microarrays) e proteoma de folhas de Eucalyptus grandis, para a descoberta de genes e marcadores de resistência à ferrugem causada por Puccinia psiidi Winter. A descoberta desses genes servirá para a produção de árvores transgênicas de clones e progênies comerciais de Eucalyptus grandis, que apresentam susceptibilidade à doença, bem como no desenvolvimento de marcadores moleculares para a seleção assistida de árvores resistentes a ferrugem. Para tanto, utilizaremos várias populações e clones do programa de melhoramento genético da Suzano Papel e Celulose, que apresentam resistência e susceptibilidade à ferrugem. A partir da análise da expressão gênica e de proteínas será possível identificar genes que conferem resistência à ferrugem. O projeto baseia-se nos resultados preliminares que obtivemos em estudo piloto utilizando a tecnologia SAGE e que possibilitaram a identificação de cerca de 471 genes diferencialmente expressos entre árvores resistentes e susceptíveis à ferrugem. Dentre esses genes, foram identificadas 30 sequências cujas funções são desconhecidas, e que se expressam preferencialmente ou apenas nas árvores resistentes. Esses resultados preliminares indicaram o enorme potencial de aplicação das técnicas de genômica funcional para a identificação de genes de resistência à ferrugem e seleção de árvores mais produtivas. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (4) . Integrantes: Carlos Alberto Labate - Coordenador / Monica T V Labate - Integrante / David H Moon - Integrante / Livia Maria Franceschini - Integrante / Thiago Falda Leite - Integrante / Maria Carolina Quecine - Integrante / Ivan Miletovic Mozol - Integrante / Felipe Garbeline Marques - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Suzano Papel e Celulose - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 2
Membro: Carlos Alberto Labate.
14.   2010-2012. Identificação e caracterização fisiológica e do perfil de expressão gênica de cultivares de cana-de-açúcar (Sacccharum spp.) contrastantes para eficiência no uso do Nitrogênio
Descrição: A crescente demanda por alimentos e energia, aliada a maior preocupação com o ambiente e os custos dos fertilizantes nitrogenados, levam a uma intensa mobilização visando à melhoria da produtividade e da eficiência na utilização de fertilizantes nitrogenados em plantas cultivadas. O Brasil é líder mundial na produção de cana-de-açúcar, que é utilizada tanto para a produção de açúcar como de etanol. Devido à constante expansão da cultura de cana-de-açúcar para solos marginais, o uso de fertilizantes a base de nitrogênio (N) na agricultura se tornou inevitável. Por outro lado, a produção industrial de fertilizantes nitrogenados representa um grande emissor de gases do efeito estufa. Considerando esses aspectos, fica evidente a necessidade da obtenção de alta produtividade em plantas cultivadas sob baixa fertilização de N. Estudos prévios demonstraram que a resposta da cana-de-açúcar à aplicação de fertilizantes à base de N é baixa quando comparada a outras plantas cultivadas, sendo que as causas fisiológicas e genéticas dessa reduzida responsividade ainda permanecem desconhecidas. Este projeto objetiva identificar cultivares adaptadas a condições limitantes de aplicação N e caracterizar fisiologicamente cultivares com maior capacidade de absorção de N, por meio de estudos de cinética de absorção de N pela raiz, e utilizando-se técnicas moleculares para análise massal de transcritos, seguidas de validação da expressão gênica via RT-qPCR para caracterizar genes diferencialmente expressos em genótipos de cana-de-açúcar contrastantes para a o uso eficiente de N.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Joni Esrom Lima - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
15.   2010-2015. Identificação molecular por interação complementar ponta- amostra em microscopia de força atômica
Descrição: Nos últimos anos, informações relevantes sobre a arquitetura da parede celular têm sido obtidas utilizando microscopia de força atômica e suas variantes. Entretanto, devido à escala em que atua, a técnica apresenta como sua principal limitação a incapacidade de identificar os componentes da amostra, uma vez que as formas de radiação tipicamente utilizadas para identificar a composição química apresentam comprimentos de onda muito superiores à resolução do microscópio e os métodos de hibridação molecular requerem o uso de polímeros da mesma ordem de grandeza ou maiores que as estruturas observadas. Este projeto estabelece um protocolo para observação da parede celular da cana-de-açúcar in situ e em filmes finos, visando o desenvolvimento de uma nova técnica para identificar a nano composição das estruturas da parede celular utilizando AFM. Para tanto, enzimas e anticorpos serão imobilizados na ponta de AFM, de modo a funcionalizar a ponta para a identificação dos substratos/antígenos específicos durante a varredura da amostra.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Buckeridge, Marcos S. - Integrante / Vinicius Pimentel - Coordenador / Marco Aurélio Silva Tiné - Integrante / Maysa Costa Alves - Integrante.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
16.   2010-Atual. INCT do Bioetanol
Descrição: Esta proposta une um conjunto de 30 laboratórios de 5 estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (38) / Mestrado acadêmico: (38) / Doutorado: (84) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Marcos S. Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
17.   2010-Atual. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol
Descrição: Esta proposta envolve trinta laboratórios de cinco estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Integrante / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
Descrição: Esta proposta une um conjunto de 30 laboratórios de 5 estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
Descrição: Esta proposta une um conjunto de 30 laboratórios de 5 estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
18.   2010-Atual. Isolamento e caracterização de leveduras presentes na fermentação de cacau e cupuaçu para a melhoria desse processo
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Gildemberg Amorim Leal Junior - Integrante / Gomes, Luiz H. - Integrante / Irene Coelho - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
19.   2010-Atual. Mecanismos de hidrólise de polissacarídeos de parede celular de cana de açúcar
Descrição: Visa estudara estrura fina dos arabinoxilanos e beta-glucanos de gramíneas com foco na cana-de-açúcar. Hidrolases, como celulases, xilanases, alfa/arabinofuranosidases, xiloglucano transglicosilase-hidrolase (XTH) e feruloil esterases são utilizadas com o objetivo de determinar astrutura fina dos polissacarídeos e com isto abrir caminho para a produção de etanol de segunda geração (etanol celulósico). As enzimas utilizadas são tando de microorganismos como da própria planta.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
20.   2010-Atual. Núcleo de pesquisa, desenvolvimento e inovação na produção de etanol - Biomassa Vegetal - PRONEM
Descrição: O projeto visa a criação de rede de pesquisa no estado de Pernambuco que congrega laboratórios e/ou grupos de instituições de pesquisa (UFPE, UFRPE, UPE, CETENE, RIDESA e IPA) que atuam em temas complementares na cadeia de produção do bioetanol combustível, nas áreas de fisiologia, biologia molecular e melhoramento de cana de açúcar (sub-proposta em biomassa vegetal), sustentabilidade sócio-econômica do setor sucro-alcooleiro, química de biomassa, engenharia de bioprocessos, fermentação e fisiologia de microrganismos industriais e genética e biologia molecular de microrganismos industriais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Marcos Antonio de Morais Junior - Coordenador. Financiador(es): (FACEPE) Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
21.   2010-2012. Otimização de Biorreatores de Estado Semi-Sólido Contínuos através da Modelagem do Escoamento Multifásico Interno
Descrição: Proc. CNPq 551120/2010-0. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
22.   2010-Atual. Pesquisa, desenvolvimento e inovação aplicados ao setor sucroalcooleiro
Descrição: Este projeto visa integrar vários aspectos envolvidos na geração de novas variedades de cana-de-açúcar, fortalecendo o alinhamento das pesquisas em biotecnologia de cana-de-açúcar e melhoramento genético clássico, com vistas ao atendimento das necessidades do setor de biocombustíveis, a saber: I- Ações no melhoramento genético convencional: objetivando gerar novas variedades de cana-de-açúcar de modo a serem mais produtivas, apresentar maiores teores de açúcar e biomassa, serem mais resistentes a pragas e doenças, maior tolerância a estresse hídrico de modo a atender as novas áreas de expansão da agricultura canavieira e as áreas tradicionais; II- Ações biotecnologias: almejando fortalecer o melhoramento molecular, através da criação de grande banco de informações moleculares relativas a genes, proteínas e sistemas regula tórios em cana-de-açúcar associando a dados de campo, visando desenvolver e utilizar novos marcadores moleculares e obter plantas transgênicas que: suplantem os principais estresses bióticos/abióticos, como a seca, sejam mais resistentes a pragas e doenças existentes na lavoura canavieira, que maiores teores de sacarose e maior quantidade e maior qualidade das fibras. III- Produção de mudas: apoiar 11 (onze) bases de produção de mudas através da termoterapia expandindo a produção e distribuição de mudas para pequenos e médios produtores. IV- Implantação de infra-estrutura: em 3 (três) novas Universidades (UFMT, UFPI e UFGD), com vistas permitir a integração à Rede RIDESA. V- Formação de Recursos Humanos: disponibilização de bolsas para contratação de pessoal para integrarem os programas de pesquisas. . . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Márcio Henrique Pereira Barbosa - Coordenador / João Carlos Bespalhok Filho - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
23.   2010-2012. PRODUÇÃO DE DIESEL VERDE A PARTIR DE ALGAS
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
24.   2010-Atual. Produção de etanol celulósico-projeto temático Fapesp
Descrição: O objeto de estudo do projeto é a produção de etanol a partir de bagaço de cana de açúcar com as seguintes etapas: a) isolamento de fungos termofílicos produtores de celulases, xilanases e ligninases com propriedades adequadas ao processo industrial, assim como, a obtenção de cepas super-produtoras por meio de técnicas moleculares; b) pré-tratamento físico e químico do bagaço de cana visando à desestruturação das fibras lignocelulósicas de modo a facilitar o acesso das enzimas aos seus substratos; c) hidrólise enzimática dessa biomassa; d) caracterização química do material pré-tratado e do hidrolisado obtido; e) desenvolvimento de biorreatores para produção das enzimas fibrolíticas por fungos termofílicos; f) fermentação alcoólica utilizando açúcares obtidos da biomassa sacarificada; g) purificação e caracterização das enzimas hidrolíticas envolvidas no processo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (2) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Mauricio Boscolo - Integrante / Gustavo Bonilla Rodriguez - Integrante / João Cláudio Thomeo - Integrante / Rhaguvir Arni - Integrante / Roberto da Silva - Integrante.
Membro: Eleni Gomes.
25.   2010-2011. Produção, purificação, Identificação e caracterização da atividade uma feruloil esterase sobre bagaço de cana-de-açúcar
Descrição: Feruloil esterases (FAEs) são enzimas capazes de extrair resíduos fenólicos esterificados à arabinoxilanos, as principais hemiceluloses da cana-de-açúcar. Nesta pesquisa uma FAE de Penicillium funiculosum foi expressa, purificada e caracterizada e será empregada para reduzir o grau de esterificações da biomassa a fim de verificar a relevância destes fenilpropanóides sobre a digestibilidade da parede e eventualmente servir como método para extração de ácido ferúlico e pré-tratamento. O bagaço e a palha de cana-de-açúcar foram submetidos a um pré-tratamento com FAE. Na seqüência iremos digerir a biomassa lignocelulósica com diferentes coquetéis enzimáticos visando produzir ácido ferúlico e testar o efeito da enzima sobre a digestibilidade da biomassa. Por fim, faremos o escalonamento desta metodologia para aplicações industriais utilizando a Planta Piloto para desenvolvimento de processos do CTBE.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Coordenador / Fábio Marcio Squina - Integrante. Financiador(es): Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - Outra.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
26.   2010-Atual. Prospecção e Validação de Atividade em Defensinas Vegetais para Desenvolvimento de Novos Agentes Antimicrobianos
Descrição: Peptídeos antimicrobianos são fundamentais para o sistema imune inato, promovendo uma resposta relativamente rápida do organismo com um custo energético comparativamente menor do que o usado no sistema imune adaptativo dos vertebrados superiores. Tal resposta reflete a estrutura genética e protéica dessas moléculas: codificadas por genes únicos, com tamanho pequeno, carga geral positiva, tolerância a solventes ácidos e orgânicos, estabilidade térmica e ampla atividade biológica. Dentre os peptídeos existentes, destacam-se as defensinas, conhecidas por serem conservadas entre plantas, invertebrados e vertebrados. Defensinas são peptídeos estrutural e funcionalmente relacionados presentes em eucariotos, e maioria das defensinas vegetais conhecidas apresenta atividade antifúngica e anti-bactérias gram-positivas. Apesar do potencial antimicrobiano, poucas defensinas vegetais tem sido isoladas e sua atividade biológica testada, restringindo-se a defensinas de plantas cultivadas e sem atividade antimicrobiana destacada. O projeto pretende estabelecer uma rede para estudos de compostos antimicrobianos a partir de plantas brasileiras, Incluindo isolamento, caracterização estrutural, síntese e avaliação da atividade de defensinas isoladas de seis modelos vegetais, incluindo quatro espécies da flora nativa, testando sua atividade antimicrobiana com vistas ao desenvolvimento de novos fármacos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Coordenador / Ederson Akio Kido - Integrante / Valesca Pandolfi - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Semíramis J. H. Monte - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
27.   2010-2012. Resistência a estresse hídrico: gesso de minério associado a silicato de cálcio para cana-de-açúcar
Descrição: Projeto aprovado pelo edital CNPQ 46/2009, faz uma aboradagem do efeito fisiológico do silício e gesso sobre a resistência à seca e produtividade da cana-de-açúcar.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Laurício Endres.
28.   2010-2011. Sistema para produção de proteínas recombinantes
Descrição: No ano de 2005 a produção brasileira de bagaço de cana-de-açúcar foi de 106.470 milhões de toneladas. A utilização deste resíduo lignocelulósico para produção de etanol é um processo viável, porém, requer uma mistura de grande quantidade de enzimas necessárias a hidrólise desse material para obtenção de açúcares fermentáveis. O fungo filamentoso Trichoderma reesei (T. reesei) apresenta uma eficiente maquinaria de secreção que poderia ser utilizada para produção em larga escala de proteínas homólogas ou heterólogas com aplicação industrial. Nossa proposta visa construir um sistema para produção de enzimas em larga escala, por meio da identificação, substituição ou modificação de promotores de T. reesei com capacidade de dirigir a alta produção e eficiente secreção de enzimas envolvidas na degradação de biomassa. A geração de cepas mutantes de T. reesei com potencial utilização industrial permitirá produzir em larga escala as enzimas necessárias para hidrólise da biomassa com conseqüente diminuição de seu custo, favorecendo a disseminação da utilização de biomassa como fonte para biocombustíveis.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) . Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Coordenador / Laura Correia Villela - Integrante / Bruno Rodrigues Marques - Integrante / Gabriel Stephani de Oliveira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
29.   2010-2011. SÍNTESE DE ALQUILBENZENOS VIA CATÁLISE HOMOGÊNEA / HETEROGÊNEA PELO PROCESSI DE ALQUILAÇÃO DO BENZENO UTILIZANDO ÓLEOS FINOS LINEARES E / OU RAMIFICADAS NA FAIXA DE C6 A C12
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): MSRIBEIRO ENGENHARIA LTDA - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
30.   2010-Atual. Uso da abordagem de biologia de sistemas para desenvolver um modelo de funcionamento em plantas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
31.   2010-Atual. Variação alélica em cana de açúcar: analise da meiose num organismo autopoliploid
Descrição: O projeto visa definir a variacao allelica em loci unicos do genoma polyploid da cana de acucar para avaliar a evolucao de genomas autopoliploids. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador / Marie-Anne van Sluys - Integrante / Anete Pereira de Souza - Integrante / Del Bem, L. E. V. - Integrante / Berges, Helene - Integrante / Mariane de Mendonça Vilela - Integrante / Augusto Franco Garcia - Integrante.
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.
32.   2010-Atual. vassoura-de-brucha
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador / F Aragão - Integrante / Caribé dos Santos, A.C. - Integrante / Pirovani, C.P. - Integrante / Fátima Cerqueira Alvim - Integrante / Júlio C M Cascardo - Integrante / Karina Gramacho - Integrante / Fabienne Micheli - Integrante / marcelo porto bemquerer - Integrante / amura vianna prates - Integrante / José Luis Pires - Integrante / Carlos Blocj junior - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.

2009

1.   2009-Atual. (Bioen/Pronex) Topochemistry, porosity and chemical composition determining succesfull enzymatic sacharification of sugar cane bagasse
Descrição: Desenvolver um novo conceito para a sacarificação dos polissacarídeos do bagaço de cana-de-açúcar baseado na hidrólise enzimática de uma nova geração de plantas com conteúdo reduzido de lignina. O objetivo é preparar modelos de bagaço com diferentes teores de lignina através de um método de deslignificação seletiva. Com estes modelos, serão estudados porosidade, conteúdo e distribuição da lignina na parede celular para se identificar as características superficiais do material que restringem a hidrólise enzimática. A hipótese do projeto é que estas plantas com conteúdo reduzido de lignina possam ser pré-tratadas em condições mais brandas, gerando menos produtos de degradação e menores perdas de carboidratos. Dados obtidos neste estudo serão validados utilizando-se plantas geneticamente modificadas apresentando menor teor de lignina. Valor: R$ 516.320,53 e US$238,568.34. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / André Ferraz - Integrante / Marcio Henrique Barbosa - Integrante / Pedro Fardin - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
2.   2009-2012. (UNIVERSAL 2009) Estudos Moleculares, Estruturais e Funcionais de Enzimas Ligno-Celulolíticas dos Fungos Trichoderma harzianum e Phanerochaete chrysosporium, com Potencial na Transformação Enzimática da Biomassa
Descrição: Projeto Universal CNPq Edital 14/2009, No. 471834/2009-2. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
3.   2009-2012. : CARACTERIZAÇÃO DO PROTEOMA DA PAREDE CELULAR PRIMÁRIA DE CANA-DE-AÇÚCAR
Descrição: As proteínas são constituintes essenciais das paredes celulares vegetais; estando envolvidas em modificações dos componentes da parede, em sua estrutura, sinalização e interação com proteínas da membrana plasmática na superfície celular. O proteoma da parede celular vegetal é menos caracterizado do que os proteomas subcelulares. Enquanto os dados quanto ao tamanho e à complexidade do genoma ainda estão sendo obtidos, a combinação de ferramentas experimentais e computacionais está rapidamente ampliando o catálogo de proteínas de parede conhecidas, sugerindo uma inesperada localização extracelular de outros peptídeos e fornecendo a base para explorações da estrutura e função da parede celular. Neste projeto de doutorado, pretende-se isolar e seqüenciar as proteínas da parede celular primária de cana-de-açúcar, Saccharum spp, a fim de se estabelecer quais proteínas são encontradas nas paredes de cana, se existem proteínas desconhecidas, e realizar a genética reversa dessas proteínas, já que os ESTs (etiquetas de seqüências transcritas) da cana-de-açúcar estão disponíveis no banco mundial (NCBI) para identificação das proteínas. Uma primeira etapa referente ao isolamento de proteínas da parede celular de células em suspensão de cana foi realizada, sendo finalizada uma das metodologias. Este sub-projeto é de especial importância, já que a utilização da cana-de-açúcar para fabricação de etanol está em franco processo de expansão devido às suas vantagens sócio-ambientais em comparação ao petróleo. Com isso, o projeto visa aumentar o conhecimento sobre a biossíntese dos componentes da parede celular, componentes chave do processo de produção de etanol a partir do bagaço da cana. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Carlos Alberto Labate - Coordenador / Maria Juliana Calderan Rodrigues - Integrante. Financiador(es): INCT de Biotecnologia para o Bioetanol - Auxílio financeiro.
Membro: Carlos Alberto Labate.
4.   2009-Atual. A alelopatia a serviço da agricultura no Paraná: Estudos laboratoriais e no campo
Descrição: A proposta deste projeto é investigar os mecanismos das interações alelopáticas e o modo de ação dos aleloquímicos que possam estar implicados nas interferências entre espécies utilizadas em sistema de rotação/sucessão com a soja. Assim, o projeto tem por objetivos: 1) avaliar os efeitos de palhadas de diferentes plantas, cultivadas em sistema de rotação/sucessão com a soja; 2) identificar as espécies implicadas nas interações alelopáticas com a soja; 3) obter extratos (aquoso e orgânico) e avaliar seus efeitos sobre a germinação e variáveis fisiológicas e bioquímicas da soja, visando a elucidação de seus possíveis modos de ação, e 4) identificar os possíveis aleloquímicos presentes nas palhadas. Para isto, experimentos são desenvolvidos em duas etapas: em casa de vegetação e em laboratório. Determinações da germinação, crescimento, fotossíntese, viabilidade celular, condutividade elétrica e medidas das atividades de enzimas relacionadas à lignificação das raízes são realizadas. As metodologias empregadas envolvem fotometria, espectroscopia no infravermelho, espectroscopia de massa, ressonância magnética nuclear e cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Os tratamentos estatísticos são efetuados com o programa Sisvar. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes Lucio Ferrarese - Integrante / Daniele Iara Lucca Zanardo - Integrante / Emy Luiza Ishi Iwamoto - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante / Anderson Ricardo Soares - Integrante / Rita de Cássia Siqueira-Soares - Integrante / Rogério Barbosa de Lima - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação Araucária - Auxílio financeiro / Ministério da Ciência e Tecnologia - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 6 / Número de orientações: 8
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
5.   2009-2009. Alexander Golubev - St. Petesburg Nuclear Physics Institute/Russian Academy of Sciences - Russia
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
6.   2009-2010. Análise dos mecanismos de tolerância a seca em cana-de-açúcar através do uso da análise micro-transcriptômica e metabôlomica
Descrição: Edital Fapesp/Fapemig 2008-Etanol, processo EDT 1572. Título: Análise dos mecanismos de tolerância a seca em cana-de-açúcar através do uso da análise micro-transcriptômica e metabôlomica (Coordenador: Marcelo Ehlers Loureiro; Vice-Coordenador: Marcio Henrique Barbosa) Valor total financiado: R$ 280.578,10. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Marcio Henrique Barbosa - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Werner Camargos Antunes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
7.   2009-2011. Análise dos mecanismos de tolerância à seca em cana-de-açúcar através do uso da análise transcritômica e metabolômica
Descrição: A seca é um dos principais estresses que reduzem a produtividade da cana-de-açúcar e a produção de variedades tolerantes não só representa ganhos econômicos como contribui para a sustentabilidade dos canaviais. A base genética da tolerância à seca ainda é pouco conhecida. Uma nova forma de regulação mediada por micro RNAs (miRNA) foi recentemente descrita como um componente importante e decisivo no desenvolvimento vegetal e na modulação da resistência aos mais diversos estresses. O objetivo é a identificação da regulação regulação gênica mediada por miRNA durante o estresse hídrico e correlacioná-la com a tolerância à seca observada em algumas variedades de cana-de-açúcar. Serão produzidos chips de DNA contendo miRNA de cana e de outras espécies que serão hibridados com amostras de RNA de cana-de-açúcar de variedades contrastantes para a tolerância à seca. Em paralelo, a equipe da UFV realizará ensaios de metaboloma nas mesmas amostras que serão empregadas na presente proposta. Assim, um segundo objetivo da proposta é integrar os dados de expressão gênica e alterações no metabolismo da planta. Esta sinergia contribuirá para um salto qualitativo na compreensão dos mecanismos de tolerância à seca em cana-de-açúcar. Valor financiado: R$ 403.443,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
8.   2009-2011. Análise molecular da variabilidade patogênica de Puccinia melanocephala em diversas regiões produtoras de cana-de-açúcar no Brasil.
Descrição: Entre as doenças que trazem preocupações e podem causar prejuízos no setor canavieiro em todo o Brasil, destaca-se a ferrugem ou sugarcane rust, causada pelo fitopatógeno Puccinia melanocephala H. P. Sydow. Essa doença ocorre em todas as regiões canavieiras do mundo, desde a Ásia e a África, de onde o complexo "Sacharum spp." é originário, até as Américas e Oceania. No Brasil, a ferrugem foi detectada, pela primeira vez em São Paulo em 1986. A melhor forma de controle desta doença é o plantio de cultivares resistentes, pois, o uso de fungicidas não é prático e nem econômico. Desde o primeiro surgimento no Brasil, a ferrugem tem sido mantida sob controle, com grande parte das cultivares apresentando resistência. Entretanto, o surgimento da ferrugem tem sido relatado em regiões não tradicionais de cultivo como, por exemplo, no oeste da Bahia e no estado de Goiás. O conhecimento acerca da estrutura populacional de P. melanocephala é necessário para desenvolver estratégias satisfatórias no controle desta doença e no desenvolvimento de cultivares resistentes. As diferenças e similaridades entre isolados podem ser avaliadas por meio de microssatélites e os dados podem ser usados para monitorar a composição de grupo de isolados nas populações do patógeno. Este trabalho tem como objetivo desenvolver um banco enriquecido em locos microssatélite para P. melanocephala e correlacionar a diversidade genética e patogênica deste fitopatógeno.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Silvana Aparecida Creste Dias - Integrante / Rafael Fávaro Peixoto Junior - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
9.   2009-Atual. AVALIAÇÃO DE METODOLOGIAS ANALÍTICAS E MICROBIANAS DE BIOMASSAS PARA PROCESSO DE CONVERSÃO DE ETANOL A PARTIR DE RESÍDUOS LIGNOCELULÓSICOS
Descrição: As biomassas residuais são fontes renováveis de produção de energia em escala suficiente para desempenhar um papel expressivo no desenvolvimento de programas de energias renováveis e na criação de uma sociedade ecologicamente mais consciente. Embora seja uma fonte de energia primitiva, seu amplo potencial ainda precisa ser explorado. Depois de um longo período de negligência, o interesse pela biomassa como fonte de energia renasce e os novos avanços tecnológicos sinalizam que o uso de matéria-prima renovável pode tornar-se mais eficiente e competitiva. O Brasil é pioneiro no ressurgimento de sistemas de energia da biomassa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Roberto Nobuyuki Maeda - Integrante / Danielle da Silveira dos Santos - Integrante. Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.
Membro: Nei Pereira Junior.
10.   2009-2013. Avaliação dos possíveis efeitos alelopáticos de plantas indesejáveis sobre a soja
Descrição: Reduzir os riscos ambientais para a saúde dos seres humanos e dos animais, decorrentes do uso de produtos químicos sem reduzir o nível de produção dos alimentos é, sem dúvida alguma, um dos grandes desafios da moderna agricultura. Estratégias com base na alelopatia podem contribuir para este ideal de uma agricultura sustentável. As ações dos aleloquímicos podem ser um dos fatores a serem considerados na rotação de culturas, nas práticas de plantio direto e no controle de plantas indesejáveis (daninhas). A proposta deste projeto é investigar os mecanismos das interações alelopáticas e o modo de ação dos aleloquímicos que possam estar implicados nas interferências entre espécies utilizadas em sistema de rotação/sucessão com a soja. Assim, o projeto tem por objetivos: 1) avaliar os efeitos de palhadas de diferentes plantas, cultivadas em sistema de rotação/sucessão com a soja; 2) identificar as espécies implicadas nas interações alelopáticas com a soja; 3) obter extratos (aquoso e orgânico) e avaliar seus efeitos sobre a germinação e as variáveis fisiológicas e bioquímicas da soja, visando a elucidação dos seus possíveis modos de ação, e 4) identificar os possíveis aleloquímicos presentes nas palhadas. Para isto, experimentos serão desenvolvidos visando as determinações da germinação, crescimento, fotossíntese, viabilidade celular, condutividade elétrica e medidas das atividades de enzimas relacionadas à lignificação das raízes serão realizadas. As metodologias empregadas basicamente envolvem espectrofotometria e cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Adicionais técnicas cromatográficas, de espectroscopia e de ressonância magnética nuclear poderão ser aplicadas visando a caracterização dos aleloquímicos. As análises estatísticas serão efetuadas pelo programa Sisvar.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (5) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes L Ferrarese - Integrante / Graciene de Souza Bido - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante / Anderson Ricardo Soares - Integrante / Gisele Adriana Bubna - Integrante / Rita de Cássia Siqueira-Soares - Integrante / Ana Paula Ferro - Integrante / Angela Valderrama Parizotto - Integrante. Financiador(es): Fundação Araucária - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 9 / Número de orientações: 6
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
11.   2009-2010. Caracterização do ângulo de microfibrilas em monostelos do colmo de cana-de-açúcar
Descrição: O ângulo de inclinação das microfibrilas em relação à fibra tem sido correlacionado com a resistência à tensão em madeira. Este projeto visa determinar a distribuição do ângulo das microfibrilas de celulose em monostelos (fibras) do colmo de cana-de-açúcar. Colmos de cana-de-açúcar de diferentes cultivares serão medidos (diâmetro, comprimento), identificados e seccionados. Segmentos de monostelos serão isolados do ápice , meio apical, meio basal e base do colmo. A distribuição do ângulo das microfibrilas nos monostelos está sendo determinada a partir de difração de raios-X.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Carlos Driemeier - Coordenador. Financiador(es): Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - Outra.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
12.   2009-2011. Caracterização Genética, Populacional e Epidemiológica de Amostras Clínicas e Ambientais de Giardia duodenalis coletadas em cidades das regiões Norte, Nordeste e Sudeste
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Ana Carolina Fonseca Lindoso Melo - Integrante / Maria Helena S. S. de Britto - Integrante / Regina Maura Bueno Franco - Integrante / Marcelo Otake Sato - Integrante.
Membro: Anete Pereira de Souza.
13.   2009-2013. Centro de Projetos Biológicos e Industriais para Biocombustíveis - CeProBIO
Descrição: O CeProBIO está propondo um modelo industrial de produção de etanol celulósico que seja passível de integração ao arranjo produtivo já existente em regiões desenvolvidas do Brasil ou, alternativamente, que possa ser implementado em áreas cuja infra-estrutura agro-industrial esteja ainda em fase de implementação e consolidação. Este modelo inovador prevê a diminuição drástica e eventual eliminação total da necessidade de qualquer insumo de origem fóssil através do reaproveitamento dos resíduos, efluentes e emisões na geração de energia e produção de produtos químicos de valor.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Integrante / Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
14.   2009-2010. CNPq Edital 292008 CTAgrPlant,
Descrição: pesquisadora colaboradora sob coordenação do Prof. Dr. Mario Luiz Teixeira de Moraes FEIS, UNESP, Campus de Ilha Solteira, SP, com o projeto: Programa de Melhoramento em Myracrodruon urundeuva (F.F. M.F. Allemão).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / Selma Maria Buzzetti de Moraes - Integrante / Marcela A. Moraes - Integrante / Mario Luiz Teixeira de Moraes - Coordenador.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
15.   2009-Atual. CNPq Edital dos Institutos Nacionais de Ciência, Tecnologia e Inovação, pesquisadora colaboradora, sob coordenação do Prof. Dr. Marcos Buckeridge, IB-USP, com o projeto Bases tecnológicas para a produção de etanol de cana-de-açucar , processo 574
Descrição: O Instituto Nacional de Biotecnologia para o Bioetanol (INCT), tem como proposta unir um conjunto de 30 laboratórios de 5 estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir da cana-de-açúcar no Brasil. O laboratório da Dra. Maria de Lourdes Polizeli vem trabalhando na prospecção de fungos filamentosos capazes de produzir enzimas que degradam a parede celular de plantas, resíduos agrícolas, de florestas e industriais. Enzimas do sistema xilanolítico, celulolítico, lignolítico, amilolítico e pectinolítico estão sendo purificadas e caracterizadas em nível estrutural e molecular. Além disso, as enzimas hidrolíticas estão sendo aplicadas no biobranqueamento de polpas de celulose e em ração animal. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (5) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / MarcosSilveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
16.   2009-2010. Desenvolvimento de novas estratégias de monitoramento biológico da presença de arsênio no meio ambiente e avaliação de sua genotoxidade
Descrição: Edital 034/2007 Edital MEC/CAPES e MCT/CNPq: Programa Nacional de Pós-Doutoramento. Bolsa concedida a Andre Rocha Campos Narvaes. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
17.   2009-2011. Engenharia de Enzimas Multifuncionais para a Hidrólise de Hemicelulose
Descrição: Visando o desenvolvimento de enzimas com uso potencial nas indústrias de papel e celulose, bioenergia e alimentos, pretendemos desenvolver o conhecimento e as metodologias necessárias para fundir enzimas que degradam lignocelulose e criar enzimas multifuncionais com combinações catalíticas não encontradas na natureza. Alem de ter funcionalidades com potencial aplicação na indústria, analise das novas enzimas fornecerão informações para a compreensão das relações de estrutura-função destas proteínas que será indispensável no desenho de enzimas para o catalise de reações específicas na biorefinaria de biomassa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
18.   2009-Atual. Epigentic Variation and its Impact on Adaptation and Evolution
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador / Renato Vicentini - Integrante / Amanda Bortolini Silveira - Integrante / DEL BEM, LUIZ EDUARDO VIEIRA - Integrante / LOUDET, OLIVIER - Integrante / COLOT, VINCENT - Integrante / Raphael Ricon de Oliveir - Integrante.
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.
19.   2009-Atual. ESTUDOS MOLECULARES, ESTRUTURAIS E FUNCIONAIS DE ENZIMAS LIGNO-CELULOLÍTICAS DOS FUNGOS Trichoderma harzianum e Phanerochaete chrysosporium, COM POTENCIAL NA TRANSFORMAÇÃO ENZIMÁTICA DA BIOMASSA
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
20.   2009-2013. FUNCTIONAL ANALYSIS OF THE TRANSCRIPTION FACTOR XINR INVOLVED IN REGULATION OF TRANSCRIPTION OF CELLULASES - AND HEMICELLULASES-ENCONDING GENES IN ASPERGILLUS NIGER
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Iran Malavazi - Integrante / Marcia Eliana da Silva Ferreira - Integrante.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
21.   2009-2012. Gene expression profile and carbon isotope discrimination in sugarcane genotypes under water déficit stress (BIOEN-FAPESP)
Descrição: Sugarcane (Saccharum spp.) is major crop in Brazil as feedstock for the sugar and ethanol industries. To attend the increasing ethanol demand from external and internal markets, the sugarcane industry must expand the cultivated area, incorporating land from cerrado and pastures from Southeast and Western Central Brazil, characterized by a dry winter with a prolonged water deficit period. For the last 10 years, more than 80 sugarcane cultivars have been released in Brazil, but few with yield potential to be cultivated in drought-prone environments. Mechanisms of response and tolerance to water stress have been investigated in model plant species, whose genes were classified into two groups: one includes proteins that act directly on dehydration tolerance, and the other comprises regulatory genes. Previous work on sugarcane response to water deficit stress detected similar induced regulatory genes to the ones from rice and Arabidopsis, but structural genes associated with stress response have not been evaluated. Elucidation of sugarcane mechanisms involved in tolerance to water deficit would be valuable to develop cultivars productive and adapted to drought-prone regions, which could potentially assist in the sustainability of the sugarcane industry in these marginal regions. This proposal intends to establish an efficient and dependable method to evaluate water deficit stress in sugarcane by evaluation of several protocols, to enable the analysis of gene expression profiles between genotypes tolerant or sensitive to water stress using microarrays, followed by validation of differential gene expression by quantitative amplification of reversed transcripts (RT-qPCR). Analyses of marker gene expression (drought- or ABA-related structural or regulatory genes) will be conducted using RT-qPCR to validate the observed physiological responses. At the same time, carbon isotope discrimination () will be tested and optimized to evaluate the genetic diversity available. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Ferreira, Renato Rodrigues - Integrante / Mariana Belloti - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
22.   2009-Atual. Genomic-assisted breeding of sugarcane: using molecular markers for understanding the genetic architecture of quantitative traits and to implement marker assisted selection
Descrição: Breeding programs have been successfully over the years in the generation of new improved sugarcane varieties (Saccharum spp.), which are more productive and resistant to pests, diseases and abiotic stresses. These varieties are of central importance for sugar and ethanol production. However, breeding process takes about 10 to 15 years to release new varieties, mainly because of the difficulty to correctly identify good genotypes on the fields, since there is strong influence of environmental conditions. This process could be speed up with the development and the use of genetic markers, which are genomic regions that could be observed (evaluated) on each individual. By studying the segregation of those markers, it is possible to estimate the genetic distances between them, resulting in the so called genetic maps. After, linkage studies are performed in order to associate genotype (based on molecular traits) and phenotypes (traits that are evaluated on field conditions, such as sugar and fiber content). If the genomic regions are strongly linked with genes that control agronomic traits, they could be used for help the breeding process. Since most of the traits of agronomic and economic importance are quantitative (controlled by many loci), the major goal is to identify genomic regions associated with such traits, named quantitative trait loci (QTL). The use of markers in genetic studies, including QTL mapping, has allowed important progress in the knowledge of the genomic structure, genetics and evolution of sugarcane. In this project, new markers will be developed and used for QTL mapping. A new class of very useful markers called genic molecular markers (GMMs) will be developed and used. This kind of marker (EST-SSRs and SNPs), also named Functional Markers, will be obtained from expressed sequences from the SUCEST data bank, and sequencing genes from BAC clones. BAC libraries will be constructed using DNA from parental sugarcane varieties employed in the biparenta. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (6) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Integrante / Marcos Landell - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante / Roland Vencovsky - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Anete Pereira de Souza - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 36 / Número de orientações: 6
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
Descrição: Breeding programs for the generation of new improved sugarcane varieties, could be speed up with the development and use of genetic markers that are PCR-specific and strongly linked to genes that control the desired agronomic traits. The use of genetic markers has allowed important progress in the knowledge of the genomic structure and genetics of sugarcane. In this work we propose to develop and use for genetic studies a new class of very useful markers called genic molecular markers (GMMs). The GMM markers (EST-SSRs and SNPs), which also can be called Functional Markers, will be obtained in this work from EST sequences (SUCEST data bank) and from gene sequences from BAC clones. Five hundred EST-SSRs have already been developed and characterized in our previous work. In order to identifying and mapping SNPs, BAC libraries will be constructed using DNA from parental sugarcane varieties employed in the biparental crosses. In order to identify and evaluate the contribution of these genomic regions for breeding programs, the GMMs developed will be used for mapping biparental crosses, for constructing association maps and also for mapping QTLs. The allelic variation for 30-40 economically important genes, present in each BAC libraries from parental varieties will be evaluated. For associating the allelic variation to expression profile, the sequence polymorphisms and expression profile for the alleles from each gene will be determined. With the aim of helping the genetic mapping and to bring a better understanding of the sugarcane genomic structure, the BAC clones identified having different alleles from a specific gene of interest will be used for in situ hybridization, for the identification of the homeologous chromosomes set from each homologous group. For contributing to the sugarcane sequencing project developed in Bioen program a representative SP 80-32-80 BAC library (10-15 x genome coverage) will be constructed.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Roland Vencovsky - Integrante / Augusto Franco Garcia, Antonio - Integrante / Eliana Formi Martins - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 2
Membro: Anete Pereira de Souza.
23.   2009-Atual. Genomica Funcional de Genes Fotossintéticos em Cana-de-açúcar
Descrição: Sugarcane transgenics are particularly obligatory for traits that are intractable to breeding, especially those requiring exogenous genes or temporal expression or suppression of endogenous genes. Increase of sucrose content in sugarcane is a main point to be addressed, and is directly dependent of increasing photosynthetic efficiency. The present proposal aims to develop efficient methods of sugarcane in vitro culture as well as methods of nuclear and chloroplast transformation, applying them to modify photosynthetic genes and to incorporate new photosynthetic traits in productive Brazilian germplasm. This proposal counts also with the expertise of national and abroad scientific groups joined as collaborators. Genes related to photosynthesis will be searched in the SUCEST database and they will be main targets for transformation in conjunction with already well known photosynthetic genes. The sugarcane photosynthetic efficiency is expected to be improved upon manipulation of those photosynthetic genes, generating novel knowledge as well as leading to increased synthesis of triose phosphates and, ultimately, increased sucrose content in the transgenic varieties. In addition, this transgenic sugarcane research will be integrated to the other BIOEN sub-projects and, therefore, it will encompass genes associated to photosynthesis and cell wall biosynthesis regarding high [CO2] integrated with high temperature and drought. The transformation sugarcane transformation will be based on the development and optimization of in vitro cultures and nuclear genetic transformation via Agrobacterium tumefaciens and biolistic methods, as well as gene transfer to plastids via biolistic. It is expected that the transgenic plants will generate novel knowledge in the sugarcane genetics, biochemistry and physiology and, furthermore, it is anticipated to accomplish significant improvement in specific agronomic and commercial traits, within short time and at reduced cost.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Helaine Carrer - Coordenador.
Membro: Helaine Carrer.
24.   2009-Atual. Genômica de cana de açúcar: elemetos de transposição contribuintes para diversidade gênica, genética e genômica
Descrição: Este projeto está integrado ao programa BioEn-FAPESP. A cana de açúcar é uma das fontes mais importantes para a produção de biocombustíveis no Brasil. Também ocupa posição de destaque no agronegócio do Estado de São Paulo. A produção de biocombustíveis a partir de cana de açúcar é dependente de sacarose como matéria prima. Espera-se que a indústria sucro alcooleira brasileira ganhe em competividade desde que haja um aumento de produtividade (biomassa) garantindo a preservação do meio ambiente evitando-se o uso de novas terras. Aumento de produção de biomassa pode ser atingido através do uso de técnicas que permitam o monitoramento e modulação do metabolismo de sacarose em condições adequadas e restritivas de crescimento da planta, como por exemplo condições de pouca disponibilidade de água. O uso potencial do bagaço como fonte de biomassa é dependente da disponibilização do carbono fixado nos polímeros que constituem a parede celular. O presente projeto tem como objetivo gerar um sequenciamento parcial de duas cultivares de cana de açúcar (R570 e SP80-3280) de modo a subsidiar o desenvolvimento de ferramentes moleculares que poderão auxiliar na compreensão deste genoma híbrido e poliplóide. A descoberta de genes e a identificação das regiões regulatórias envolvidas no metabolismo de sacarose e partição dos esqueletos de carbono na planta são algumas das áres na pesquisa básica que serão beneficiadas pelo presente estudo. Programas de melhoramento também poderão ser beneficiados tendo a cesso a informações moleculares com potencial ao desenvolvimento de marcadores moleculares. Os cultivares modernos de cana de açúcar são híbridos de Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum. Seu genoma monoplóide é estimado em aproximadamente 1Gb comparável em escala aos genomas do milho e do ser humano. Utilizar-se-á uma abordagem combinada de seqüências geradas por pirosequenciamento e pelo método clássico de Sanger de 1000 clones de BAC. Uma coleção de ESTs geradas pelo projeto. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
25.   2009-2012. Identificação, caracterização e alteração da expressão de genes afetando a eficiência da produção de etanol a partir do bagaço da na cana-de-açúcar
Descrição: Edital MCT/CNPq nº 27/2007 Bolsas de Doutorado (Marcelo Loureiro, Coordenador):. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Marco Oliva Cano - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Aristeia de Azevedo - Integrante / Ivo Ribeiro da Silva - Integrante / Jaime Vargas de Mello - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
26.   2009-Atual. INCT - Instituto Nacional de Biotecnologia para o Bioetanol - Genômica funcional e proteômica das respostas da cana-de-açúcar à seca
Descrição: Este projeto visa ampliar o conhecimento sobre o fluxo da informação genética ao fenótipo e aos mecanismos metabólicos/fisiológicos envolvidos na tolerância à seca. Identificar transcritos e peptídeos e os genes codificantes correspondents com expressão contrastante associada ao estresse hídrico. Seleção de genes alvo para uso no melhoramento genético como marcadores funcionais auxiliaries, na transformação genética e outras aplicações biotecnológicas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Valesca Pandolfi - Integrante / Mauro Guida dos Santos - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Pestana-Calsa, Maria Clara - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
27.   2009-Atual. Instituto Nacional De Biotecnologia Para O Bioetanol - INCT BIOETANOL
Descrição: O projeto une um conjunto de 30 laboratórios de cinco estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil. O programa do instituto é focado em cinco centros que definem as principais áreas de pesquisa a serem trabalhadas: 1) Fisiologia Vegetal e Biologia Celular; 2) Expressão gênica e transformação de cana; 3) Melhoramento da cana; 4) Prospecção de fungos e desenvolvimento de enzimas; 5) Caracterização enzimática e engenharia de processos. Os cinco centros têm como foco comum obter informações para desenvolver biotecnologia capaz de obter carboidratos fermentáveis a partir da parede celular de cana de açúcar.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador / Adriane Maria Ferreira Milagres - Integrante / Anete Pereira de Souza - Integrante / Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Carlos Alberto Labate - Integrante / Donato Alexandre Gomes Aranda - Integrante / Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Integrante / Helaine Carrer - Integrante / Igor Polikarpov - Integrante / Marcio de Castro Silva Filho - Integrante / Richard J. Ward - Integrante / Michel Vincentz - Integrante / Marie-Anne Van Slyus - Integrante / Munir S. Skaf - Integrante / Nei Pereira Junior - Integrante / Paulo Seleghim Junior - Integrante / Sandro R. Marana - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
28.   2009-Atual. Instituto Nacional de Ciencia e Tecnologia do Bioetanol
Descrição: O objetivo do INCT é produzir conhecimento científico para embasar a tecnologia do etanol celulósico a partir de cana de açúcar e outros materiais vegetais, informando à sociedade sobre o desenvolvimento do projeto e seus impactos nos níveis social e ambiental. A coordenação do projeto é do prof. Marcos Buckeridge (USP) e o meu laboratório atua na seleção de leveduras fermentadoras de pentoses e otimização do meio de cultura para produção de etanol a partir de hidrolisados lignocelulósicos. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Integrante / Cristina Martini - Integrante / Marcos Buckeridge - Coordenador / Maisa Helena Heluany - Integrante / Ana Ligia Buzolin - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
Descrição: 3) Edital MCT/CNPq/FNDCT/CAPES/FAPEMIG/FAPERJ/FAPESP nº015/2008- Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT)´. Título: Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (Valor Total: R$ 6.200.000,00). (Coordenador: Marcos Buckeridge); Subprojeto: Aplicação da análise metabolômica para a identificação de genótipos que propiciem maior eficiência de produção do etanol celulósico e eficiência do uso da água em cana-de-açúcar , (Coordenador Marcelo Ehlers Loureiro: Valor financiado após os cortes: R$ 229.261,64). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador / Glaucia Souza - Integrante / Igor Polikarpov - Integrante / Gustavo Goldman - Integrante / Maria de Lourdes T. M. Polizeli - Integrante / Antonio Figueira - Integrante / Helaine Carrer - Integrante / Marie Anne VAn Sluys - Integrante.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
Descrição: O INCT do Bioetanol pretende gerar conhecimento basico e tecnológico para otimizar a produção de bioetanol a partir de diversos substratos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Integrante / Marcos Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Renato Rodrigues Ferreira - Integrante / Buckeridge, Marcos S. - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
29.   2009-Atual. Mecanismos de Reconhecimento Molecular dos Receptores Nucleares
Descrição: Edital nº 34/2007- LINHA 3 - Projetos Vinculados a Grupos de Pesquisas 558629/2008-3. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
30.   2009-Atual. Minimização de estresses abióticos e bióticos em cana-de-açúcar pela aplicação de silício. Bolsa PNPD-CAPES
Descrição: Independente do papel que o silício desempenhe na fisiologia das plantas, sabe-se que as gramíneas, como a cana-de-açúcar estão entre as plantas com maior capacidade de assimilação deste mineral que tem sido reconhecido como um importante fator de resistência contra estresse biótipos e abióticos. O projeto tem como objetivo avaliar o efeito de gesso de minério associado a silicato de cálcio na resistência da cana-de-açúcar a estresse abiótico e bióticos. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurício Endres - Coordenador / Vilma Marques Ferreira - Integrante / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Simério Carlos Silva Cruz - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Laurício Endres.
31.   2009-2012. NÚCLEO DE GENÔMICA, PROTEÔMICA E ENZIMOLOGIA DE FUNGOS E BACTÉRIAS ANAERÓBICAS LIGNOCELULOLÍTICOS
Descrição: Pronex. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (4) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Integrante / Carlos R. Félix - Integrante / Marcelo Valle de Sousa - Coordenador / Eliane Ferreira Noronha - Integrante / Carlos André Ornellas Ricart - Integrante / Henrique Kruger - Integrante / Robert Miller - Integrante.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
32.   2009-2011. O papel da via dos fenilpropanóides nas raízes de soja submetidas à ação de compostos alelopáticos derivados do ácido cinâmico
Descrição: Estudos recentes em nosso Laboratório indicam que a redução do crescimento das raízes de soja, pelo ácido ferúlico, está associada à prematura lignificação das paredes celulares, aumento nas atividades de enzimas da via dos fenilpropanóides e aumento no conteúdo de lignina. Para testar a hipótese que a aplicação exógena do ácido cinâmico e seus derivados resulta na canalização destes compostos na via dos fenilpropanóides seguido de aumento dos teores de lignina, e possíveis alterações na sua composição monomérica, associados à redução do crescimento das raízes, nós avaliamos a lignificação e a composição dos principais monolignóis das raízes de soja, tratadas com cada um dos aleloquímicos. Além disso, determinamos as atividades de enzimas relacionadas à via dos fenilpropanóides (PAL, 4CL, CAD e POD), e os teores de H2O2 e de ácidos fenólicos. Para indicar os possíveis pontos de entrada dos aleloquímicos na via metabólica usamos inibidores específicos dessas enzimas. A conclusão principal foi a de que a via dos fenilpropanóides está efetivamente incluída como um dos possíveis modos de ação dos aleloquímicos na soja.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes Lucio Ferrarese - Integrante / Graciene de Souza Bido - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante / Rita de Cássia Siqueira-Soares - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 6 / Número de orientações: 1
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
33.   2009-2010. Obtenção, seqüenciamento e caracterização funcional de bibliotecas de cDNAs completos para o estudo funcional de genes importantes para a produção de etanol celulósico a partir da cana-de-açúcar
Descrição: Edital Fapesp/Fapemig-Etanol 2008, processo EDT 1571. Título: Obtenção, seqüenciamento e caracterização funcional de bibliotecas de cDNAs completos para o estudo funcional de genes importantes para a produção de etanol celulósico a partir da cana-de-açúcar (Coordenador: Marcio Henrique Barbosa, Vice-Coord: Marcelo Ehlers Loureiro. Total financiado: R$ 303.239,32. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Marcio Henrique Barbosa - Coordenador / Glaucia Souza - Integrante.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
34.   2009-Atual. OTIMIZAÇÃO DE CULTIVO DE MICROALGAS PARA OBTENÇÃO DE MATÉRIA-PRIMA EM FOTOBIORREATOR PARA PRODUÇÃO DE BIODIESEL
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Petróleo Brasileiro S.A. - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
35.   2009-Atual. Peter S Reinach - State University of New York - Estados Unidos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
36.   2009-Atual. Projeto de Cooperação Científica
Descrição: Projeto de cooperação científica entre o Lab. de Enzimologia da Universidade de Brasília e o Laboratory of Renewable Resources Engineering/University of Purdue/USA, sob as coordenações dos professores Edivaldo Ximenes e Michael Ladisch, respectivamente. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
37.   2009-2011. Prospecção e utilização de fungos celulolíticos e hemicelulolíticos para hidrólise enzimática de bagaço de cana-de-açúcar
Descrição: projeto aprovado dentro da chamada pública MEC/MDIC/MCT 01/2007. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Marcelo Valle de Sousa - Integrante / Carlos André Ornellas Ricart - Integrante / Ildinete Silva Pereira - Integrante / Marcio José Poças Fonseca - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
38.   2009-2011. Proteômica da resposta à seca e salinidade em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
Descrição: Identificação de peptídeos e genes codificantes com expressão diferencial potencialmente associada a respostas fisiológicas e moleculares ao estresse por seca e ou salinidade, visando seleção de marcadores funcionais úteis aos programas de melhoramento genético e a estratégias de transgenia para aumentar a tolerância a fatores abióticos limitantes da produtividade em cana-de-açúcar, especialmente na região Nordeste.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Mauro Guida dos Santos - Integrante / Maria Clara Pestana-Calsa - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
39.   2009-Atual. Structure and Function of Enzymes and Auxiliary Proteins from Trichoderma, Active in Cell-Wall Hydrolysis
Descrição: Projeto Temático. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
40.   2009-Atual. Sustainable bioenergy sugarcane breeding and cultivar development
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Silvana Aparecida Creste Dias - Integrante / Andrade Landell, Marcos Guimarães - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
41.   2009-Atual. THE RED SEA MARINE GENOMICS PROJECT: AN ENVIRONMENTAL GENOMICS APPROACH FOR THE STUDY OF MARINE ORGANISMS IN THE RED SEA
Descrição: O projeto visa a identificação de microorganismos marinhos presentes em diversos niveis de profundeza no mar vermelho, utilizando metagenomica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (6) . Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Integrante / Hamza El-Dorry - Coordenador / Rania Siam - Integrante. Financiador(es): The American University in Cairo - Cooperação.
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
42.   2009-2011. US-Brazilian Rice Ionomics Collaborative , DCC-PGR proposal, US National Science Foundation
Descrição: The activities proposed here to occur in collaboration with the laboratories of the Dr. David Salt, Dr. Mary Lou Guerinot and Dr. Shannon Pinson involve the use of equipments or expertise not available in Brazilian research groups, and include research activities complementary to other ones already in course in our labs. Whereas in the Brazilian side, this collaboration will improve the research quality and data produced, the American research teams will benefit from new rice variability, and from contrasting environmental conditions important for QTL identification and mapping. Additionally, comparative genomics and the identification and characterization of Arabidopsis mutants from genes homologous to rice QTL components will be performed synergistically between the American and Brazilian teams, speeding up the functional characterization of genes important for ionic homeostasis in plants. In other hand, Brazilian PhD students will have an exceptional opportunity to complement their graduate education working in the top world leading research groups. Both country research teams consider that this proposal opportunity represents a key action of reciprocity in this collaboration and will further support this research collaboration already in course. This, in turn, would allow the consolidation of a long-term partnership among participating laboratories. The success of this proposal will open the door to other opportunities to further get grants available at CAPES (Brazilian Ministry of Education) and CNPq fellowship agencies to support the expenses of long term Brazilian PhD student s research activities in American partner s laboratories. Further opportunities in the American side will be also explored, and includes NSF/IGERT and NSF/PIRE proposals.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Antonio Costa Oliveira - Integrante / Janette Fett - Integrante. Financiador(es): The National Science Foundation - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.

2008

1.   2008-2010. A Utilização de Misturas Enzimáticas na Hidrólise de Resíduos Agrícolas
Descrição: A utilização de processos biotecnológicos alternativos, como a biocatálise industrial, tem um papel fundamental na implementação de tecnologias sustentáveis, contribuindo para a redução dos problemas de poluição ambiental, além de trazer outros benefícios processuais. A utilização de enzimas é atrativa para propósitos industriais devido a sua alta especificidade e eficiência no processo de catálise, visto que a catálise biológica leva à transformação de reagentes comparativamente não tóxicos em produtos relativamente puros sob condições amenas, tendo como conseqüência uma redução nos custos do processo. A implementação bem sucedida de enzimas como biocatalizadores industriais requer a disponibilidade de enzimas com alta atividade, especificidade e estabilidade . A utilização de enzimas em processos industriais pode contribuir para limitar o uso de altas temperaturas, solventes orgânicos e extremos de pH, enquanto que, ao mesmo tempo, aumenta a especificidade das reações, a pureza do produto, além de reduzir o impacto ambiental. Além disso, a crescente utilização de enzimas na indústria é dependente de uma constante inovação visando a uma melhor performance e redução de custo. Os fungos escolhidos, Aspergillus niger, Trichoderma longibrachiatum, Penicillium corylophilum, Acrophialophora nainiana e Trichoderma harzianum para este projeto são produtores de enzimas com um amplo espectro de aplicações tecnológicas nas indústrias têxtil, alimentícia, biocombustível, agropecuária, de celulose e papel, dentre outras. Particularmente, A. niger também apresenta aplicações em processos de bioremediação, enquanto que T. harzianum é potente agente de controle biológico de pragas de plantas. Resultados obtidos anteriormente no Laboratório de Enzimologia da UnB, demonstraram que as espécies de fungos em questão produzem alta atividade específica de celulase, pectinase e hemicelulase quando crescidas em substratos lignocelulósicos, possuindo portanto grande potencial de aplicaça. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Carlos André Ornellas Ricart - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio a Pesquisa do DF - Auxílio financeiro.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
2.   2008-2013. Análise molecular da resistência genética do cacaueiro (Theobroma cacao L.) à vassoura-de-bruxa (agente causal Moniliophthora perniciosa)
Descrição: A vassoura-de-bruxa, causada pelo basidiomiceto Moniliophthora perniciosa, consiste numa importante enfermidade do cacaueiro (Theobroma cacao). As fontes de resistência já caracterizadas possuem regiões genômicas associadas distintas, e exibem diferentes dinâmicas de expressão de genes de defesa. Para dissecar a resposta de defesa utilizando genótipos de cacaueiro resistentes ou suscetíveis, inoculados ou não com isolados de diversos biótipos, pretende-se avaliar a expressão de genes que codificam receptores do tipo LRR-kinase; componentes das cascatas de resposta subseqüentes; enzimas da síntese de jasmonato, etileno, e salicilato; enzimas da síntese de flavonóides e proteínas pathogenesis-related baseando-se em seqüências disponíveis nas bibliotecas da interação ou por amplificação de regiões conservadas. As análises do padrão de expressão gênica e de polimorfismos de base única (SNPs) em indivíduos de população segregante para resistência serão empregadas para localizar esses genes associados à defesa em relação à QTLs conhecidos. A região promotora de genes induzidos pela infecção será caracterizada e analisada funcionalmente, após a otimização da transformação genética do cacaueiro. A cultivar Micro-Tom de tomateiro, modelo genético miniatura suscetível ao biótipo-S de M. perniciosa, será utilizada para investigar o papel dos hormônios na patogênese empregando mutantes disponíveis, e também para análise funcionais de genes candidatos associados à defesa por transgenia. Isolados de M. perniciosa da Amazônia serão classificados utilizando microssatélites e caracterizados de acordo com agressividade a genótipos diferenciais de cacaueiro, e terão seus prováveis genes de virulência e/ou patogenicidade analisados para polimorfismo e para expressão in vitro em condição de estresse. Proteínas de parede celular do fungo já identificadas serão expressas de forma heteróloga e seus efeitos na ativação da resposta de defesa serão avaliados. Portanto, pretende demonstrar que. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Gildemberg Amorim Leal Junior - Integrante / Angela Sanche Artero - Integrante / Lázaro Eustáquio P. Peres - Integrante / Albuquerque, Paulo S. B - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 4
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
3.   2008-2011. Aumento da produtividade da cana-de-açúcar através da promoção do crescimento vegetal, resistência a estresses bióticos e abióticos e fixação biológica de nitrogênio - SuperSAGE
Descrição: Este projeto visa aumentar a produtividade do cultivo de cana-de-açúcar em diversas regiôes do Brasil utilizando-se de tecnologias avançadas para incrementar o crescimento vegetal, aumentar a resistência a estresses bióticos e abióticos, otimizar a fixação biológica de nitrogênio (e potencialmente a fotossíntese e o teor de sacarose). Visa também estabelecer colaborações entre Usinas e grupos de pesquisa multidisciplinares para implementação de aplicações biotecnológicas na cultura.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Coordenador / Laureen Michele Hollou-Kido - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Gunther Kahl - Integrante / Mauro Guida dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Cooperação / Universidade Federal do Rio de Janeiro - Cooperação / Universidade Federal do Rio Grande do Sul - Cooperação / Universidade Federal do Paraná - Cooperação / Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro - Cooperação.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
4.   2008-2010. Caracterização da interação entre a sinalização em resposta ao ácido abscísico e óxido nítrico com o transporte e metabolismo da sacarose no controle dos movimentos estomáticos
Descrição: Segundo a FAO, as principais estratégias para assegurar a satisfação da demanda crescente de alimentos a nível mundial estão baseadas no desenvolvimento de variedades de plantas com menor demanda de água, e/ou com maior tolerância à seca, e a importância destas estratégias também é ressaltada quando analisa-se as previsões de redução da produtividade agrícola a nível mundial e, especialmente no Brasil, decorrentes das mudanças climáticas associadas ao aquecimento global. A regulação eficiente do fechamento estomática é parte fundamental do mecanismo de economia hídrica e da tolerância a seca das plantas, e esta regulação ocorre através de uma integração de respostas a vários sinais ambientais e internos da planta. Embora vários destes sinais tenham sido identificados, nosso conhecimento de sua integração e significância relativa é ainda incipiente. Embora existam dados de que o metabolismo da sacarose pode ter um papel nos movimentos estomáticos, sua importância relativa em relação a outros estímulos, que também influem nestes movimentos, como ácido abscísico (ABA), óxido nítrico (NO), CO2, umidade do ar e luz, é ainda ou insuficiente, ou indefinida. Em particular, não existem dados na literatura que permitam verificar se existe alguma inter-relação entre o metabolismo e transporte de sacarose e a sinalização em resposta ao ABA ou ao NO nas células-guarda. Baseados em nossos resultados anteriores, pretende-se confirmar, agora com plantas de Arabidopsis e tabaco, que é possível obter-se uma maior abertura estomática com o aumento da atividade sacarolítica, e o fenótipo inverso, com sua redução em células-guarda sem, entretanto, produzir efeitos negativos na taxa fotossintética média. Adicionalmente, evidência adicional da importância da sacarose nos movimentos estomáticos será obtida com a caracterização do efeito da redução da expressão de um transportador da sacarose expresso nestas células em plantas transgênicas. Como a sinalização em resposta ao ABA envolve vá. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Fábio Murilo da Matta - Integrante / Elizabeth Batista Pacheco Fontes - Integrante / Maria M. S. Gomes - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
5.   2008-Atual. Caracterização de Enzimas Celulolíticas e Hemicelulolíticas de Fungos Filamentosos
Descrição: subprojeto do INCT do Bioetanol coordenado pelo Prof. Marcos Buckeridge. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) .
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
6.   2008-2010. Caracterização de populações naturais de Avicennia germinans e de A. schaueriana (Achantaceae) de manguezais do litoral norte brasileiro e análise de zona de hibridação utilizando marcadores microssatélites
Descrição: Os manguezais são considerados um dos ecossistemas tropicais mais ameaçados, estando em um estado tão crítico ou até mesmo mais preocupante quando se compara com os recifes de corais ou com a Mata Atlântica. Há estimativas de que, nos últimos 50 anos, um terço da área mundial com manguezais foram destruídos e, em relação ao Brasil, segundo país em extensão de florestas de mangue, estima-se que, entre 1983 e 1997, 46,4% da área de manguezais tenha sido perdida. Esses ecossistemas apresentam uma baixa diversidade de plantas superiores dominantes, havendo, ao redor do mundo, 34 espécies em cinco gêneros de plantas verdadeiras de mangue . Na realidade brasileira esta diversidade é ainda menor: há apenas seis espécies de árvores de mangue distribuídas em três gêneros. Um destes é o gênero Avicennia que está distribuído, no Brasil, desde o extremo norte do nosso litoral até aproximadamente a Ilha de Florianópolis, em Santa Catarina. Em nosso país, há apenas duas espécies do gênero, A. germinans e A. schaueriana, as quais apresentam distribuições distintas, havendo uma região de simpatria no litoral norte brasileiro, onde há evidências de que esta seja uma zona de hibridação entre elas. No Brasil, a Biologia Populacional destas espécies, cujo entendimento é indispensável para programas eficientes de manejo, de conservação e/ou de restauração de manguezais, ainda não foi estudada. Este projeto tem como objetivos desenvolver marcadores microssatélites para A. germinans e A. schaueriana e estimar parâmetros biológicos importantes como taxa de cruzamento, sistema reprodutivo, estruturação genética, fluxo gênico, tamanho efetivo de população além de se elucidar a questão sobre a zona de hibridação entre as espécies. Tais questões, além de muito interessantes cientificamente, são extremamente valiosas para a conservação e restauração desses ecossistemas tão ameaçados e degradados. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (4) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Iracilda sampaio - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 9
Membro: Anete Pereira de Souza.
7.   2008-2010. Caracterização fisiológica e molecular da resposta à seca em cana-de-açúcar - Proteoma - GENOPROT
Descrição: Este projeto visa identificar genes e peptídeos de cana-de-açúcar significativamente associados a respostas de maior tolerância ao estresse hídrico, através da utilização integrada de tecnologias de análises fisiológicas e de biologia molecular em experimentos conduzidos em várias regiões do Brasil.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Integrante / Valesca Pandolfi - Integrante / Maria Clara Pestana - Integrante / Isadora Louise Alves da Costa Ribeiro - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Tatianna Rodrigues Martins - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Universidade Federal Rural de Pernambuco - Cooperação / Universidade Federal de Alagoas - Cooperação / Universidade Federal de São Carlos - Cooperação / Universidade Estadual de Campinas - Cooperação / Universidade de São Paulo - Cooperação.Número de orientações: 2
Membro: Tercilio Calsa Junior.
8.   2008-2011. Caracterização fisiológica e molecular da resposta à seca em cana-de-açúcar.
Descrição: Projeto que envolve seis universidade públicas: UNICAMP, UFRPE, UFPE, USP, UFAL, UFSCar. Pretende reunir as competências em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular de vários integrantes, com o objetivo geral de desvendar as alterações fisiológicas decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcritômica e proteômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / José Vieira Silva - Integrante / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Michel Georges Albert Vincentz - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
9.   2008-2010. CNPq Edital MCT/CNPq Universal Faixa A, coordenadora com o projeto: Bioprospecção em fungos filamentosos para estudo de enzimas de aplicação industrial. Processo 472978/2008-0, no valor de R$ 20.000,00, com vigência de 18 de novembro de 2008 a
Descrição: Este projeto contempla o estudo de alguns sistemas enzimáticos, produzidos por fungos termotolerantes ou termofílicos, que hidrolisam biomassa vegetal. Essas enzimas oferecem um material de estudo interessante, sobre problemas relacionados com os mecanismos de catálise e regulação das mesmas, bem como pela possibilidade de utilização tecnológica. O projeto está dividido em cinco subprojetos: I) Estudo de amilases; II) Estudo de fosfatases, fitases e fosfatases alcalinas; III) Estudo de lipases; IV) Estudo de pectinases e V) Estudo de xilanases (celulases e ligninases). Resultados prévios obtidos no laboratório tornaram esses estudos interessantes e justificam uma pesquisa mais aprofundada. Estamos sugerindo no presente projeto, num primeiro momento, a coleta de microrganismos a partir de solo, compostagem e águas termais de diversas regiões do estado de São Paulo, isolamento de fungos filamentosos, selecionamento de cepas que se destacam na produção de enzimas de interesse, identificação e catalogação das cepas selecionadas, buscas e possíveis estratégias para a otimização da produção das atividades estudadas, nos fungos coletados. Posteriormente, pretende-se realizar a purificação, a caracterização de propriedades bioquímicas das respectivas hidrolases, o seqüenciamento de aminoácidos e busca de homologias. Haverá uma abordagem envolvendo a aplicação biotecnológica destas enzimas, como as xilanases que deverão ser aplicadas no biobranqueamento da polpa de celulose para produção de papel. Para este propósito, será feita a determinação do número kappa das polpas de celulose tratadas com xilanases, bem como a determinação da viscosidade e a alvura da polpa celulósica. As xilanases, em conjunto com as amilases deverão ser utilizadas na hidrólise de fibras alimentares visando uma aplicação na indústria alimentícia. As fosfatases ácidas (fitases) e as xilanases (em conjunto com as celulases e ligninases) serão utilizadas em ração animal visando melhorar a digestibilidad. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
10.   2008-2010. Desenvolvimento de novos marcadores baseados em microssatélites para bananeira (Musa spp.)
Descrição: A banana consiste num importante alimento básico em países tropicais, e também uma fonte geradora de divisas como fruta para exportação. O melhoramento genético da bananeira é baseado na obtenção de híbridos tetraplóides derivados de cruzamentos entre algumas poucas cultivares triplóides (genitor feminino) e diplóides (doador de pólen). Entretanto, a esterilidade ou baixa fertilidade das principais cultivares limitam a obtenção desses híbridos. A variabilidade genética se concentra nas formas selvagens diplóides das subespécies de Musa acuminata (AA) e M. balbisiana (BB) e cultivares do grupo AA, que deverão contribuir com resistência a doenças e outras características agronômicas favoráveis. O Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de Musa da Embrapa Fruticultura Tropical possui mais de 400 acessos, principalmente diplóides AA. A esterilidade total ou parcial de cultivares triplóides e diplóides também dificulta a geração de populações segregantes para obtenção de mapas genéticos, restringindo a identificação de locos de caracteres quantitativos empregando metodologias convencionais. A abordagem de mapeamento por associação ou por desequilíbrio de ligação, utilizando informações fenotípicas disponíveis do germoplasma e de linhas diplóides avançadas associadas à genotipagem com marcadores consiste numa alternativa promissora. Para avaliar a aplicação desse conceito de mapeamento por associação em populações diplóides de elite do BAG será necessário obter um número elevado de locos de marcadores, inclusive microssatélites. O presente projeto propõe o desenvolvimento e validação de novos locos microssatélites, junto com a avaliação de marcadores envolvendo retrotransposons e microssatélites (IRAP e REMAP) para complementar a caracterização do BAG da Embrapa, e auxiliar na saturação do genoma para avaliar a estratégia de mapeamento por associação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Onildo Nunes Jesus - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 2
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
11.   2008-2011. DESENVOLVIMENTO DE TÉCNICAS DE AVALIAÇÃO DE ADITIVOS PARA CAPTURA DE METAIS NO PROCESSO DE FCC
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Petróleo Brasileiro S.A. - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
12.   2008-Atual. Enzimas para Saccarificação de Biomassa
Descrição: Responsãvel para o projeto "Enzimas para Saccarificação de Biomassa" dentro o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT/CNPq) do Bioetanol, coordenadores Prof. Dr. Marcos Silveira Buckeridge (IB/USP) e Profa. Dra. Gláucia Mendes Souza (IQ/USP). A matriz da parede celular é uma estrutura complexa e, assim, nenhuma enzima é capaz de hidrolisar completamente os polissacarídeos constituintes, sendo previsível a necessidade de uma mistura de enzimas, com diferentes especificidades, para alcançar este objetivo. O subprojeto tem objetivo do desenvolvimento de uma plataforma tecnológica que compreende desde a Bioprospecção de fungos filamentosos até a expressão heteróloga de enzimas e engenharia de proteínas envolvidas na degradação de biomassa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador / Arthur Henrique Cavalcante de Oliveira - Integrante / POLIZELI, M.L.T.M - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
13.   2008-2010. EXTRAÇÃO DE CAROTENÓIDES DO ÓLEO RESIDUAL DE BAGAÇOS DE PALMÁCEAS
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador. Financiador(es): Petróleo Brasileiro S.A. - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
14.   2008-2011. Fisiologia, biologia molecular e biotecnologia da tolerânica à seca em cana-de-açucar - Proteoma
Descrição: Este projeto visa reunir as competências em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular dos vários integrantes, com o objetivo geral de desvendar as alterações fisiológicas e moleculares decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcritômica e proteômica. Esse conhecimento será a base para a plataforma de modificação genética de cana-de-açúcar visando não apenas a comprovação do papel dos genes/proteínas descobertos, como também a produção de novas variedades com maior tolerância à seca.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Integrante / Valesca Pandolfi - Integrante / Maria Clara Pestana - Integrante / Isadora Louise Alves da Costa Ribeiro - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Tatianna Rodrigues Martins - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Universidade Federal Rural de Pernambuco - Cooperação / Universidade Federal de Alagoas - Cooperação / Universidade Federal de São Carlos - Cooperação / Universidade Estadual de Campinas - Cooperação / Instituto de Química - Universidade de São Paulo - Cooperação / Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Usp - Cooperação.Número de orientações: 2
Membro: Tercilio Calsa Junior.
15.   2008-2010. FISIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR E BIOTECNOLOGIA DE TOLERÂNCIA À SECA EM CANA-DE-AÇÚCAR
Descrição: A seca é um dos principais estresses abióticos que atingem a cultura da cana-de-açúcar. Existe uma grande variabilidade nos cultivares comerciais de cana quanto à tolerância a seca. Diversas evidências indicam que essa variabilidade tem um componente genético. No entanto, pouco é conhecido sobre a base fisiológica e molecular da tolerância à seca em cana. O presente projeto aprovado pelo CNPq, reuniu as competências em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular de vários integrantes, com o objetivo geral de desvendar as alterações fisiológicas decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcritômica e proteômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Laurício Endres - Integrante / Vilma Marques Ferreira - Integrante / José Vieira Silva - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Michel Georges Albert Vincentz - Integrante / Alessandro Jaquiel Waclawovsky - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
Descrição: Projeto que envolve seis universidade públicas: UNICAMP, UFRPE, UFPE, USP, UFAL, UFSCar. Pretende reunir as competências em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular de vários integrantes, com o objetivo geral de desvendar as alterações fisiológicas decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcritômica e proteômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / José Vieira Silva - Integrante / Vilma Marques Ferreira - Integrante / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Michel Georges Albert Vincentz - Integrante / Alessandro Jaquiel Waclawovsky - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
16.   2008-2011. GENOSOJA
Descrição: PROJETO COMPONENTE (PC3) - TRANSCRIPTOMA: visa identificar e caracterizar a expressão de genes e fatores de regulação (e.g. microRNAs) em soja relacionados com os processos de resposta a estresses abióticos e bióticos, especificamente em condições de estresse hídrico, ferrugem asiática da soja e nematóides. PROJETO COMPONENTE (PC6) - BIOINFORMÁTICA: visa criar e gerenciar banco de dados transcricionais e funcionais integrando as informações geradas no âmbito do projeto, assim como os dados gerados por Instituições de outros países (ex: estudo de sintenia em leguminosas).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Coordenador / Valesca Pandolfi - Integrante / Maria Clara Pestana - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Cooperação / Universidade Estadual de Campinas - Cooperação / Universidade Federal de Viçosa - Cooperação / Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Usp - Cooperação.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
17.   2008-2010. GenoSoja: Consórcio Nacional para Estudos do Genoma da Soja
Descrição: Edital CT-Agronegócio/MCT/CNPq GENOSOJA - Nº 38/2007, Processo 552735/2007-8/CNPq (Ricardo Abdenor, Coordenador, CNPSo). Marcelo Loureiro coordena dois subprojetos neste projeto Contrução de bibliotecas full lenght e Análise proteômica diferencial e de alterações de fosforilação de proteínas de um genótipo tolerante à seca. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Especialização: (16) / Mestrado acadêmico: (12) / Doutorado: (8) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Maria Fátima Grossi de Sa - Integrante / Elizabeth Batista Pacheco Fontes - Integrante / Sergio Hemínio Bromoshenkel - Integrante / Maurílio Alves Moreira - Integrante / Francisco Murilo Zerbini Júnior - Integrante / Everaldo Gonçalves de Barros - Integrante / Ricardo Vilela Abdelnoor - Coordenador / Alexandre Nepomuceno - Integrante / Rogerio Margis - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
18.   2008-Atual. Homeostase Energética e Sinalização por Açúcar: Diversificação dos Mecanismos Moleculares Envolvidos no Controle do Balanço Energético em Angiospermas
Descrição: Para otimizar o crescimento e o desenvolvimento, as plantas, sendo organismos fixos, precisaram desenvolver uma gama de mecanismos eficientes para perceber e responder adequadamente a condições sempre flutuantes do meio ambiente. A produção de açúcar pela fotossíntese depende primeiramente do acesso a luz. Estes açúcares derivados da fotossíntese representam importantes sinais que em combinação com sinais do desenvolvimento ou outros "inputs" do meio ambiente, tal como a nutrição mineral, a disponibilidade de água ou o ataque de patógenos, influenciam o uso das reservas energéticas para garantir a sobrevivência e a propagação. A interação entre sinais do desenvolvimento, hormonais e açúcares representa um aspecto central do controle do crescimento e conseqüentemente da produção de biomassa. Os mecanismos moleculares responsáveis para comunicação cruzada entre estas diferentes vias de sinalização, assim como a diversificação destes mecanismos em plantas, ainda precisam ser elucidados de maneira mais precisa para entendermos melhor os padrões de crescimento e a produção de biomassa. A proposta apresentada tem como objetivo abrangente desvendar novos aspectos dos mecanismos da transdução de sinal por açúcares em plantas. Mais especificamente, pretendemos: 1) Definir a diversificação dos programas de expressão gênica regulados por glicose e saccarose em angiospermas (cana de açúcar, arroz e Arabidopsis thaliana); 2) Avaliar e descrever o controle da estabilidade de mRNAs por glicose; 3) Caracterizar as funções de fatores da transcrição do tipo bZIP que mediam processos relacionados a glicose; 4) Obter novas informações sobre a sinalização por manose. Antecipamos que os dados deverão melhorar nossos conhecimentos sobre a sinalização por açúcares e a homeostase energética em plantas, e os resultados serão integrados em bancos de dados que poderão que beneficiariam projetos de pesquisa relacionados à biomassa e bioenergia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Institut National de La Recherche Agronomique - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.
19.   2008-2010. Identificação de Genes de Cana-de-Açúcar Diferencialmente Expressos em condições de estresse hídrico - SuperSAGE
Descrição: O projeto visa traçar o perfil transcricional da cana-de-açúcar em resposta ao estresse hídrico, a partir de duas abordagens complementares: análise da expressão diferencial através da tecnologia SuperSAGE e estudo da regulação gênica por meio de microRNAs.. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Coordenador / Laureen Michele Hollou-Kido - Integrante / Sergio Crovella - Integrante / Gunther Kahl - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / CTC - Centro de Tecnologia Canavieira - Cooperação / Universidade Federal do Rio de Janeiro - Cooperação.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
20.   2008-Atual. Impactos ambientais, economicos e sociais, sobre o solo, paisagem e biodiversidade do plantio de cana-de-açúcar em sistema de aléias
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Integrante / Luiz Antonio Correa Margarido - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
21.   2008-2013. Instituto Nacional de Biotecnologia para o Bioetanol- INBB
Descrição: O Instituto Nacional de Biotecnologia para o Bioetanol reuni um conjunto de 30 laboratórios de 5 estados brasileiros para desenvolver as bases tecnológicas necessárias para viabilizar a produção de etanol celulósico a partir de cana-de-açúcar no Brasil.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Laurício Endres - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador / Adriane Maria Ferreira Milagres - Integrante / Anete Pereira de Souza - Integrante / Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Carlos Alberto Labate - Integrante / Donato Alexandre Gomes Aranda - Integrante / Eleni Gomes - Integrante / Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Integrante / Felipe Chambergo - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Integrante / Helaine Carrer - Integrante / Igor Polikarpov - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante / Marcos G. A. Landell - Integrante / Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Marcio de Castro Silva Filho - Integrante / Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / Richard J. Ward - Integrante / Marie-Anne Van Slyus - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Michel Vincentz - Integrante / Munir S. Skaf - Integrante / Nei Pereira Junior - Integrante / Paulo Seleghim Jr. - Integrante / Sandra Regina Ceccato Antonini - Integrante / Sandro R. Marana - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
22.   2008-Atual. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol
Descrição: Coordenador do Centro de Estudos Enzimáticos e Tecnologias Industriais. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Integrante / Marcos Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
Descrição: O sistema de agroenergia que produz cana-de-açúcar no Brasil é atualmente o mais eficiente do mundo. No entanto,apenas parte da biomassa produzida é usada efetivamente para a produção de bioetanol, sendo 1/3 para este a produção de sacarose (parte da qual é fermentada para o etanol), 1/3 é bagaço, que é queimado para produzir eletricidade e 1/3 é a palhada, que fica no campo e é decomposta por microorganismos. Portanto, para suprir necessidade ainda maiores de bioetanol, um aumento significativo na produção de etanol é possível se desenvolvermos tecnologias para retirar a energia armazenada nas ligações glicosídicas nos polissacarídeos de parede celular (celulose, hemicelulose e pectinas). Ainda que a hidrólise ácida da biomassa esteja quase consolidada em laboratório e em planta piloto, sua aplicação em larga escala ainda não é economicamente viável. Uma alternativa é o uso de enzimas hidrolíticas que ataquem a parede celular. No entanto, muito pouco é conhecido sobre como este processo de degradação se dá. O Centro de Prospecção de fungos irá manter um levantamento continuo de espécies de fungos capazes de produzir enzimas hidrolíticas e ao mesmo tempo testar e melhorar o desempenho destas utilizando técnicas de engenharia genética. À medida em que enzimas das plantas e dos fungos sejam produzidas, o Grupo do Centro de Caracterização de Enzimas e Processos Industriais irá trabalhar na determinação da estrutura das proteínas, tentar melhorá-las se possível e efetuar testes em pequena escala de preparação do material de cana para uso industrial na produção de bioetanol. Um dos principais objetivos desta proposta é compreender a estrutura fina e a arquitetura dos polissacarídeos da parede celular da cana de açúcar para usá-la como fonte de biomassa para bioenergia. Este aspecto, assim como estudos sobre as características fisiológicas de plantas de cana relacionadas à performance de crescimento em condições de estresses bióticos e abióticos, serão estudados, como tam. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Helaine Carrer - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador.
Membro: Helaine Carrer.
23.   2008-2010. Interações alelopáticas de diferentes palhadas sobre a soja: distúrbios metabólicos e modos de ação dos aleloquímicos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
24.   2008-2010. Isolamento dos polissacarídeos do bagaço de cana-de-açúcar e obtenção de oligossacarídeos através de hidrólise enzimática e cromatografia de exclusão molecular
Descrição: O presente projeto tem por meta, preencher lacunas e avançar na pesquisa de aspectos que tangem: o isolamento e caracterização de enzimas para uma maior eficiência hidrolítica da biomassa disponível no bagaço; avaliar o comportamento da hemicelulose obtida do bagaço de cana-de-açúcar frente a enzimas; usar compostos redutores de Fe3+, na presença ou não de enzimas ligninolíticas, visando a oxidação da lignina residual presente nos polissacarídeos extraídos do bagaço. Valor: R$ 83.881,87. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / Michel Brienzo - Integrante / Joseana R do Monte - Integrante / Marcos Paulo Vicentim - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 8 / Número de orientações: 4
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
25.   2008-2010. Mapeamento genético de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) por associação empregando microssatélites e polimorfismo de base única SNPs
Descrição: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma das principais culturas do Brasil, sendo o agronegócio sucro-alcooleiro responsável por 3,6% do PIB nacional. Para atender ao incremento na demanda, principalmente por etanol combustível, o agronegócio canavieiro deverá expandir a área plantada, principalmente para áreas com condições sub-ótimas ou marginais para o cultivo. A competitividade e a sustentabilidade do agronegócio requerem o desenvolvimento contínuo de cultivares melhoradas, tolerantes aos fatores bióticos e abióticos de cada região e sistema de cultivo, visando aumentar o rendimento médio da cultura. Neste sentido, a busca por novas estratégias que possam auxiliar no desenvolvimento de cultivares são extremamente oportunas no melhoramento da cana-de-açúcar. Portanto, os objetivos desse projeto serão analisar a aplicação do conceito de Mapeamento por Associação em cana-de-açúcar, assim como avaliar a aplicabilidade de dois métodos de detecção de Polimorfismos de Base Única (SNPs) para o mapeamento de cana-de-açúcar. A estratégia de Mapeamento por Associação é baseada na associação não casual entre alelos, em dois ou mais locos, chamada desequilíbrio de ligação, sendo uma das suas principais vantagens a possibilidade de realizar o mapeamento em populações naturais não estruturadas, sem a necessidade de obter populações ou famílias derivadas de cruzamentos. Serão avaliados os métodos de detecção de SNPs denominado de EcoTilling, que emprega endonucleases para digerir seqüências heteroduplex resultantes de amplificação enzimáticas, detectando polimorfismos por analisador automático de DNA utilizando iniciadores marcados com fluorescência, e outro, por análise de curva de desnaturação em PCR em Tempo Real. Os SNPs serão analisados em genes análogos de resistência e em genes associados ao acúmulo de sacarose, que juntamente com a análise com locos de microssatélite, serão empregados no mapeamento por associação de características de produção da cana-de-açúcar.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Silvana Aparecida Creste Dias Souza - Integrante / Francisco Claudio Conceição Lopes - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
26.   2008-2010. O fungo filamentoso Aspergillus nidulans como um sistema modelo para a caracterização das funções citoplasmáticas da ATM (Ataxia-Telangiectasia) quinase
Descrição: 470358/2008-4 , Universal 2008 FaixaC. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
27.   2008-Atual. Pesquisa, desenvolvimento e inovação para áreas tradicionais da atividade canavieira e para a pequena e média produção de cana de açúcar
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Coordenador.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
28.   2008-2010. Produção de cachaça: avaliação da influência das variedades de cana-de-açúcar sob manejo orgânico sobre a diversidade de leveduras do caldo e no preparo do fermento
Descrição: Processo 07/06979-8 A produção atual de cachaça no Brasil atende principalmente o mercado interno, sendo uma porcentagem muito pequena destinada à exportação. Os produtores da bebida são prioritamente pequenos produtores, que utilizam ainda processos e técnicas rudimentares de produção, com pouco ou inexistente controle de qualidade. O fermento é preparado de forma artesanal (chamado fermento caipira ), o que dificulta o controle da qualidade da bebida, no entanto, pode contribuir para a melhor qualidade sensorial da mesma. A produção de cachaça orgânica aparece como uma alternativa promissora para pequenos produtores, devido à crescente demanda por produtos naturais, saudáveis e ecologicamente corretos. Dessa forma, este projeto se propõe a avaliar a influência das variedades de cana-de-açúcar sob manejo orgânico sobre a diversidade/número de leveduras presentes em caldo de cana-de-açúcar e no preparo do fermento, verificando a contribuição destes fatores (variedades de cana e preparo do fermento) sobre a qualidade sensorial do caldo e/ou da cachaça, visando contribuir para o desenvolvimento deste segmento agroindustrial.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador / Luiz Antonio Correa Margarido - Integrante / Cristina Martini - Integrante / Marta Regina Verruma-Bernardi - Integrante / Afra Vital Matos Dias Gabriel - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
29.   2008-2011. Produção de hidrolisados fermentescíveis a partir do pré-tratamento do bagaço de cana com ácido sulfúrico diluído e hidrólise enzimática de materiais lignocelulósicos
Descrição: Responsãvel para o projeto "Enzimas para Saccarificação de Biomassa" dentro o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT/CNPq) do Bioetanol, coordenadores Prof. Dr. Marcos Silveira Buckeridge (IB/USP) e Profa. Dra. Gláucia Mendes Souza (IQ/USP). A matriz da parede celular é uma estrutura complexa e, assim, nenhuma enzima é capaz de hidrolisar completamente os polissacarídeos constituintes, sendo previsível a necessidade de uma mistura de enzimas, com diferentes especificidades, para alcançar este objetivo. O subprojeto tem objetivo avaliar como as condições de pré-hidrólise do bagaço de cana-de-açúcar (concentração ácida, temperatura e tempo de residência) influenciam a composição e a digestibilidade enzimática da celulignina resultante.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / Walter de Carvalho - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
30.   2008-2010. Prospecção e Utilização de Fungos Celulolíticos e Hemicelulolíticos do Cerrado para Hidrólise de Resíduos Agrícolas
Descrição: Os fungos filamentosos compreendem uma importante classe de organismos de relevante valor comercial, onde são usados pela indústria biotecnológica para produzirem uma variedade de enzimas comerciais que representam bilhões de dólares em vendas anuais. A demanda mundial por processos otimizados na transformação de biomassa em produtos diversificados e de maior valor agregado tem resultado no uso de enzimas em diversos processos industriais. Grande parte dessas enzimas é de origem microbiana (fungos e bactérias) e extracelular. Como parâmetro de aplicação tecnológica, uma enzima somente possui valor comercial se houver demanda ou apresentar propriedades de acordo com os requerimentos técnicos e econômicos do processo em escala industrial. Para se obter uma viabilidade econômica e comercial da produção de enzimas industriais é necessário identificar e isolar microorganismos com potencial para hiperprodução dessas enzimas. Dentro desse contexto, o presente projeto de pesquisa visa isolar e identificar espécies de fungos do cerrado com potencial para produção de enzimas de interesse biotecnológico, além de agregar valores a resíduos agrícolas que muitas vezes são utilizados como coberturas mortas. Dessa forma, tais resíduos serão úteis como fontes de carbono para o crescimento de microorganismos e para indução de enzimas hidrolíticas de interesse biotecnológico. Como perspectiva, o aproveitamento desses resíduos agrícolas será matéria para o estabelecimento no futuro de biorefinarias nas regiões agrícolas do DF e Entorno. O projeto receberá R$ 103.267,10 para sua execução.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Eliane Ferreira Noronha - Integrante / Carlos André Ornellas Ricart - Integrante / Luis Roberto Batista - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio a Pesquisa do DF - Auxílio financeiro.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
31.   2008-2012. PROSPECÇÃO TECNOLÓGICA DE PROCESSOS PARA O APROVEITAMENTO DE BIOMASSA LIGNOCELULÓSICA NO CONTEXTO DE BIORREFINARIA
Descrição: Com a tendência industrial na adoção de tecnologias mais limpas para a redução da poluição ambiental, a implementação do aproveitamento biotecnológico de biomassa implica em vantagens nos aspectos ambientais, sociais e econômicos, podendo ser considerado como um importante fator de viabilização do desenvolvimento sustentável, especialmente em comunidades rurais. A biomassa constituída de celulose, hemicelulose e lignina, denominada de lignocelulósica, é a fonte mais rica em carboidratos do planeta. No passado, devido à carência de tecnologias sustentáveis, essas biomassas de composição lignocelulósica não foram devidamente aproveitadas. Hoje, já se dispõe de tecnologias para tornar seus açúcares biodisponíveis, o que possibilita a produção de uma gama de moléculas, que se inserem no conceito de Biorrefinaria. O conceito de biorrefinaria é construído com base em duas plataformas diferentes, a plataforma sucro-química e a termo-química. Ambas visam fornecer blocos de construção para a obtenção de diferentes produtos. Este projeto tem como objetivo mapear as tecnologias, tanto de natureza biotecnológica quanto química, para o aproveitamento das biomassas residuais, de natureza lignocelulósica, para produção de compostos de interesse industrial. Tal projeto terá como foco principal os processos de produção de substâncias químicas que hoje são produzidas utilizando matérias-primas de origem fóssil, já que o interesse maior com relação ao aproveitamento das biomassas é criar opções potenciais para a redução, ou até mesmo a substituição, de insumos provenientes da indústria do petróleo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Luiz André Felizardo Silva Schlittler - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
32.   2008-Atual. Redes Regulatórias e de Sinalização da Cana-de-açúcar
Descrição: Este projeto foca estudos de regulação gênica e visa a geração de ferramentas que permitam abordagens da Biologia Sistêmica em cana-de-açúcar e a identificação de redes regulatórias. Como ponto de partida escolhemos caracterizar dois tratos agronômicos de interesse desta cultura: o teor de sacarose e a resposta à seca. Pretendemos estudar categorias gênicas com conhecido papel regulatório (Fatores de Transcrição, Proteínas Quinases e Fosfatases), aprofundar estudos do Transcriptoma, produzir plantas transgênicas para genes de interesse e desenvolver ferramentas de bioinformática e bancos de dados integrando os vários níveis de informação. Identificaremos os alvos de TFs utilizando a técnica de ChIP-HTS e clonando promotores. Os resultados terão consequëncias diretas múltiplas nos programas de melhoramento que frequentemente selecionam mudanças nos CREs e TFs na busca de genótipos mais adaptados ao ambiente e com maior performance agronômica. As Proteínas Quinases atuam em cascatas de sinalização de respostas a estímulos ambientais e nossos dados apontam para um papel predominante das PKs na regulação do teor de sacarose e resposta à seca. Para identificar novos genes associados a brix e seca caracterizaremos o transcriptoma de genótipos e cultivares contrastantes para estes tratos utilizando chips de oligonucleotídeos. Genes de interesse serão então avaliados quanto à sua função pela geração e análise de plantas transgênicas. Para integrar o grande conjunto de dados públicos e gerados pelo projeto uma infra-estrutura computacional robusta será desenvolvida. O banco de dados SUCEST-FUN integrará dados do SUCEST, promotores, CREs, dados de expressão e a caracterização agronômica, fisiológica e bioquímica de cultivares da cana. Em paralelo também desenvolveremos o banco de dado GRASSIUS para o estabelecimento das redes regulatórias de cana, arroz, milho e sorgo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
Membro: Glaucia Mendes Souza.
33.   2008-2010. Respostas fisiológicas e bioquímicas de três espécies de leguminosas tropicais às mudanças climáticas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
34.   2008-2010. Seleção e caracterização bioquímico-molecular de clones de cana-de-açúcar e de microrganismos lignocelulolíticos visando à maximização da sacarificação e fermentação a partir do bagaço para produção de álcool celulósico
Descrição: O presente projeto, por meio das parcerias firmadas entre os diferentes grupos de pesquisa participantes, tem por meta, preencher lacunas e avançar na pesquisa de aspectos que tangem: seleção de materiais genéticos melhorados para a quantidade e qualidade de fibra; caracterização, por meio de ferramentas de biologia molecular, dos aspectos de regulação da expressão gênica que influenciam na composição da fibra; isolar, caracterizar e modificar geneticamente microrganismos para uma maior eficiência hidrolítica e fermentativa da biomassa disponível no bagaço; avaliar o comportamento de clones de cana-de-açúcar contrastantes em relação à composição da fibra frente a tratamentos com enzimas digestivas de parede celular, visando à seleção dos melhores clones e a determinação da composição e estrutura adequada da fibra, que direcionará os programas de melhoramento para a produção de etanol ligno-celulósico. Dez clones com alto teor de lignina e dez clones com baixo teor serão selecionados a partir de vários experimentos de campo. Os vinte clones serão subdivididos em duas populações que serão avaliadas nos anos 2008, 2009 e 2010. Os genes diferencialmente expressos nos clones contrastantes identificados no experimento de campo serão investigados utilizando-se um chip de microarray com 44.000 sequências organizadas. Os genes envolvidos com o metabolismo de parede celular e outros interessantes da classe de fatores transcricionais, relacionados a estresses e outros caracteres terão sua seqüencia completa definida por meio do seu isolamento e seqüenciamento a partir de uma biblioteca CAP trapper de mRNA. Estão previstas também, abordagens microbiológicas como o isolamento de microrganismos com alto potencial de produção de enzimas ligno-celulolíticas e fermentativo, testes de enzimas da classe de xilanases, celulases dentre outras quanto à eficiência hidrolítica. Para viabilizar a execução deste projeto, contaremos com a participação, troca de experiência e integração ent. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Luciano G. Fietto - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Marcio Henrique Barbosa - Coordenador / Adriane Milagres - Integrante / Flavia Passos - Integrante / Julio Francis Lopes - Integrante / Glaucia Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
35.   2008-Atual. Sugarcane Signaling and Regulatory Networks
Descrição: Este projeto foca estudos de regulação gênica e visa a geração de ferramentas que permitam abordagens da Biologia Sistêmica em cana-de-açúcar e a identificação de redes regulatórias. Como ponto de partida escolhemos caracterizar dois tratos agronômicos de interesse desta cultura: o teor de sacarose e a resposta à seca. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
36.   2008-2010. Uso do Biocarvão para o aumento da produtividade de cana-de-açucar em Pernambuco
Descrição: O biocarvão desenvolvido pela Universidade Técnica de Berlin, se apresenta como uma inovação tecnológica, que tem grande potencial de aplicação no mercado das indústrias sucroalcooleiras em Pernambuco e no Brasil. Esta biocarvão será produzido a partir do bagaço da cana-de-açucar e será misturado ao solo para aumentar a produtividade da cana cultivada. Os benefícios sociais que se deseja atingir repercutirá diretamente na população da área da Zona da Mata de Pernambuco, onde a atividade sucroalcooleira predomina, uma vez que permitirá um maior benefício econômico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Marcelle Almeida da Silva - Integrante / José Antônio Aleixo da Silva - Integrante / Marília Regina Costa Castro Lyra - Integrante / Maria do Carmo Martins Sobral - Coordenador / Hélio Leandro Lopes - Integrante / Renata Maria C.M. Carvalho - Integrante / Gustavo Lira de Melo - Integrante / Maiara Gabrielle de Souza - Integrante.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
37.   2008-2012. Variabilidade genética e estimativa da taxa de cruzamento do pinhão-manso (Jatropha curcas L.) empregando marcadores moleculares
Descrição: A demanda mundial por combustíveis renováveis tem expandido rapidamente, e os biocombustíveis têm se destacado no cenário mundial como uma alternativa aos derivados de petróleo. O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma planta oleaginosa que possui características agrícolas como produtividade e conteúdo de óleo nas sementes, que o torna um excelente candidato na produção de biocombustível. Sua domesticação teve início apenas nos últimos 30 anos, e pouco se conhece sobre sua diversidade genética. Este estudo tem como objetivos caracterizar acessos de pinhão-manso utilizando microssatélites a serem desenvolvidos para a espécie a partir de biblioteca genômica enriquecida e/ou de ESTs (Expressed sequence tags), assim como avaliando a transferibilidade de primers de outras Euphorbiaceae (mandioca e/ou seringueira). O estudo visa também estimar a taxa de cruzamento, trazendo maiores informações sobre o sistema reprodutivo da espécie. Serão analisados 235 acessos, provenientes de Minas Gerais, Goiás, Mato Grosso, Pará, São Paulo, Santa Catarina, Bahia, Pernambuco; algumas variedades selecionadas para teor de óleo provenientes da China, Camboja; e algumas variedades do Paraguai, Tanzânia, Moçambique e República Dominicana mantidos no Banco de Germoplasma de pinhão-manso da Universidade Federal de São Carlos (Araras) quanto à diversidade e a estrutura genética dos acessos e populações de origem. Para o estudo do sistema reprodutivo e modelo de fluxo gênico serão utilizados nove acessos de pinhão-manso, provenientes das diversas regiões do Brasil e uma variedade do Sudeste Asiático. As informações geradas auxiliarão na domesticação, conservação e no melhoramento genético da espécie.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / BRESSAN, E. A. - Integrante / Gerald, L. T. S. - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.

2007

1.   2007-Atual. (UNIVERSAL 2007) Mecanismos de Reconhecimento Molecular do Receptor de Hormônio Tireoidiano
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
2.   2007-Atual. Allelopatia a serviço da agricultura no Paraná: estudos laboratóriais e no campo
Descrição: Extração, ensaios de atividade e purificação de princípios ativos extraídos de plantas com atividade alelopática sobre culturas de interesse comercial.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Integrante / Emy Luiza Ishii Iwamoto - Coordenador. Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Wanderley Dantas dos Santos.
3.   2007-2009. ANALISE MOLECULAR DA CALCINEURINA EM FUNGOS PATOGENICOS HUMANOS
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
4.   2007-2009. Análise molecular da calcineurina em fungos patogênicos humanos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Marcia Eliana da Silva Ferreira - Integrante.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
5.   2007-2010. Análise molecular da resposta de milho a solo ácido.
Descrição: A toxidez de Al é o principal fator limitante da produtividade agrícola em grandes áreas do Brasil e do mundo. A resposta desenvolvida pelas plantas contra esse íon é complexa e sua compreensão pode ser ampliada com a identificação de genes que têm sua expressão alterada pelo Al. Este projeto tem por objetivo ampliar o conhecimento sobre a fisiologia e a regulação gênica associada à resistência a Al utilizando variedades contrastantes cultivadas em solo ácido saturado por Al, algo inédito. Chips da Affymetrix serão usados para comparar variedades de milho resistentes e sensíveis e identificar novos genes que podem estar associados à tolerância a esse íon sendo potenciais alvos biotecnológicos. Valor Financiado: 214.005,92.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
6.   2007-2009. Análise serial de expressão gênica (SAGE) em feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) associada à fixação biológica de nitrogênio
Descrição: Este projeto de pesquisa tem por objetivo geral desenvolver a aplicação da análise serial de expressão gênica (SAGE; Velculescu et al., 1995; Saha et al., 2002) para análise transcricional aberta de feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) em interação simbiótica com microorganismos fixadores de nitrogênio atmosférico (bactérias do gênero Rhizobium), visando favorecer estudos funcionais úteis ao melhoramento genético desta cultura. Para tanto, são objetivos específicos: a) instalação de cultivo de feijão-caupi em casa-de-vegetação, inoculação com Rhizobium e verificação de nodulação; b) construção e seqüenciamento de bibliotecas SAGE de raízes de feijão-caupi contrastantes para presença/ausência do microrganismo simbionte; c) extração e análise quali-quantitativa dos dados SAGE; d) validação dos resultados obtidos via SAGE através de RT-qPCR (transcrição reversa seguida de reação em cadeia da polimerase quantitativa); e) seleção de genes candidatos auxiliares ao melhoramento da espécie. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Pedranne Kelly Araújo Barbosa - Integrante / Rodrigo assunção de Holanda - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
7.   2007-2009. Análises genéticas em gramíneas forrageiras tropicais por meio de marcadores moleculares
Descrição: Recentemente, nosso grupo tem se dedicado ao desenvolvimento de marcadores microssatélites para espécies forrageiras tropicais, para as quais pouca ou nenhuma informação genética está disponível. Estão sendo desenvolvidos microssatélites - a partir de bibliotecas genômicas enriquecidas ou a partir de sequências ESTs em genótipos e/ou condições de interesse do melhoramento genético para 15 espécies compreendidas principalmente nos gêneros Brachiaria, Paspalum, Panicum e Stylosanthes. A disponibilidade de marcadores robustos e específicos para estas espécies tem contribuído significativamente para os programas de melhoramento de Brachiaria, através da caracterização da diversidade genética em bancos de germoplasma. Uma contribuição importante seria a utilização destes marcadores na construção de mapas genéticos e no mapeamento de características de interesse agronômico. Para as espécies nativas de Paspalum, pouco se conhece sobre a diversidade disponível na natureza e em bancos de germoplasma brasileiros. Além disso, questões envolvendo o modo de reprodução, como a taxa de sexualidade em acessos apomíticos e o quanto desta sexualidade seria representada pela alogamia, são preponderantes na determinação dos métodos de melhoramento adequados. Deste modo, o presente projeto visa à realização de estudos genéticos em gramíneas forrageiras tropicais, contemplando a) construção do mapa genético e o mapeamento de QTLs envolvidos no controle genético da apomixia em uma população segregante de B. humidicola; b) caracterização da diversidade genética em quatro espécies de Paspalum; c) determinação da taxa de cruzamento de Paspalum regnelli. Espera-se que os resultados obtidos sejam diretamente incorporados aos programas de melhoramento de forrageiras tropicais, resultando na diminuição do tempo necessário para o lançamento de novas cultivares e na geração de genótipos com maior valor agregado, além destes resultados também contribuírem significativamente para a pe. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Cacilda Borges do Valle - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Anete Pereira de Souza.
8.   2007-2009. Atuação das vias do chiquimato e dos fenilpropanóides em resposta ao tratamento de soja convencional e transgênica com glifosato
Descrição: A contribuição deste projeto é a de avaliar os efeitos do glifosato nas atividades de enzimas das duas vias metabólicas (chiquimato desidrogenase, PAL, CAD e POD) e os teores de lignina, de ácido chiquímico, de ácidos hidroxibenzóicos (protocatecuico e gálico) e de derivados do ácido cinâmico (p-cumárico, caféico e ferúlico), após submissão de soja convencional e transgênica ao glifosato. Três conduções experimentais são efetuadas: germinação das sementes, crescimento das plântulas em meio hidropônico e crescimento das plantas em casa de vegetação. A metodologia proposta prevê o uso de espectrofotometria, cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) e eletroforese. A possível aplicação das técnicas a serem desenvolvidas neste projeto visando diferenciar soja convencional de transgênica é, também, um das metas pretendidas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Osvaldo Ferrarese Filho - Coordenador / Maria de Lourdes L Ferrarese - Integrante / Edicléia Aparecida Bonini - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 16 / Número de orientações: 7
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
9.   2007-2010. Avaliação do potencial de uso de leveduras como agentes no controle biológico de fitopatógenos
Descrição: Isolamento de leveduras de rizosfera de cana-de-açúcar para emprego potencial no controle biológico de fitopatógenos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Integrante / Sâmia Maria Tauk Tornisielo - Coordenador / Marcia Maria Rosa - Integrante / Pedro Eduardo Rampazzo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 2
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
10.   2007-2009. Bioetanol: desenvolvimento de leveduras industriais Brasileiras para fermentação eficiente dos açúcares presentes na biomassa
Descrição: Identificação e análise de leveduras industriais com potencial utilização no processo de fermentação de açucares obtidos da biomassa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Integrante / Stambuk Boris - Coordenador / Luis C Basso - Integrante.
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
11.   2007-2009. Bionformática para análise in silico de expressão gênica em cana-de-açúcar (Saccharum spp.), feijão-caupi (Vigna unguiculata) e mamona (Ricinus communis)
Descrição: Este projeto de pesquisa tem por objetivo geral desenvolver a aplicação de ferramentas de bioinformática úteis para análise dos dados de expressão gênica disponíveis para cana-de-açúcar (Saccharum spp.), feijão-caupi (Vigna unguiculata) e mamona (Ricinus communis) in silico, de modo a favorecer sua aplicação em estudos de genômica funcional e melhoramento genético destas espécies vegetais. Para tanto, são objetivos parciais a identificação e análise virtual da expressão de genes candidatos, potencialmente ligados a processos biológicos de impacto favorável nestas culturas para a agricultura e agroindústria do Nordeste. Além da tolerância a estresses bióticos (patógenos, pragas) e abióticos (deficiência hídrica, salinidade, toxidez do solo), de análise comum nas espécies citadas, outros processos de aplicação específica serão investigados, tais como: cana-de-açúcar: biossíntese e acúmulo de sacarose, resposta a fitorreguladores e teor de fibras; feijão-caupi: simbiose para fixação biológica de nitrogênio atmosférico; mamona: biossíntese e acúmulo de ácidos graxos. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador. Financiador(es): Universidade Federal de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
12.   2007-2009. Bioprospecção e biotecnologia de defensinas e proteínas associadas em plantas nativas e cultivadas
Descrição: Defensinas são proteínas pequenas (15-20 resíduos) catiônicas, ricas em cisteína, encontradas em diversos organismos, com atividade contra bactérias, fungos e vírus encapsulados. Diversos estudos têm comprovado a ação de defensinas vegetais na ativação do sistema imunológico e em mecanismos associados a processos anticarcinogênicos em humanos. Estes peptídeos possuem alta atividade antimicrobiana (concentração mínima inibitória entre nM e mM), são facilmente produzidas por expressão heteróloga e são bastante resistentes a condições adversas. As defensinas de planta possuem cerca de 5 kDa, e estrutura contendo fitas-beta antiparalelas, alfa-hélice e pontes dissulfeto. Apesar da grande biodiversidade vegetal do Brasil e da região Nordeste, pouco é conhecido sobre as diversas denfensinas produzidas pelas espécies de plantas nativas e ou cultivadas, e quais podem ser suas atividades biológicas úteis do ponto de vista farmacológico e até mesmo terapêutico. Neste projeto de pesquisa objetiva-se identificar e caracterizar genes e peptídeos classificados como defensinas em espécies vegetais da região Nordeste, além de investigar seu potencial de aplicação na saúde humana, especialmente associado à prevenção e tratamento de distúrbios do sistema imunológico, alteração da microbiota endógena e mecanismos de desenvolvimento de tumores.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Integrante / Valesca Pandolfi - Integrante / Maria Clara Pestana - Integrante / Sergio Crovella - Coordenador. Financiador(es): Universidade Federal de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
13.   2007-Atual. Caracterização Fisiológica e Molecular da resposta à seca em cana-de-açúcar
Descrição: Esse projeto envolve seis universidade públicas (UNICAMP, UFRPE, UFPE, USP, UFAL e UFSCar) e tem como objetivo geral reunir profissionais especialistas em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular de plantas cultivadas, para desvendar as alterações fisiológicas decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcriptômica e proteômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Laurício Endres - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Tercílio Calsa Jr - Integrante / Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - FINEP - Auxílio financeiro.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
Descrição: O projeto é uma colaboração entre seis Universidades públicas (UFAL, UFPE, UFRPE, UFSCAR, USP e UNICAMP) e visa integrar competências na área de fisiologia, genética e melhoramento clássico, de forma a entender a fisiologia e a base genética da tolerância à seca em cana-de-açúcar com vistas à produção de plantas mais tolerantes. Os objetivos são o estudo dos mecanismos fisiológicos que permitem o escape, a tolerância ou evasão à seca, a caracterização da base molecular da tolerância à seca através de análises do transcritoma, microtranscritoma e proteoma. Valor Financiado: R$ 1.620.477,17. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Souza, G. M. - Integrante / Monalisa Carneiro Sampaio - Integrante / Lauricio Endres - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
14.   2007-2009. Caracterização fisiológica e molecular da resposta à seca em cana-de-açúcar - GENOPROT
Descrição: Projeto que envolve seis universidade públicas: UNICAMP, UFRPE, UFPE, USP, UFAL, UFSCar. Pretende reunir as competências em cultivo, fisiologia, melhoramento e biologia molecular de vários integrantes, com o objetivo geral de desvendar as alterações fisiológicas decorrentes da seca em variedades de cana contrastantes para a tolerância, bem como identificar as bases moleculares da tolerância através de um enfoque de transcritômica e proteômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
15.   2007-2009. Caracterização funcional de genes associados com a tolerância ao estresse hídrico em Coffea Canephora
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Fábio Murilo da Matta - Integrante / Elizabeth Batista Pacheco Fontes - Integrante / Marco Aurélio Pedron e Silva - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
16.   2007-2007. Composição, estrutura e implicações filogenéticas da parede celular de pteridófitas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
17.   2007-2008. Construção e sequenciamento de bibliotecas de cDNA de feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp)
Descrição: Auxiliar na construção das bibliotecas de cDNA e SAGE de feijão-caupi pertinentes ao Projeto NordEST/ReNorBio [Convênio: BNB/MCT/UFPE/FACEPE Genômica Funcional, Estrutural e Comparativa de Feijão-Caupi (Vigna unguiculata)] e no sequenciamento de seus clones. Auxiliar na análise dos dados transcricionais produzidos e de sua potencial aplicação no melhoramento genético de feijão-caupi no Estado de Pernambuco. Possibilitar treinamento nas áreas de Genômica e Biologia Molecular de Plantas. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Coordenador / Rodrigo assunção de Holanda - Integrante. Financiador(es): Ministério da Ciência e Tecnologia - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
18.   2007-2010. Desenvolvimento de novas estratégias de monitoramento biológico da presença de arsênio no meio ambiente e avaliação de sua genotoxidade
Descrição: EDITAL Nº 04/07/ Fapemig-Grupos Emergentes de Pesquisa APQ-6221-5.02/07 (Marcelo Ehlers Loureiro, Coordenador,UFV: O arsênio sido considerado o elemento mais tóxico a saúde humana e altos níveis contaminação por têm sido detectados no estado de Minas Gerais. As técnicas utilizadas atualmente para determinar o impacto ambientam subestimam significativamente o nível de contaminação. Plantas biosensoras são mais adequadas a este propósito por refletirem diretamente o fluxo de metais tóxicos do solo para a cadeia alimentar. Neste projeto aqui proposto, criaremos uma planta transgênica de mostarda indiana (Brassica juncea) biosensora do arsênio, utilizando o promotor induzido por arsênio controlando a expressão da proteína GFP. A sensibilidade deste método será avaliada por diferentes ensaios de linearidade em cultivo hidropônico e em em solo. Adicionalmente utilizaremos outros tipos de plantas biosensoras da genotoxidade da contaminação ambiental, avaliando o efeito do arsênio no aumento das taxas de mutações pontuais e recombinações cromossômicas. Protocolos para a detecção da genotoxidade com amostras de solo e água contaminados serão otimizados, e será avaliado potencial mutagênico da contaminação ambiental em algumas amostras de nosso estado. Adicionalmente, nos aprofundaremos na elucidação dos mecanismos de tolerância ao arsênio, identificando novos genes e isolando novos promotores induzidos pelo arsênio, utilizando hibridação de macroarranjos de DNA formados a partir de bibliotecas subtrativas enriquecidas com genes de baixo nível de expressão e induzidos por arsênio em espécies hiper-acumuladoras ocorrendo naturalmente em nosso estado, identificadas por nosso grupo. Os dados aqui gerados permitirão o maior conhecimento sobre os mecanismos de tolerância e acumulação do arsênio em plantas e permitirá posterior evolução das tecnologias aqui aplicadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Fábio Murilo da Matta - Integrante / Marco Oliva Cano - Integrante / Andréa Miyasaka de Almeida - Integrante / Aristeia de Azevedo - Integrante / Ivo Ribeiro da Silva - Integrante / Luiz Eduardo Dias - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
19.   2007-Atual. DESENVOLVIMENTO DE UM PROCESSO BIOTECNOLÓGICO PARA PRODUÇÃO DE ÁCIDO SUCCÍNICO
Descrição: Técnicas avançadas de Engenharia Bioquímica tem sido utilizadas para desenvolver processos de produção de uma série de moléculas de interesse industrial a partir de matérias-primas renováveis, que sejam economicamente competitivos com os que tradicionalmente utilizam derivados de petróleo. Por fazerem uso de materiais de origem biológica, propõe-se o termo Biorrefinaria para designar os processos ou os arranjos industriais dessa natureza. Dentro desta perspectiva, várias categorias de produtos devem ser destacadas como candidatos potenciais para desenvolvimento de commodities de larga utilização; destacando-se os ácidos orgânicos. O objetivo do presente trabalho é o desenvolvimento de um processo de produção do ácido succínico, tendo em vista sua ampla aplicação na indústria de transformação, principalmente a química, farmacêutica e de alimentos. Por possuir uma reatividade bastante elevada, devido à sua quiralidade natural, o ácido succínico pode ser usado como plataforma ( blocos de construção para síntese química) para obtenção de diversos produtos de interesse industrial, com ênfase na obtenção de plásticos biodegradáveis. Sua produção por síntese química não é viável do ponto de vista ecológico, pois geram altos níveis de poluentes, impulsionando a busca por alternativas biotecnológicas a partir de bactérias como Anaerobiospirillum succiniproducen e Actinobacillus succinogenes, reportadas como as melhores produtoras de ácido succínico. O presente projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um bioprocesso para a produção desse importante ácido orgânico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Elcio Ribeiro - Integrante / Danielle da Silveira dos Santos - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
20.   2007-2009. Ecofisiologia do pinhão manso sob condições de sequeiro no semi-árido do Estado de Pernambuco
Descrição: A convivência de recursos limitados do semi-árido com o homem existe e sempre existirá, no entanto, há necessidade de se encontrar atividades sustentáveis e que possibilitem essas famílias a romperem o ciclo de miséria que se encontram presas. Dessa forma, várias áreas do semi-árido estão se tornando árido e o que é árido vem se tornando desértico. A alternativa de culturas que possam ser exploradas nesta região e que possam vir a ter sua produção comercializada pode ser uma saída para este problema, neste contexto, o pinhão manso (Jatropha curcas L.) pode ser uma espécie promissora em um futuro em médio prazo. O óleo produzido a partir da semente de pinhão manso é semelhante ao do diesel extraído do petróleo. As propriedades encontradas no biocombustível atendem às especificações que a Agência Nacional do Petróleo (ANP) para o petrodiesel. Esta qualidade destaca a espécie para integrar o time de plantas oleaginosas que irão compor o programa de produção de combustível vegetal na região seca do Nordeste. As pesquisas com a planta na região ainda são bem recentes e é preciso ser prudente e buscar as informações técnicas já disponíveis para que não se venha a montar sistemas de produção insustentáveis. Além disso, pouco se sabe da diversidade do comportamento ecofisiológico dessas plantas. O investimento em pesquisa de base se faz necessário no momento para que no futuro se possa explorar essa espécie com sucesso. Diante do exposto a proposta ora apresentada tem como objetivo principal caracterizar o comportamento ecofisiológico, sobretudo as relações hídricas e as trocas gasosas de plantas de pinhão manso sob cultivo de sequeiro no semi-árido nordestino... Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Mauro Guida dos Santos - Coordenador / Bruno Rafael Monteiro Rodrigues - Integrante / Antônio Celso Dantas Antonino - Integrante / Gabriela Burle Arcoverde - Integrante / Marcelo Francisco Pompelli - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
21.   2007-2010. Engenharia de Proteínas para Biomedicina e Indústria
Descrição: A engenharia de proteínas necessita a integração multidisciplinar para incorporar diversas técnicas da microbiologia, biologia molecular, bioquímica de proteínas e biofísica. O projeto envolve dois sub-projetos que aplicam as técnicas de engenharia de proteínas para entender a base estrutural da interação de inibidores com as fosfolipases A2 secretadas, e para desenvolver enzimas industriais termoestáveis utilizando evolução dirigida. As fosfolipases A2 apresentam uma larga distribuição na natureza com diversas funções desde danificação de membranas o (PLA2 de serpente) até como um fator na regulação da resposta inflamatória e agregação de plaquetas (PLA2 de mamíferos). Essa função reguladora da resposta inflamatória faz com que as PLA2s sejam alvo de intervenção químico-farmacológica para o tratamento de doenças como artrite, e o projeto pretende analisar a base estrutural da ligação de um inibidor as fosfolipases A2 secretadas humano de grupo II. O projeto de engenharia de xilanase representa uma iniciativa pelo grupo para desenvolver projetos visando aplicações para enzimas de interesse no setor de biotecnologia e na indústria biofarmacêutica. O uso de enzimas em processos industriais pode garantir um aumento da especificidade sob substrato, pureza do produto e uma redução dos impactos ambientais. O projeto pretende aplicar evolução dirigida para introduzir propriedades de interesse industrial na xilanase 11 de Bacillus subtilis (linhagem 1A1). Proc. # 304982/2006-7. CNPq, Bolsa de Produtividade em Pesquisa, nível 1D. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
22.   2007-2010. Estratégias integradas para o melhoramento genético da cana-de-açúcar visando tolerância a seca
Descrição: O desenvolvimento de variedades tolerantes à seca tem sido uma das prioridades dos programas de melhoramento do Instituto Agronômico de Campinas. Apesar de aproximadamente 80 variedades de cana-de-açúcar terem sido desenvolvidas no Brasil nos últimos 10 anos, poucas possuem potencial produtivo para o cultivo nas condições de cerrado. A escassez de informações genéticas e moleculares sobre os mecanismos de tolerância à seca e sua herança são fatores limitantes para o maior sucesso na geração de variedades melhoradas. Técnicas que permitam uma melhor eficiência na identificação de genótipos tolerantes aumentariam a eficiência de seleção e poderiam reduzir o tempo necessário para o desenvolvimento de genótipos melhorados. Ferramentas moleculares têm auxiliado na identificação, mapeamento e isolamento de locos de características quantitativas e genes responsivos ao estresse hídrico em uma série de gramíneas A análise da expressão gênica em escala genômica permite que se identifiquem padrões espaciais e temporais de indução e repressão de determinados genes, bem como a sua localização subcelular, fornecendo indicações importantes sobre os processos biológicos nos quais os produtos gênicos estão envolvidos. Este projeto representa uma linha temática do Centro de Cana IAC, cujo objetivo principal é caracterizar a tolerância ao estresse hídrico em cana-de-açúcar e aplicar este conhecimento no programa de melhoramento para a obtenção de variedades tolerantes para cultivo na região de cerrado. Para tal, etapas de caracterização molecular de clones tolerantes a seca, mapeamento de uma população segregante e análise de expressão global de genótipos contrastantes para a característica estão sendo conduzidas. . . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luciana Rossini Pinto - Integrante / Jorge Gonçalves da Silva - Integrante / Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Marcos Guimarães Landell - Coordenador / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Márcio Aurélio Pitta Bidoia - Integrante / Daniel Nunes da Silva - Integrante / Silvana Creste. - Integrante / Roland Vencovsky - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Luciana Rossini Pinto.
23.   2007-2010. Fisiologia, biologia molecular e biotecnologia da tolerância à seca em cana-de-açúcar
Descrição: O objetivo do projeto é estudar os efeitos da seca em cana-de-açúcar, com vistas à produção de novas variedades com maior tolerância a esse estresse abiótico. Os grupos da UFAL, UFRPE e UFSCAR realizarão ensaios para identificar as diferenças fisiológicas e bioquímicas entre variedades de cana em condições de irrigação e de supressão da rega. Os grupos da UNICAMP E USP farão estudos de expressão gênica com chips de DNA para avaliar o transcritoma e o microtranscritoma. O grupo da UFPE fará estudos de proteômica para complementar a identificação de alvos com potencial biotecnológico. Numa etapa final do projeto, os grupos da UNICAMP e da ESALQ/USP desenvolverão plantas transgênicas de cana utilizando genes alvo identificados. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Geraldo Verríssimo de Souza Barbosa - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante / Carrer, H. - Integrante.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
Descrição: Descrição: O objetivo do projeto é estudar os efeitos da seca em cana-de-açúcar, com vistas à produção de novas variedades com maior tolerância a esse estresse abiótico. Os grupos da UFAL, UFRPE e UFSCAR realizarão ensaios para identificar as diferenças fisiológicas e bioquímicas entre variedades de cana em condições de irrigação e de supressão da rega. Os grupos da UNICAMP E USP farão estudos de expressão gênica com chips de DNA para avaliar o transcritoma e o microtranscritoma. O grupo da UFPE fará estudos de proteômica para complementar a identificação de alvos com potencial biotecnológico. Numa etapa final do projeto, os grupos da UNICAMP e da ESALQ/USP desenvolverão plantas transgênicas de cana utilizando genes alvo identificados. Valor Financiado: R$ 694.000,00.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Helaine Carrer - Integrante / Gláucia M Souza - Integrante / SOUZA, GLAUCIA MENDES - Integrante / Lauricio Endres - Integrante / Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Tercílio Calsa Jr. - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
24.   2007-2009. Manipulação da atividade sacarolítica em células-guarda e caracterização de sua interação com o metabolismo do ácido abscísico no controle dos movimentos estomáticos
Descrição: Edital Fapemig Universal 2006: - CAG 1358/06 (Marcelo Ehlers Loureiro, Coordenador,UFV): Este projeto possui duas principais justificativas. A primeira de aspecto mais biotecnológico, baseia-se na necessidade de pormenorizar e comprovar o fenótipo já observado nos nossos resultados anteriormente citados. A avaliação da extensão dos mesmos fenótipos a uma outra espécie de planta (Arabidopsis), utilizando agora um promotor totalmente específico à célula guarda (promotor Kco1), permitirá conferir se os fenótipos previamente observados não seriam devidos a uma mudança pleiotrópica relacionado a mudanças do metabolismo em diferentes órgãos e células da planta. Assim sendo, parte das atividades deste projeto se definem como verificações necessárias que poderão gerar uma patente de metodologia para obter-se plantas transgênicas mais tolerantes à seca. A segunda justificativa deste projeto é de natureza científica, embora tenha ainda um aspecto biotecnológico. Este trabalho gerará informações ainda não disponíveis na literatura, e que são de importância para a compreensão dos mecanismos de regulação da abertura estomática, a saber: (i) caracterização da inter-relação entre o metabolismo de sacarose e da sinalização do ácido abscísico em Arabidopsis e, (ii) Caracterização fenotípica mais pormenorizada das plantas mutantes na resposta ao ácido abscísico, visto que será realizada uma análise metabólica e fisiológica detalhada, gerando dados ainda não disponíveis na literatura. Em suma, este trabalho justifica-se pelo fato de gerar novas informações importantes para elucidar a regulação estomática, e de também avaliar o potencial biotecnológico dos efeitos de modificações acumuladas na expressão de vários genes com potencial de conferir maior tolerância à seca, o que é particularmente recomendado no caso de redundância de mecanismos de controle, particularmente complexos para as células estomáticas, como já revisadas na introdução. Este projeto também permitira as condições. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Fábio Murilo da Matta - Integrante / Elizabeth Batista Pacheco Fontes - Integrante / Maria M. S. Gomes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
25.   2007-2010. Mapa genético-molecular para Hevea brasiliensis e mapeamento de QTL s para características de importância econômica
Descrição: O presente projeto visa o desenvolvimento de um mapa-genético molecular utilizando marcadores microssatélites e mapeamento de locos associados a características de importância econômica em Hevea brasiliensis, dentre as quais, a resistência ao frio, para a população F1 (280 indivíduos) obtida a partir de cruzamento entre os genitores PB217 (alto potencial produtivo) x (tolerância ao frio) PR255. Essa população já foi obtida, tendo sido plantada no campo no início de 2006. Tal projeto tem grande urgência no desenvolvimento pois ele abrirá o caminho para a utilização da biotecnologia e técnicas de biologia molecular na obtenção de cultivares mais adaptados e produtivos de H. brasiliensis. A construção de um mapa genético molecular saturado contribuirá para o mapeamento de muitos outros genes importantes, bem como abrirá a possibilidade de seleção assistida por marcadores e inúmeros estudos sobre variabilidade genética, estrutura populacional, fluxo gênico e sistema reprodutivo em H. brasiliensis, estudos estes ainda por fazer até o momento. Uma vez construído um mapa de ligação saturado para H. brasiliensis, espera-se poder estender o uso desta ferramenta à diferentes cruzamentos e germoplasmas brasileiro de seringueira. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Paulo de Souza Gonçalves - Integrante / Domimique Garcia - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Anete Pereira de Souza.
26.   2007-2010. Mapeamento genético de genes de resistência à murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli) do feijoeiro comum com base em marcadores AFLP e microssatélites
Descrição: Mapeamento de genes associados a resistência à murcha de fusário em feijoeiro comum através de marcadores moleculares do tipo microssatélites e AFLP. Específicos: Obtenção de populações segregantes. Avaliação da resistência à murcha de fusário nas famílias das gerações F2:3 e F2:5. Genotipagem da população de mapeamento com marcadores microssatélites e AFLP. Identificação do número e da localização cromossômica, bem como tipo e magnitude dos efeitos dos genes envolvidos na resistência à murcha de fusário. Validação na geração F2:5 dos marcadores moleculares identificados nas famílias da geração F2:3. Obtenção de famílias resistentes á murcha de fusário. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Joaquim Geraldo Cáprio Costa - Coordenador / Carlos Agustín Rava - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
27.   2007-2009. Metabolismo de compostos aromáticos em Trichoderma reesei
Descrição: Diversos compostos químicos complexos estão contaminando e se acumulando no meio ambiente, colocando em risco a saúde humana e a vida no planeta. Na natureza vários microorganismos (bactérias e fungos) desenvolveram a capacidade metabólica de degradação e utilização destes compostos contaminantes (hidrocarbonetos mono- ou poli- aromáticos, benzeno, tolueno, etilbenzeno, xileno, óleo cru, etc.), como fonte de carbono, nitrogênio e energia. Os fungos filamentosos são reconhecidos por sua versatilidade metabólica, entretanto existem poucas informações sobre as vias metabólicas que utilizam estes compostos. Neste projeto, pretendemos identificar e caracterizar, no nível molecular, genes envolvidos nas vias metabólicas que utilizam compostos aromáticos (nitrilos e fenol) no fungo filamentoso Trichoderma reesei a fim de estabelecer um modelo de expressão gênica regulada por compostos aromáticos e determinar sua potencial utilização como agente de biorremediação de áreas contaminadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Felipe Santiago Chambergo Alcalde - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Felipe Santiago Chambergo Alcalde.
28.   2007-2010. Metabolismo de ácidos fenólicos de soja convencional e transgênica, submetidas ao glifosato
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 4
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
29.   2007-2010. O efeito do CO2 sobre a biomassa de açaí e mata pasto e suas consequências para produção de energia elétrica em sistemas isolados na Amazônia
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Centrais Elétricas do Norte do Brasil - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
30.   2007-2009. Obtenção de enzimas e compostos quelantes de metais produzidos por basidiomicetos e sua relação com a degradação de compostos recalcitrantes
Descrição: O projeto proposto pretende avaliar o papel dos compostos quelantes de metal produzidos por basidiomicetos de decomposição branca em conjunto com fenoloxidases na degradação dos compostos de natureza recalcitrante. Como modelos serão empregados: azure B, Poly-R , Remazol Brilliant Blue (RBBR), lignina, celulose e hemicelulose.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / Valdeir Arantes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 8 / Número de orientações: 3
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
31.   2007-2009. PRODUÇÃO DE BIOETANOL A PARTIR DE BIOMASSAS RESIDUAIS DA INDÚSTRIA DE CELULOSE
Descrição: Projeto de parceria entre LADEBIO, ARACRUZ Celulose (hoje FIBRIA) e Petrobrás que visa a produção de etanol a partir de etapas de hidrolise seguida de fermentação, tendo como matéria-prima biomassas residuais do setor de papel e celulose (cavacos e pastas de celulose). O projeto objetivou desenvolver um processo de produção de etanol a partir de biomassa residual da indústria de celulose, através de hidróse enzimática e fermentação simultâneas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Luiz André Felizardo Silva Schlittler - Integrante / Neumara Luci Conceição Silva - Integrante. Financiador(es): ARACRUZ CELULOSE S.A. - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Nei Pereira Junior.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Integrante / Nei Pereira Jr - Coordenador. Financiador(es): ARACRUZ CELULOSE S.A. - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
32.   2007-2009. Produção de um Complexo Multienzimático pelo Fungo Penicillium corylophilum (Edital Universal)
Descrição: O engaço de bananeira, suporte que sustenta o cacho da banana, representa um componente residual com estrutura altamente fibrosa composta de celulose, hemicelulose e lignina, que pode ser aproveitado na indústria de celulose e papel, especificamente na produção de papelão para sacaria e caixas, assim como fonte de carbono para produção de enzimas hidrolíticas de interesse biotecnológico. O engaço é descartado no processo de separação das pencas nas casas de embalagens ou centros distribuidores, sendo depositados sobre o solo. A possibilidade de aproveitamento deste material, como fonte de carbono para produção de enzimas, representa uma alternativa para regiões produtoras de banana por agregar um valor a um resíduo. Experimentos anteriores (Medeiros et al., 2003) demonstraram que o fungo Penicillium corylophilum, pertencente à Micoteca do Laboratório de Enzimologia, é um excelente produtor de enzimas hidrolíticas, apresentando um grande potencial para aplicações nas industrias de celulose e papel, combustível, têxtil e alimentos. Em estudos previamente realizados, verificou-se que tal microorganismo apresentou, em comparação com outras espécies, maior atividade celulolítica e xilanolítica quando crescido em meios de culturas contendo diferentes fontes de carbono, incluidno engaço de bananeira. Outros experimentos envolvendo ultrafiltração (membrana do tipo PM 300) e cromatografia de filtração em gel (Sephacryl S-400) do extrato bruto (obtido através do crescimento do fungo em meio de cultura contendo engaço de bananeira como fonte de carbono) revelaram a presença de um complexo multienzimático contendo atividades de xilanase, celulase, pectinase e mananase. Nesses experimentos, o complexo foi detectado no concentrado da ultrafiltração e no volume vazio da coluna cromatográfica. Desse modo, com o intuito de ampliar os conhecimentos sobre o complexo acima descrito e e utilização em processos biotecnológicos colocam-se como objetivos desse projeto de pesquisa: a) Produ. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
33.   2007-2011. Propagação de ondas de pressão acústica em escoamentos multifásicos
Descrição: Proc. Fapesp 07/08555-0. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
34.   2007-2008. Recursos Complementares para Apoio a Grupos de Pesquisa - Pró Reitoria de Pesquisa - USP
Descrição: Contrapartida de auxílio pesquisa FAPESP 06/00182-8; Número do processo: 07.1.12523.1.0; Valor total concedido: R$ 3.000,00; . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador.
Membro: Igor Polikarpov.
35.   2007-2010. Rede Sul-Americana de Propriedades Termofísicas e Mecânicas - Técnicas de Medida
Descrição: Edital CNPq Nº 005/2007 Chamada I Redes Temáticas Proc. 490556/2007-8. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
36.   2007-2008. Reparo de equipamento - liofilizador
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
37.   2007-2010. Seleção e caracterização bioquímico-molecular de clones de cana-de-açúcar e de microrganismos lignocelulolíticos visando a maximização da sacarificação e fermentação a partir do bagaço para produção de álcool celulósico
Descrição: Responsãvel pelas etapas do projeto referentes ara o projeto "Enzimas para Saccarificação de Biomassa" dentro o Instituto do Milenio coordenado pelo Prof. Dr. Marcio H.P. Barbosa (UFV) cujo objetivo é produzir substratos celulósicos a partir dos clones selecionados pelas características diferenciadas de fibra, Caracterizar a susceptibilidade dos materiais pré-tratados à hidrólise por celulase e avaliar a fermentabilidade dos hidrolisados de bagaço oriundos de sua hidrólise enzimática para a produção de etanol Valor R$ 570.682,00 . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Integrante / Marcio Henrique Barbosa - Coordenador / Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Flávia Maria Lopes Passos - Integrante / Gláucia Mendes Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.

2006

1.   2006-2009. (BOLSA PRODUTIVIDADE) Estudos estruturais de macromoléculas de interesse biomédico e biotecnológico
Descrição: Bolsa Produtividade em Pesquisa Nível 1A; Processo nro 300703/2005-8; Vigência: 01/03/2006 a 28/02/2009 . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
2.   2006-2008. (UNIVERSAL 2006) Estudos de Relação Estrutura-Função do Receptor de Estrógeno e do Receptor de Hormônio Tireoidiano
Descrição: Proc. nro 470232/2006-4; Edital MCT/CNPq 02/2006 Universal Aux.Pesquisa - REGULAR; Valor total concedido R$44.557,70. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
3.   2006-2006. Alfredo Fusco - Medical School of Naples - Italia
Descrição: Aux. Vinda Pesquisador Visitante; Processo nro 06/00359-5; Vigência: 29/07/2006 a 31/08/2006. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador / A Fusco - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
4.   2006-Atual. Biofísica estrutural dos receptores e proteínas relacionadas
Descrição: Proc. nro 06/00182-8 Aux.Pesquisa - TEMÁTICO; Vigência: 1/6/2006 31/5/2010; Valor total concedido: R$277.741,28 + US$179.9373,24 + RT R$93.140,23. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador / P Webb - Integrante / M S Skaf - Integrante / L M T R Lima - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
5.   2006-2009. Caracterização bioquímica e genética das glutationas S-transferases de cana-de-açúcar envolvidas na desintoxicação de herbicidas
Descrição: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) possui grande importância para a economia brasileira, sendo fonte de matéria prima para produção de açúcar e álcool, chegando a representar cerca de 3,5% do PIB. Os gastos inerentes à proteção dessa cultura contra ervas daninhas pelo uso de diversos herbicidas são muito expressivos, da ordem de 240 milhões de dólares/ano. A glutationa S-transferase (GST) é uma enzima que tem a capacidade de conferir resistência aos efeitos danosos dos herbicidas em várias espécies vegetais, inclusive algumas de interesse agronômico. Da mesma forma, compostos sintéticos denominados de safeners (protetores) têm a capacidade de induzir a expressão de GSTs em gramíneas, que por sua vez, protegem a cultura contra a aplicação de determinados herbicidas. Em cana-de-aççuar, resultados preliminares do nosso laboratório sugerem o papel potencial das GSTs na tolerância à alguns herbicidas largamente empregados na cultura. O projeto SUCEST identificou presumivelmente inúmeros transcritos das principais classes dessa enzima, mas ainda não foram realizados estudos funcionais das GSTs em resposta à herbicidas. Portanto, a identificação e caracterização das isoformas de GSTs de cana-de-açúcar que estejam associadas à resposta a aplicação de herbicidas e safeners oferecem o potencial na possível seleção de cultivares com expressão diferencial ou isoformas que aumentem a tolerância à herbicidas, ou mesmo sua utilização por manipulação direta em plantas transgênicas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Renato Rodrigues Ferreira - Integrante / Deborah Sane Nishimura - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
6.   2006-2012. Caracterização Ecofisiológica de Fruteiras Tropicais Submetidas a estresses Abióticos
Descrição: A seleção de genótipos de fruteiras tropicais com características agronômicas que atendam as exigências dos mercados interno e externo, cada vez mais competitivos, é um tema estratégico para a Região do Nordeste brasileiro, uma vez que a pesquisa agrícola faz parte do eixo de sustentabilidade para a fruticultura atual. No entanto, para as condições edafoclimáticas nas quais as espécies são cultivadas, é imprescindível o embasamento ecofisiológico, para que dessa forma se possam elucidar algumas das alterações metabólicas nas plantas, principalmente aquelas relacionadas com a produtividade e qualidade dos seus frutos. No presente trabalho será estudado, sob condições de campo, casa de vegetação e laboratório, durante um período de seis anos, as frutíferas tropicais de interesse econômico para o Nordeste, tais como, aceroleira (Malpighia emarginata DC), pitangueira (Eugenia uniflora L.), araçazeiro (Psidium araca Raddi),, caramboleira (Averrhoa carambola L.)., cirigueleira (Spondias purpurea L.), cajazeira (Spondias Mombin Jacq.), umbuzeiro (Spondias tuberosa Arr. Cam.), jaqueira (Artocarpus heterophyllus Lam.),, abacateiro (Persea americana Mill.) e jambeiro (Eugenia sp.). Para cada espécie, serão avaliados e correlacionados dados de natureza ecofisiológica e correlatos com o objetivo de se identificar alguns parâmetros que possam servir de marcadores de tolerância aos estresses abióticos aplicados, e, dessa forma, proceder a indicações futuras para os produtores, de genótipos mais adaptados para as condições fisiográficas da Região.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / André Dias de Azevedo Neto - Integrante / Elizamar Ciriaco da Silva - Integrante / João Emmanoel Fernandes Bezerra - Integrante / Ildo Eliezer Lederman - Integrante / Maria Alice Vasconcelos da Silva - Integrante / Francisco Pinheira de Araújo - Integrante / Fernando Henrique de Aguiar Vale - Integrante / Hans Raj Gheyi - Integrante / Laurício Endres - Integrante / Maria Fernanda F. da Silva - Integrante / Marcio de Oliveira Martins - Integrante / Wayse Maria de Siqueira - Integrante / Lis Fernandes Stegmann - Integrante / Marcelo Siqueira Ribeiro - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal de Campina Grande - Cooperação / Universidade Federal de Minas Gerais - Cooperação / Universidade Federal de Alagoas - Cooperação / Instituto Agronômico de Pernambuco - Cooperação / empresa brasileira de pesquisa agropecuária - Cooperação.Número de orientações: 10
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
7.   2006-2010. COMPORTAMENTO DE PINHÃ-MANDO (Jatropha curcas L.) SOB DÉFICIT HÍDRICO E FENOLOGIA DA ESPÉCIE PARA O ESTADO DE ALAGOAS.
Descrição: O programa de biodiesel brasileiro ainda está no seu início. Políticas de incentivo e fomento a produção de biodiesel tem sido estabelecidas. Somente com a mistura de 2% de biodiesel, o país necessita produzir cerca de 800 milhões de litros de biodiesel/ano a partir de 2007. Entre as espécies oleagenosas, o pinhão-manso (Jatropha curcas) vem se destacando para a produção de biodiesel, principalmente por apresentar menor exigências hídricas e nutricionais em relação a outras espécies, ideal para as condições nordestinas. O objetivo do trabalho é estudar a fenologia do pinhão-manso para o Estado de Alagoas, o comportamento das atividades fotossintéticas e relações hídricas ao longo do ciclo anual e sua capacidade de resistir ao déficit hídrico. Para isso serão feitos experimentos em casa de vegetação em que a planta será submetida a crescentes déficits hídricos e será avaliada a capacidade da espécie de se recuperar do estresse. Também serão feitos experimentos de campo em que serão acompanhadas a fenologia da espécie e sua adaptação ao Agreste Nordestino. Entre os parâmetros avaliados estão a fotossíntese, transpiração, condutância estomática, potencial hídrico foliar, teor de óleo, etc. O estudo possibilitará o desenvolvimento de novas tecnologias para o incremento da produtividade do pinhão-manso.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
8.   2006-2008. Desenvolvimento de um sensor de título para medição em linhas de distribuição de vapor
Descrição: Desenvolvimento de um sensor de título para medição em linhas de distribuição de vapor a partir um modelo de rede naural alimentado por medições de pressão e de impedância capacitiva. Auxílio FAPESP (PIPE) 06/12819-6, ordenadores Dr. Eng. Paulo Roberto Barbosa (SF-Brasil) e Prof. paulo Seleghim Jr.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
9.   2006-Atual. Engaço de bananeira como substrato para produção de celulase de fungo com potencial biotecnológico (EDITAL UNIVERSAL)
Descrição: O projeto visa o estudo das propriedades bioquímicas e físico-químicas de endoglucanase, produzida a partir do crescimento de fungo em meio contendo resíduo de bananeira, e sua aplicação na indústria têxtil. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Jurgen Andreaus - Integrante / Danielle de Oliveira braga - Integrante / Rômulo de Araújo Castro - Integrante / Marísia Ferreira Cortes - Integrante / Félix Gonçalves Siqueira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
10.   2006-2008. Influência de Estresses Abióticos nos Caracteres Fisiológicos e Bioquímicos da Mangabeira
Descrição: A necessidade de expansão do mercado de frutas tropicais tem levado a utilização de áreas não tradicionais de certas espécies para o seu cultivo em escala comercial. No entanto, para que estes empreendimentos agrícolas tenham resultados positivos é preciso que haja conhecimento sobre o comportamento ecofisiológico destas plantas sob situações de estresses abióticos. A mangabeira tem sinalizado como uma espécie com grande potencial econômico, graças à ampla aceitação de seus frutos no mercado interno. Além disto, é de conhecimento popular existência de propriedades medicinais no seu látex e que no passado foi usado para a produção de borracha natural. O Nordeste apresenta características que propiciam a exploração de diversas frutas tropicais, todavia, a ocorrência de secas e salinização de solo ocasionada por altas taxas de evaporação, irregularidade na quantidade e distribuição da pluviosidade e manejo inadequado de áreas irrigadas, tem provocado a redução da produtividade e da área cultivável. Informações sobre as respostas fisiológicas e bioquímicas da mangabeira frente a estas situações, bem como alterações no seu metabolismo diante de mudanças climáticas em seu habitat natural que são imprescindíveis para o desenvolvimento de tecnologias que possam viabilizar a exploração econômica desta cultura. Neste projeto pretende-se submeterem mudas de mangabeira a situações de estresse hídrico e salino em condições de casa de vegetação e avaliar possíveis alterações no seu comportamento estomático e composição bioquímica. Além disso, pretende-se identificar e selecionar genótipos promissores através da avaliação do comportamento estomático, bem como a composição bioquímica das folhas e látex em plantas adultas de um pomar natural e fornecer informações de grande utilidade para o melhoramento genético dessa cultura, referentes ao grau de adaptação para as condições climáticas da região.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Elizamar Ciriaco da Silva - Integrante / André Dias de Azevedo Neto - Integrante / Josué Francisco da Silva Junior - Integrante / Maria Alice Vasconcelos da Silva - Integrante / Hans Raj Gheyi - Integrante / Marcio de Oliveira Martins - Integrante / Eric Beserra de Melo Sousa - Integrante / Marcelle Almeida da Silva - Integrante / Danúbia Ramos Moreira de Lima - Integrante. Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Cooperação / Universidade Federal de Campina Grande - Cooperação / Universidade Federal Rural de Pernambuco - Cooperação.Número de orientações: 3
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
11.   2006-Atual. Isolamentos de fungos termofílicos produtores de lipases para obtenção de biodiesel
Descrição: O projeto referente à Produção de lipases por fungos termofílicos e produção de biodiesel trata da seleção de fungos termofílicos produtores de lipases capazes de promoverem reações de hidrólise e transesterifcação de óleo de soja visando a produção. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Tassia Egea - Integrante / Ana Lucia Ferrarezzi - Integrante.
Membro: Eleni Gomes.
12.   2006-2008. Localização subcelular de proteínas de cana-de-açúcar (Saccharum spp.): caracterização in silico e avaliação funcional
Descrição: A caracterização funcional dos genes descobertos no projeto EST da cana-de-açúcar é um grande desafio. A identificação da localização subcelular das proteínas contribuiria nesse sentido, pois a localização determina potenciais padrões de interação metabólica. Nosso grupo, em colaboração com outras equipes, identificou genes com expressão associada à síntese e à acumulação de açúcar em folhas e entrenós, e genes que apresentam expressão constitutiva ou tecido preferencial. O principal objetivo deste projeto é ampliar o estudo funcional de genes de cana-de-açúcar através do estabelecimento de uma rotina para a determinação da localização subcelular de suas proteínas. Para tal serão utilizados métodos de bioinformática para predição in silico e experimentos de expressão transiente de proteínas fusionadas com a proteína GFP (green fluorescent protein) em células de cana-de-açúcar ou de cebola. Na visualização da fluorescência da GFP o uso de microscópio confocal será de grande valia. A localização subcelular será correlacionada com diversos dados funcionais, ampliando o conhecimento sobre importantes processos da cana-de-açúcar. Valor: R$ 148.428,98 e U$ 55.268,30.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Renato Vicentini dos Santos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
13.   2006-2008. Manipulação da atividade sacarolítica em células-guarda e caracterização de sua interação com o metabolismo do ácido abscísico no controle dos movimentos estomáticos
Descrição: Este projeto possui duas principais justificativas. A primeira de aspecto mais biotecnológico, baseia-se na necessidade de pormenorizar e comprovar o fenótipo já observado nos nossos resultados anteriormente citados. A avaliação da extensão dos mesmos fenótipos a uma outra espécie de planta (Arabidopsis), utilizando agora um promotor totalmente específico à célula guarda (promotor Kco1), permitirá conferir se os fenótipos previamente observados não seriam devidos a uma mudança pleiotrópica relacionado a mudanças do metabolismo em diferentes órgãos e células da planta. Assim sendo, parte das atividades deste projeto se definem como verificações necessárias que poderão gerar uma patente de metodologia para obter-se plantas transgênicas mais tolerantes à seca. A segunda justificativa deste projeto é de natureza científica, embora tenha ainda um aspecto biotecnológico. Este trabalho gerará informações ainda não disponíveis na literatura, e que são de importância para a compreensão dos mecanismos de regulação da abertura estomática, a saber: (i) caracterização da inter-relação entre o metabolismo de sacarose e da sinalização do ácido abscísico em Arabidopsis e, (ii) Caracterização fenotípica mais pormenorizada das plantas mutantes na resposta ao ácido abscísico, visto que será realizada uma análise metabólica e fisiológica detalhada, gerando dados ainda não disponíveis na literatura. Em suma, este trabalho justifica-se pelo fato de gerar novas informações importantes para elucidar a regulação estomática, e de também avaliar o potencial biotecnológico dos efeitos de modificações acumuladas na expressão de vários genes com potencial de conferir maior tolerância à seca, o que é particularmente recomendado no caso de redundância de mecanismos de controle, particularmente complexos para as células estomáticas, como já revisadas na introdução. Este projeto também permitira as condições para solidificar a principal linha de pesquisa do coordenador deste projeto, a qual resi. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Marcelo Ehlers Loureiro - Coordenador / Fábio Murilo da Matta - Integrante / Elizabeth Batista Pacheco Fontes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Ehlers Loureiro.
14.   2006-2008. O FUNGO FILAMENTOSO ASPERGILLUS NIDULANS COMO UM SISTEMA MODELO PARA A CARACTERIZACAO DAS FUNCOES CITOPLASMATICAS DA ATM (ATAXIA - TELANGIECTASIA) QUINASE).
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
Membro: Gustavo Henrique Goldman.
15.   2006-Atual. PRODUÇÃO DE CELULASES E SUA APLICAÇÃO NA HIDRÓLISE DE MATERIAIS LIGNOCELULÓSICOS
Descrição: Resíduos agrícolas e agroindustriais são, em sua maioria, de natureza lignocelulósica. A utilização destes materiais para obtenção de biocombustíveis, alimentos, enzimas, ácidos orgânicos e outras substâncias químicas de alto valor econômico é um dos campos de pesquisa mais importantes na atualidade. As pesquisas sobre celulases têm se concentrado no desenvolvimento de uma mistura de enzimas que atuem cooperativamente e com altas atividades e, no desenvolvimento de processos de produção mais econômicos. Desta forma, surge a necessidade de se desenvolverem estudos para a otimização da produção de celulases em nosso próprio país, pois o integral aproveitamento da biomassa lignocelulósica requererá a produção de celulases "in plant" para prover a sustentabilidade econômica do setor. Dessa forma, este estudo tem como objetivo, avaliar as variáveis que afetam na produção de enzimas do complexo celulásico por uma linhagem, previamente selecionada, de Penicillium funiculosum, por fermentação em estado sólido em biorreator especialmente dimensionado para este fim.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Roberto N Maeda - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
16.   2006-Atual. Produção de etanol por hidrólise enzimática da biomassa de cana-de-açúcar
Descrição: Projeto de pesquisa financiado pela FINEP, coordenado pelo Prof. Rogério Cerqueira Leite (Unicamp) e adminstrado pela Fundação de Desenvolvimento da Unicamp (Funicamp). Tendo como as seguintes Instituições como colaboradoras: 1. CENTRO DE TECNOLOGIA CANAVIEIRA CTC 2. ESCOLA DE ENGENHARIA DE LORENA EEL USP 3. FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE REGIONAL DE BLUMENAU FURB 4. INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGIA INT 5. INSTITUTO DE PESQUISAS TECNOLÓGICAS DO ESTADO DE SÃO PAULO S.A. IPT 6. TOYOBO DO BRASIL LTDA. 7. UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA - UnB 8. UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ UEM 9. UNIVERSIDADE ESTADUAL DO NORTE FLUMINENSE DARCY RIBEIRO UENF 10. UNIVERSIDADE DE CAXIAS DO SUL UCS 11. UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS UFLA 12. UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO UFPE 13. UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO UFRJ 14. UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO USP 15. UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIAS - UFG . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Danielle de Oliveira braga - Integrante / Félix Gonçalves Siqueira - Integrante / Rômulo de Araújo Castro - Integrante / Marísia Ferreira Cortes - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
17.   2006-2008. Produção e purificação de xilanase de Penicillium corylophilum
Descrição: Projeto financiado pelo Funpe (fundo de pesquisa da UnB), visando o estudo de enzimas xilanolíticas de fungo filamentoso (Penicillium corylophilum). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho - Coordenador / Danielle de Oliveira braga - Integrante. Financiador(es): Universidade de Brasília - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
18.   2006-2008. Renovação e Inovação Instrumental em Bioquímica e Biofísica para o Centro-Oeste
Descrição: Projeto financiado pelo CT-infra da FINEP. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
19.   2006-2011. Respostas Fisiológicas de plantas às Mudanças Climáticas Globais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa do Agronegócio - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Silveira Buckeridge.
20.   2006-2009. Sistema de detecção de vazamentos em oleodutos e gasodutos
Descrição: Desenvolvimento de um sistema de detecção de vazamentos em oleodutos e gasodutos baseado em técnicas de análise tempo-freqüência e de processamento com auxílio de redes neurais. Auxílio FAPESP (PIPE) Proc. No. 06/12916-9, coordenadores Dr. Eng. Marcelo Selli (ASELCO) e Prof. Paulo Seleghim Jr.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (2) . Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
21.   2006-2008. Uso do etanol e da ACC sintase para indução da maturação da cana-de-açúcar.
Descrição: A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum sp) está entre as mais importantes do Brasil, sendo um setor de grande importância econômica no país devido ao crescente consumo de álcool e açúcar. Uma prática comum antes da colheita da cana é a aplicação de precursores do hormônio etileno para acelerar o amadurecimento final das plantas, e conseqüentemente aumentar o teor de sacarose. O objetivo principal deste projeto é desenvolver uma estratégia para promover o amadurecimento controlado da cana-de-açúcar no final da safra, usando o etanol em substituição aos precursores de etileno. Para tal, será avaliado o uso de um promotor ativo somente na presença de etanol (sistema de expressão alc de Aspergillus nidulans) controlando a expressão do gene que codifica a ACC sintase, enzima chave na biossíntese de etileno. Desta forma, pretende-se ativar a biossíntese de etileno através da pulverização com etanol. Valor Financiado: R$ 49.287,50. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Juliana de Maria Felix - Integrante / Rafael Garcia Tavares - Integrante / Maira Zorzetto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.

2005

1.   2005-2007. Análise transcriptômica global de meristemas florais da cana-de-açúcar via análise serial (SAGE
Descrição: O florescimento da cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é um fenômeno indesejado para a produção de sacarose. Estudos moleculares visando à identificação dos principais genes responsáveis pelo processo de indução floral poderão disponibilizar estratégias a serem empregadas no melhoramento de materiais menos indutivos, seja por seleção assistida, seja por controle direto por manipulação genética. O presente projeto propõe utilizar a técnica de Análise Serial da Expressão Gênica (SAGE) para confrontar a transcrição global de meristemas florais em início de desenvolvimento de duas variedades, uma de fácil ('SP87-432') e outra de difícil indução floral ('SP902-3414'), nas condições de Piracicaba, SP. Dada a grande potencialidade e eficiência da SAGE em relação às outras técnicas de análise transcricional, esta técnica tem sido extensivamente utilizada especialmente em fungos e humanos, mas ainda muito poucos trabalhos têm sido relatados em espécies vegetais. A SAGE consiste no isolamento de pequenas porções (tags) de cada transcrito (10-14 pb) e a posterior concatenação destes em vetores de seqüenciamento. Cada vetor, então, carrega diversas tags, cada qual originada de um único transcrito. Cada tag é, então, confrontada com um banco de seqüência de ESTs da espécie em estudo e análises em programas especificamente desenvolvidos para a técnica identificam a origem de cada tag e fornecem sua freqüência relativa. As tags geradas neste projeto serão confrontadas com o banco de dados gerado pelo projeto SUCEST-FAPESP e no Gene Indices do TIGR (www.tigr.org). Os transcritos que forem identificados por apresentar contrastes entre as variedades serão validados empregando a técnica de PCR quantitativo em tempo real e/ou northern blot. A validação final dos resultados gerados poderá ser conduzida por manipulação direta dos genes por transformação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Raul Santin Almeida - Integrante / Tercílio Calsa Júnior - Integrante / Vagner Augusto Benedito - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
2.   2005-2009. Arquitetura Genética e Mapeamento de QTL´s (Quantitative Trait Loci) de Características de Desempenho Zootécnico e de Carcaça em Frangos de Corte (Gallus gallus)
Descrição: A avicultura brasileira e mundial vêm alcançando expressiva evolução nos índices de desempenho devido ao melhoramento genético baseado em conceitos de genética quantitativa, onde ocorre a seleção de indivíduos com fenótipos desejáveis para serem os genitores da geração seguinte. Com o advento das técnicas moleculares de análise genética (marcadores moleculares), um novo horizonte abriu-se aos melhoristas, vislumbrando-se maiores possibilidades de ganhos à medida que o controle genético dos caracteres quantitativos sob seleção é desvendado, permitindo que novas informações sejam incorporadas aos métodos clássicos de melhoramento, por meio da identificação de genes que controlam tais caracteres. Grandes esforços vêm sendo realizados para a construção de um mapa genético de frango de corte com o uso de marcadores microssatélites, que servem de base para a realização de estudos para a identificação de QTL´s (quantitative trait loci) que estejam associados às características de interesse comercial. Atualmente, os métodos de análise genético-estatísticas envolvidas no mapeamento de QTL´s são muito complexos, envolvendo profundos conhecimentos nas áreas de Genética, Estatística e Computação. Com o uso desses métodos, é possível estudar a arquitetura genética dos caracteres quantitativos, pois os mesmos permitem determinar o número, a posição, os efeitos e as interações entre os QTL´s. Assim, os objetivos deste projeto de pesquisa serão; i) mapear QTL´s associados às características de desempenho zootécnico e de carcaça em uma população referência de frangos de corte (CT); ii) realizar estudos sobre a arquitetura genética de caracteres quantitativos nessa população, determinando localização e número de QTL´s envolvidos no controle destas características, o(s) tipo(s) de ação(ões) gênica(s) dos QTL´s que controla(m) tais características; iii) estudos detalhados da correlação entre tais caracteres.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Millor Fernandes do Rosário - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
3.   2005-2009. Avaliação do florescimento de genótipos de cana-de-açúcar na serra do ouro
Descrição: AVALIAÇÃO DO FLORESCIMENTO DE GENÓTIPOS DE CANA-DE-AÇÚCAR NA SERRA DO OURO . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador / João Messias dos Santos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
Membro: Laurício Endres.
4.   2005-2008. Caracterização do gene SsNAC23 em plantas transgênicas de cana-de-açúcar.
Descrição: O estudo dos mecanismos de resposta a estresse em cana-de-açúcar pode contribuir na criação de variedades mais resistentes à condições como frio e seca. Este projeto visa caracterizar o papel do gene SsNAC23, induzido por baixas temperaturas e com alta similaridade com fatores de transcrição. Para tal serão estudadas as respostas de plantas superexpressando ou silenciadas para o gene SsNAC23. Análises da fotossíntese, níveis de prolina e peroxidação de lipídeos serão conduzidas nas plantas transgências e em plantas controle, submetidas ou não à condições de frio e estresse hídrico, a fim de verificar a maior resistência das plantas transgênicas à essas condições. Os genes regulados pelo fator de transcrição SsNAC23 serão identificados via microarranjos de cDNA, comparando pantas controle e transgênicas. Valores Financiados: R$ 69.714,07 e U$ 5.790,42.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
5.   2005-2009. Dekkera e Brettanomyces : caracterização e comportamento fermentativo de linhagens contaminantes da fermentação alcoólica
Descrição: Processo: 05/04011-0 As leveduras Brettanomyces/Dekkera estão envolvidas no processo de deterioração de vinhos após o término das fermentações alcoólicas e maloláticas e são responsáveis pela formação de compostos secundários que conferem odores desagradáveis aos mesmos. Trata-se de um microrganismo oportunista e não competitivo que já foi documentado em processo contínuo de produção de etanol e que podem ser combatidas pelas leveduras "killer". Devido ao importante papel que essas leveduras exercem nos processos fermentativos do vinho e do álcool como contaminantes e a pouca informação que se tem sobre isso especialmente quanto à fermentação etanólica, o presente estudo propõe a caracterizar as de linhagens de Dekkera/Brettanomyces isoladas de processos fermentativos diversos utilizando-se testes fisiológicos/bioquímicos e moleculares, verificar a atividade 'killer' e a sensibilidade das mesmas à toxinas 'killer' diversas, além de avaliar o crescimento e o comportamento fermentativo dessas linhagens em condições industriais. Espera-se com os resultados poder contribuir para o entendimento do papel que as leveduras Dekkera/Brettanomyces tem no processo de fermentação alcoólica, em comparação com isolados de ambientes vinícolas, onde o conhecimento está melhor estabelecido. Propõe-se também testes rápidos e confiáveis para a detecção dessas linhagens nos processos, uma vez que elas têm taxas lentas de crescimento e baixo nível de ocorrência.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador / Ana Paula Guarnieri Bassi - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
6.   2005-2007. Desenvolvimento e caracterização de marcadores microssatélites em espécies forrageiras tropicais para uso em estudos genéticos e melhoramento
Descrição: O presente projeto tem como objetivos o desenvolvimento de microssatélites para as espécies forrageiras tropicais de maior importância no Brasil, sendo elas representadas por diferentes espécies de gramíneas: Brachiaria (B. brizantha, B. decumbens, B. dictioneura, B. humidicola e B. ruziziensis), Panicum maximum (panicum), Paspalum sp (regnnelli, plicatulum, notatum, dilatatum) e, para as leguminosas Stylozanthes sp (S. capitata, S guianensis e S. macrocephala), Calopogonium mucunoides (calopogônio), Cajanus cajan (feijão guandu) e Centrosema pubescens (centrosema). Os microssatélites desenvolvidos serão utilizados em estudos genéticos destas espécies e em programas de melhoramento, incluindo avaliação da diversidade dos acessos disponíveis em bancos de germoplasma, determinação da taxa de cruzamento, caracvterização varietal, etc. Tais estudos serão extremamente valiosos aos programas de melhoramento que vêm sendo desenvolvidos para estas espécies em diferentes Centros de Pesquisa no Brasil (EMBRAPA-Gado de Corte, EMBRAPA SUDESTE, IAC, IZ, entre outros).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Letícia Jungmann Cançado - Integrante / Melissa de Oliveira Santos - Integrante / Cacilda Borges do Valle - Integrante / Rodrigo Possidonio Sassaki - Integrante / Adna Cristina Barbosa de Souza - Integrante / Jussara de Paiva - Integrante / Liana Jank - Integrante / Rosangela M S Resende - Integrante / Fernanda Witt Cidade - Integrante / Diana Geraldi Balque - Integrante / Deise Juliana da Silva Lima - Integrante / Patricia Mara Francisco - Integrante / Bianca Baccili Zanotto Vigna - Integrante / Patricia Zambon - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Anete Pereira de Souza.
7.   2005-2007. Determinação do estado hídrico de pinheiras (Annona squamosa L.) submetidas a diferentes regimes hídricos por meio de parâmetros ecofisiológicos.
Descrição: Apesar da grande importância sócio-econômica da pinheira (Annona squamosa L.) para Alagoas, a sua produtividade ainda é muito baixa (cerca de três toneladas por hectare). Em algumas áreas do Nordeste onde se cultiva a pinheira com um mínimo de tecnologia, principalmente irrigação e adubação, consegue-se produtividades superiores a 25 toneladas por hectare. O estresse hídrico é um dos principais obstáculos para o aumento da produção de pinha no Estado de Alagoas e no Nordeste Brasileiro. As perdas de produtividade devido às secas têm sido cada vez mais freqüentes. Entre os parâmetros fisiológicos sensíveis ao estresse hídrico estão a fotossíntese e o potencial hídrico foliar, que podem ser utilizados para correlacionar produtividade e estresses ambientais. O projeto de pesquisa aqui proposto tem por objetivo ampliar os conhecimentos sobre a dinâmica dos processos fisiológicos das pinheiras, por meio da análise de parâmetros fisiológicos que indiquem o estado hídrico da planta (por exemplo, a taxa fotossintética, a transpiração, a condutância estomática, o potencial hídrico, a relação entre temperaturas da folha e do ar, a atividade de enzimas antioxidantes, etc), entre plantas irrigadas e plantas não irrigadas. Através dessa análise, poderão ser identificados os parâmetros fisiológicos que indiquem o estado hídrico da planta para um correto manejo da irrigação e, conseqüentemente, aumento de produtividade dos pomares e da renda do produtor rural.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
8.   2005-2008. ESTUDOS DE HIDRÓLISE E DESTOXIFICAÇÃO DA TORTA DE MAMONA (Ricinus communis L.) PARA PRODUÇÃO DE BIOETANOL
Descrição: O óleo da semente de mamona, após processo de transesterificação com uso de etanol e catalisador, pode ser usado como um combustível alternativo (biodiesel) que vem ganhando importância frente à problemática dos combustíveis fósseis. O resíduo sólido proveniente da prensagem das sementes de mamona (torta de mamona) é rico em amido e peptídeos alergênicos. A demanda certa de biodiesel prevista até 2013 garante pleno crescimento na geração de torta de mamona, que se destaca com potencial para geração de bioetanol e que por isso necessita de processos que garantam sua destoxificação. Neste trabalho abordamos o aproveitamento desse resíduo de forma a destiná-lo para produção de bioetanol e, concomitantemente, assegurar a redução da toxicidade causada pela presença de proteínas tóxicas. Métodos de hidrólise química e enzimática serão utilizados a fim de hidrolisar o amido a açúcares livres sob condições experimentais que resultem na destoxificação da torta de mamona. Para padronização da hidrólise química, que atua mais como uma etapa de destoxificação e gelificação do amido para a subseqüente etapa enzimática, serão avaliadas as variáveis tempo de hidrólise, concentração de ácido, razão sólido:líquido e temperatura. O processo de hidrólise da torta por via enzimática será avaliado com o uso combinado de α-amilase, glicoamilase e pululanase, seguido por fermentação usando Saccharomyces cerevisiae. O principal objetivo é desenvolver um processo com elevada eficiência de hidrólise, no qual a torta de mamona perca seu efeito tóxico, e gere um meio hidrolisado com máxima concentração de açúcares. Dessa forma, por fermentação é possível obter uma concentração de etanol capaz de integrar o processo biodiesel (etapa de transesterificação) como insumo 100% proveniente da torta de mamona residual da extração do óleo de rícino.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Walber Carvalho Melo - Integrante. Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.
Membro: Nei Pereira Junior.
9.   2005-2007. Expressão diferencial e purificação de peroxidases dependentes de manganês produzidas por Ceriporiopsis subvermispora durante a biodegradação de Eucalyptus grandis (processo FAPESP
Descrição: O presente projeto se insere na linha de pesquisa: Biodegradação da madeira : uma abordagem química, bioquímica e tecnológica, em desenvolvimento no Departamento de Biotecnologia da Faenquil. Especificamente propõe-se estabelecer uma metodologia para purificar as isoformas de peroxidases dependentes de manganês produzidas pelo fungo Ceriporiopsis subvermispora durante a biodegradação de cavacos de Eucalypus grandis. O domínio desta metodologia permitirá avaliar e comparar o perfil das isoenzimas produzidas em condições de expressão diferenciada (na presença ou ausênciua de co-substratos) e proverá subsídios para realização de estudos futiroa. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / Hévila Brognaro - Integrante / Walter de Carvalho - Integrante / Joseana R do Monte - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Número de produções C, T A: 1
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
10.   2005-2007. Expressão, purificação e análise estrutural de proteínas de interesse em saúde e biotecnologia
Descrição: Edital CNPq 040/2005 - Prosul; Número do processo: 490215/2005-0; Vigência: 01/11/2005 a 31/10/2007. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Integrante / H Terenzi - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.
11.   2005-2008. Filamentação em Saccharomyces cerevisiae e seus efeitos sobre a capacidade fermentativa de linhagens industriais: aspectos genéticos e fisiológicos
Descrição: Processo 04/06669-0 A levedura S. cerevisiae é dimórfica, ou seja, é capaz de crescer tanto na forma unicelular quanto na forma filamentosa. Uma variedade de condições promove crescimento pseudohifal, como condições limitantes de nitrogênio, meio com fonte pobre de carbono ou outras condições estressantes. Como S. cerevisiae é uma levedura largamente utilizada industrialmente (produção de etanol), esse projeto tem por objetivos avaliar a filamentação apresentada por linhagens industriais em resposta à deficiência de nitrogênio, carbono e presença de álcoois superiores, condições que ocorrem largamente durante o processo fermentativo; avaliar se em condições industriais estressantes, leveduras industriais apresentam crescimento filamentoso, verificando a ação do sorbitol como inibidor da filamentação e atividade da quitinase; realizar deleção de genes associados à filamentação em leveduras industriais (MPK1, SWE1, PHO85 e SIC1), verificando a influência da inativação desses genes sobre a ´performance´ fermentativa das cepas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador / Paula Cristina da Silva - Integrante / Heloísa Gallera Brunetto - Integrante / Guilherme Tadeu Vancetto - Integrante / Viviane Santos Miranda - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
12.   2005-2008. Mapeamento Genético e Identificação demarcadores moleculares genômicos e funcionais associados a características importantes em cana-de-açúcar
Descrição: No Brasil, o agronegócio da cana-de-açúcar movimenta cerca de 36 bilhões de reais por ano e constitui um dos setores de maior geração de empregos diretos e indiretos. A construção de mapas genéticos de ligação contribui para a elaboração de estratégias a serem introduzidas no programa de melhoramento, de forma a acelerar o desenvolvimento de novas variedades. O mapeamento de locos associados com o teor de açúcar e os componentes de produção (número de perfilhos, diâmetro e altura de colmos) é de grande importância para o melhoramento da cana-de-açúcar. O banco de dados do SUCEST tem viabilizado o desenvolvimento de marcadores funcionais para serem aplicados no mapeamento genético. Esses marcadores são considerados ideais para seleção assistida, visto que os mesmos podem ser os responsáveis pela característica em questão. O presente projeto visa iniciar um programa de mapeamento genético para o programa Cana IAC. Para tanto marcadores moleculares do tipo AFLP (polimorfismos de comprimento do DNA amplificado), microssatélites genômicos (gSSRs) e microssatélites provenientes de seqüências expressas (EST-SSRs) com homologia a genes de interesse serão utilizados para a construção de um mapa genético a partir de um cruzamento bi-parental, entre materiais elites do programa. Pretende-se também, detectar e mapear QTLs associados ao teor de açúcar e aos componentes de produção e verificar a associação de marcadores RFLPs-PCRs (polimorfismos de restrição de fragmentos amplificados) desenvolvidos a partir de ESTs correspondentes a genes expressos durante a interação com Puccinia melanocephala, com a resistência a ferrugem em cana-de-açúcar. A construção de um mapa genético utilizando materiais elites do programa Cana IAC auxiliará na validação de marcadores genômicos e funcionais associados a características agronômicas de interesse (ou locos de características quantitativas - QTLs) identificados em outros mapas de cana-de-açúcar, dando suporte na aplicação destes marcadores p. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Luciana Rossini Pinto - Coordenador / Anete Pereira de Souza - Integrante / Antonio Augusto Franco Garcia - Integrante / Silvana Creste Souza - Integrante / Marcos Guimarães Landell - Integrante / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Márcio A. Pitta Bidóia - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Luciana Rossini Pinto.
13.   2005-2010. OTIMIZAÇÃO DA PRODUÇÃO DE CELULASES POR Penicillium funiculosum EM FERMENTAÇÃO SUBMERSA
Descrição: Nas últimas décadas, recursos renováveis têm sido empregados significativamente em diversos processos industriais, aumentando com isso a quantidade de resíduos industriais derivados da biomassa. Portanto, encontrar um destino apropriado para estes resíduos tem se tornado prioritário para economias em desenvolvimento e, dentre uma variedade de alternativas propostas até o momento, muita atenção tem sido dada ao aproveitamento de hidrolisados de biomassa (celulose) para produção de etanol. Nesse caso, estudos são realizados para investigar a viabilidade da via hidrólise enzimática, utilizando os complexos celulásicos produzidos por fungos filamentosos. A hidrólise enzimática da celulose em glicose envolve uma ação sinérgica entre três diferentes enzimas: endoglucanases, exoglucanases e beta-glucosidases. Atualmente, a maior dificuldade do uso de enzimas em processos industriais está relacionada ao alto custo desses biocatalisadores. Apesar do seu alto custo, suas vantagens fazem com que uma variada gama de indústrias as utilizem em seus processos. Os maiores consumidores deste mercado são as indústrias de alimentos e rações, papel e celulose, química fina e fármacos, indústria têxtil e de manufatura de couros e biocombustíveis. Penicillium funiculosum é um excelente fungo filamentoso para produção de celulases. Extratos celulásicos produzidos por este microrganismo apresentam uma adequada aplicação na hidrólise de biomassas, pois promovem a liberação de maiores níveis de glicose, comparado a outras linhagens de Trichoderma e Aspergillus. Este sub-projeto tem como objetivo geral otimizar um bioprocesso para a produção de enzimas do complexo celulásico, por fermentação submersa, a partir do fungo filamentoso Penicillium funiculosum, investigando o melhor substrato, a composição do meio de fermentação ideal e as melhores condições para experimentos em biorreatores instrumentados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Roberto Nobuyuki Maeda - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
14.   2005-2007. Otimização de tecnologia da compostagem de resíduos agrindustriais para a produção de hortaliças orgânicas em Alagoas.
Descrição: x. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Tâmar Cláudia de Araújo Gomes - Coordenador / José Paulo Vieira da Costa - Integrante. Financiador(es): Banco do Nordeste do Brasil S/A - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
15.   2005-2010. PRODUÇÃO DE BETA-GLUCOSIDASE POR Saccharomyces cerevisiae RECOMBINANTE
Descrição: Inúmeros problemas ambientais e sociais estão associados à exploração e ao uso de combustíveis fósseis e levam à busca de novas tecnologias para converter biomassa vegetal em combustíveis alternativos. A celulose representa o maior componente dessa biomassa e é um polissacarídeo hidrolisável por celulases, classificadas em endoglucases, exoglucanases e beta-glucosidases. A produção de celulases por microrganismos naturalmente ocorrentes muitas vezes apresenta como obstáculo as baixas atividades enzimáticas no meio de produção, necessitando o bioprocesso de intensivas operações para concentração dessas atividades. Por outro lado, as técnicas da Biologia Molecular possibilitam a super-expressão de enzimas, minimizando as etapas relacionadas à concentração enzimática, configurando-se em um grande passo para obtenção de celulases, de forma economicamente viável e com grande potencial para aplicação industrial. A levedura Saccharomyces cerevisiae destaca-se como sistema de expressão atraente por ser facilmente manipulada geneticamente e por ser uma boa fermentadora do principal produto de hidrólise das celulases (a glicose). Ressalta-se que linhagens selvagens não apresentam atividade celulolítica. Este projeto tem como principal objetivo avaliar a produção de β-glucosidase em diferentes condições de cultivo a partir da linhagem recombinante de Saccharomyces cerevisiae MFL(Leu2) contendo o gene de beta-glucosidase de Humicola grisea. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Verônica Ferreira - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
16.   2005-2006. Produção, Purificação, Caracterização e Aplicação Biotecnológica de Enzimas Hidrolíticas projeto financiado pelo Funpe
Descrição: estudo bioquímico e tecnológico de enzimas hidrolíticas (xilanases, celulases e pectinases) de fungos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (3) .
Membro: Edivaldo Ximenes Ferreira Filho.
17.   2005-2008. Revitalização do agronegócio da pinha em Alagoas por meio do melhoramento genético de plantas
Descrição: x. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Tâmar Cláudia de Araújo Gomes - Integrante / João Gomes da Costa - Coordenador. Financiador(es): Fundo de Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Bnb - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
18.   2005-2007. Ácido chiquímico como marcador na discriminação de soja transgênica da convencional
Descrição: Cultivares de soja transgênica, capazes de expressar suficientemente o gene CP4-EPSPS, não acumulam ácido chiquímico quando tratadas com o herbicida glifosato, Já, cultivares convencionais acumulam. Assim, nesse projeto se objetiva identificar e quantificar o ácido chiquímico em sementes e plântulas de soja, convencional e transgênica, após tratamento ou não com glifosato. Como prinmcipal meta se almeja o emprego dessa metodologia na seleção de cultivares de soja em programas de melhoramento genético.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes Lucio Ferrarese - Integrante / Edicléia Aparecida Bonini - Integrante / Rogério Marchiosi - Integrante / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante / Ana Paula Ferro - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 7 / Número de orientações: 5
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.

2004

1.   2004-2007. Aspectos Etiológicos, Bioquímicos e moleculares de Guinardia Citricarpa, agente causal da Mancha Preta dos frutos Cítricos.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Helaine Carrer - Integrante / Sérgio Florentino Pascholati - Integrante / Antonio de Goes - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Helaine Carrer.
2.   2004-2008. BIOPROSPECTION IN FUNGI: THE SEARCH OF LEAD COMPOUNDS FOR DRUG DESIGN AND ENZYMES FOR PHARMACEUTICAL AND INDUSTRIAL APPLICATIONS
Descrição: Projeto FAPESP- 04/07935-6 (Projeto temático)Valor: R$ 484.110,25 + US$ 72.982,05 + Reserva técnica R$ 57.274,74. SPECIFIC AIMS 1. To collect, isolate and maintain a library in our laboratories of soil fungi species from several geographic regions of São Paulo State; 2. To collect leaves and roots from some species of Asteraceae (V. arenaria, V. robusta, T. diversifolia and S. sonchifolia) in order to isolate and preserve its endophyte fungi in our laboratory; 3. To prepare a library of extracts from both soil and endophytic fungi previously isolated, as well as from those isolated in new field collections; 4. To carry out preliminary antimicrobial bioassays in our laboratories to select fungal extracts for further chemical study. The extracts will be available to other bioassays of the network, which can detect other promising activities. We have special interest in screening for anticancer and antiparasitic activities; 5. To compare the chemical profiles of the endophyte extracts and its pure compounds with those from its plant sources by HPLC analysis, in order to verify if there are similarities between fungal and plant metabolisms; 6. To fractionate selected extracts by using different chromatographic techniques. This step may be monitored by bioassays; 7. To characterize isolated pure compounds by spectroscopic techniques (NMR, MS, IR, UV); 8. To submit pure compounds to antimicrobial assays. Compounds will be available to other bioassays of the network; 9. To carry out biotransformation of bioactive natural products (grandisin, budlein A, tagitinin C) using isolated fungi, in order to obtain new derivatives, which are not easily obtained by laboratorial synthesis; 10. To undertake the bioassays with the products of biotransformation, mainly in antiprotozoal and antitumoral assays (if available in the network); 11. To identify the promising fungi either from soil or endophytes, which may be of industrial interest or that produce potential. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (5) . Integrantes: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli - Integrante / S. SAID - Integrante / Simone Carvalho Peixoto - Integrante / Michele Michelin - Integrante / Altino Barbosa Junior - Integrante / Jorge Henrique A. Betini - Integrante / Vivian M. Benassi - Integrante / Jairo Kenupp Bastos - Coordenador / Monica T. Pupo - Integrante / Fernando B. Costa - Integrante / Ivone Carvalho - Integrante / Alan Pádua Tristão - Integrante / Juliana Maria Leão - Integrante / Ana Claudia Paiva Alegre - Integrante / Alexandre Maller - Integrante / André Ricardo de Lima Damásio - Integrante / Tony Marcio da Silva - Integrante / Ana Claudia Vici - Integrante / Victor Ricardo Amim Reis - Integrante / Fernanda Dell Antonio Facchini - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 30 / Número de orientações: 20
Membro: Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli.
3.   2004-Atual. Biossolubilização de potássio de pós de brecha, carbonatito e rocha ultramáfica por microrganismos
Descrição: Este projeto faz parte de um projeto maior "Rochas brasileiras como fontes alternativas de potássio para uso em sistemas agropecuários", com coordenação do D. Éder de Souza Martins, cujo objetivo é avaliar em uma rede multi-institucional de pesquisa, o potencial de rochas como fontes alternativas de fertilizantes potássicos. Desse projeto, participam a EMBRAPA, UNB, UFSCar, UFBA, CETEM e EBDA, com financiamento do CNPq.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Integrante / CHRISTIANN DAVIS TOSTA - Integrante / Maria Leonor Lopes Assad - Coordenador / Greice Erler - Integrante / Aline Ferrari - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
4.   2004-2007. Biotipagem de leveduras industriais através do sistema Killer
Descrição: Processo 03/09417-0 Sabe-se que durante o processo de fermentação alcoólica, o fermento sofre inúmeras reciclagens e interferências externas advindas do caldo, do ambiente e de outras fontes, tornando-se vulnerável a contaminação por outros microrganismos e mesmo leveduras indesejáveis. Métodos de monitoramento microbiológico que possibilitem a discriminação das linhagens de forma rápida e inequívoca, além de baratos, são altamente desejáveis. A utilização de meios diferenciais e seletivos, métodos bioquímicos e análise molecular tem se mostrado eficientes, porém são demorados e dispendiosos. A reação ´killer´ é um fenômeno descoberto há 40 anos em Saccharomyces cerevisiae, e resultados satisfatórios já foram obtidos na caracterização de leveudras, considerando-se o perfil ´killer´. Pretende-se nesse projeto avaliar o perfil de atividade ´killer´ de leveduras industriais, e comparado com técnicas de taxonomia clássica e moleculares de identificação, atestar a confiabilidade do mesmo como instrumento de biotipagem de leveduras industriais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Sandra Regina Ceccato Antonini - Coordenador / CHRISTIANN DAVIS TOSTA - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Sandra Regina Ceccato Antonini.
5.   2004-2006. Caracterização e modo de ação de enzimas degradadoras de celulose e hemicelulose de Ceriporiopsis subvermispora
Descrição: O tema do projeto é a purificação de enzimas hidrolíticas produzidas por Ceriporiopsis subvermispora e o estudo do seu modo de ação em substratos presente na madeira, a fim de melhor entender o processo tecnológico da biopolpação. O tema de estudo será abordado utilizando os extratos obtidos após 30 dias de cultivo em cavacos de eucalipto e pinos, que anteriormente já demonstraram êxito no processo tecnológico da biopolpação. O estudo da biodegradação de madeira se justifica com base na importância tanto acadêmica quanto tecnológica do tema. A aplicação da biodegradação de madeira, sob condições controladas e com fungos pré-selecionados, como pré-tratamento aos processos de polpação tem demonstrado grande êxito, principalmente quando utilizada previamente à polpação mecânica. Essa combinação tem sido denominada de polpação biomecânica e a aplicação desse bioprocesso permite reduzir em até 40% o consumo de energia no refinamento mecânico posterior. Adicionalmente, as biopolpas apresentam resistência mecânica significativamente melhor que as polpas convencionais. De fato, esse processo já foi testado em escala ampliada (degradação de 50 toneladas de cavacos) e está em vias de implementação industrial em vários países, inclusive no Brasil. Embora o processo de biopolpação já se encontre em vias de implementação industrial, os mecanismos químicos e bioquímicos envolvidos na biodegradação de madeira ainda são pouco conhecidos e restritos ao que está estabelecido para um pequeno número de fungos decompositores da madeira. O entendimento desses mecanismos pode certamente levar ao melhor desenvolvimento e otimização desse processo biotecnológico. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Coordenador / Perola O Magalhaes - Integrante / Ana Keley Tonon Fuliaro - Integrante / Amanda Monteiro Elias - Integrante / Joseana R do Monte - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 29 / Número de orientações: 8
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
6.   2004-2009. Caracterização estrutural e funcional de proteínas relacionadas à patogenicidade de Magnaporthe grisea (teleomorfo de Pyricularia grisea)
Descrição: Em virtude do valor econômico e social de diferentes plantas, comestíveis ou não, o conhecimento nos níveis genético e molecular da patogenicidade e virulência de fungos patogênicos mostra-se de suma importância. No Brasil e em diferentes países do mundo, a brusone ou "queimadura" é a doença mais significativa que acomete inúmeras variedades de arroz (gênero Oryza). A severidade desta doença deve-se ao fato de o fungo Pyricularia grisea (anamorfo de Magnaporthe grisea) poder afetar todas as partes aéreas da planta em qualquer época de desenvolvimento. Observando a importância da brusone, Magnaporthe grisea tem recebido atenção especial de pesquisadores, a ponto de merecer ter seu genoma analisado de modo detalhado como estímulo para a busca de soluções visando o controle da doença. Os produtos dos genes envolvidos na patogenicidade podem indicar o modo de ação utilizado pelo microorganismo para causar a doença. Muitos de tais produtos gênicos são polipeptídeos cuja função ainda não foi determinada ou não está plenamente caracterizada. No entanto, sabe-se que as diversas funções biológicas de moléculas complexas são determinadas por e dependentes de suas estruturas tridimensionais e também da habilidade destas estruturas responderem a outras moléculas por mudanças conformacionais. Assim, faz-se necessária a elaboração de protocolos adequados tanto para a expressão como para a purificação de proteínas relacionadas à patogenicidade visando a solubilização, a extração e a quantificação eficientes. Este projeto, fazendo uso da clonagem de genes de patogenicidade, da extração e purificação de seus produtos proteicos, da cristalografia, de estudos estruturais por técnica espectroscópica e espalhamento dinâmico de lu e de ensaios bioquímicos adequados, poderá tornar possível a caracterização estrutural de proteínas permitindo uma apreciação de suas funções e auxiliar na compreensão do modo utilizado pelo fitopatógeno para infectar e causar doenças.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Dilaine Rose Silva Schneider - Integrante / Hercília Roberta Cristina Acri Nunes Miranda - Integrante / Beatriz Gomes Guimarães - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Anete Pereira de Souza.
7.   2004-Atual. Descoberta de ligantes do receptor de estrógeno candidatos a novos fármacos no tratamento da osteoporose, câncer de mama e reposição hormonal
Descrição: Processo FINEP 3039/04; Valor total concedido: R$ 1.356.262,2; Vigência: 15/12/2004 a 01/12/2007 Convenente:FAFQ - Fundação de Apoio à Física e à Química; Executor: FFI/ IFSC - Instituto de Física de São Carlos; Co-executor: Instituto Internacional de Pesquisas Farmacêuticas; Interveniente:EMS/SA . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador / A D Andricopulo - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Ems S A - Auxílio financeiro / Fundação de Apoio à Física e à Química - Outra / Instituto de Física de São Carlos - Cooperação.
Membro: Igor Polikarpov.
8.   2004-2006. Desenvolvimento de metodologias moleculares para identificação varietal, análise da variação somaclonal e da presença de vírus em mudas de batata obtidas por micropropagação
Descrição: A cultura da batata (Solanum tuberosum L.) representa a quarta maior produção vegetal do planeta. No Brasil, a produção de batata figura entre as dez principais culturas do país, atingindo a cifra de 2,8 milhões de t. A importação de batata-semente representa uma parcela considerável do custo de produção, além de representar a porta de entrada para patógenos principalmente da classe dos vírus. Com o objetivo de reduzir os custos de produção, vários produtores paulistas associados a laboratórios de culturas de tecidos, estão procurando alternativas para certificar a produção nacional de batata-semente. Uma delas consiste em multiplicar matrizes importadas com alta qualidade fitossanitária, por meio da técnica de cultura de meristemas in vitro. Como a cultura de tecidos tende a induzir a ocorrência de variações somaclonais, sobretudo em condições de repicagens sucessivas, é necessário um estudo para monitorar e definir o n de repiques possíveis de serem efetuados sem que o material sofra alterações genéticas durante o processo. Sendo assim, neste projeto pretende-se utilizar marcadores moleculares do tipo AFLP na identificação varietal dos principais genótipos de batata e no monitoramento da fidelidade genética do material micropropagado. Pretende-se também desenvolver um protocolo simplificado e rápido de detecção molecular dos principais vírus de batata para a fiscalização da sanidade das batatas-sementes.. Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Alexandre Franco Garcia - Integrante / Gisele Abgail Montan Torres - Integrante / Patrícia Maerchezi Rosa - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Anete Pereira de Souza.
9.   2004-2010. Desenvolvimento de microssatélites e construção de mapa genético em Drosophila mediopunctata
Descrição: Marcadores microssatélites há algum tempo se tornaram a ferramenta de escolha no estudo de diversos organismos. Esses marcadores possibilitam a realização de diferentes trabalhos, como genética de populações, mapeamento de QTLs, construção de filogenias, etc. O isolamento de microssatélites para espécies que ainda não têm grande parte de seu genoma seqüenciado é trabalhoso. Drosophila mediopunctata, espécie pertencente ao grupo tripunctata, vem sendo utilizada para estudos genéticos e ecológicos por grupos no Brasil. Essa espécie possui poucos marcadores que facilitem os estudos até agora desenvolvidos. Com esse trabalho, objetiva-se desenvolver, caracterizar e mapear marcadores microssatélites em D. mediopunctata para serem utilizados em estudos de variação morfológica, identificação de QTLs e genética de populações. O uso de microssatélites em D. mediopunctata abrirá também oportunidade de avaliação de outras espécies do grupo tripunctata, ao mesmo tempo em que pode estabelecer essa espécie como modelo para estudo das espécies neotropicais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Prianda Rios Laborda - Integrante / Louis Bernard Klaczko - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Anete Pereira de Souza.
10.   2004-2006. Desenvolvimento de Métodos Genético-estatísticos Para o Mapeamento de QTL's e Seleção Assistida por Marcadores
Descrição: Projeto para desenvolvimento de pós-doutorado no Bioinformatics Research Center, Department of Statistics, North Carolina State University.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Zhao-Bang Zeng - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
11.   2004-2010. DESENVOLVIMENTO DE UM BIOPROCESSO PARA A PRODUÇÃO DE ETANOL A PARTIR DE HIDROLISADO HEMICELULÓSICO
Descrição: Os processos biotecnológicos industriais que utilizam as matérias-primas lignocelulósias têm, tradicionalmente, feito uso somente da glicose oriunda do componente celulósico. Um dos obstáculos encontrados para o total aproveitamento dessas matérias-primas é que as mesmas não podem ser fermentadas diretamente, necessitando, portanto, de hidrólise prévia. A fração celulósica oferece maior resistência ao ataque químico, resultando em rendimentos de hidrólise que não ultrapassam 60%. Por outro lado, a fração hemicelulósica pode ser quase que totalmente extraída do complexo lignocelulósico durante o pré-tratamento da matéria-prima ("steam explosian"), podendo ser hidrolisada com rendimentos da ordem de 90%. A alta proporção de pentoses, particularmente D-xilose, na fração hemicelulósica, aliada a sua maior facilidade de extração do complexo lignocelulósico, ditam que essa fração necessita ser utilizada para efetiva exploração dessas matérias-primas. No Brasil, o bagaço de cana-de-açúcar, subproduto da indústria sucro-alcooleira, representa uma das biomassas com maior potencial tecnológico para a produção de etanol. A fração hemicelulósica desse resíduo agro-industrial é constituída principalmente por xilose e arabinose, arranjadas em uma cadeia facilmente hidrolisável. Entre os diferentes tipos de processos utilizados para se separar seletivamente a fração hemicelulósica, e simultaneamente aumentar a susceptibilidade da celulose ao ataque enzimático, destaca-se a hidrólise com ácido diluído, processo no qual é obtido um licor, contendo os açúcares em sua forma monomérica, que servem como substratos para a produção de etanol pela ação da levedura Pichia stipitis. Durante o desenvolvimento deste projeto, tem-se conseguido determinar condições eficientes de hidrólise para a obtenção de meios com alto conteúdo de xilose e que apresentam alta fermentabilidade. Entre os processos a serem avaliados destacam-se a fermentação em bateladas seqüenciais e contínua. O objetivo geral. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Gabriel Jaime Vargas Betancur - Integrante. Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.
Membro: Nei Pereira Junior.
12.   2004-2006. Desenvolvimento e Caracterização de Marcadores Moleculares do Tipo Microssatélites para Brachiaria brizantha
Descrição: Desenvolver e caracterizar marcadores microssatélites em Brachiaria brizantha visando inicialmente, realizar estudos de diversidade genética entre os acessos presentes no banco de germoplasma e, no futuro, construir um mapa para a espécie e efetuar o mapeamento de características de importância agronômica.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Leticia Jungmann Cançado - Integrante / Cacilda Borges do Valle - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Embrapa Gado de Corte - Cooperação / Fundação de Apoio e Desenvolvimento do Ensino, Ciência e Tecnologia do MS - Bolsa.
Membro: Anete Pereira de Souza.
13.   2004-2007. Determinação da disponibilidade hídrica em culturas agrícolas de semi-árido, feijão e milho, por meio de associação de variáveis agrometeorológica e ecofisiológica
Descrição: O projeto tem como objetivo ampliar os conhecimentos sobre a dinâmica dos processos agrometeorológicos e ecofisiológicas em áreas cultivadas com feijão e milho em Alagoas, visando a caracterização energética e hídrica em ambientes com diferentes tipos de cobertura do solo e estresse hídrico na fase reprodutiva dessas culturas. Tendo como metas: 1. Instalação de experimentos agrometeorológicos em cultivos de feijão e milho; 2. Determinação do balanço de radiação, energia e água da cultura do feijão e milho; 3. Determinação de parâmetros fenológicos e de crescimento de plantas cultivadas; 4. Relação do balanço de energia, fotossíntese e água com o desenvolvimento e práticas de cultivos; 5. Adaptação de modelos agrometeorológicos visando economia de água pela redução da evaporação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / José Leonaldo de Souza - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
14.   2004-2006. Efeitos do óxido nítrico no metabolismo de fenilpropanóides em raízes de soja (Glycine max (L.) Merr.)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Rita de Cássia Siqueira - Integrante / Aparecida Maria Dantas Ramos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
15.   2004-2008. Estudos dos parâmetros morfofisiológicos e bioquímicos em cultivares de cana-de-açúcar submetidos aos estresses hídrico e salino durante a fase inicial de crescimento vegetativo.
Descrição: O presente projeto de pesquisa tem por objetivo estudar, de maneira comparativa, as características morfofisiológicas e bioquímicas em diferentes variedades de cana-de-açúcar submetidas aos estresses hídrico e salino, durante a fase inicial de crescimento vegetativo, sob condições de casa-de-vegetação e identificar quais as características que possam servir como marcadores efetivos para o melhoramento genético da cana-de-açúcar. Para isso, através de ensaios preliminares, seis variedades de cana-de-açúcar, escolhidas entre as mais cultivadas no estado de Alagoas, serão submetidas a dois screening, um para estresse hídrico e outro para estresse salino, respectivamente. De cada screening, com base nos parâmetros de crescimento, serão selecionadas duas variedades, a de melhor (tolerante) e a de pior (sensível) desempenho sob estresse. Nos experimentos comparativos, as plantas de cana-de-açúcar serão cultivadas em vasos plásticos contendo 20 kg de solo, por até 120 dias da semeadura. No experimento de estresse hídrico, as duas variedades contrastantes serão submetidas a três lâminas de irrigação (100, 60 e 20% da água disponível no solo), com 6 repetições cada. No experimento com estresse salino, as 2 variedades selecionadas serão submetidas a 3 níveis de sal, sendo um controle (sem sal) e mais dois níveis, em função da PST e da classificação do solo, com 6 repetições. Serão estudados os parâmetros morfológicos (altura, número de nós/folhas emitidas, área foliar, comprimento e diâmetro de colmo), teor de sacarose nos colmos, produção de biomassa, taxas de crescimento relativo e de assimilação líquida, potencial hídrico e teor relativo de água, teores de clorofila, prolina, carboidratos, N-aminossolúvel e proteínas solúveis nas folhas, além dos teores dos íons Na+, Cl- e K+ e vazamento de íons.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Laurício Endres - Integrante / Nereivana Ferreira Nunes dos Santos - Integrante / José Vieira Silva - Coordenador / Vilma Marques Ferreira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro.
Membro: Laurício Endres.
16.   2004-2008. Genômica do feijão-caupi (Vigna unguiculata)
Descrição: Este projeto pretende organizar uma rede de laboratórios da região nordeste do Brasil visando desenvolver programa de análise genômica funcional, estrutural e comparativa em Vigna unguiculata, com o intuito de tornar o feijão-caupi uma cultura altamente produtiva e rentável no futuro, constituindo-se em uma fonte de renda e desenvolvimento no Nordeste brasileiro. Para isso, serão utilizadas ferramentas de genômica expressa (EST e SAGE), relacionadas a diversos aspectos de maior importância para o melhoramento da citada cultura, associadas a técnicas modernas de mapeamento genético assistido por marcadores moleculares. Adicionalmente, pretende-se estabelecer protocolos eficientes para a transformação e regeneração de indivíduos estáveis expressando genes importantes para o rápido melhoramento desta cultura com metodologias biotecnológicas. Além disso, objetiva-se também estabelecer um protocolo de regeneração de plantas via embriogênese somática e a posterior utilização deste protocolo para a obtenção de linhagens transgênicas com características de tolerância à seca. O projeto deverá integrar 9 instituições e 10 Laboratórios estabelecidos em seis Estados (PE, CE, PB, PI, GO, SP), incluindo 33 doutores de diferentes formações (biólogos moleculares, bioquímicos, biotecnólogos, bioinformatas, melhoristas e agrônomos), sendo 29 atuando na região Nordeste, bem como alunos de graduação e pós-graduação, no sentido de aproveitar plenamente os dados gerados, transformando as informações científicas em benefícios para a classe produtiva. O projeto pretende também gerar no mínimo três publicações de impacto, explorando plenamente os resultados obtidos e dando ampla divulgação científica. Finalmente a proposta da rede NORDEST foi desenhada de modo a colaborar com a concretização da Rede Nordestina de Biotecnologia (RENORBIO), através da integração dos laboratórios e dos programas de pós-graduação, fomentando assim a formação de pessoal em todos os níveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Antonio Figueira - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Coordenador / Ederson Akio Kido - Integrante. Financiador(es): Ministério da Ciência e Tecnologia - Auxílio financeiro / Banco do Nordeste do Brasil - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
17.   2004-2006. IDENTIFCAÇÃO DE GENES RELACIONADOS À QUALIDADE DE GRÃO UTILIZANDO MARCADORES MICROSSATÉLITES E BUSCA DE VARIABILIDADE ALÉLICA NA COLEÇÃO NUCLEAR DE FEIJÃO
Descrição: Este projeto visa desenvolver uma batéria inédita de marcadores SSR para o feijão, a construção de mapas genéticos utililizando estes marcadores, identificação de locos de caracteres quantitativos envolvidos na expressão de características importantes relacionadas à qualidade de grão, e com base nestas informações, organizar os recursos genéticos da coleção de base do feijão para essas características. Serão estudados o teor de fibra, teor de protéina e tempo de cocção de grãos de feijão. As duas primeiras são de importância nutricional para atender principalmente às necessidades alimentares sobretudo de populações carentes, e a última, está relacionada com o aumento da aceitabilidade do consumidor urbano, que exige menor tempo destinado ao cozimento do feijão. Identificados os marcadores SSR relacionados à qualidade nutricional nas populações segregantes desenvolvidas, será feita a busca direcionada por variantes alélicas para os marcadores SSR na coleção de feijão, que conta com 1026 acessos representativos da variabilidade genética do banco de germoplasma do feijão. Os acessos que apresentarem variabilidade alélica de SSRs nas regiões relacionadas às características de qualidade de grão, serão utilizados como parentais em cruzamento com variedades elite de fiejão. Os acessos identificados também serão estudados posteriormente para expressão gênica via análise genômica funcional, por possuírem alelos relacionados com o aumento do valor fenotípico para a qualidade de grão em feijão.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Monalisa Sampaio Carneiro - Integrante / Sergio Tadeu Sibov - Integrante / Rosana Brondani - Integrante / Ariane Leão - Integrante / Maria José Del Peloso - Coordenador / Claudio Brondani - Integrante / Luciana Gomes - Integrante. Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.
Membro: Monalisa Sampaio Carneiro.
18.   2004-2008. Identificação de regiões genômicas e genes diferencialmente expressos associados à resistência do cacaueiro (Theobroma cacao L.) a vassoura-de-bruxa (agente causal Crinipellis perniciosa
Descrição: A doença vassoura-de-bruxa do cacaueiro (Theobroma cacao), causada pelo basidiomiceto Crinipellis perniciosa, levou a total destruição da lavoura sul-baiana, cultivada principalmente com variedades altamente suscetíveis, e tornou o Brasil, um país tipicamente exportador de cacau em importador em poucos anos. O método mais eficiente de controle da doença consiste no uso de variedades resistentes, sendo o genótipo Scavina 6 a única fonte de resistência reconhecida para C. perniciosa em utilização. A região genômica associada a essa resistência já foi identificada por mapemento genético. Porém, a resistência dessa fonte já foi quebrada, possivelmente devido a variabilidade genética do patógeno. Novas fontes de resistência foram identificadas na região Amazônica brasileira (CAB 214 e CAB 208). Populações específicas segregantes derivadas dessas fontes de resistência foram geradas para desenvolver mapas genéticos, e permitir a identificação de regiões genômicas contendo esses fatores de resistência, que serão comparados com aqueles identificados para Scavina 6 . Essas marcas associadas a essas regiões serão usadas em seleção assistida e para a piramidização desses genes. Uma abordagem para identificação de seqüências gênicas presentes e associadas com resistência se baseia na subtração de populações de cDNAs de genótipos e/ou condições (inoculadas ou não) e enriquecimento para genes diferencialmente expressos por meio da construção de bibliotecas subtrativas por supressão. Portanto, os objetivos desse projeto consistem em desenvolver mapas genéticos de duas populações segregantes para a resistência a vassoura-de-bruxa e identificar regiões associadas; e conduzir o seqüenciamento de bibliotecas subtrativas por supressão construídas a partir dos genótipos resistentes, contrastando materiais resistentes e suscetível inoculados com C. perniciosa, e resistentes inoculados e não inoculados, para identificar seqüências diferencialmente expressas a serem usadas para a. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Gildemberg Amorim Leal Junior - Integrante / Paulo Sérgio Bevilacqua Albuquerque - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 3 / Número de orientações: 2
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
19.   2004-2008. Instrumentação e controle de escoamentos multifásicos industriais
Descrição: Proc. Fapesp 03/13819-6, coordenador Prof. Paulo Seleghim Jr. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (8) . Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Seleghim Júnior.
20.   2004-Atual. Levantamento de basidiomicetos da região do Noroeste Paulista
Descrição: O projeto em questão visa o isolamento, identificação e estudos de distribuição de fungos basidiomicetos da região do Noroeste Paulista e faz parte do projeto Biota" Fauna Flora de fragmentos florestais remanescntes do Noroeste Paulista: base para estudos de conservação da biodiversidade" (Fapesp-04/04820-3) e está sendo desenvolvido em interação com o Instituto de Botânica-SP.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Roberto Da Silva - Integrante / Solange Xavier dos Santos - Integrante / Mauricio Boscolo - Integrante / Maira Cortellini Abrahão - Integrante / Roberto JY Fujieda - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 20 / Número de orientações: 9
Membro: Eleni Gomes.
21.   2004-2008. Mapeamento comparativo em cana-de-açúcar por meio do emprego de seqüências heterólogas oriundas de arroz e sorgo
Descrição: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) possui grande importância para a economia brasileira, sendo fonte de matéria prima para produção de açúcar e álcool. As espécies de Saccharum são poliplóides e apresentam genoma relativamente grande e complexo. As variedades comerciais são muitas vezes aneuplóides, resultado do processo chamado nobilização, que envolve cruzamentos interespecíficos, seguido por uma série de retrocruzamentos para S. officinarum, denominada cana nobre . Mapas genéticos são de extrema importância para a compreensão do genoma de uma espécie, pois possibilitam a identificação de regiões genômicas associadas a características agronômicas importantes, que podem ser utilizadas diretamente no melhoramento para seleção assistida ou para a caracterização de genes. Um mapa genético saturado para cana-de-açúcar está sendo desenvolvido no Brasil sob financiamento da FAPESP a partir de uma progênie de 500 indivíduos resultantes do cruzamento entre dois clones de elite, obtidos pelo Centro Tecnológico Copersucar. A análise molecular do genoma de Saccharum poderá ser simplificada pela investigação de sua relação próxima com os genomas mais compactos, como os de sorgo e arroz, possibilitando que características precisamente mapeadas em cana-de-açúcar possam ser dissecadas pelo isolamento de genes ortólogos em sorgo e/ou arroz. Este projeto objetiva saturar o mapa genético de ligação em desenvolvimento, por meio do emprego de sondas heterólogas provenientes de sorgo e arroz, como também comparar a correspondência deste mapa àqueles anteriormente desenvolvidos para cana-de-açúcar por outros grupos de pesquisa no exterior.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Silvana Aparecida Creste Dias Souza - Integrante / Janaína de Cássia Albino - Integrante / Ana Carolina Gasparetti - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
22.   2004-2007. OTIMIZAÇÃO DO PROCESSO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA E FERMENTAÇÃO SIMULTÂNEAS PARA A PRODUÇÃO DE ETANOL A PARTIR DE CELULIGNINA DE BAGAÇO DE CANA DE AÇÚCAR
Descrição: O uso indiscriminado de hidrocarbonetos para o desenvolvimento industrial, além de ocasionar uma diminuição das reservas de petróleo e um aumento excessivo dos preços de seus derivados, tem gerado altos índices de contaminação ambiental. Estes fatores têm motivado a humanidade a procurar novas alternativas energéticas e industriais nas quais diferentes derivados de petróleo sejam substituídos. As biomassas residuais de composição lignocelulósica oferecem uma ampla gama de alternativas para a obtenção de diferentes substâncias de interesse industrial, que podem ser substitutos dos derivados do petróleo, em particular os biocombustíveis, destacando-se o etanol como substituto da gasolina no setor de transporte. Os materiais lignocelulósicos estão constituídos por duas frações polissacarídicas (celulose e hemicelulose) e lignina, sendo majoritária a celulose (40-60%). No caso da utilização da celulose contida no material lignocelulósico, existem diferentes etapas críticas no processo. Inicialmente, faz-se necessário o pré-tratamento do material para reduzir a cristalinidade da estrutura celulósica e remover outras frações. O objetivo principal deste projeto é desenvolver uma concepção de processo, denominada de Simultaneus Saccharification and Fermentation (SSF) para a produção de etanol combustível, a partir da celulose contida no resíduo sólido proveniente do pré-tratamento ácido do bagaço de cana-de-açúcar (celulignina), estabelecendo condições que obedeçam a critérios de alta produtividade e eficiência.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Mariana Peñuela Vásquez - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
23.   2004-2008. PRODUÇÃO DE BIOSSURFACTANTE POR Rhodococcus sp E SUA APLICAÇÃO NA REMOÇÃO DE METAIS PESADOS E DE BORRAS OLEOSAS EM SEDIMENTOS ARENOSOS
Descrição: Os surfactantes constituem uma importante classe de moléculas na indústria química, com possibilidades de uso na indústria farmacêutica, têxtil, de produtos de limpeza, na agricultura e na medicina. Pode-se, também, destacar sua aplicação na biorremediação de áreas contaminadas com óleo e metais pesados. Avanços na Biotecnologia e o aumento da preocupação com o meio ambiente têm contribuído para o uso dos surfactantes de origem biológica como possível alternativa aos surfactantes químicos. Os biossurfactantes são produzidos por diversos microrganismos e sua ação tem sido descrita como sendo a mesma apresentada pelos surfactantes quimicamente sintetizados. Os biossurfactantes apresentam vantagens como baixa toxicidade, são biodegradáveis, podem ser produzidos in situ e apresentam capacidade de atuação em valores extremos de temperatura, pH e salinidade. A aplicação comercial de surfactantes microbianos tem sido limitada devido ao custo de produção mais elevado que os surfactantes quimicamente sintetizados. Para a redução dos custos, com maior produção de biossurfactantes, os estudos devem enfocar: a otimização do bioprocesso de produção por meio de um substrato econômico que garanta um bom crescimento microbiano e uma eficiente recuperação do biossurfactante evitando perdas no processo de purificação. O objetivo geral deste trabalho é contribuir para o desenvolvimento de um bioprocesso para a produção de um biossurfactante por uma linhagem de Rhodococcus erythropolis. Como objetivos específicos têm-se: otimizar as condições de cultivo, considerando-se as seguintes variáveis do processo: fonte de carbono; temperatura; fonte de nitrogênio; relação C/N; avaliar diferentes condições de oxigênio dissolvido; melhor forma de condução do bioprocesso em biorreator instrumentado; investigar a localização do biossurfactante e definir estratégias para maximizar a sua recuperação; caracterizar o biossurfactante produzido; avaliar a ação do biossurfactante na remoção de metais p. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nei Pereira Junior - Coordenador / Graziela Jardim Pacheco - Integrante / Elisa Mara Prioli Ciapina - Integrante.
Membro: Nei Pereira Junior.
24.   2004-2008. SUCEST-FUN: Transcriptoma da Cana-de-açúcar
Descrição: O Projeto SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org) reune quatro Universidades (USP, UNICAMP, UNESP e UFRJ) e duas empresas (COPERSUCAR e Centralcool) num esforço por mim coordenado para o estudo funcional do genoma e transcriptoma da cana-de-açúcar. A cana-de-açúcar é de grande importância econômica para o Brasil estando entre os seus principais produtos de exportação. A produção de açúcar e álcool se beneficiaria largamente de variedades com maior teor de sacarose e resistentes a estresses. O estabelecimento de tais variedades utilizando-se técnicas de melhoramento genético tradicionais é demorado e complicado pela grande complexidade do genoma da cana e poderia ser acelerado se genes alvos para o melhoramento fossem identificados. O projeto SUCEST (http://sucest.lbi.ic.unicamp.br/public/) permitiu a identificação de cerca de 238 mil ESTs (Expressed Sequence Tags) da cana. Estas sequências correspondem a aproximadamente 43 mil SAS (Sugarcane Assembled Sequences). Acredita-se que mais de 90% do genoma expresso da cana tenha sido etiquetado (30 mil genes). A verificação do padrão de expressão destes genes é um passo importante para que se possa inferir sua função nos diferentes tecidos e estágios de desenvolvimento da planta, e para que estas informações possam ser utilizadas em programas de melhoramento. O transcriptoma da cana será estudado com o auxílio de microarrays de cDNA. ESTs foram selecionados por estarem associados a processos envolvidos no crescimento, desenvolvimento e adaptação a variações ambientais. Através do projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) nós catalogamos mais de 3600 possíveis genes de cana-de-açúcar envolvidos na sinalização destas vias. Destes, cerca de 1000 estão sendo analisados através dos microarrays de cDNA, uma tecnologia já estabelecida pelo grupo (Papini-Terzi et al., 2005). Outras categorias de destaque nos chips incluem Fatores de Transcrição (cerca de 500 SAS), patogênese (242), resposta a estresses (557) e metabolismo de. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador / Flavia Riso Rocha - Integrante / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Integrante / Juliana de Maria Felix - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Cristiane de Rocha Souza - Integrante / Eugenio César Ulian - Integrante / Sonia Marli Zingaretti di Mauro - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Marcio de Castro Silva-Filho - Integrante / Adriana Silva Hemerly - Integrante / Marcelo Dornelas - Integrante / Antonio Figueira - Integrante. Financiador(es): Central de Álcool Lucélia - Auxílio financeiro / Cooperativa de Produtores de Cana-de-Açúcar, Açúcar e Álcool de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Instituto Uniemp - Bolsa. Número de produções C, T A: 5
Membro: Glaucia Mendes Souza.
25.   2004-2008. Three-dimensional structure of the eucaryotic transcription components identified in the fapesp sucest program
Descrição: A transcrição é uma das principais etapas da regulação gênica. Diversos fatores protéicos estão envolvidos na síntese de mRNA, mediada pela RNA polimerase II. O projeto genoma da cana-de-açúcar (SUCEST) permitiu a identificação de diversos componentes da maquinaria de transcrição dessa espécie. A proposta desse projeto é a determinação da estrutura tridimensional de diferentes subunidades dos fatores basais de transcrição de mRNA bem como de reguladores transcricionais do tipo bZIP (Basic Leucine Zipper) presentes na cana-de-açúcar. Espera-se uma maior compreensão desse mecanismo tão crucial para os seres vivos. Valores Financiados: R$ 30.760,00 e U$ 112.401,91. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Paulo Schlogl - Integrante / Agustina Gentile - Integrante / Pedro Cruz - Integrante / Eduardo Kiyota - Integrante / Natalia Troiani Perez - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
26.   2004-2008. Tolerância ao alumínio em milho: avaliação do efeito de transgenes e de um promotor específico de ápices radiculares
Descrição: A toxidez do Al é o principal fator limitante da produtividade agrícola em grandes áreas do Brasil. A superexpressão de genes em plantas transgênicas é uma forma de aumentar a tolerância ao Al. Este projeto tem como objetivo avaliar a tolerância ao Al em plantas de milho superexpressando os genes Zmal1 (codifica uma proteína da mucilagem da raiz) e GSTIV (codifica uma glutationa S-transferase, envolvida na defesa contra estresse oxidativo), ambos induzidos pelo Al, e o gene OMT134, de Panicum miliaceum, que codifica um translocador de malato e citrato/oxoglutarato. Todas as plantas transgênicas com maior tolerância ao Al obtidas até o momento utilizam o promotor constitutivo 35S, o que causa algumas alterações metabolícas indesejáveis. Para solucionar esse problema, neste projeto também se propõe a construção e caracterização de um cassete de expressão baseado em três cópias do promotor do gene Zmal1. Dado que esse gene é ativo em células da epiderme do ápice radicular, sua disponibilidade pode permitir a superexpressão de genes de interesse no local mais sensível ao ataque do Al. Valor Financiado: R$ 55.251,25.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Vanusia Amorim - Integrante / Lucia Mattielo - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Marcelo Menossi Teixeira.
27.   2004-2007. Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos
Descrição: Com o recente surgimento dos marcadores moleculares, tornou-se possível a construção de mapas genéticos, que têm grande aplicação no estudo de locos que controlam caracteres quantitativos (QTL's) de importância agronômica. A construção desses mapas genéticos envolve a ordenação de locos dentro de grupos de ligação, principalmente através do método da verossimilhança. Existem vários softwares disponíveis que realizam essas análises, como por exemplo MAPMAKER/EXP, JoinMap e QTL Cartographer. No entanto, nenhum deles fornece parâmetros para avaliação da ordem final obtida. Mapas construídos com erros na ordem das marcas podem causar sérios problemas, já que serão utilizados como base para outros estudos de grande importância, como a localização de genes e de QTL's. Uma maneira de avaliar a ordem dos locos é com uso de técnicas não-paramétricas, como o método de reamostragem bootstrap. O presente trabalho tem por objetivo, primeiramente, desenvolver um software que permita a realização de análises bootstrap para a validação da ordem dos locos. Posteriormente, será avaliado o comportamento do método bootstrap nessa situação, via simulação computacional. Pretende-se, com isso, verificar se o método bootstrap pode ser empregado com segurança, o que permitiria a obtenção de informações importantes a respeito dos mapas genéticos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Gabriel Rodrigues Alves Margarido - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.

2003

1.   2003-Atual. Catalisadores para Shift - CENPES-Petrobrás
Descrição: Preparação e Avaliação de novos catalisadores para shift. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
2.   2003-2007. Construção de um mapa genético para cana-de-açúcar com marcadores RFLP usando os programas computacionais MAPMAKER/EXP e JoinMap simultaneamente
Descrição: Projeto de pesquisa que visa desenvolver formas de aproveitar as vantagens de dois programas muito usados para a construção de mapas genéticos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Maria Marta Pastina - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
3.   2003-2008. Efeitos do óxido nítrico no metabolismo de fenilpropanóides em raízes de soja (Glycine max (L.) Merr.)
Descrição: O presente projeto tem por metas: 1. Analisar o crescimento e a biomassa das raízes de soja (Glycine max (L.) Merr.), cultivadas em solução nutritiva, sob ação de nitroprussiato de sódio, como liberador de óxido nítrico (NO); 2. Determinar as atividades das peroxidases, solúvel e ligada à parede celular, da fenilalanina amônia liase e os conteúdos de lignina, após tratamento com nitroprussiato de sódio e, 3. Correlacionar as medidas das atividades enzimática e dos teores de lignina com o desenvolvimentos das raízes, em condições controladas de temperatura, pH e de fornecimento de nutrientes. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Maria de Lourdes Lucio Ferrarese - Integrante / Daniele Iara Lucca Zanardo - Integrante / Franciele Mara Lucca Zanardo - Integrante / Rita de Cássia Siqueira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação Araucária - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 18 / Número de orientações: 6
Membro: Osvaldo Ferrarese-Filho.
4.   2003-2006. Investigação da interação entre Botropstoxina-I (BthTX-I) e membranas artificiais por mapeamento de superfície através de mutagênese sítio dirigda de triptofanos
Descrição: As fosfolipases A2 (EC 3.1.1.4; PLA2) apresentam diversas funções desde danificação de membranas celulares como é o caso das PLA2 dos venenos, até como participação no padrão da regulação da resposta inflamatória e agregação de plaquetas como é o caso das PLA2 de mamíferos. Estas funções fazem com que as PLA2 sejam um alvo em potencial para intervenção química no tratamento de doenças como, por exemplo, a artrite. A bothropstoxina I (BthTx-I) é uma PLA2-Lis49 do veneno de Bothrops jararacussu que apresenta uma substituição do aminoácido ácido aspártico por lisina na posição 49 do sítio ativo, o que impede a ligação do cofator Ca2+. Apesar de não apresentar atividade hidrolítica, a interação da PLA2-Lis49 com membranas provoca uma permeabilização rápida das mesmas. Utilizando a BthTx-I, as bases estruturais do mecanismo de danificação à membrana pelas PLA2-Lis49 foi investigado pelas mudanças na fluorescência intrínseca dos triptofanos. A técnica de mutagênese sitio-dirigida foi usada para criar uma série de proteínas recombinantes com triptofanos únicos em diferentes regiões da molécula foi produzida, que permitiu o mapeamento das regiões de BthTx-I fazendo contato com a membrana e monitoramento das mudanças conformacionais envolvidas no mecanismo de danificação de membranas independente do Ca2+. CNPq Bolsa de Produtividade em Pesquisa nível 2B. Proc. No. 300725/98-1 (NV).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Richard John Ward.
5.   2003-2006. Mapeamento de superfície de botropstoxina-I por mutagênese de varredura de alanina
Descrição: Além da função catalítica, muitas PLA2s do veneno de serpentes apresentam propriedades farmacológicas variadas, embora os mecanismos através dos quais as PLA2s causam tais efeitos, sejam ainda pouco conhecidos. A função catalítica não é necessária para algumas propriedades farmacológicas, como mostradas pelas variantes do grupo II, PLA2 Lys49. As atividades biológicas das PLA2s Lys-49 são determinadas por resíduos na superfície da molécula, e por mapeamento de superfície por mutagênese de varredura de alanina os determinantes estruturais das atividades farmacológicas e bactericidas de botropstoxina-I (BthTx-I), uma PLA2s Lys-49 isolada do veneno de Bothrops jararacussu foram identificados. A BthTx-I e a PLA2 grupo II secretada humana (hsPLA2) mostram homologia estrutural, e ambas tem atividade bactericida, que no caso das PLA2s Lys-49 é independente da atividade hidrolítica. Este projeto demonstrou que a função bactericida de hsPLA2 também tem um componente independente e atividade catalítica. Proc. # 300231/2003-2. CNPq, Bolsa de Produtividade em Pesquisa, nível 2 (2003-2005) e 1D (2005-2006).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Richard John Ward - Coordenador.
Membro: Richard John Ward.
6.   2003-Atual. Novas Rotas para a Produção de Hidrogênio - CENPES-Petrobrás
Descrição: Produção de H2 principalmente a partir de biomassa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Donato Alexandre Gomes Aranda - Coordenador / Príscila M Siqueira - Integrante. Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.
Membro: Donato Alexandre Gomes Aranda.
7.   2003-2006. Recursos Genéticos de Fruteiras Nativas dos Tabuleiros Costeiros e da Baixada Litorânea do Nordeste do Brasil
Descrição: A acelerada erosão genética a qual vem sendo submetido o germoplasma de mangaba e jenipapo em alguns ecossistemas brasileiros tem despertado a atenção de pesquisadores e da sociedade em geral para a necessidade de se conservar os recursos genéticos dessas espécies. O presente Plano de Ação terá com foco principal a prospecção, coleta, conservação ex situ e caracterização do germoplasma de mangaba e jenipapo nos ecossistemas de Tabuleiros Costeiros e de Baixada Litorânea do Nordeste Brasileiro, com a finalidade de ampliar a base genética de fruteiras nativas da Mata Atlântica e das áreas de restinga em extinção. Para realização do referido Plano serão desenvolvidas cinco atividades concernentes à 1) prospecção e coleta de germoplasma; 2) implantação dos bancos ativos de germoplasma de mangaba e jenipapo; 3) caracterização agronômica, morfológica, físico-química e centesimal do germoplasma; 4) desenvolvimento de estratégias para multiplicação e conservação in vitro do germoplasma de mangaba e; 5) transferência de tecnologia. Para a execução do Plano, além da Embrapa Tabuleiros Costeiros, foram firmadas parcerias com outro centro de pesquisa da Embrapa (Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical), uma OEPA (Deagro), duas universidades federais (UFBA e UFRPE) e um instituto de pesquisa privado (ITP-UNIT).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / Josué Francisco Silva Júnior - Coordenador / Wilson Menezes Aragão - Integrante / Ana da Silva Ledo - Integrante / Evandro Almeida Tupinambá - Integrante / Eliana Lima da Fonseca - Integrante / Milene da Silva Castellen - Integrante / Arlene Maria Gomes Oliveira - Integrante / Carlos Alberto da Silva Ledo - Integrante / Raul Dantas Vieira Neto - Integrante / Maria Angélica Pereira de Carvalho Costa - Integrante / Álvaro Silva Lima - Integrante. Número de orientações: 3
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.
8.   2003-2008. Rede Nordestina de Biotecnologia - ReNorBio
Descrição: Este projeto pretende organizar uma rede de laboratórios da região nordeste do Brasil visando desenvolver programa de análise genômica funcional, estrutural e comparativa em Vigna unguiculata, com o intuito de tornar o feijão-caupi uma cultura altamente produtiva e rentável no futuro, constituindo-se em uma fonte de renda e desenvolvimento no Nordeste brasileiro. Para isso, serão utilizadas ferramentas de genômica expressa (EST e SAGE), relacionadas a diversos aspectos de maior importância para o melhoramento da citada cultura, associadas a técnicas modernas de mapeamento genético assistido por marcadores moleculares. Adicionalmente, pretende-se estabelecer protocolos eficientes para a transformação e regeneração de indivíduos estáveis expressando genes importantes para o rápido melhoramento desta cultura com metodologias biotecnológicas. Além disso, objetiva-se também estabelecer um protocolo de regeneração de plantas via embriogênese somática e a posterior utilização deste protocolo para a obtenção de linhagens transgênicas com características de tolerância à seca. O projeto deverá integrar 9 instituições e 10 Laboratórios estabelecidos em seis Estados (PE, CE, PB, PI, GO, SP), incluindo 33 doutores de diferentes formações (biólogos moleculares, bioquímicos, biotecnólogos, bioinformatas, melhoristas e agrônomos), sendo 29 atuando na região Nordeste, bem como alunos de graduação e pós-graduação, no sentido de aproveitar plenamente os dados gerados, transformando as informações científicas em benefícios para a classe produtiva. O projeto pretende também gerar no mínimo três publicações de impacto, explorando plenamente os resultados obtidos e dando ampla divulgação científica. Finalmente a proposta da rede NORDEST foi desenhada de modo a colaborar com a concretização da Rede Nordestina de Biotecnologia (RENORBIO), através da integração dos laboratórios e dos programas de pós-graduação, fomentando assim a formação de pessoal em todos os níveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tercilio Calsa Junior - Integrante / Antonio Figueira - Integrante / Ana Maria Benko Iseppon - Integrante / Ederson Akio Kido - Coordenador. Financiador(es): Ministério da Ciência e Tecnologia - Auxílio financeiro / Banco do Nordeste do Brasil - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa.
Membro: Tercilio Calsa Junior.
9.   2003-2007. Título - Ecofisiologia de Anonáceas Submetidas a Estresse Hídrico
Descrição: O estudo de fruteiras tropicais com características agronômicas que atendam as exigências dos mercados interno e externo, cada vez mais competitivos, é um tema estratégico para a região do Nordeste brasileiro, uma vez que a pesquisa agrícola faz parte do eixo de sustentabilidade para a fruticultura atual. No entanto, para as condições edafoclimáticas nas quais as espécies são cultivadas, é imprescindível o embasamento ecofisiológico, para que dessa forma se possa elucidar algumas das alterações metabólicas nas plantas, principalmente aquelas relacionadas com a produtividade e qualidade dos seus frutos. No presente trabalho serão estudadas, sob condições de casa de vegetação, durante um período de dois anos, duas frutíferas tropicais de interesse econômico para o Nordeste, a gravioleira e a pinheira. Para cada espécie, serão avaliados e correlacionados dados de natureza ecofisiológica com o objetivo de se identificar alguns parâmetros que possam servir de indicadores de tolerância aos diferentes níveis de água aplicados, e, dessa forma, proceder indicações futuras para os produtores, do grau de adaptação para as condições fisiográficas da região.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira - Integrante / João Emmanoel Fernandes Bezerra - Integrante / Ildo Eliezer Lederman - Integrante / Manoel Bandeira de Albuquerque - Integrante. Número de produções C, T A: 18 / Número de orientações: 13
Membro: Rejane Jurema Mansur Custódio Nogueira.

2002

1.   2002-2006. "Estudio de hongos ectomicorricicos e identificación de los posibles
Descrição: "Estudio de hongos ectomicorrícicos e identificación de los posibles sistemas enzimáticos y no-enzimáticos de detoxificación in vitro y ex vitro y su relación con el crecimiento de plantulas de Pinus radiata D.Don en suelos" OBJETIVOS 1.- Implementar y aplicar en el Laboratorio de Microbiología de Suelos los ensayos específicos para determinar la naturaleza química de los agentes quelantes de metal producidos por hongos ectomicorrícicos. A través de los ensayos se determinará el tipo de estructura química, catecol y/o hidroxamato, de los agentes quelantes de metal. 2.- Perfilar nuevas líneas de acción conjuntas en el estudio de los agentes quelantes de metal producidos por hongos degradadores de madera (saprófitos) y hongos micorrícicos (simbiontes) . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Adriane Maria Ferreira Milagres - Integrante / Angela Machuca - Coordenador / Valdeir Arantes - Integrante / Carolina Baldocchi - Integrante / Amanda Priscila R. de Oliveira - Integrante. Financiador(es): Faculdade de Engenharia Química de Lorena - Cooperação / Universidad de Concepcion Campus Los Angels - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 3 / Número de orientações: 3
Membro: Adriane Maria Ferreira Milagres.
2.   2002-2007. Avaliação da tolerância de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) a metais: expressão dos genes das enzimas da biossíntese de fitoquelatinas, de metalotioneínas e de glutationa S-transferases
Descrição: O potencial de crescimento e produção das plantas depende da capacidade de absorver nutrientes, restrita pela disponibilidade de elementos no solo. Os nutrientes são encontrados dentro de tecidos vegetais em concentração muito superior àquela do solo. Essa diferença de concentração resulta da atividade de proteínas de transporte, localizadas na membrana plasmática. As plantas possuem sistemas de absorção e efluxo responsáveis pelo controle das concentrações ótimas de nutrientes. Vários metais (ex. Cu, Zn, Mn, Fe) são essenciais para o metabolismo celular, participando como co-fatores de diversas enzimas em várias reações bioquímicas. Entretanto, esses metais apresentam uma alta reatividade, promovendo a formação de espécies ativas de oxigênio. Portanto, esses metais devem ser absorvidos, transportados e mantidos dentro de limites precisos de concentração de modo a evitar danos oxidativos. Para isso, as plantas possuem mecanismos que controlam a absorção e transporte de metais, sendo que certos peptídeos (metalotioneínas e fitoquelatinas) parecem possuir uma função associada com o controle da homeostasia de metais nas plantas. As atividades industriais e urbanas tem causado a poluição e contaminação de áreas agriculturáveis com metais resultantes dessas atividades, sendo que o incremento nessas áreas e/ou águas poluídas aumentam o risco de intoxicação de alimentos. As concentrações des metais pesados muito acima daquelas encontradas na natureza, entram na cadeia alimentar humana através dos meios de dispersão de poluentes, como o ar, água e solo. Genes codificando para transportadores de íons já foram isolados em plantas e leveduras, e foram usados para identificar genes homólogos putativos no banco de dados de seqüências de ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana-de-açúcar (SUCEST).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Raul Santin Almeida - Integrante / Arthur Eduardo Ribeiro Bastos - Integrante / Christiane Cristina Borges - Integrante / Daniela Neves Ribeiro - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 8 / Número de orientações: 2
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
3.   2002-2006. Desenvolvimento de marcadores moleculares a partir de ESTs de cana-de-açúcar para seleção de características economicamente importantes
Descrição: As variedades comerciais de cana-de-açúcar (Saccharum sp.) são autopoliplóides complexos, altamente heterozigóticos, derivadas de cruzamentos inter-específicos. O melhoramento genético da cana poderia ser beneficiado por métodos que possibilitassem a seleção precoce e/ou indireta. A seleção assistida por marcadores em cana-de-açúcar teria um grande impacto no incremento do ganho genético por unidade de tempo e área, e aumentaria a precisão na seleção para características de qualidade industrial da cana. Outra perspectiva de grande impacto seria a seleção indireta de características de difícil avaliação, devido ao grande efeito do ambiente, ou características com avaliação mais demorada, como a brotação de soqueira, que leva cerca de 30 meses para obtenção dos resultados. Até o presente, todos os mapas de ligação em cana-de-açúcar foram construídos para cruzamentos entre materiais não comerciais e/ou espécies selvagens, limitando a sua utilização pelos melhoristas. Esse projeto tem como objetivo desenvolver uma mapa de ligação genético empregando marcadores moleculares do tipo RFLP, AFLP e microssatélites, visando avaliar o emprego da seleção indireta de materiais superiores. Para tanto, dispõe-se de uma progênie de 500 indivíduos resultante de um cruzamento entre materiais de elite da Copersucar ('SP80-180' e 'SP80-4966'), apresentando segregação para vários componentes da produção, principalmente teor de açúcar; número de perfilhos; altura, peso e diâmetro dos colmos; e resistência a escaldadura (Xanthomonas albilineans). As análises de AFLP foram conduzidas sob a nossa orientação, enquanto que as análises de microssatélites estão sendo conduzidas em nosso laboratório, utilizando 278 pares de primers de microssatélites de cana-de-açúcar, disponibilizados pelo Consórcio Internacional de Biotecnologia de Cana (ICSB), através da Copersucar. As análise de RFLP foram conduzidas pela Profa. Dra. Anete Pereira de Souza do CBMEG, UNICAMP. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Eugenio Ulian - Integrante / Anete Pereira de SOuza - Coordenador / Antonio Augusto Franco - Integrante / MArcelo Menossi - Integrante. Financiador(es): Cooperativa de Produtores de Cana, Açúcar e Álcool - Centro de Tecnologia - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
Descrição: A cana-de-açúcar (Saccharum sp.) está entre as espécies de maior importância econômica no mundo, constituindo uma das principais fontes de produção de açúcar e álcool. Apesar do Brasil ocupar posição de destaque, como o maior produtor mundial, os níveis de produtividade são considerados baixos. A obtenção de novas variedades de cana-de-açúcar, mais produtivas e resistentes a pragas e doenças, é um processo demorado que consome vários anos até o lançamento para o plantio comercial. O desenvolvimento de marcadores genéticos, PCR específicos, fortemente ligados a genes que controlam as características de interesse, pode acelerar significativamente os programas de melhoramento. O projeto de seqüenciamento de ESTs (SUCEST) do programa Genoma da FAPESP já identificou cerca de 40 mil "clusters" que representam os genes de cana-de-açúcar. Os ESTs apresentam potencial para serem utilizados no desenvolvimento de marcadores genéticos. Deste modo, marcadores microssatélites podem ser obtidos a partir de bancos de dados de ESTs, e sondas ESTs podem ser utilizadas em ensaios de RFLP para o mapeamento de QTLs. Tendo em vista os avanços que serão alcançados no melhoramento genético da cana-de-açúcar com a exploração das informações contidas nos bancos de dados de ESTs, pretende-se a partir destas seqüências, desenvolver marcadores moleculares do tipo RFLP, microssatélites, bem como marcadores específicos para características agronômicas de interesse, via conversão de marcadores RFLPs (hibridizados com sondas ESTs) em marcadores PCR específicos (SCARs, STSs). O desenvolvimento de tais marcadores será integrado a um programa de mapeamento de características qualitativas e quantitativas que vem sendo desenvolvido, empregando uma população F1 obtida a partir do cruzamento de duas variedades comerciais de cana-de-açúcar. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Antonio Augusto Franco Garcia - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante / Karine Miranda Oliveira - Integrante / Andréia Navarro Meza - Integrante / Laura Helena Marcon Teixeira - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Integrante / Eugenio Cesar Ulian - Integrante / Cinthya Saraiva Leite - Integrante. Financiador(es): Cooperativa dos Produtores de Açúcar e Álcool - Cooperação / Escola Superior de Agricultura Luis de Queiroz - Cooperação / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 6
Membro: Anete Pereira de Souza.
4.   2002-2008. DESENVOLVIMENTO E CARACTERIZAÇÃO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES EM FEIJÃO COMUM (Phaseolus vulgaris L.)
Descrição: O presente projeto visa o desenvolvimento e caracterização de marcadores microssatélites em feijão comum, utilizando o cultivar carioca, pela sua importância econômica. Seu desenvolvimento é urgente e abrirá o potencial para o mapeamento de muitos genes, para a seleção assistida por marcadores e inúmeros estudos sobre variabilidade genética, estrutura populacional, fluxo gênico e sistema reprodutivo. O objetivo principal do projeto é desenvolver "primers" de microssatélites para feijão a partir de bibliotecas genômicas enriquecimento de bibliotecas para repetições específicas. Uma vez desenvolvidos, os "primers" serão carcterizados quanto ao polimorfismo e heterozigosidade em materiais divergentes. O desenvolvimento de microssatélites em feijão possibilitará, numa próxima etapa, o seu mapeamento em linhagens recombinantes F7, obtidas de cruzamentos com genitores divergentes. Uma vez ancorados num mapa de ligação, espera-se poder extender o uso desta ferramenta à diferentes germoplasmas de feijão, utilizando os microssatélites tanto para o mapeamento de características agronômicas de interesse quanto para seleção assistida por marcadores.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Luciana Lasry Benchimol - Integrante / Tatiana Campos - Integrante / Sergio Augusto Moraes Carbonell - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Instituto Agronômico de Campinas - Cooperação. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 1
Membro: Anete Pereira de Souza.
5.   2002-2006. Wiggler MAD beamline for structural molecular biology
Descrição: Número do Processo: 99/07150-9; Valor Total Concedido: US$ 886.989,26 + R$ 1.100.692,41; Vigência: 01/04/2002 a 31/12/2006. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Igor Polikarpov.

2001

1.   2001-Atual. (BOLSA PRODUTIVIDADE) Estudos estruturais e funcionais de receptores nucleares
Descrição: Bolsa Produtividade e Pesquisa Nível 1A; Processo 300468/08-3; Vigência: 1/3/2009 a 28/02/2012. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Igor Polikarpov - Coordenador.
Membro: Igor Polikarpov.
2.   2001-Atual. Centro de Biotecnologia Molecular Estrutural
Descrição: Número do processo: 98/14138-2; Valor total concedido: R$ 3.835.863,34 (Projeto) + US$ 4.373.659,51 + R$ 890.542,54 (Reserva Técnica); Vigência: 01/10/2000 a 31/12/2008 Resumo do projeto: O CBME é uma iniciativa conjunta resultante da existente colaboração científica entre pesquisadores da USP no campus de São Carlos, do LNLS em Campinas, e da UFSCar. O objetivo principal do CBME é realizar pesquisas e desenvolvimentos tecnológicos em todas as áreas da biotecnologia que dependem do planejamento Molecular Baseado em Estruturas, particularmente na descoberta de novos compostos bioativos (fármacos, vacinas, pesticidas) e na engenharia de proteínas. Esta é hoje a tecnologia mais eficiente e de melhor relação custo/benefício para o desenvolvimento de novas drogas, podendo contribuir em todas as etapas do processo, desde a descoberta de compostos de partida, sua otimização (afinidade, especificidade, eficácia, efeitos colaterais) e aprovação pelos organismos competentes. É uma metodologia que se baseia na inibição ou estimulação da atividade biológica de macromoléculas, proteínas ou ácidos nucleicos (DNA e RNA), responsáveis por doenças. A Cristalografia de Proteínas, usando difração de raios-X e a Ressonância Magnética Nuclear, são técnicas de preferência, na medida em que podem elucidar a estrutura tridimensional molecular de proteínas alvo associadas às doenças em foco. Está informação estrutural permite a descoberta e síntese de compostos complementares que podem se tornar potentes drogas especificamente dirigidas às doenças alvo. Para atingir este objetivo o CBME promove uma abordagem multidisciplinar integrada entre as técnicas de Biologia Molecular, Bioquímica, Biologia Estrutural (Cristalografia de Proteínas e de Moléculas Pequenas, Ressonância Magnética Nuclear, Técnicas Espectroscópicas, Modelagem Molecular de Fármacos e Vacinas, e Bio-informática), Radiação Síncrotron, Química Medicinal de Síntese Orgânica e Inorgânica e de Produtos Naturais, Imunologia Mole. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Igor Polikarpov - Integrante / J Kobarg - Integrante / O H Thiemann - Integrante / S T Ferreira - Integrante / R C Garratt - Integrante / G Oliva - Coordenador / A Spisni - Integrante / N Zanchin - Integrante / L M Beltramini - Integrante / A D Andricopulo - Integrante / A G Correa - Integrante / B G Guimaraes - Integrante / C E Benedetti - Integrante / C H I Ramos - Integrante / D H F Souza - Integrante / P C Vieira - Integrante / T A Pertinhez - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Auxílio financeiro / Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Igor Polikarpov.
3.   2001-2008. Comparação de algoritmos genéticos usados na construção de mapas de ligação
Descrição: Pesquisa que visa fornecer subsídios úteis para a construção de mapas genéticos. Normalmente, o número de marcadores por grupo de ligação é elevado, o que impede que algoritmos de busca exaustiva sejam usados. Esse projeto estuda algoritmos alternativos à busca exaustiva.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Marcelo Mollinari - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
4.   2001-2008. Desenvolvimento de marcadores moleculares a partir de EST's em cana-de-açúcar para seleção de características economicamente importantes
Descrição: Projeto que visa fornecer subsídios para o entendimento da arquitetura genética de caracteres quantitativos importantes para a cana-de-açúcar. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Integrante / Maria Marta Pastina - Integrante / Andréia Navarro Meza - Integrante / Éderson Akio Kido - Integrante / Henrique Marques B de Souza - Integrante / Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Integrante / Eugênio César Ulian - Integrante / Anete Pereira de Souza - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
5.   2001-Atual. Evolução de Genomas Angiosperma
Descrição: O projeto visa avaliar os processos evolutivos envolvidos na divergência em espécies angiospermas e de maneira mais abrangente em plantas verdes. A abordagem considera estudos de genômica comparativa focando na detecção e interpretação das especificidades de cada linhagem evolutiva.Os interesses mais específicos são relacionados a: via de sinalização dos açúcares; genes novos; fatores da transcrição da classe bZIP e a parede celular.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.
6.   2001-Atual. Mapeamento genético de caracteres quantitativos em cana-de-açúcar
Descrição: As variedades comerciais de cana-de-açúcar (Saccharum sp.) são autopoliplóides complexos, altamente heterozigóticos, derivadas de cruzamentos inter-específicos. O melhoramento genético da cana poderia ser beneficiado por métodos que possibilitassem a seleção precoce e/ou indireta. A seleção assistida por marcadores em cana-de-açúcar teria um grande impacto no incremento do ganho genético por unidade de tempo e área, e aumentaria a precisão na seleção para características de qualidade industrial da cana. Outra perspectiva de grande impacto seria a seleção indireta de características de difícil avaliação, devido ao grande efeito do ambiente, ou características com avaliação mais demorada, como a brotação de soqueira, que leva cerca de 30 meses para obtenção dos resultados. Até o presente, todos os mapas de ligação em cana-de-açúcar foram construídos para cruzamentos entre materiais não comerciais e/ou espécies selvagens, limitando a sua utilização pelos melhoristas. Esse projeto tem como objetivo desenvolver uma mapa de ligação genético empregando marcadores moleculares do tipo RFLP, AFLP e microssatélites, visando avaliar o emprego da seleção indireta de materiais superiores. Para tanto, dispõe-se de uma progênie de 500 indivíduos resultante de um cruzamento entre materiais de elite da Copersucar ('SP80-180' e 'SP80-4966'), apresentando segregação para vários componentes da produção, principalmente teor de açúcar; número de perfilhos; altura, peso e diâmetro dos colmos; e resistência a escaldadura (Xanthomonas albilineans). As análises de AFLP foram conduzidas sob a nossa orientação, enquanto que as análises de microssatélites estão sendo conduzidas em nosso laboratório, utilizando 278 pares de primers de microssatélites de cana-de-açúcar, disponibilizados pelo Consórcio Internacional de Biotecnologia de Cana (ICSB), através da Copersucar. As análise de RFLP foram conduzidas pela Profa. Dra. Anete Pereira de Souza do CBMEG, UNICAMP. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Antonio Vargas de Oliveira Figueira - Coordenador / Ederson Akio Kido - Integrante / J A G Silva - Integrante / Eugenio Ulian - Integrante / Henrique Marques Barbosa de Souza - Integrante / Anete Pereira de SOuza - Integrante. Financiador(es): Ministério da Ciência e Tecnologia - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 2
Membro: Antonio Vargas de Oliveira Figueira.
7.   2001-2007. Projeto genoma FAPESP - SMOLBnet - "The structural basis of xilanase thermostability"
Descrição: Xylanases (1,4--D-xylanhydrolase, EC 3.2.1.8) are endo-enzymes that randomly hydrolyse xylans, the principal polysaccharide of hemicelluloses, to release xylo-oligosaccharides and have a demonstrated application as an environmentally acceptable alternative to chlorine treatment of wood pulp in the Kraft process. Enzymes with high thermal tolerances are essential for this application, and we have chosen the G/11 xylanase from Bacillus subtilis (strain 1A1) as a model protein for understanding the structural bases of thermostability of xylanases by combining protein engineering (directed evolution) and spectroscopic techniques. The three dimensional structure of the wild-type xylanase was used as a starting model in a series of molecular dynamics simulations over a range of temperatures. These studies were aimed at detecting temperature dependent structural differences which could be correlated with biochemical and spectroscopic data. A structural transition in the catalytic region of the molecule could be observed at the temperature corresponding to the optimum catalytic temperature of the enzyme. The results of this study raises further questions as to how the individual energy terms calculated in the molecular dynamics simulations are related to the macroscopic thermodynamic properties which can be measured using the purified protein. In order to address this question, we developed a technique based on themal denaturation of the xylanase as monitored by circular dichroism, which allows reliable estimates of the thermodynamic parameters of this protein. The results suggest that thermostability may be achieved by the modulation of either the difference in the enthalpy or the change in heat capacity on the transition between the native and the unfolded states. SMOLBnet: FAPESP (Proc. No. - 01/07537-2) Valor:US$ 20.200,00 + R$ 46.000,00. Coordenadores: Prof. Dr. Roy Edward Larson, Prof. Dr. Richard John Ward, Prof. Dr. Raguvir Krishnaswamy Arni, Prof. Dr.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Richard John Ward - Coordenador / Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Roy Edward Larson - Integrante / Marcos Fontes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Richard John Ward.
8.   2001-2009. Resolução da Estrutura Tridimensional de Proteínas Relacionadas à Patogenicidade de Xylella fastidiosa
Descrição: A bactéria Xylella fastidiosa é o agente causador de diversas doenças em plantas, incluindo a Clorose Variegada dos Citros (CVC), a qual vem prejudicando consideravelmente a citricultura nacional. Isto ocorre porque ainda não existe um método definitivo de combate ao patógeno, sendo possíveis apenas algumas medidas paliativas de controle. A Xylella fastidiosa foi a primeira bactéria patogênica de plantas a ter seu genoma completamente seqüenciado, sendo que ela possui uma grande importância econômica e biológica no Brasil. De posse dos dados gerados pelo seqüenciamento, tornou-se possível estudar os mecanismos relacionados à sua patogenicidade através da análise de proteínas envolvidas nos processos de interação bactéria-planta. O presente projeto objetiva estudar 20 proteínas relacionadas à patogenicidade e adaptação de X. fastidiosa, inicialmente, através de sua expressão "in vitro", purificação e cristalização das mesmas. Os resultados obtidos fornecerão conhecimento para que seja possível analisar-se a estrutura tridimensional destas proteínas. O conhecimento da estrutura protéica possibilitará a criação de novas abordagens de manipulação genética que alterem a conformação nativa destas proteínas e, então, tornará os métodos de combate ao patógeno mais diretos e eficientes, o que dará um novo impulso na produção e comercialização de citros. . Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (3) . Integrantes: Anete Pereira de Souza - Coordenador / Susely Ferraz Siqueira - Integrante / Luciana Kauer Rosseli - Integrante / Debora Pires Paula - Integrante / Antonio Marcos Saraiva - Integrante / Adriano Azzoni - Integrante / Cleide Catani - Integrante / Tomomasa Yano - Integrante / José Sergio de Macedo Soares - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 6 / Número de orientações: 6
Membro: Anete Pereira de Souza.

2000

1.   2000-Atual. Biometria de Marcadores Genéticos
Descrição: Desde o recente advento dos marcadores moleculares, estudos detalhados sobre a arquitetura genética dos caracteres quantitativos têm sido desenvolvidos, usando como base os mapas de ligação. Com base nesses resultados, deve ser possível aumentar ainda mais a eficiência dos programas de melhoramento, uma vez que eles permitem individualizar os locos que controlam tais caracteres, além de determinar seus efeitos e interações. O projeto em questão tem como objetivo desenvolver e/ou adaptar métodos genético-estatísticos que permitam utilizar, de forma eficiente, as informações dos marcadores genéticos (morfológicos, isoenzimáticos, moleculares e genômicos) em programas de melhoramento e estudos básicos de genética. Os tópicos considerados nas pesquisas são: i) desenvolvimento de métodos genético-estatísticos para construção de mapas em populações geradas pelo cruzamento de linhagens endogâmicas, como é o caso do milho, e em F1 s resultantes do cruzamento de plantas de polinização aberta (não endogâmicas), como a cana-de-açúcar; ii) desenvolvimento de métodos genético-estatísticos para mapeamento de QTL s em populações individuais (principalmente em milho, cana-de-açúcar e frangos de corte); iii) desenvolvimento de modelos para mapeamento de QTL's e estudo da base genética da heterose;iv) desenvolvimento de métodos genético-estatísticos para mapeamento de QTL s de múltiplos caracteres, ambientes e populações; v) desenvolvimento de métodos genético-estatísticos para realizar seleção assistida por marcadores considerando múltiplos caracteres e ambientes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (6) . Integrantes: Antonio Augusto Franco Garcia - Coordenador / Maria Marta Pastina - Integrante / Priscilla Karen Sabadin - Integrante / Graciela Rocha Sobierajski - Integrante / Karine Miranda Oliveira - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante / Renato Rodrigues Silva - Integrante / Íris Satie Shimano - Integrante / Jéssica Câmara Nonaka - Integrante / Edjane Gonçalves Freitas - Integrante / Marcelo Mollinari - Integrante / Gabriel Rodrigues Alves Margarido - Integrante / Anete Pereira de Souza - Integrante / Rodrigo Gazaffi - Integrante / Millor Fernandes do Rosário - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 158 / Número de orientações: 14
Membro: Antonio Augusto Franco Garcia.
2.   2000-Atual. Produção de enzimas lignno-Hemi-celulolíticas por basidiomicetos e fungos termofílicos e aplicação das enzimas em bioprocessos
Descrição: O presente projeto visa o estudo de ligninases (lacase, lignina peroxidase e manganes peroxidase), celulases e xilanases por cepas de basidiomicetos isoladas de mata nativa da Estação Ecologica do Noroeste Paulista. Nesse estudo são abordados: a produção das enzimas em diferentes meios sólidos, uso de resíduos agrícolas e agro-industriais como substato para a fermentação sólida, caracterização das enzimas produzidas, aplicação das enzimas em tratamento de resíduos recalcitrantes derivados de compostos aromáticos como corantes e herbicidas e como componente de ração animal.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Roberto Da Silva - Integrante / Solange Xavier dos Santos - Integrante / Maricy Raquel Lindenbach Bonfá - Integrante / Érika B N Graminha - Integrante / Caroline Henn - Integrante / Aline Zorzetto Gonçalves - Integrante / Ricardo Luis Morisugi Arakaki - Integrante / Marica Maria Souza Moretti - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 22 / Número de orientações: 1
Membro: Eleni Gomes.
3.   2000-2009. SUCAST - Transdução de sinal da cana-de-açúcar
Descrição: O projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) foi iniciado em 2000 com o objetivo de identificar, catalogar e caracterizar os ESTs da cana-de-açúcar que estão envolvidos em vias de transdução de sinal, bem como a organização de todas estas informações em um banco de dados que facilite futuras análises funcionais (Souza et al, 2001). As etapas do projeto SUCAST compreendem, de forma sucinta, a prospecção de dados, a anotação e a caracterização estrutural e funcional de componentes de transdução de sinais em cana-de-açúcar utilizando-se ferramentas de bioinformática e a análise de expressão gênica através da tecnologia de microarranjos de cDNA. Os dados são armazenados em um banco sequências, domínios, categorias funcionais e dados de expressão (http://sucestfun.cbmeg.unicamp.br/sucestfun/sucast/index.shtml). Entre os alvos do projeto temos a determinação do padrão de expressão dos genes de transdução de sinal e fatores de transcrição nos diversos tecidos da cana (Papini-Terzi et al., 2005), a caracterização estrutural e funcional do Quinoma da Cana-de-Açúcar (receptores, proteínas quinase e genes-R com domínio pkinase) e a análise da resposta a fitohormônios (ABA e MeJ).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador / Ana Carolina Quirino Simoes - Integrante / Milton Yutaka Nishiyama-Junior - Integrante / Aline Maria da Silva - Integrante / Katia Cristina Oliveira - Integrante / Rosangela Campanha - Integrante / Mara Lucia Zucheran Silvestri - Integrante / Flavia Stal Papini-Terzi - Integrante / Flavia Riso Rocha - Integrante / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Integrante / Juliana de Maria Felix - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Cristiane de Rocha Souza - Integrante / Eugenio César Ulian - Integrante / Carlos Alberto de Bragança Pereira - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Marcio de Castro Silva-Filho - Integrante / Adriana Silva Hemerly - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 10 / Número de orientações: 1
Membro: Glaucia Mendes Souza.

1999

1.   1999-2006. Produção de amilases por microrganismos termofílicos
Descrição: O presente projeto visa a obtenção de amilases termofílicas e termoestáveis a partir de cepas microbianas termofílicas. A primeira parte dese projeto correspondeu ao isolamento de cepas fungicas e bacterianas de diferentes materiais e a avaliação das mesmas quanto à produção de a-amilases, b-amilases e glucoamilases. As enzimas produzidas foram caracterizadas e usadas na hidrólise de amido na produção de xarope. Nesses experimentos são avaliados diferentes tipos de resíduos amiláceos como meio de cultivo pasra as cepas, asssim como, vários tipos de amido como substratos para as enzimas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Roberto Da Silva - Integrante / Heloiza F. Alves Prado - Integrante / Tony Márcio da Silva - Integrante / Alessandra Aparecida Rabalho - Integrante / Célia Maria Landi Franco - Integrante / Ana Flávia de Azevedo Carvalho - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 62 / Número de orientações: 12
Membro: Eleni Gomes.
2.   1999-Atual. Reguladores da Transcrição bZIP em Plantas Verdes: Análise Funcional e Evolução
Descrição: O projeto visa entender a evolução das funções associadas a fatores da regulação da transcrição da classe bZIP de angiospermas, combinando análises filogenéticos e funcionais. A forma de atuação dos reguladores bZIP nas redes de regulação metabólicas no organismo modelo eudicot. Arabidopsis thaliana representa a principal abordagem. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Michel Georges Albert Vincentz - Coordenador. Financiador(es): COFECUB - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 4
Membro: Michel Georges Albert Vincentz.

1997

1.   1997-Atual. Análise comparativa de genomas Bacterianos
Descrição: O grupo participou ativamente do sequenciamento e análise dos genomas bacterianos financiados pelo Programa Genoma ONSA/FAPESP. Neste contexto analisamos os elementos de transposição (TE) e ilhas genômicas associadas aos TEs, bacteriófagos e plasmídeos. O grupo tem especial interesse na compreensão da diversificação dos elementos e do impacto destes sobre a estabilidade e diferenciação dos genomas de organismos filogenéticamente próximos. Estudos de genômica comparativa entre diferentes linhagens patogênicas e não patogênicas são o foco central.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / C B Monteiro Vitorello - Integrante / Mariana Cabral de Oliveira - Integrante / Alessandro Varani - Integrante / Ana Tereza Vasconcelos - Integrante / Marcelo Zerillo - Integrante / Luis Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Jonas Weissmann Gaiarsa - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / United States Department of Agriculture - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 17 / Número de orientações: 4
Membro: Marie-Anne Van Sluys.

1996

1.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Adamantina, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Antônio Carlos Machado Vasconcelos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Auxílio financeiro.
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
2.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Assis, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 5
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
3.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Jaú, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Mário Percio Campana - Integrante / Marcelo de Almeida Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 13
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
4.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Mococa, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Paulo Boller Gallo - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante / MÁRCIO A PITTA BIDÓIA - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 7
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
5.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Pindorama, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Paulo Boller Gallo - Integrante / Pery Figueiredo - Integrante / Ricardo A D Kanthack - Integrante / Sérgio Augusto Tatizana - Integrante / José Carlos Cavichioli - Integrante / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Marcelo de Almeida Silva - Integrante / Antônio Carlos Machado Vasconcelos - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante / MÁRCIO A PITTA BIDÓIA - Integrante / Ivan Antônio dos Anjos - Integrante / Silvana Creste Souza - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Cooperação. Número de produções C, T A: 9
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
6.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Piracicaba, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de seedling e clones , em seis regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Hélio do Prado - Integrante / Leila L DinardoMiranda - Integrante / Raffaella Rossetto - Integrante / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Pery Figueirdo - Integrante / Antônio Carlos Machado Vasconcelos - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante / MÁRCIO A PITTA BIDÓIA - Integrante / Ivan Antônio dos Anjos - Integrante / Silvana Creste Souza - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Cooperação. Número de produções C, T A: 11
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
7.   1996-Atual. Identificação de genótipos superiores de cana-de-açúcar por processos de seleção de seedlings e de clones na região de Ribeirão Preto, SP.
Descrição: Como cultura propagada vegetativamente, a cana-de-açúcar possibilita a perpetuação de formas em alto grau de heterose logo após a hibridação. Esta particularidade, enseja uma ampla variabilidade para os genótipos existentes em uma população . Cabe ao melhorista, selecionar os indivíduos superiores , tarefa muitas vezes dificultada quando se trabalha em diferentes ambientes indistintamente , sem a preocupação de caracteriza-los em relação ao seu potencial edafoclimático. O presente subprojeto propõem-se a estudar populações de "seedling" e clones , em sete regiões do Estado de São Paulo , utilizando-se de critérios conceituais e biométricos , na mensuração do potencial agroindustrial de tais indivíduos . Para tanto, a acumulação de observações em anos sucessivos , abrangendo ciclos distintos das plantas ( cana-planta , soca e ressoca ) , interagindo com anos agrícolas subsequentes , será usado como principal ferramenta , para o exercício do discernimento do melhorista. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Marcelo de A Silva - Integrante / Hélio do Prado - Integrante / Leila L DinardoMiranda - Integrante / Raffaella Rossetto - Integrante / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Pery Figueirdo - Integrante / Antônio Carlos Machado Vasconcelos - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante / MÁRCIO A PITTA BIDÓIA - Integrante / Ivan Antônio dos Anjos - Integrante / Silvana Creste Souza - Integrante / Luciana Rossini Pinto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Cooperação. Número de produções C, T A: 20
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
8.   1996-Atual. Melhoramento genético da cana-de-açúcar: Validação tecnológica para novos clones IAC de cana-de-açúcar, em diferentes regiões edafoclimáticas do Centro-Sul do País.
Descrição: Os melhores genótipos , oriundos da sucessivas seleções das fases anteriores , são então testados em ensaios de competição regional os quais contam com esquemas estatísticos visando a aplicação de testes de comparação de médias em relação às cultivares comerciais. Nesta ocasião , são instalados dois ensaios por região ecológica do Programa Cana , avaliando-se o comportamento agroindustrial específico. Posteriormente , os melhores clones de cada região , participarão de ensaios estadual determinando-se neste momento , a adaptabilidade e potencial produtivo em, condições dantes não estudadas . Os clones que tiveram comportamento superior ( es ) à cultivares testemunhas poderão ser consideradas novas cultivares de cana-de-açúcar . . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Pery Figueiredo - Integrante / Orivaldo Brunini - Integrante / Hélio do Prado - Integrante / Leila L DinardoMiranda - Integrante / Raffaella Rossetto - Integrante / Mauro Alexandre Xavier - Integrante / Marcelo de Almeida Silva - Integrante / Antônio Carlos Machado Vasconcelos - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante / MÁRCIO A PITTA BIDÓIA - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Cooperação. Número de produções C, T A: 36
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.
9.   1996-Atual. Seleção de clones de cana-de-açúcar para fins forrageiros
Descrição: Os melhores clones oriundos do Programa de Melhoramento de Cana do IAC (Programa Cana IAC) são analisados quanto às características bromatológicas e quanto ao potencial produtivo em diferentes regiões e épocas de corte. Posteriormente, será avaliado o efeito desses clones na dieta de novilhos em crescimento. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Marcos Guimarães de Andrade Landell - Coordenador / Marcelo de A Silva - Integrante / Antônio L M Martins - Integrante / Leila L DinardoMiranda - Integrante / Daniel Nunes da Silva - Integrante / Pery Figueirdo - Integrante / Mário Pércio Campana - Integrante. Financiador(es): Fundação de Apoio A Pesquisa Agrícola - Cooperação.
Membro: Marcos Guimarães de Andrade Landell.

1995

1.   1995-Atual. Produção de pectinases por linhagens microbianas mesofílicas e termofílicas, purificação e caracterização das enzimas
Descrição: O projeto em questão visa a seleção de cepas microbianas fíngicas mesofílicas e termofílicas produtoras de pectinases, a produção, purificação e caracterização das enzimas . Esse projeto está sendo, ao longo dos anos, dividido em sub-projetos envolvendo: seleção de cepas do meio ambiente; estudo de indução e características das enzimas, estudo da produção das enzimas por de fermentação em estado sólido, estudo da produção de pectinases por fungos termofílicos e purificação das enzimas. O projeto visa ainda, a purificação e estudos bioquímicos de poligalacturonases mesofílicas e termofílicas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (9) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Eleni Gomes - Coordenador / Dênis Silva - Integrante / Roberto Da Silva - Integrante / Márcia Luzia Rizzatto - Integrante / Eduardo da Silva Martins - Integrante / Ranulfo Monte Alegre - Integrante / Natália Martin - Integrante / Alexandre Costa Monteiro - Integrante / Natlia sa Silva Porto - Integrante / Paula Mendes de Freitas - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação Para Desenvolvimento da Unesp - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 93 / Número de orientações: 27
Membro: Eleni Gomes.
2.   1995-Atual. Reparo de DNA em plantas
Descrição: Este projeto visa estudar diferentes aspectos de reparo de DNA e suas principais consequências para a célula: morte e mutagênese. Em células de mamíferos em cultura estamos desenvolvendo sistemas de vetores virais para o controle da expressão de genes de reparo de DNA. Estamos dedicando especial atenção à expressão do gene da fotoliase de marsupial em células humanas. Com estes estudos, conseguimos demonstrar que o sinal necessário para iniciar o estímulo de apoptose por UV em células humanas pode ser fotorreativado, o que indica a participação da lesão CPD (dímeros de pirimidina) e permite realizar uma série de investigações da sequência de eventos que levam a morte celular. Vetores ponte de replicação epissomal estão também sendo empregados em estudos de mutagênese, possibilitando a determinação da "assinatura" molecular de mutagênese de agentes como o oxigênio singlete e ozônio. Estamos também envolvidos em caracterizar genes envolvidos em reparo de DNA de plantas. Além de termos sido pioneiros na identificação de alguns desses genes em Arabidopsis (genes araXPB1 e arathi1), o início de busca em banco de dados do Projeto Genoma SUCEST, permitiu a identificação de vários genes de cana-de-açúcar, potencialmente homólogos aos genes humanos. A completa caracterização destes está em andamento. A equipe indicada está associada ao laboratório da Dra. MA Van Sluys, há outros integrantes no laboratório do Dr. Menck e Dr. Silva-Filho.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Integrante / D. Ribeiro - Integrante / Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Myna Nakabashi - Integrante / Marcio C Silva Filho - Integrante / Marisa Moura Momoli - Integrante / F. S. Papini Terzi - Integrante / Leonardo Paiva Farias - Integrante / Priscila Mayumi Kashiwabara - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 22 / Número de orientações: 9
Membro: Marie-Anne Van Sluys.

1989

1.   1989-Atual. Elementos de transposição e seu impacto no genoma (GaTE)
Descrição: Elementos de transposição são seqüências genéticas móveis responsáveis em parte por gerar variabilidade genética. Variabilidade esta gerada como conseqüência de capacidade intrínseca de mudar de lugar nos genomas em que se encontram associados. Este projeto pretende analisar o impacto destes elementos em genomas de plantas e em bactérias. A abordagem experimental será diversificada uma vez que elementos distintos e com conhecimento inerente heterogêneo são a base deste projeto. Em plantas, daremos continuidade aos trabalhos iniciados pelo grupo quando do isolamento e caracterização do retrotransposon Retrolyc1 e o estudo estará centrado no controle da expressão do elemento em nível transcricional. Ainda no contexto de Solanaceae, iniciaremos uma busca por retroelementos em plantas silvestres e cultivadas de Solanum dando ênfase ao estudo do polimorfismo de inserção associado à ploidia e domesticação das espécies selecionadas. A partir do projeto SUCEST foram identificadas 21 famílias de elementos de transposição presentes e expressos no genoma de cana de açúcar. Pretendemos aprofundar os estudos em quatro destas famílias sendo elas a família dos transposons do tipo Mu e hAT, assim como dos retroelementos Tnt1 e Hopscotch. De um lado, será avaliada a atividade de transposição destes elementos e também a contribuição dos progenitores em elementos de transposição na constituição do genoma híbrido de cana de açúcar. A função integrase é uma atividade protéica associada ao corte da cadeia fosfodiéster da molécula de DNA e é comum as transposases, recombinases e integrases, sendo que o que as diferencia é o modo em que o corte é efetivamente gerado na molécula. O estudos das integrases presentes nos genomas bacterianos tem como objetivo a identificação das famílias e das regiões associadas de quatro linhagens de Xylella fastidiosa. Nosso objetivo central é a compreensão da diversificação dos elementos e do impacto destes sobre a estabilidade e diferenciação dos genomas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissionalizante: (0) / Doutorado: (5) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / Maria Magdalena Rossi - Integrante / Ana Paula Pimentel Costa - Integrante / Regina Yuri Hashimoto Miura - Integrante / Erika Maria de Jesus - Integrante / Alessandro Varani - Integrante / Douglas Silva Domingues - Integrante / Maria Elisa Manetti - Integrante / Bruno Karolski - Integrante / Nilo Saccaro - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 52 / Número de orientações: 21
Membro: Marie-Anne Van Sluys.


(*) Relatório criado com produções desde 2006 até 2014
Data de processamento: 17/02/2014 11:51:51